(19)【発行国】日本国特許庁(JP)
(12)【公報種別】公開特許公報(A)
(11)【公開番号】P2022175983
(43)【公開日】2022-11-25
(54)【発明の名称】マイクロ流路チップにおいてエマルジョンを生成及び保持する方法
(51)【国際特許分類】
G01N 35/08 20060101AFI20221117BHJP
G01N 37/00 20060101ALI20221117BHJP
【FI】
G01N35/08 B
G01N37/00 101
【審査請求】未請求
【請求項の数】16
【出願形態】OL
(21)【出願番号】P 2021082821
(22)【出願日】2021-05-14
【公序良俗違反の表示】
(特許庁注:以下のものは登録商標)
1.TWEEN
2.SPAN
(71)【出願人】
【識別番号】000003300
【氏名又は名称】東ソー株式会社
(74)【代理人】
【識別番号】100099759
【弁理士】
【氏名又は名称】青木 篤
(74)【代理人】
【識別番号】100123582
【弁理士】
【氏名又は名称】三橋 真二
(74)【代理人】
【識別番号】100117019
【弁理士】
【氏名又は名称】渡辺 陽一
(74)【代理人】
【識別番号】100141977
【弁理士】
【氏名又は名称】中島 勝
(74)【代理人】
【識別番号】100138210
【弁理士】
【氏名又は名称】池田 達則
(74)【代理人】
【識別番号】100217179
【弁理士】
【氏名又は名称】村上 智史
(72)【発明者】
【氏名】服部 篤紀
【テーマコード(参考)】
2G058
【Fターム(参考)】
2G058DA02
2G058DA05
2G058DA07
2G058DA09
2G058EA14
(57)【要約】 (修正有)
【課題】マイクロ流路チップにおいて簡便かつ安定してエマルジョンの生成及び保持を行う改善された方法を提供する。
【解決手段】マイクロ流路チップ10に分散相液及び連続相液を供給してエマルジョンの生成及び保持を行う方法であって、分散相液保持部102、103に分散相液を供給すること、連続相液保持部101に連続相液を供給すること、及び外部送液駆動力によってエマルジョン形成部120において分散相液から構成される液滴及び連続相液から構成される連続相を含むエマルジョンを生成し、このようにして生成されたエマルジョンをエマルジョン流路130を介して気体で充填された状態のエマルジョン保持流路140に輸送すること、を含み、分散相液と連続相液とをエマルジョン形成部又はその上流で、気泡トラップを介さずに接触させること、を特徴とする、方法。
【選択図】
図1
【特許請求の範囲】
【請求項1】
マイクロ流路チップに分散相液及び連続相液を供給してエマルジョンの生成及び保持を行う方法であって、
前記マイクロ流路チップが、分散相液保持部、分散相液流路、連続相液保持部、連続相液流路、エマルジョン形成部、エマルジョン流路、エマルジョン保持流路、及び排出口を有しており、
前記分散相液保持部が、前記分散相液流路を介して、前記エマルジョン形成部に接続しており、
前記連続相液保持部が、前記連続相液流路を介して、前記エマルジョン形成部に接続しており、
前記エマルジョン形成部が、前記エマルジョン流路を介して、前記エマルジョン保持流路に接続しており、
前記エマルジョン保持流路が、前記排出口に接続しており、
前記分散相液保持部に、分散相液を供給すること、
前記連続相液保持部に、連続相液を供給すること、及び、
外部送液駆動力によって、前記エマルジョン形成部において、前記分散相液から構成される液滴及び前記連続相液から構成される連続相を含むエマルジョンを生成し、このようにして生成された前記エマルジョンを、前記エマルジョン流路を介して、気体で充填された状態の前記エマルジョン保持流路に輸送すること、
を含み、
前記分散相液と、前記連続相液とを、前記エマルジョン形成部又はその上流で、気泡トラップを介さずに接触させること、
を特徴とする、方法。
【請求項2】
外部送液駆動力なしでも前記分散相液と前記連続相液とが接触することができる程度に、前記エマルジョン形成部及びその上流の流路抵抗が十分に小さい、請求項1に記載の方法。
【請求項3】
前記接触の前に、
前記分散相液を、気体で充填された状態の前記分散相液流路を通して前記エマルジョン形成部にまで移動させ、かつ、
前記連続相液を、気体で充填された状態の前記連続相液流路を通して前記エマルジョン形成部にまで移動させること
を特徴とする、請求項1又は2に記載の方法。
【請求項4】
前記分散相液及び/又は前記連続相液を、毛細管力及び/又は液面差圧によって移動させる、請求項3に記載の方法。
【請求項5】
前記排出口に陰圧を印加し、それにより、前記接触の前に、前記分散相液を、気体で充填された状態の前記分散相液流路を通して前記エマルジョン形成部にまで移動させることを特徴とする、請求項3又は4に記載の方法。
【請求項6】
前記接触の前に、前記連続相液を、気体で充填された状態の前記連続相液流路、前記エマルジョン形成部、及び前記分散相液流路を通して、前記分散相液保持部にまで移動させることを特徴とする、請求項1又は2に記載の方法。
【請求項7】
前記連続相液を、毛細管力及び/又は液面差圧によって移動させる、請求項6に記載の方法。
【請求項8】
前記連続相液及び/又は前記分散相液の前記供給を、分注手段によって行う、請求項1~7のいずれか一項に記載の方法。
【請求項9】
前記外部送液駆動力によって前記マイクロ流路チップに適用される圧力が、30kPa以下であることを特徴とする、請求項1~8のいずれか一項に記載の方法。
【請求項10】
前記エマルジョン形成部における前記エマルジョンの生成速度が、5液滴/秒以上であることを特徴とする、請求項1~9のいずれか一項に記載の方法。
【請求項11】
前記外部送液駆動力が、前記排出口に適用される陰圧であることを特徴とする、請求項1~10のいずれか一項に記載の方法。
【請求項12】
前記エマルジョン保持流路に保持されている前記エマルジョンに対して検出処理を行うことをさらに含む、請求項1~11のいずれか一項に記載の方法。
【請求項13】
前記エマルジョン保持流路の流路高さが、前記エマルジョン保持流路に保持される前記エマルジョン中の前記液滴が垂直方向に互いに重ならない高さであることを特徴とする、請求項1~12のいずれか一項に記載の方法。
【請求項14】
前記エマルジョン保持流路の流路体積が、エマルジョン形成部で生成される液滴の合計体積以上、及び/又は1μL以上であることを特徴とする、請求項1~13のいずれか一項に記載の方法。
【請求項15】
前記液滴の平均体積が、0.1~10nLであることを特徴とする、請求項1~14のいずれか一項に記載の方法。
【請求項16】
前記エマルジョン保持流路が、1000個以上の前記液滴を保持することができることを特徴とする、請求項15に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【0001】
本発明は、マイクロ流路チップにおいてエマルジョンを生成及び保持する方法に関する。特には、本発明は、液滴アレイ測定をより効率的かつ簡便・迅速に行うことができる方法に関する。
【背景技術】
【0002】
反応液を微小区画に分画し独立して反応を行なう技術として、微小液滴中に反応液を分画する微小液滴法が知られている。この手法は、例えばマイクロ・ナノ粒子の作製などに応用が期待されており、特に、マイクロ流体装置を用いて、標的分子を1分子単位で微小区画化し、微小液滴内で反応を行なうことで、標的分子の有無をシグナルの有無で計測し、標的分子の数の絶対定量を行なうデジタル計測に利用されている。
【0003】
微小液滴法では、一般に、オイルなどの連続相と、この連続相に分散した水溶液の液滴とから構成されるエマルジョンが使用される。
【0004】
非特許文献1は、遠心ステップ液滴生成法を開示している。当該文献は、装置の注入口にオイルを充填し、このオイルを遠心によって液滴回収室に送った後で、同じ注入口から、サンプル溶液を導入し、遠心によって液滴生成を行うことを記載している。
【0005】
このような液滴生成法に対して、反応液などの分散相液とオイルなどの連続相液とを、別個の供給部を介してマイクロ流路チップに供給し、チップ内で合流させてエマルジョン生成を行う方法が知られている。
【0006】
特許文献1は、液滴を生成するためのそのようなシステム及び方法を開示している。当該文献は、生成された液滴を、ピペットチップ又は液滴ウェルからなる出口領域に輸送することを記載している。また、当該文献は、気泡トラップ(エアトラップ)を記載しており、この気泡トラップによって、サンプルとオイルとが、(陰圧又は陽圧などの)流体駆動力の適用までの間、実質的に離され、その後、流体駆動力を適用することによって、サンプルからなる液滴とオイルからなる連続相を有するエマルジョンを形成することを記載している。
【0007】
また、微小液滴法に関して、近年、装置の簡便化・迅速化の観点から、検出領域に液滴を単層に整列させて簡便にシグナルを測定する液滴アレイ測定が注目されている。
【0008】
特許文献2及び3は、液滴を形成するための流路及び液滴を保持するための液滴保持部を有するマイクロ流路チップを開示している。特許文献2は、2以上の反応液同士を合流させた後、反応液とは混和しない非混和性液体を接触させることで液滴を形成させることを記載している。特許文献3は、分散相流入部と連続相流入部とから流入した分散相及び連続相を、流路を介して液滴生成部で接触させることで液滴化することを記載している。
【0009】
非特許文献2は、チップ上で液滴を生成する方法及びそのための装置について記載している。当該文献に記載の方法は、送液前に、液滴アレイ部をオイルで充填する操作(充填操作)を含む。
【先行技術文献】
【特許文献】
【0010】
【特許文献1】欧州特許第2550528号明細書
【特許文献2】特開2019-170363号公報
【特許文献3】特開2020-169911号公報
【非特許文献】
【0011】
【非特許文献1】Centrifugal step emulsification applied for absolute quantification of nucleic acids by digital droplet RPA, Lab Chip, 2015, 15, 2759-2766
【非特許文献2】1-Million droplet array with wide-field fluorescence imaging for digital PCR、Lab on a Chip、2011、11、3838-3845
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【0012】
エマルジョンの生成及び保持を1つのマイクロ流路チップ上で行う方法は、簡便・迅速な測定の観点から好ましい。また、チップ内の流路をあらかじめ連続相液で充填することなく、連続相液及び分散相液をマイクロ流路チップに供給する方法によれば、(流路内に発生した気泡を圧力送液等によって流路外へ排出する操作、過剰なオイルを除去する操作などを含む)準備作業、及び必要な装置を省略することができるので、自動化などの観点から有利である。
【0013】
しかしながら、このような方法では、エマルジョン保持流路におけるエマルジョンの保持性に問題が生ずる場合がある。
【0014】
本発明は、マイクロ流路チップにおいて簡便かつ安定してエマルジョンの生成及び保持を行う改善された方法を提供することを目的とする。
【課題を解決するための手段】
【0015】
本発明に係る上記の課題は、本発明に係る下記の態様によって解決することができる。
<態様1>
マイクロ流路チップに分散相液及び連続相液を供給してエマルジョンの生成及び保持を行う方法であって、
前記マイクロ流路チップが、分散相液保持部、分散相液流路、連続相液保持部、連続相液流路、エマルジョン形成部、エマルジョン流路、エマルジョン保持流路、及び排出口を有しており、
前記分散相液保持部が、前記分散相液流路を介して、前記エマルジョン形成部に接続しており、
前記連続相液保持部が、前記連続相液流路を介して、前記エマルジョン形成部に接続しており、
前記エマルジョン形成部が、前記エマルジョン流路を介して、前記エマルジョン保持流路に接続しており、
前記エマルジョン保持流路が、前記排出口に接続しており、
前記分散相液保持部に、分散相液を供給すること、
前記連続相液保持部に、連続相液を供給すること、及び、
外部送液駆動力によって、前記エマルジョン形成部において、前記分散相液から構成される液滴及び前記連続相液から構成される連続相を含むエマルジョンを生成し、このようにして生成された前記エマルジョンを、前記エマルジョン流路を介して、気体で充填された状態の前記エマルジョン保持流路に輸送すること、
を含み、
前記分散相液と、前記連続相液とを、前記エマルジョン形成部又はその上流で、気泡トラップを介さずに接触させること、
を特徴とする、方法。
<態様2>
外部送液駆動力なしでも前記分散相液と前記連続相液とが接触することができる程度に、前記エマルジョン形成部及びその上流の流路抵抗が十分に小さい、態様1に記載の方法。
<態様3>
前記接触の前に、
前記分散相液を、気体で充填された状態の前記分散相液流路を通して前記エマルジョン形成部にまで移動させ、かつ、
前記連続相液を、気体で充填された状態の前記連続相液流路を通して前記エマルジョン形成部にまで移動させること
を特徴とする、態様1又は2に記載の方法。
<態様4>
前記分散相液及び/又は前記連続相液を、毛細管力及び/又は液面差圧によって移動させる、態様3に記載の方法。
<態様5>
前記排出口に陰圧を印加し、それにより、前記接触の前に、前記分散相液を、気体で充填された状態の前記分散相液流路を通して前記エマルジョン形成部にまで移動させることを特徴とする、態様3又は4に記載の方法。
<態様6>
前記接触の前に、前記連続相液を、気体で充填された状態の前記連続相液流路、前記エマルジョン形成部、及び前記分散相液流路を通して、前記分散相液保持部にまで移動させることを特徴とする、態様1又は2に記載の方法。
<態様7>
前記連続相液を、毛細管力及び/又は液面差圧によって移動させる、態様6に記載の方法。
<態様8>
前記連続相液及び/又は前記分散相液の前記供給を、分注手段によって行う、態様1~7のいずれか一項に記載の方法。
<態様9>
前記外部送液駆動力によって前記マイクロ流路チップに適用される圧力が、30kPa以下であることを特徴とする、態様1~8のいずれか一項に記載の方法。
<態様10>
前記エマルジョン形成部における前記エマルジョンの生成速度が、5液滴/秒以上であることを特徴とする、態様1~9のいずれか一項に記載の方法。
<態様11>
前記外部送液駆動力が、前記排出口に適用される陰圧であることを特徴とする、態様1~10のいずれか一項に記載の方法。
<態様12>
前記エマルジョン保持流路に保持されている前記エマルジョンに対して検出処理を行うことをさらに含む、態様1~11のいずれか一項に記載の方法。
<態様13>
前記エマルジョン保持流路の流路高さが、前記エマルジョン保持流路に保持される前記エマルジョン中の前記液滴が垂直方向に互いに重ならない高さであることを特徴とする、態様1~12のいずれか一項に記載の方法。
<態様14>
前記エマルジョン保持流路の流路体積が、エマルジョン形成部で生成される液滴の合計体積以上、及び/又は1μL以上であることを特徴とする、態様1~13のいずれか一項に記載の方法。
<態様15>
前記液滴の平均体積が、0.1~10nLであることを特徴とする、態様1~14のいずれか一項に記載の方法。
<態様16>
前記エマルジョン保持流路が、1000個以上の前記液滴を保持することができることを特徴とする、態様15に記載の方法。
【発明の効果】
【0016】
本発明の方法によれば、マイクロ流路チップにおいて簡便かつ安定してエマルジョンの生成及び保持を行う改善された方法を提供することができる。特に、本発明の方法は、エマルジョンの生成及び保持を自動化する上で利点を有する。
【図面の簡単な説明】
【0017】
【
図1】
図1は、本開示の方法に係るマイクロ流路チップの1つの実施態様の平面概略図である。
【
図2】
図2は、本開示に係る分散相液保持部の1つの実施態様を示す断面概略図である。
【
図3】
図3は、本開示に係る方法の1つの実施態様におけるエマルジョン生成の様子を示す写真である。
【
図4】
図4は、本開示に係る方法の別の実施態様におけるエマルジョン生成の様子を示す写真である。
【
図5】
図5は、本開示に係る方法の1つの実施態様における、エマルジョン保持流路に保持された液滴に対する検出処理の様子を示す写真である。
【発明を実施するための形態】
【0018】
≪エマルジョンの生成及び保持を行う方法≫
本開示に係る方法は、マイクロ流路チップに分散相液及び連続相液を供給してエマルジョンの生成及び保持を行う方法であって、
マイクロ流路チップが、分散相液保持部、分散相液流路、連続相液保持部、連続相液流路、エマルジョン形成部、エマルジョン流路、エマルジョン保持流路、及び排出口を有しており、分散相液保持部が、分散相液流路を介して、エマルジョン形成部に接続しており、連続相液保持部が、連続相液流路を介して、エマルジョン形成部に接続しており、エマルジョン形成部が、エマルジョン流路を介して、エマルジョン保持流路に接続しており、エマルジョン保持流路が、排出口に接続しており、
分散相液保持部に、分散相液を供給すること、
連続相液保持部に、連続相液を供給すること、及び、
外部送液駆動力によって、エマルジョン形成部において、分散相液から構成される液滴及び連続相液から構成される連続相を含むエマルジョンを生成し、このようにして生成されたエマルジョンを、エマルジョン流路を介して、気体で充填された状態のエマルジョン保持流路に輸送すること、
を含み、
分散相液と、連続相液とを、エマルジョン形成部又はその上流で、気泡トラップを介さずに接触させることを特徴とする。
【0019】
従来、チップ内の流路に気泡トラップを設け、それによって、気体で充填された流路内をそれぞれ別個に進行する分散相液(水溶性反応液)と連続相液(オイル)との間に気泡を生じさせる方法が知られていた。
【0020】
このような気泡トラップは、生成された液滴を液滴ウェルに回収する従来の方法、例えば、従来の一般的な液滴生成チップ(例えばフローサイトメトリー検出法に使用されるチップ)を用いる方法では良好に機能する。すなわち、従来の方法では、常圧開放されたエマルジョンウェルにエマルジョンを誘導するので、気泡をエマルジョンウェルの気液界面に接触させて消滅させることが比較的容易であった。
【0021】
しかしながら、エマルジョン生成部だけでなく、生成されたエマルジョンに対して検出処理等を行うためのエマルジョン保持部(エマルジョン保持流路)も有しているマイクロ流路チップにおいて、このような気泡トラップ用いると、エマルジョンの安定した保持に問題が生ずることを見出した。
【0022】
具体的には、生成されたエマルジョンを同一のマイクロ流路チップ内に保持する場合、発生した気泡がエマルジョン保持流路に混入することによって、エマルジョンの均一性を低下させる原因となり、例えば、液滴の合一などのおそれが発生する。また、エマルジョン保持流路における気泡に起因して液滴同士が高さ方向に部分的に重なり、単層状に整列できなくなることがある。さらに、エマルジョン保持流路における気泡が膨張することによって検出範囲外に液滴が流出してしまうこともある。これらは、特に、保持されたエマルジョンに対して検出処理を行う場合に、検出精度の低下などの問題を生ずる。また、エマルジョン保持流路は、一般に、検出液滴を多く保持する目的で流路断面積及び流路長さが大きい流路(流路体積が大きい流路)に設計するため、発生した気泡が滞留しやすくなり、連続相液の過剰な送液等(上記の従来技術に係る準備作業)を行わないと、エマルジョン保持流路に形成された気泡を除去することは容易でない。
【0023】
本発明に係る方法では、生成されたエマルジョンを保持するためのエマルジョン保持流路を有しているマイクロ流路チップにおいて、気泡トラップを介さずに分散相液と連続相液とを接触させる。本開示の方法によれば、気泡の発生を抑制することができるので、エマルジョン保持流路に気泡が侵入することによる問題を回避することができる。
【0024】
したがって、本発明によれば、エマルジョンを生成及び保持するためのマイクロ流路チップにおいて、あらかじめ連続相液でチップを充填する準備工程等を省きつつ、安定したエマルジョンの生成及び保持を行うことができる。
【0025】
図1に示すマイクロ流路チップを用いて、本発明を具体的に説明する。なお、
図1のマイクロ流路チップは例示的な実施態様の概略図であり、本発明に係る方法は、この実施態様に限られず、種々のマイクロ流路チップで実施することができる。
図1は、理解を容易にするための概略図であり、縮尺どおりではない。
【0026】
図1のマイクロ流路チップ10は、平面型の構成を有しており、すなわち、エマルジョンの生成、輸送及び保持が、実質的に1つの平面内で行われるようになっている。
図1の方向Wは、幅方向を示しており、方向Lは、長さ方向を示している。W及びLに垂直な方向が、鉛直方向である。
図1のマイクロ流路チップ10は、第一分散相液保持部102、第二分散相液保持部103、(114、115、及び116で示されている)分散相液流路、連続相液保持部101、連続相液流路111、エマルジョン形成部120、エマルジョン流路130、エマルジョン保持流路140、及び排出口を150有している。分散相液保持部102、103が、分散相液流路を介して、エマルジョン形成部120に接続しており、連続相液保持部101が、連続相液流路111を介して、エマルジョン形成部120に接続している。
図1に係る態様では、分散相液流路が、第一分散相液流路114、第二分散相液流路115、及び分散相液合流部116からなり、連続相液流路111が、第一連続相液流路112及び第二連続相液流路113からなる。エマルジョン形成部120が、エマルジョン流路130を介して、エマルジョン保持流路140に接続しており、エマルジョン保持流路140が、排出口150に接続している。
【0027】
本開示に係る方法によれば、検出対象となる物質を含有する水溶性反応液などの分散相液を、分散相液保持部102、103に供給し、オイルなどの連続相液を、連続相液保持部101に供給する。この時点で、マイクロ流路チップ10の各流路には気体(特には空気)が充填されている(すなわち、「空」のマイクロ流路チップを用いる)。本発明に係る方法では、マイクロ流路チップの流路を連続相液であらかじめ充填せずに分散溶液及び連続相液をチップに供給するので、準備工程を省略することができる。
【0028】
なお、空のマイクロ流路チップとは、流路内が気体(特には空気)で充填された状態のことを指し、流路全体に液体(例えば、分散相液、連続相液など)がない状態、すなわち流路全体が気体で充填されている状態が好ましい。なお、マイクロ流路チップの流路内に表面処理や空気中の水の凝結等によって液体が残留・発生していてもこの限りではないが、少なくとも流路の一部が液体によって閉塞していないことが好ましく、特に、分散相液流路、連続相液流路、エマルジョン形成部が閉塞していないことが好ましい。
【0029】
図1のマイクロ流路チップ10は、毛細管力及び/又は液面差圧によって、分散相液及び連続相液をそれぞれの保持部からそれぞれの流路を通してエマルジョン形成部120にまで移動させることができるように構成されている。したがって、各保持部101、102、103に供給された分散相液及び連続相液は、毛細管力及び/又は液面差圧によって、エマルジョン形成部120の方向(下流)に向かって移動する。なお、この移動(特には分散相液の移動)のために、外部から印加される圧力(特には排出口に印加される陰圧)を用いてもよい。
【0030】
本発明によれば、このように移動した分散相液と連続相液とを、エマルジョン形成部又はその上流で、気泡トラップを介さずに接触させる。すなわち、本発明によれば、好ましくはマイクロ流路チップに外部送液駆動力を適用して送液を開始する前に、エマルジョン形成部又はその上流で、分散相液と連続相液とを接触させ、この接触の際に、分散相液と連続相液との間に気泡が介在しない。
【0031】
本発明に係る方法では、外部送液駆動力を適用することによって、エマルジョン形成部120において、分散相液から構成される液滴及び連続相液から構成される連続相を含むエマルジョンを生成し、このようにして生成されたエマルジョンを、エマルジョン流路130を介して、気体で充填された状態のエマルジョン保持流路140(すなわち「空」のエマルジョン保持流路)に輸送し、そこに保持する(「エマルジョン充填法」)。
【0032】
エマルジョン充填法では、エマルジョン形成部で生成されたエマルジョンが、気体で充填されているエマルジョン保持流路の中を(特には排出口の方向に向かって)移動し、エマルジョン保持流路を充填する。すなわち、エマルジョン保持流路を充填している気体とエマルジョンとによって形成される「気液界面」が、エマルジョン保持流路の下流(特には排出口)に向かって移動する。エマルジョン充填法は、マイクロ流路チップの流路をあらかじめ連続相液で充填する準備工程及びそのための装置を省くことができるため、好ましい。
【0033】
外部送液駆動力としては、陰圧又は陽圧を用いることができる。例えば、マイクロ流路チップ10の排出口150に接続された吸引装置によって、陰圧を適用することができる。また、陽圧の適用は、例えば分散相液保持部102及び103並びに連続相液保持部101に接続された圧力印加装置によって行うことができる。なお、エマルジョン保持流路140は、エマルジョンが輸送される際に、気体で完全に充填されている必要はなく、例えば部分的に連続相液で充填されていてもよい。
【0034】
外部送液駆動力は、エマルジョンの生成に必要な相液の流れ、及び、エマルジョン保持流路内におけるエマルジョンの流れ(気体(特には空気)と連続相液との間の気液界面の移動)をもたらす。
【0035】
<接触>
上述したとおり、本開示の方法では、好ましくは陰圧又は陽圧の適用の前に、分散相液と連続相液とを、エマルジョン形成部又はその上流で、気泡トラップを介さずに接触させる。なお、本開示で「接触」という場合、別段の指示がない限り、分散相液と連続相液との接触を意味し、特には、エマルジョンの生成の前段階における分散相液と連続相液との接触を意味する。また、「気泡トラップ」は、特には、チップに別個に供給された連続相液と分散相液との接触を阻害する気泡を発生させるための構造であり、この構造は、例えば、分散相液保持流路に設けられており、流路内における気泡の生成を促すように構成されている。
【0036】
上述の接触は、各保持部(分散相液保持部及び連続相液保持部それぞれ)ヘの各相液(分散相液及び連続相液ぞれぞれ)の供給のタイミング、及び流路内における各相液の移動速度などを調節することによって行うことができる。各流路内における各相液の移動速度は、例えば、各保持部への各相液の供給量、並びに分散相液流路及び連続相液流路の特性(流路表面の特性、流路の圧力損失など)、並びに各相液の液物性を適宜選択することによって調節することができる。なお、この移動速度の調整は、主に毛細管力と液面差圧で制御することができる。
【0037】
毛細管力は、キャピラリー力とも呼ばれる力であり、大きく開けた保持部内の気液界面とより小さい断面を有する流路内の気液界面の表面張力差によって発生する流路に侵入する方向に働く力である。よって、毛細管力は各流路の特性だけでなく保持部の構造も影響し、特にエマルジョン充填法ではエマルジョンの気液界面の移動を制御するため、送液(液滴生成)中及び送液停止後の液滴保持中においても毛細管力が大きく影響する。
【0038】
また、液面差圧は、静水圧とも呼ばれる力であり、一般に静止状態の液体中に重力によって発生する圧力、すなわち各保持部への各相液の供給量(重量)に依存した圧力を指す。
【0039】
理想的には、各相液の物性及び供給量、各流路の特性に依存する毛細管力、並びに/又は液面差圧によって、上述の各相液の供給のタイミングや移動速度を制御するのが測定毎の再現性の観点から好ましい。しかし、実際は、供給時の吐出圧や各保持部内での対流等により意図しない圧力が各相液に印加されうる。そこで、後述のピペットのような分注手段を用いたチップで、滴下によって連続相液及び又は分散相液を供給するのが好ましい。
【0040】
なお、本開示において「上流」とは、マイクロ流路チップにおける液体の全体的な流れの方向を考慮したときの「上流」を意味している。具体的には、マイクロ流路チップにおいて、相液保持部側が上流であり、排出口側が下流である。
【0041】
(エマルジョン形成部での接触)
本開示に係る方法の1つの実施態様では、接触の前に、分散相液を、気体で充填された状態の分散相液流路を通してエマルジョン形成部にまで移動させ、かつ、連続相液を、気体で充填された状態の連続相液流路を通してエマルジョン形成部にまで移動させる。
【0042】
あらかじめ流路を連続相液で充填することなくチップに分散相液及び連続相液を供給する方法は、準備工程を省くことができるので好ましいが、各相液のエマルジョン形成部への到達のタイミングに応じて、気泡が発生することがある。例えば、分散相液が連続相液よりも先にエマルジョン形成部に到達し、エマルジョン形成部を充填してしまうと、後からエマルジョン形成部に向かって移動してくる連続相液とエマルジョン形成部を満たす分散相液との間(例えば連続相液流路内)に、気体(特には気泡)が残留するおそれが生じる。
【0043】
これに対して、分散相液を気体で充填された状態の分散相液流路を通してエマルジョン形成部にまで移動させ、かつ連続相液を気体で充填された状態の連続相液流路を通してエマルジョン形成部にまで移動させる上記の態様によれば、連続相液及び分散相液が連続相液流路及び分散相液流路を全長にわたって充填した後で、エマルジョン形成部で接触することとなる。この態様によれば、相液流路内に気体が残留することを抑制又は防止することができ、結果として、気泡の発生をさらに効果的に抑制することができる。
【0044】
特に好ましくは、分散相液を、気体で充填された状態の分散相液流路を通してエマルジョン形成部への流入部にまで移動させ、かつ、連続相液を、気体で充填された状態の連続相液流路を通してエマルジョン形成部にまで移動させる。なお、流入部は、分散相液流路のうち、エマルジョン形成部に隣接する部分である。
【0045】
この場合には、分散相液がエマルジョン形成部に進入しないうちに連続相液をエマルジョン形成部に進入させるので、分散相液がエマルジョン形成部を閉塞するおそれを、より効果的に抑制することができる。
【0046】
なお、この態様では、分散相液をエマルジョン形成部への流入部まで移動させているが、これとは逆に、連続相液をエマルジョン形成部への流入部まで移動させる態様も想定することができる。しかしながら、連続相液は一般にオイル成分を主成分としており、流動性が比較的高いので、流路内における移動を制御する上での容易さの観点から、分散相液を流入部まで移動させることが好ましい。
【0047】
接触の前に分散相液を気体で充填された状態の分散相液流路を通してエマルジョン形成部(又はエマルジョン形成部への流入部)にまで移動させ、かつ連続相液を気体で充填された状態の連続相液流路を通してエマルジョン形成部にまで移動させるために、上述のように、各保持部ヘの各相液の供給のタイミング、及び各流路内における各相液の移動速度などを調節することができる。
【0048】
分散相液が水性溶液の場合、エマルジョン形成部付近の流路壁面が疎水性であれば、分散相液がエマルジョン形成部への分散相液流路の流入部に留まる時間が長くなり、エマルジョン形成部が分散相液によって充填される(閉塞する)までの時間が長くなるため、好ましい。
【0049】
なお、エマルジョン形成部を選択的に疎水性にすることは、分散相液のエマルジョン形成部への意図しない早期の進入を抑制することができるので好ましいが、製作費用の増大につながるおそれもある。一方で、分散相液流路を含めた流路全体を疎水性にする場合には、表面張力の大きい水溶液をキャピラリー力(毛細管力)でエマルジョン形成部まで導入する速さが小さくなりやすい。この場合には、送液手段及び/又は分注手段によって分散相液に圧力を加えて移動を促進することができる。
【0050】
<分散相液保持部での接触>
本開示に係る方法の別の実施態様では、接触の前に、連続相液を、気体で充填された状態の連続相液流路、エマルジョン形成部、及び分散相液流路を通して、分散相液保持部にまで移動させる。
【0051】
分散相液は、一般に、連続相液と比較して流動性が低いので、分散相液で充填された流路内に気泡が発生した場合に、その気泡を除去することは容易ではない。特に、外部送液駆動力として陰圧を用いる場合には、分散相液に直接に送液圧力を及ぼすことが容易でないため、このような気泡の除去は、より困難となる。
【0052】
これに対して、接触の前に連続相液を気体で充填された状態の連続相液流路、エマルジョン形成部、及び分散相液流路を通して分散相液保持部にまで移動させる上記の態様では、分散相液を、気体で充填された流路内で移動させないので、分散相液流路において分散相液中に気泡が発生するおそれがさらに抑制される。なお、この場合、分散相液を分散相液保持部に滴下などによって供給することで、気泡の発生をさらに抑制することができる。後述するとおり、分散相液保持部への分散相液の供給は、分注手段によって行うことができる。
【0053】
なお、この態様では、連続相液が分散相液保持部まで達してから分散相液が分散相液保持部に供給されるまでの時間、及び/又は分散相液が分散相液保持部に供給されてから外部送液駆動力によって送液が開始されるまでの時間を短くし、それにより、分散相液保持部に逆流する連続相液の量を低減し、分散相液と連続相液が分散相液保持部で接触して生じる不均一液滴を低減することが好ましい。また、この態様では、外部送液駆動力の適用の前に連続相液がエマルジョン保持流路を過剰に充填しないようにすることが好ましい。
【0054】
<移動>
【0055】
上述したとおり、本発明では、分散相液と連続相液とを、エマルジョン形成部又はその上流で、気泡トラップを介さずに接触させる。好ましくは、外部送液駆動力なしでも分散相液と連続相液とが接触できる程度に、エマルジョン形成部及びその上流の流路抵抗が、十分に小さい。
【0056】
本開示に係る1つの実施態様では、接触の前に、分散相液及び/又は連続相液を、毛細管力及び/又は液面差圧によって移動させる。
【0057】
このような態様によれば、追加的な装置を必要とすることなく、容易に、分散相液及び連続相液の移動を制御することができる。
【0058】
上述したとおり、例えばマイクロ流路チップの流路構造を適宜設定することによって、所望の毛細管力を得ることができる。また、例えば各相液保持部に供給される液量(特には液面高さ)を調節することによって、所望の液面差圧を得ることができる。
【0059】
本開示に係る1つの実施態様では、外部送液駆動力なしでも分散相液と連続相液とが接触できる程度にエマルジョン形成部及びその上流の流路抵抗が十分に小さくなっており、それにより、例えば、接触の前に分散相液を気体で充填された状態の前記分散相液流路を通してエマルジョン形成部にまで移動させ、かつ連続相液を気体で充填された状態の連続相液流路を通してエマルジョン形成部にまで移動させる場合に、(特には空の状態のマイクロ流路チップの)分散相液保持部に分散相液が供給された時点から、分散相液が連続相液と接触するまでの時間が、5分以内であるようになっている。この時間は、好ましくは3分以内であり、より好ましくは1分以内である。この場合には、エマルジョンの生成及び保持に要する時間をさらに短縮することができる。
【0060】
また、本開示に係る別の実施態様では、外部送液駆動力なしでも分散相液と連続相液とが接触できる程度にエマルジョン形成部及びその上流の流路抵抗が十分に小さくなっており、それにより、例えば、接触の前に連続相液を気体で充填された状態の連続相液流路、エマルジョン形成部、及び分散相液流路を通し分散相液保持部にまで移動させる場合に、(特には空の状態のマイクロ流路チップの)連続相液保持部に連続相液が供給された時点から、連続相液が分散相液保持部で分散相液と接触するまでの時間が、1分以内であるようになっている。この時間は、好ましくは30秒以内であり、より好ましくは15秒以内である。この場合には、エマルジョンの生成及び保持に要する時間をさらに短縮することができる。
【0061】
なお、上記の接触前の(分散相液及び/又は連続相液の、特には分散相液の)移動のために、外部から印加される圧力を用いてもよい。特に、上記の接触の前に、排出口に陰圧を印加し、そのようにして、分散相液を、気体で充填された状態の分散相液流路を通してエマルジョン形成部にまで移動させることができる。一般に、分散相液は流路表面に対して親和性が低いため、接触前の分散相液の移動速度を増大させるのが好ましい。その手段の1つとして陰圧を用いることで、装置を簡便化することができる。外部から印加される圧力については、外部送液駆動力に関する下記の記載を参照することができる。
【0062】
各保持部に陽圧を印加することで上記の接触前の移動を制御する場合、流路内の微小量の各相液を制御するには、陽圧供給源を小さな圧力に制御し、かつ/又は陽圧の印加時間を極めて小さい時間に制御する必要があるため、装置として再現性が低下するおそれがある。
【0063】
一方で、例えば連続相液を供給する前に分散相液が分散相液流路内を移動する際に排出口に陰圧を印加する場合、連続相液流路及び連続相液保持部は液体で閉塞していないため、排出口から連続相液保持部への流路は外気に開放されている状態となり、陰圧供給源が有する陰圧よりも小さい陰圧が分散相液に印加されることになるので、流路内の微小量の分散相液の移動を精度よく制御する上で、印加圧力を小さく制御しやすいため装置として再現性を確保しやすく好ましい。
【0064】
また、分散相液を供給する前に連続相液が連続相液流路内を移動する際に排出口に陰圧を印加する場合、一般に連続相液は表面張力及び/又は粘性が小さい液体を使用するので、外部送液駆動力を利用した前記移動にはより精度の高い制御が必要となるため、より好ましい。なお、上記の移動の制御は流路閉塞による気泡の発生の抑制に直結するため重要である。また、上記の場合、陰圧供給源の圧力は外気に開放されて徐々に低下するため、圧力を維持できるような機構を有しているのがより好ましい。
【0065】
以下で、本開示に係る発明を構成する各構成要素についてさらに詳細に説明する。
【0066】
<エマルジョン>
本開示に係る方法によって生成されるエマルジョンは、分散性溶液であり、分散相液から構成される液滴、及び連続相液から構成される連続相を含む。エマルジョン中で、分散相液から構成される液滴が、連続相液から構成される連続相に分散している。
【0067】
(分散相液)
分散相液は、エマルジョンに含有される液滴を構成する液体である。
【0068】
分散相液は、例えば、水溶液である。分散相液は、随意に、界面活性剤、有機溶剤、増粘剤、血清、酵素などを含有することができる。分散相液は、反応液であってよく、例えば、後述する検出処理において検出対象となる試料を含有する液体、検出用の試薬を含有する液体、又はこれらの混合液であってよい。
【0069】
(連続相液)
連続相液は、エマルジョンに含有される連続相を構成する液体である。
【0070】
連続相液は、分散相液と混和しない非混和性液体であることが好ましい。例えば、分散相液が水溶液である場合、連続相液はオイルであってよく、この場合、ウォーターインオイル(W/O)型エマルジョンが形成される。
【0071】
連続相液がオイルである場合、オイルとしては、シリコーンオイル、鉱油、フッ素系分散媒、植物油、又はこれらの組み合わせが挙げられる。
【0072】
フッ素系分散媒としては、フルオロカーボン、特には、ペルフルオロヘキサン、ヘキサフルオロベンゼン、ペルフルオロメチルシクロヘキサン、ペルフルオロオクタン、及びペルフルオロトリペンチルアミンが挙げられる。
【0073】
市販されているフルオロカーボンとしては、FC-3283(フロリナート(商品名)3M社製)、FC-40(フロリナート(商品名)3M社製)、及びHFE-7500(3MTMNovecTM高機能性液体、3M社製)が挙げられる。
【0074】
連続相液としてフッ素系分散媒、特に上記のフルオロカーボンを使用した場合には、特に安定かつ迅速な液滴生成が可能となる。また、極性溶媒や無極性溶媒に対して極めて相溶性が低い特徴を有するため、エマルジョン内の液滴の成分が連続相液を介して他の液滴に移動してしまう問題(クロストーク、コンタミ)を抑制することができる。また、炭化水素系分散媒やシリコーンオイルで表面張力や粘性の低い液体を選択する場合、一般的に可燃性等の危険物としてのリスクが増大するが、フッ素系分散媒は消火剤や冷却媒として利用されるほど安全性が高いのが特徴である。
【0075】
なお、液滴の熱安定性の目的などのために、界面活性剤などの添加剤を連続相液に添加することもできる。これらの添加剤は、液滴における検出反応を阻害しないものであることが好ましい。界面活性剤としては、非イオン界面活性剤である、ポリエチレングリコールとポリプロピレングリコールのブロックコポリマーであるPLURONIC(登録商標)およびTETRONIC(登録商標)やTween、Span、Zonyl(登録商標)など挙げられる。連続相液としてフッ素系分散媒を使用する場合、フッ素系界面活性剤を使用するのが好ましい、例えばパーフルオロポリエーテルとポリエチレングリコールのブロックコポリマー等が挙げられる。
【0076】
(液滴)
エマルジョンに含有される液滴は、分散相液から構成される。液滴は、例えば、分散相液が連続相液との接触を介してカプセル封入されることによって形成される。
【0077】
液滴は、例えば、検出対象となる試料を含有する。液滴中で、試料中に含有される標的物質と試薬とを反応させ、その反応の有無及び/又は反応の程度を示す検出可能なシグナル(例えば、蛍光シグナル)を介して、試料の分析を行うことができる。この反応は、例えば、化学反応、結合反応、表現型の変化、又はこれらの組み合わせであってよい。
【0078】
液滴の体積は、標的物質(標的分子)をおおむね1つ(例えば1分子)保持できるだけの体積を有することが好ましい。具体的には、平均体積が、0.00001nL以上、0.0001nL以上、0.001nL以上、0.01nL以上、0.1nL以上、若しくは1nL以上、かつ/又は、100nL以下、50nL以下、若しくは10nL以下であることが好ましい。なお、液滴内における標的物質の反応を均一に行なう観点から、形成する液滴の体積は単分散性が高いと好ましい。ここでいう単分散性とは、具体的には、液滴体積の変動係数(CV)が20%以下、10%以下、5%以下、2%以下、又は1%以下のことをいう。なお、下記では説明をわかりやすくするため、液滴を球状として取り扱うが、流路構造や周囲の流れによって液滴が非球状になっていても同様に考えてよい。
【0079】
液滴は、少なくとも標的物質の反応温度条件下で液滴の形状を維持できるだけの熱安定性を有していることが好ましい。具体例として、検出処理において、TRC法による核酸増幅を行う場合は、40℃~48℃の温度条件下で、PCR法による核酸増幅を行う場合は、50℃~100℃の温度条件下で、それぞれ、形状を維持できるだけの熱安定性を液滴が有していることが好ましい。
【0080】
<マイクロ流路チップ>
本開示のマイクロ流路チップは、分散相液保持部、分散相液流路、連続相液保持部、連続相液流路、エマルジョン形成部、エマルジョン流路、エマルジョン保持流路、及び排出口を有している。分散相液保持部が、分散相液流路を介して、エマルジョン形成部に接続しており、連続相液保持部が、連続相液流路を介して、エマルジョン形成部に接続しており、エマルジョン形成部が、エマルジョン流路を介して、エマルジョン保持流路に接続しており、エマルジョン保持流路が、排出口に接続している。
【0081】
分散相液保持部、分散相液流路、連続相液保持部、連続相液流路、エマルジョン形成部、エマルジョン流路、エマルジョン保持流路、及び排出口は、互いに流体的に接続され、全体として1つの流路構造を形成する。
【0082】
特には、この流路構造は、分散相液保持部、連続相液保持部、及び排出口のみを介して、外部雰囲気(特には外部大気)に接続しうるようになっている。
【0083】
本開示に係るマイクロ流路チップは、例えば、基材、及び基材の上に配置されている上部構造体を有している。好ましくは、上部構造体が、流路構造、すなわち、分散相液保持部、分散相液流路、連続相液保持部、連続相液流路、エマルジョン形成部、エマルジョン流路、エマルジョン保持流路、及び排出口を有している。基材は、ガラスからできていてよい。上部構造体は、樹脂からできていてよい。マイクロ流路チップは、例えば、樹脂製の上部構造体と、マイクロ流路チップの底部を構成するガラス基材とを貼り合わせて作製することができる。
【0084】
マイクロ流路チップを構成する流路の大きさ(幅及び深さなど)は、目的とする液滴の体積などを考慮して適宜決定することができ、特には、標的物質の反応形態を考慮して適宜決定することができる。例えば、標的物質がDNAやRNAなどの核酸であり、標的物質の反応が当該核酸のデジタル増幅反応(1分子単位での増幅反応)である場合は、pLオーダー又はnLオーダーの液滴を作製することが必要なため、エマルジョン形成部の周辺の流路の幅及び深さが、それぞれ、0.1μm~1000μm、特には1μm~300μmの範囲であることが好ましい。
【0085】
マイクロ流路チップは、流路構造を正確かつ容易に作製可能なモールディング若しくはエンボッシングなどの鋳型を用いた技術、又は、フォトリソグラフィー、ソフトフォトリソグラフィー、ウェットエッチング、ドライエッチング、ナノインプリンティング、レーザー加工、電子線直接描画、積層造形法(Additive Manufacturing、AM)、機械加工など、当業者が通常用いる技術を組み合わせて作製することができる。
【0086】
マイクロ流路チップの作製に用いる材料として、PDMS(ポリジメチルシロキサン)及びアクリルなどのポリマー材料、ステンレスなどの金属材料、ガラス、シリコーン、セラミックスなどがあげられる。これらの中でも、ポリマー材料は、流路自体を安価に作製でき、ディスポーザブルな態様としやすい。したがって、ポリマー材料を少なくとも部分的に用いることが好ましい。
【0087】
なお、マイクロ流路チップを構成する流路は、少なくとも分散相液に対して親和性の低い流路壁面にすると好ましい。分散相液に対して親和性の低い材料を用いてマイクロ流路チップを作製してもよく、分散相液に対して親和性の低い材料で流路壁面に相当する部分を表面処理してもよい。例えば、PDMS(ポリジメチルシロキサン)、アクリル、シクロオレフィンポリマー、PTFE(ポリテトラフルオロエチレン)などのポリマー材料を用いてマイクロ流路チップを作製してもよく、炭化水素系シラン化剤、フッ化炭素系シラン化剤等によって流路壁面の表面処理を行なってもよい。
【0088】
(分散相液保持部)
分散相液保持部は、エマルジョンを生成するための材料となる分散相液を保持する部分である。分散相液保持部は、例えば、マイクロ流路チップの使用状態において鉛直方向に延在する穴部及び/又はウェルであってよく、この穴部及び/又はウェル内に、分散相液を供給しかつ保持することができるようになっている。分散相液保持部は、例えば、直径0.1mm~20mmの穴部及び/又はウェルから構成されていてよい。分散相液保持部が穴部及びウェルから構成される場合、鉛直方向に延在するウェルが、鉛直方向に延在する穴部を介して、分散相液流路に接続することができる。
【0089】
図2は、本開示に係る分散相液保持部の1つの実施態様を示す断面概略図である。
図2は、理解を容易にするための概略図であり、縮尺どおりではない。
図2のHは高さ方向であり、Lは長さ方向である。
図2に示されている分散相液保持部200は、ウェル21及び穴部23を有している。ウェル21が、穴部23を介して、分散相液流路115に接続している。ウェル21及び穴部23は、高さ方向(ここでは鉛直方向)に延在している。
図2の符号25は、ウェル21の底面と穴部23とのつなぎ目である拡張部位を示す。
図2の実施態様では、ウェル21の底面が、穴部23の延在方向(特には拡張部位25近傍における穴部23の側壁)に対して垂直に延在している。
【0090】
分散相液保持部に関しては、下記に従ってさらなる最適化を行うことが好ましい。
【0091】
送液中の駆動力としては、主に、送液圧力(陽圧、陰圧)及び/又は液面差圧(静水圧)及び/又は毛細管力(キャピラリー力)が働く。このうち、毛細管力は、送液中の流路下流(一般に、エマルジョン保持流路)の気液界面(及び固液界面)の表面張力と各保持部内の気液界面(及び固液界面)の表面張力の差によって決定される。すなわち、各保持部における気液界面の形状(壁面への濡れ挙動)によって流路内送液速度などが変化するため、特に、流路内の気液界面を制御することによって送液(エマルジョン生成及び保持)を行うエマルジョン充填法において、各保持部の形状は、安定な送液を実現するための重要な因子である。特に、一般的なエマルジョン生成チップでは、少なくともエマルジョン形成部の流路壁面を分散相液に対して親和性の低い表面(分散相液が水性液体であれば疎水表面)にすることで安定なエマルジョン生成が実施可能となるため、チップ製造コストの観点から流路内表面処理や別基板を組み合わせていない場合、分散相液保持部の壁面も分散相液に対して親和性の低い表面になるのが一般的である。このとき、分散相液保持部において界面形状の変化に伴う気液界面の表面張力の変化量が大きくなるため、送液への影響がより大きくなる。
【0092】
上述のような毛細管力の変化を低減する観点からは、実質的に壁面に不連続な形状が無く、垂直方向に延在する穴部及び/又はウェルが好ましい。また、分散相液保持部の分散相液の残量が少なくなると、気液界面が保持部のウェルの底面に実質的に接触し界面形状が変化しやすくなるため、その影響を低減するため流路と直接流体接続している穴部及び/又はウェルの口径は小さい方が好ましく、例えば5mm以下、より好ましくは2mm以下、特に好ましくは1mm以下であってよい。一方で、分散相液流路と直接に流体接続している穴部又はウェルから径を拡張することで分散相液の保持量を増加させることもできるが、この場合は、気液界面が拡張部位付近に存在すると気液界面形状が変化しやすい。したがって、1つの好ましい態様として、拡張部位の形状を調整することができ、かつ/又は、流路と直接流体接続している穴部若しくはウェルの拡張部位までの高さを小さくすることができ、例えば3mm以下、より好ましくは1mm以下、特に好ましくは0.5mm以下とすることができる。さらに、分散相液の供給量が少なくかつ/又は分散相液保持部周辺のチップ外部表面が分散相液に対して親和性が低く、かつ外部送液駆動力が排出口への陰圧印加である場合には、穴部のみの構成として、穴部に半球面状となるように分散相液を供給すると、チップ壁面への接触面積を最小限とし、分散相液の残量が少なくなっても気液界面の形状の変化を抑制できるため好ましい。
【0093】
なお、外部送液駆動力として陽圧を用いる場合、分散相液保持部が、圧力源と接続することに適していることが好ましい。この場合、分散相液保持部が、印加される圧力に対する耐性を有することが好ましい。
【0094】
(分散相液の供給)
本開示に係る方法は、分散相液保持部に分散相液を供給することを含む。
【0095】
分散相液保持部に分散相液を供給するために、分散相液を保持するために別個に用意される別容器(相液保持容器)を用いることもできる。このような容器は、保管中及び操作中における液の流出を防止する観点から、分散相液を保持した状態で完全に又は可変的に密閉されていることが好ましい。
【0096】
また、分散相液の供給(及び/又は連続相液の供給)は、分注手段によって行うことができる。分注手段の使用は、分散相液の残量を抑制し、かつ測定時間及び/又は試薬(分散相液)間のコンタミを抑制できる点で、好ましい。
【0097】
例えば、分注手段を用いて各保持部に各相液を滴下し、又は、各保持部の壁面に沿って各相液を導入することができる。これは、送液を陰圧で行う場合に、特に有利である。従来の供給方法、特に、各保持部にチューブ又はマニフォールドを流体接続(密閉接続)させて各保持部への液導入及び送液圧力を同時に行う方法では、接続時の不意の圧力変動及び圧力の安定化までに要する時間に起因して、分散相液及び連続相液の進行を正確に制御することが容易でなく、流路閉塞なく分散相液と連続相液とを接触させることが困難であった。これに対して、分注手段を用い、かつ送液を陰圧で行う場合には、各保持部に相液供給用装置及び圧力源を接続する際の圧力の変動がなくなるので、陰圧適用前の各相液の移動及び分散相液と連続相液との接触をより正確に制御することが可能となり、結果として、気泡の発生をさらに効果的に抑制することができる。
【0098】
分注手段は、保持部における圧力変動を生じないものであることが好ましい。分注手段は、例えばピペットであってよい。好ましくは、分注手段(特に、分注手段を構成する液吐出口)が、各保持部に対して流体接続(密閉接続)されておらず、空間的に離されている。
【0099】
例えば、分注手段は、ポンプ、アクチュエーター、ピペットを含む機構であってよく、別容器に保持された各相液をポンプによって吸い上げ、アクチュエーターによって各保持部までピペット先端を移動した後、ポンプによって各保持部に各相液を押し出す動作を行うことが好ましい。加えて、各相液が接触したピペット等の一部は、取り外し可能で使用毎に取り換えることができると、コンタミが抑制できるので好ましい。さらに、分注手段のポンプを送液手段として併用すると、装置構成が簡便化できるため好ましい。また、繰り返し使用が意図される場合、使い捨てのピペットを含む分注手段によって相液を添加しても良いし、共通のラインを使用して相液保持容器からマイクロ流路チップへ添加を行っても良い。後者の場合、連続相液への分散相液のコンタミ抑制のため、マイクロ流路チップへの接続部までの共用のラインを洗浄する工程を含んでいることが好ましい。また、ピペットを含まない分注手段として、外力によって、相液を保持した容器から直接保持部に各液体を添加(滴下)する方法も好ましい(例えば、容器の熱圧着した部位を圧力によって破断させ容器内の液体を押し出す手段など)。また、例えばTRC反応やPCR反応を行う場合、水溶液サンプルの精製手段や調製手段として分注手段を併用してもよい。
【0100】
(分散相液流路)
分散相液流路は、分散相液保持部とエマルジョン形成部とを接続している。分散相液流路は、分散相液がその中を通るように構成されている。なお、分散相液に加えて連続相液が分散相液流路を通ることを想定することもできる。
【0101】
分散相液流路の寸法は、使用する分散相液の種類及び特性などに応じて適宜設定することができる。分散相液流路は、例えば、10~500μm、又は50~200μmの幅を有することができ、1mm~500mm、又は10~200mmの長さを有することができる。また、分散相液流路は、1~200μm、又は10~100μmの流路高さを有することができる。分散相液流路は、1つ以上の場所で屈曲してもよく、蛇行形状を有してもよい。
【0102】
本開示に係るマイクロ流路チップは、2つ以上の分散相液保持部、及びそれらにそれぞれ対応する2つ以上の分散相液流路を有することができる。
【0103】
特には、本開示に係るマイクロ流路チップが、第一分散相液保持部及び第二分散相液保持部を有し、分散相液流路が、第一分散相液保持部に接続されている第一分散相液流路、第二分散相液保持部に接続されている第二分散相液流路、及び分散相液合流部を含む。第一分散相液流路及び第二分散相液流路は、それぞれ、分散相液合流部を介して、エマルジョン形成部に接続する。
【0104】
2つ以上の分散相液保持部を用いることによって、例えば、分析用試料を含有する反応液と、検出用試薬を含有する反応液とを、別個にマイクロ流路チップに供給し、液滴を生成する直前まで両者が混合しないようにすることができる。これは、反応開始のタイミングをより良好に制御することができるので、好ましい。
【0105】
上述の分散相液合流部を有するマイクロ流路チップにおいて、分散相液と連続相液との接触の前に、分散相液を気体で充填された状態の分散相液流路を通してエマルジョン形成部(又はエマルジョン形成部への流入部)にまで移動させ、かつ連続相液を気体で充填された状態の連続相液流路を通してエマルジョン形成部にまで移動させる場合には、第一分散相液保持部及び第二分散相液保持部にそれぞれ供給された第一分散相液及び第二分散相液を、分散相液合流部で合流させることが好ましい。
【0106】
分散相液合流部で気泡による流路閉塞が起こると、エマルジョンの生成を行うことができなくなくおそれがある。特に陰圧で送液を行う場合には、一般的に水溶性である分散相液の性質に起因して、気泡による流路閉塞を解消することが容易ではない。第一分散相液保持部及び第二分散相液保持部にそれぞれ供給された第一分散相液及び第二分散相液を分散相液合流部で合流させることによって、このような問題を回避することが可能となる。
【0107】
また、上述の分散相液合流部を有するマイクロ流路チップにおいて、接触の前に、連続相液を気体で充填された状態の連続相液流路、エマルジョン形成部、及び分散相液流路を通して分散相液保持部にまで移動させる場合、第一分散相液保持部及び第二分散相液保持部の両方に連続相液を移動させることが好ましい。
【0108】
(連続相液保持部)
連続相液保持部は、エマルジョンを生成するための材料となる連続相液を保持する部分である。
【0109】
連続相液保持部の構造は、連続相液を保持することができれば特に限定されない。連続相液保持部は、穴部又はウェルであってよく、例えば垂直方向に延在する穴部又はウェルであってよく、この穴部又はウェル内に連続相液を供給し、かつ保持することができるようになっている。連続相液保持部は、例えば、直径0.1mm~20mmの穴部又はウェルであってよい。
【0110】
なお、連続相液は、一般に表面張力及び粘性が小さい液体を使用するため、連続相液保持部における界面形状の変化に伴う表面張力の変化量は小さい。したがって、連続相液保持部の形状は、送液に大きな影響を与えない。加えて、本発明において例えばエマルジョンを保持し検出反応などを行う場合、連続相液保持部の連続相液が枯渇しないように十分な量の連続相液を供給するため、送液中に保持部の連続相液の残量が少なくなり界面形状が変化しやすい状況になることもない。したがって、やはり、連続相液保持部の形状は、送液に大きな影響は与えにくい。
【0111】
外部送液駆動力として陽圧を用いる場合、連続相液保持部が、圧力源と接続することに適していることが好ましい。この場合、連続相液保持部が、印加される圧力に対する耐性を有することが好ましい。
【0112】
(連続相液の供給)
本開示に係る方法は、連続相液保持部に連続相液を供給することを含む。
【0113】
連続相液の供給は、分散相液の供給に関して上述したのと同様に、別容器を用いて、かつ/又は分注手段によって、行うことができる。例えば、分注手段を用いて保持部に相液を滴下し、又は、保持部の壁面に沿って相液を導入することができる。別容器、及び分注手段の詳細については、分散相液の供給に関する上記の記載を参照することができる。
【0114】
(連続相液流路)
連続相液流路は、連続相液保持部とエマルジョン形成部とを接続している。連続相液流路は、連続相液がその中を通るように構成されている。
【0115】
連続相液流路の寸法は、使用する連続相液の種類及び特性などに応じて適宜設定することができる。連続相液流路は、例えば、10~500μm、又は50~200μmの幅を有することができ、1mm~500mm、又は10mm~200mmの長さを有することができる。また、連続相液流路は、1~200μm、又は10~100μmの流路高さを有することができる。連続相液流路は、1つ以上の場所で屈曲してもよく、少なくとも部分的に蛇行形状を有してもよい。
【0116】
マイクロ流路チップは、2つ以上の連続相液流路を有することができる。特には、本開示に係るマイクロ流路チップが、第一連続相液流路及び第二連続相液流路を有しており、これらの流路が、それぞれ、連続相液保持部とエマルジョン形成部とを接続している。
【0117】
図1の例示的な実施態様を参照すると、連続相液流路111が2つの流路(第一連続相液流路112及び第二連続相液流路113)から構成されている。これら2つの流路112、113は、エマルジョン形成部120において互いに対向するようになっており、かつ、エマルジョン形成部120に接続している分散相液流路(より正確には、分散相液合流部116)に対して実質的に直交するようになっている。
図1の実施態様では、第一連続相液流路112と第二連続相液流路113とが、実質的に同一の構造及び流路長を有しており、それにより、それぞれの流路を移動する連続相液の速度が、実質的に同一となるようになっている。また、上述のようにエマルジョン生成前における分散相液同士の混合を抑制したい場合、分散相液合流部116の下流部とエマルジョン形成部120とを連結する流路の長さは比較的短い方が好ましく(例えば、3mm以下、より好ましくは0.5mm以下)、流路内で分散相液が別々に層流状態を保っていることが好ましい。
【0118】
(エマルジョン形成部)
エマルジョン形成部は、エマルジョンを生成するように構成されている。エマルジョン形成部は、分散相液流路及び連続相液流路を介して、それぞれ分散相液及び連続相液の供給を受ける。また、エマルジョン形成部は、エマルジョン流路に接続されており、エマルジョン形成部で生成されたエマルジョンが、エマルジョン流路に送られる。
【0119】
エマルジョン形成部は、分散相液流路へと開く1又は複数の開口部、及び、連続相液流路へと開く1又は複数の開口部を有することができる。また、エマルジョン形成部は、エマルジョン流路へと開く1又は複数の開口部を有することができる。
【0120】
図1の例示的な実施態様を参照して、エマルジョン形成部について説明する。
図1のエマルジョン形成部120では、2つの流路112、113から構成される連続相液流路111と、分散相液流路(より正確には、分散相液合流部116)とが、実質的に直交している。外部送液駆動力の適用の間に、連続相液が、2つの互いに実質的に対向する方向からエマルジョン形成部120へと流入し、かつ、分散相液が、連続相液の流入方向に対して実質的に直交する方向でエマルジョン形成部120に流入する。その結果、エマルジョン形成部120において、連続相に分散した液滴(すなわちエマルジョン)が生成される。このようにして生成されたエマルジョンが、エマルジョン流路130を通って、気体で充填されているエマルジョン保持流路140に進入する。
【0121】
エマルジョン形成部は、T-janction、Flow-Focus、co-flow、step-emulsificationなどの一般的な液滴生成法を利用した流路を適宜用いることができる。迅速にエマルジョンを生成するために、複数のエマルジョン形成部を並列して配置してもよい。また、エマルジョン中の液滴を攪拌させるための蛇行流路などを備えていてもよい。
【0122】
(エマルジョン流路)
エマルジョン流路は、エマルジョン形成部とエマルジョン保持流路とを接続する。エマルジョン流路のうちエマルジョン形成部に隣接する部位は、好ましくは、分散相液流路(特には分散相液合流部)に対向するように配置される。
図1は、そのような態様のエマルジョン流路を示している。また、
図1では、エマルジョン流路のうちエマルジョン形成部に隣接する部位が、連続相液流路のエマルジョン形成部への流入部に対して、実質的に直交している。
図1の場合、エマルジョンが生成される際に、分散相液流路からエマルジョン形成部に流入してくる分散相液が液滴となり、そのまま流れの角度を変えずに、エマルジョン流路に進入する。
【0123】
エマルジョン流路は、エマルジョン形成部に隣接する部位の下流側(排出口の方向)で、拡張した幅及び/又は高さを有する流路を有することができ、かつ/又は蛇行していることができる。このような態様によれば、液滴中での攪拌を促進することができるので、好ましい。
【0124】
(エマルジョン保持流路)
エマルジョン保持流路は、エマルジョン流路を介してエマルジョン形成部に接続しており、エマルジョン形成部で生成されたエマルジョンを保持する機能を有している。また、エマルジョン保持流路は、随意に排出口連通流路を介して、排出口に接続されている。
【0125】
エマルジョン保持流路の幅及び長さは、保持する液滴の体積・数等に合わせて適宜設定することができ、例えば、幅と長さとがほぼ同等の幅広い単純な流路にしてもよく、連続した単一の長い流路を蛇行状又は渦巻き状に配列させてもよく、分岐させた直線流路を並行させてもよい。
【0126】
本発明において、エマルジョン保持流路の流路断面は、液滴の中心が流路の中心に沿って流れやすいため、円状、半円状、楕円状、凸型、凹型、長方形、台形が好ましい。
【0127】
エマルジョン充填法では、一般に、エマルジョン保持流路内の気液界面の移動を制御することでエマルジョン生成と保持を同時に行うため、送液中の気液界面の形状が維持される(移動しながらもその形状に変化が小さい)ように、流路断面形状が一定で屈曲の無い直線流路であることが望ましい。しかし、検出液滴数を増加させるために流路高さに対して流路幅を極端に大きくすると、意図した流路構造を有するチップを安定して製造するのが難しく、かつ/又は、流路の底面及び/若しくは上面が変形して流路側面から遠い流路領域の高さが送液圧やチップへの固定圧などによって変化して測定に悪影響を及ぼす可能性がある(ルーフコラップス)。対策として、例えば、流路高さに対する流路幅の比は、100以下、より好ましくは50以下、25以下、特に好ましくは10以下であるのが好ましい(下記のピラーが無い場合)。あるいは、流路中央に柱(ピラー)を設けることで、流路高さに対する、柱同士の間隔及び/又は柱と流路側面の間隔の比が、例えば、100以下、より好ましくは50以下、25以下、特に好ましくは10以下であるのが好ましい。一方で、イメージセンサなどによる一括検出処理を行う場合、エマルジョン保持流路が水平面で(例えば正方形や円形に近い形で)密にパッケージされていると、検出液滴数を増加させられるため好ましい。よって、同じ流路断面形状の連続した単一の長い流路を蛇行状又は渦巻き状に配列させてもよく、分岐させた直線流路を並行させてもよい。この場合、屈曲部が存在するため送液中に界面形状が変化しやすいが、屈曲部における断面形状を調整することでその影響を低減することが可能である。
【0128】
1つの実施態様では、保持されているエマルジョンに対して検出処理を行うことが意図されている。すなわち、エマルジョン保持流路に保持されたエマルジョンに対して、随意に、後述する検出処理を行うことができる。
【0129】
好ましくは、エマルジョン保持流路は、保持されているエマルジョンの大部分又は全部がマイクロ流路チップの外部雰囲気(特には外部大気)に触れないように、構成されている。好ましくは、エマルジョン保持流路に保持されている液滴のうち、検出処理の対象となっている液滴が、外部雰囲気(特には外部大気)に触れないようになっている。このために、例えば、エマルジョン保持流路の流路長を比較的長く設定し、エマルジョン保持流路の下流側末端部にのみでエマルジョンが外部雰囲気(特には外部大気)と接触しうるようにすることができる。
【0130】
好ましくは、エマルジョン保持流路に保持されるエマルジョンが、外部雰囲気(特には外部大気)に対して密封されるようになっている。
【0131】
好ましくは、エマルジョン保持流路は、エマルジョン保持流路に保持されているエマルジョンに対して検出処理を行うことに適している。
【0132】
好ましくは、エマルジョン保持流路は、外部大気に開放されていないエマルジョンに対して検出処理を行うことができるように構成されている。より具体的には、例えば、保持されているエマルジョンと検出手段との間に、エマルジョンを外部大気から隔離する構造が存在する。この構造は、例えば、光を透過する材料でできている。なお、この場合、エマルジョン保持流路に保持されているエマルジョンのうち、検出処理の対象とならないエマルジョン、例えばエマルジョン保持流路の排出側末端部に位置するエマルジョンが、外部大気に開放されていてもよい。
【0133】
好ましくは、エマルジョン保持流路の流路体積が、エマルジョン形成部で生成される液滴(特には、検出処理において検出の対象となる液滴)の合計体積以上であり、かつ/又は、エマルジョン保持流路の流路体積が、1μL以上、5μL以上、若しくは10μL以上である。このようなエマルジョン保持流路によれば、検出処理を効率的に行うことができる。なお、エマルジョン保持流路の流路体積の上限は、例えば、1000μL以下であってよい。
【0134】
好ましくは、エマルジョン保持流路が、平均体積0.1nL~10nL、特には0.3nL~3nLの液滴の液滴を、500個以上、1000個以上、2500個以上、5000個以上、若しくは10000個以上、かつ/又は100000個以下、80000個以下、60000個以下、若しくは40000個以下、保持することができる流路体積を有する。エマルジョン保持流路に保持されたこれらの液滴に対して、検出処理を行うことができる。
【0135】
なお、液滴の平均体積は、デジタルカメラなどの画像取得装置を用いて明視野画像を取得し、取得された画像においてN=10以上の液滴に関して下記に基づいて算出することができる。
【0136】
球状の液滴の体積、及びディスク状の液滴の体積(それぞれVdrop及びVdisk[nL])は、それぞれ、下記の式(1)と式(2)で表わされる。なお、下記式(1)及び式(2)におけるDdrop、Ddiskは、それぞれ、マイクロ流路チップの通常の使用状態において、エマルジョン保持流路に保持されている液滴を上方から観察した場合の、球状の液滴の直径、及びディスク状の液滴の直径である。また、式(2)中、hは、エマルジョン保持流路の流路高さである。
【0137】
【0138】
【0139】
好ましくは、検出処理で使用される(カメラなどの)検出手段に対して、検出対象となるエマルジョン中の液滴が互いに重ならないようになっており、特には、検出方向に直交する平面で単層を形成している。この場合には、検出精度をさらに向上させることができる。
【0140】
特に好ましくは、エマルジョン保持流路の「流路高さ」が調節されており、それにより、マイクロ流路チップの使用状態において、エマルジョン保持流路に保持される液滴が垂直方向で互いに重ならない(すなわち、単一の液滴層が形成される)ようになっている。このようなエマルジョン保持流路で検出処理を行う場合には、検出精度がさらに向上する。なお、「流路高さ」は、通常、マイクロ流路チップの使用状態において、垂直方向(鉛直方向)での流路の長さである。
【0141】
好ましくは、エマルジョン保持流路の流路高さが、検出処理において検出の対象となる液滴の直径に応じた寸法を有することが好ましく、例えば、液滴の直径の1/10倍~10倍、1/4倍~4倍、又は1/2倍~2倍の流路高さを有することが好ましい。また、エマルジョン保持流路の流路高さは、流路幅の1/4倍以下であってよい。なお、流路の幅は、通常、マイクロ流路チップの使用状態において流路の長さ方向に直交する水平方向での長さである。液滴の直径は、流路の幅方向で計測することができる。
【0142】
また、エマルジョン充填法では、エマルジョン形成部における連続相液と分散相液との流量比に依存してエマルジョン保持流路にエマルジョンが充填されるため、例えば、エマルジョン生成を安定させるため、分散相液に対する連続相液の流量比を大きくした場合、液滴を水平方向に密にパッケージするため流路高さを通常よりも大きく設計した方が好ましい。例えば、分散相液に対する連続相液の流量比が8~12である場合、エマルジョン保持流路の高さを、液滴の直径の2~4倍にすることができる。
【0143】
(送液の停止)
エマルジョン保持流路内にエマルジョンを保持するためには、例えば、エマルジョン保持流路内に所望の量のエマルジョンが充填された時点で、送液を停止し、かつ随意に排出口を閉じる。送液のために陰圧を用いる場合には、排出口を外部大気に(少なくとも部分的に)開放することによって、陰圧の適用を停止することもできる。送液の停止は、エマルジョン保持流路を充填していた気体がエマルジョンで完全に置換されてから行うこともできるが、好ましくは、エマルジョン保持流路を充填していた気体がエマルジョンで完全に置換されない間に送液の停止を行う。換言すると、流路内又は排出口内に気体―エマルジョン界面が存在する状態で、送液を停止させる。
【0144】
送液を停止する際に、排出口を外部大気に段階的に開放することによって、気液界面(気体―エマルジョン界面)の逆流を抑制することができる場合がある。例えば、2つの弁(特には電磁弁)の中間に比較的低圧力のタンクを別個に設け、外部大気への開放の前にこのタンクに対して排出口を開放することによって、段階的な開放を行うことができる。また、電磁弁の開放速度を調節し、開放の程度が段階的に大きくなるようにすることによって、送液停止を行うこともできる。
【0145】
また、送液の停止に関して、連続相液の流量比を大きくしたり、エマルジョン保持流路の流路体積を小さくしたりすることで、気体―エマルジョン界面と全液滴との最小距離が大きくなるように調整すると、エマルジョン中の液滴が排出口に流出しにくく、かつ気体―エマルジョン界面による近傍の液滴への悪影響(液滴同士の凝集・合一、液滴内反応やシグナル検出の阻害)を抑制できるため好ましい。
【0146】
また、送液の停止及びその後のエマルジョンの保持に関して、流動性の高い連続相液を使用する場合、外部送液駆動力が印加されていなくても毛細管力及び/又は液面差圧によって気体―エマルジョン界面が下流に流動することがある。加えて、揮発性の高い連続相液を使用する場合、かつ/又は液滴内反応等のためにエマルジョンを加熱している場合には、連続相液が蒸発し流路内の連続相液が減少し、かつ/又は蒸発した分の連続相液を補充するように連続相液保持部に残存する連続相液が流路内に流入することによって、エマルジョン保持流路の液滴が送液停止後も流動することもある。このような送液停止後の液滴の流動は、エマルジョン保持流路内の液滴が排出口方向又はエマルジョン流路方向に流出する要因となるため、対策を行うのが望ましい。このために、各保持部及び排出口を密閉し圧力制御を行い、かつ/又は、流路基板としてガス透過性の低い材料を使用することによって、毛細管力及び/又は液面差圧、並びに連続相液の蒸発に起因する液滴の流動を抑制することができる。なお、分注手段を有する場合には、このような密閉操作は分注操作後又は送液停止後に行う必要があるため、装置の自動化の観点からは好ましくない。
【0147】
(排出口)
マイクロ流路チップは、排出口を有する。この排出口は、エマルジョン保持流路に接続している。また、後述するように、排出口は、マイクロ流路チップに陰圧を適用するための陰圧源接続部としても機能しうる。
【0148】
送液のために陰圧を用いる場合、排出口が、圧力源と接続することに適しているように構成されていることが好ましい。この場合、排出口が、印加される圧力に対する耐性を有することが好ましい。
【0149】
送液のために陰圧を用いる場合、通常、排出口は、エマルジョン保持流路の下流側に位置する。この排出口に陰圧を適用することによって、エマルジョン保持流路の全長又は大部分を、生成されたエマルジョンで充填することができる。
【0150】
(送液)
外部送液駆動力は、エマルジョン形成部において分散相液及び連続相液からエマルジョンを生成するための駆動力を提供する。また、外部送液駆動力は、生成されたエマルジョンをエマルジョン保持流路に輸送するための駆動力を提供する。外部送液駆動力は、排出口への陰圧の適用、又は分散相液保持部及び連続相液保持部への陽圧の適用であってよい。なお、排出口への陰圧を適用している間は、各保持部を常圧に、分散相液保持部及び連続相液保持部への陽圧を適用している間は、排出口を常圧にしている方が、装置の簡便性の観点からは好ましいが、陰圧及び/若しくは陽圧の送液を安定化させるため、かつ/又はエマルジョンの保持のための密閉操作を兼ねるために、非常圧状態に圧力制御してもよい。
【0151】
排出口に陰圧を適用する場合、分散相液保持部及び連続相液保持部は、外部雰囲気(特には外部大気)に開放されていることができる。同様に、分散相液保持部及び連続相液保持部に陽圧を適用する場合、排出口は、外部雰囲気に開放されていることができる。
【0152】
陰圧を適用する場合、例えば、圧力タンク又はシリンジポンプを用いて、排出口を介して、マイクロ流路チップの流路内の流体(例えば気体又は連続相液)を吸引することができる。
【0153】
陰圧源として圧力タンクを用いる場合、圧力タンクの体積は、排出口から圧力タンクまでの流路の体積及びマイクロ流路チップの流路の体積の合計よりも大きいことが好ましい。圧力タンクは、外部雰囲気(特には外部大気)に開放しうるような設計とすることもできる。また、圧力タンクは例えば、ポンプで圧力タンク内の圧力を制御すると好ましい。また、圧力タンク内の圧力値をモニタリングできるように圧力センサを設けても良い。
【0154】
陽圧を適用する場合、例えば、圧力印加手段を用いて、分散相液保持部及び連続相液保持部を介して、マイクロ流路チップの流路内の流体(気体、分散相液、及び/又は連続相液)に対して圧力を印加することができる。
【0155】
なお、適用された陰圧又は陽圧の圧力値をモニタリングするための監視手段を用いて、送液状態の確認、例えばエマルジョンが問題なく生成しているかどうかを確認することができる。
【0156】
本発明では、エマルジョン形成部における液滴生成とエマルジョン保持流路へのエマルジョンの充填を同時に行うため、エマルジョン保持流路における気体(特には空気)とエマルジョン(又は連続相)との界面(エマルジョン界面)の移動を制御することが特に好ましい。特に、エマルジョンで充填された流路の体積又は長さの分だけ、送液中の圧損抵抗が増大する。この場合、適用される外部送液駆動力を一定にすると(一定の圧力差)、送液開始時及び送液停止時に、エマルジョン界面の移動速度又は流速が減少しやすい。したがって、送液中に連続的又は段階的に圧力差が大きくなるように、送液手段が設計されていることが好ましい。これは、例えば、シリンジポンプの移動速度で制御することができ、又は、シリンジ若しくはタンク内圧力をセンサでモニタリングして圧力制御することもできる。
【0157】
(陰圧による送液)
本開示に係る1つの実施態様では、外部送液駆動力として陰圧を用いる。すなわち、本開示に係る1つの実施態様では、排出口に陰圧を適用することによって、エマルジョン形成部においてエマルジョンを生成し、このようにして生成されたエマルジョンを、エマルジョン流路を介して、気体で充填された状態のエマルジョン保持流路に輸送する。
【0158】
陰圧送液は、陽圧送液と比較して、必要な装置を簡略化することができるので好ましい。
【0159】
また、陽圧送液、特に、各保持部へ気体を介して陽圧を印加する場合、各保持部に分散相液及び連続相液を添加してから送液手段と各保持部とを密封接続する必要があるが、接続時に不要な外部圧力がかかりやすい。特に、シリコンゴム等の柔軟性が高い基板を使用する場合、接続時にマイクロ流路チップが変形し、流路断面が変形するおそれがある。また、連続相液として粘性及び表面張力が低い液体を使用することで、エマルジョン形成部におけるせん断力を利用した安定かつ迅速な液滴生成が可能となるが、上記の物性を持つ液体は密閉状態が不完全な場合に液漏れしやすく、適切な圧力印加が困難になりやすい。また、密閉接続後に連続相液及び/又は分散相液を導入することで、上述の接続時の不要な外部圧力による送液や液漏れの問題を抑制することが可能だが、これは前述の液導入と圧力送液を同時に行う手段の一例であり、分散相液と連続相液とを接触させる操作の再現性が低下しやすい。
【0160】
これに対して、陰圧送液の場合、分散相液及び連続相液を添加する前に送液手段を接続できるため、接続時の圧力が分散相液及び連続相液に加わることがないという利点を有する。また、粘性及び表面張力が低い連続相液を保持する連続相液保持部を密閉する必要を回避できるという利点も有する。
【0161】
さらに、流路圧損抵抗の小さいマイクロ流路チップを用いる場合、各保持部に陽圧を印加する方法では、送液手段と接続する際の不要な圧力によって意図せず分散相液又は連続相液が流路内に侵入してしまうおそれがある。
【0162】
これに対して、排出口に陰圧を印加する方法は、分散相液及び連続相液を添加する前に排出口と送液手段とを接続できるため、不要な圧力がかからないという利点を有する。
【0163】
このように、陰圧送液は多くの利点を有する。しかしながら、その一方で、陰圧で送液を行う場合には、マイクロ流路チップの流路に発生した気泡を解消することが容易ではない。
【0164】
これに対して、本発明によれば、気泡の発生を抑制することができるので、陰圧送液を用いた場合であっても、陰圧の利点を生かして、良好なエマルジョンの生成及び保持を行うことができる。
【0165】
本開示に係る方法の1つの実施態様では、排出口に陰圧制御手段が流体接続されており、陰圧制御手段が、陰圧源、接続部及び弁から構成されており、陰圧源が、一定の陰圧に制御されており、かつ、この弁が、陰圧源と接続部との間に配置されている。接続部を介して、陰圧制御手段を、排出口に接続することができる。この態様によれば、弁を開放することによって瞬時に陰圧を適用することができるので、相液の接触後の陰圧の適用のタイミングをより正確に制御することが可能となる。
【0166】
弁の具体的態様については特に制限はない。送液停止時の逆流を防止するという観点からは、弁の開閉時の流路における圧力変動を抑制できるもの、例えば開閉動作が比較的遅いものが好ましい。弁は、例えば三方弁であってよく、マイクロ流路チップを陰圧源(例えば圧力タンク)及び外部雰囲気(特には外部大気)のいずれかに接続することができるようになっていてもよい。
【0167】
本開示に係る方法の1つの実施態様では、分散相液及び連続相液の接触の前に、排出口に陰圧制御手段が流体接続されている。この場合には、分散相液と連続相液との接触の後に迅速に陰圧を適用することができるため、早期の液滴の発生を抑制し、液滴の均一性をさらに向上させることができる場合がある。
【0168】
(エマルジョン充填法における送液)
エマルジョン充填法では、一般に、エマルジョンが排出口に到達する前に(すなわち、気液界面が排出口に到達する前に)送液を停止した方が検出液滴のロスを低減し、検出液滴数を増加させられるため好ましい。また、排出口にエマルジョン中の連続相液のみが充填されるように、送液中の分散相液に対する連続相液の流量比を大きくしても良いが、排出口を連続相液で十分に満たすのは困難である。
【0169】
このような理由から、エマルジョン充填法では、送液を停止する際に気液界面が流路内又は排出口の流路開口部近傍に存在する場合が多く、送液停止の際の急激な圧力変動(陰圧送液の際は排出口への空気の流入)によって気液界面が流路内を逆流し、エマルジョン保持に悪影響が生じやすい(エマルジョン保持流路外へ液滴が流出する、又は気液界面近傍で液滴同士が凝集・合一する)。
【0170】
加えて、陰圧送液の場合には、送液停止によって排出口に空気が流入してくるため、気液界面により圧力がかかりやすく、基板の材料にシリコンゴム(PDMS)のような柔軟性の高い材料を使用したり、基板の厚みを極端に薄くしたり(COCだと1mm以下ぐらい)すると、陰圧送液時に流路が変形しやすく、送液停止時にその変形を復元する力によってより逆流が起きやすくなる。(すなわち、流路側面の壁面から遠い流路の中央部において流路の上面、底面が流路断面積を小さくする方向にたわむ(ルーフコラップス)。エマルジョン保持流路は前述のとおり流路高さに対して流路幅を大きくするのが好ましいため、特に影響が大きいと考えられる)。
【0171】
このような送液停止時の逆流を抑制するため、送液圧力を小さくするのが好ましい。例えば、外部送液駆動力によってマイクロ流路チップに適用される圧力を、30kPa以下、10kPa以下、特に好ましくは5kPa以下とすることができる。なお、外部送液駆動力によってマイクロ流路チップに適用される圧力は、特には、排出口に適用される陰圧の圧力、又は分散相液保持部及び連続相液保持部に適用される陽圧の圧力である。
【0172】
一方で、例えば本発明を迅速なデジタル測定に用いる場合、送液速度と分散相液に対する連続相液の流速の比から計算される液滴生成速度は速い方が好ましい。例えば、エマルジョン形成部における液滴の生成速度が、5個/秒以上、20個/秒以上、50個/秒以上、100個/秒以上、特に好ましくは200個/秒以上であることが好ましい
【0173】
送液圧力を小さくし、かつ液滴生成速度を大きくしたい場合には、流路圧損抵抗値(=送液圧力/送液速度)が小さくなるように調整するのが望ましい。流路圧損抵抗値は、流路構造、流路壁面の表面物性、各相液の物性、送液手段の圧力制御方法等に依存するため、送液中の送液速度及び/又は液滴生成速度と送液圧力が適切な値になるように、上述のパラメータを適宜調整すればよい。
【0174】
(マイクロ流路チップの設置)
マイクロ流路チップは、鉛直方向(天地方向)に水平に設置するのが一般的であるが、エマルジョンの保持等の観点から、一定方向に意図的に傾斜を設けて設置しても良い。例えば、連続相液が分散相液よりも比重が大きい場合(例:フッ素系分散剤を連続相液、水溶液を分散相液として使用)、液滴は比重差によって浮力を有するため、エマルジョン保持流路から液滴が流出しにくいように、意図的に傾斜を設けてマイクロ流路チップを設置しても良い。
【0175】
<検出処理>
本開示に係る方法に従って生成されたエマルジョン中の液滴に対して、検出処理を行うことができる。検出処理は、例えば、液滴中での標的物質の反応、及び当該反応の検出(例えば反応生成物の検出)を含む。検出処理は、通常、エマルジョン保持流路に保持されたエマルジョン中の液滴に対して行われる。
【0176】
標的物質(特には標的分子)としては、核酸、タンパク質、ペプチド、酵素、細胞、細菌、胞子、ウイルス、オルガネラ、高分子アセンブリ、薬物候補、脂質、炭水化物、代謝物、又はこれらの任意の組合せが挙げられる。
【0177】
標的物質の反応は、特に限定されない。標的物質の反応としては、酵素反応が挙げられ、より具体的には、キナーゼ、ヌクレアーゼ、ヌクレオチドシクラーゼ、ヌクレオチドリガーゼ、ヌクレオチドホスホジエステラーゼ、(DNA又はRNA)ポリメラーゼ、プレニルトランスフェラーゼ、ピロホスパターゼ、レポーター酵素、逆転写酵素、トポイソメラーゼ等を用いた酵素反応が例示できる。標的分子がDNAやRNAなどの核酸であり、標的分子の反応が当該核酸の増幅反応である場合、LAMP法、NASBA法、TMA法、TRC法といった核酸を等温増幅可能な反応が挙げられる。また、ワンステップRT-PCRの場合、逆転写反応に適した温度で液滴を作製することは、逆転写反応の反応効率、反応時間において好ましい。また、逆転写反応による生成物であるcDNAをサイクリングプローブ法により検出することも可能である。
【0178】
反応を行う場合、2種以上の反応液をエマルジョン形成部の上流(例えば分散相液合流部)で混合し、この混合物を用いて液滴を生成することが好ましい。なお、本発明において、反応液とは、標的物質及び標的物質を反応させるのに必要な成分のうち、少なくとも一部を含んだ溶液のことをいう。全ての反応液が混合することで標的物質の反応に必要な成分全てが揃えばよく、標的物質はいずれかの反応液に含まれていればよい。反応液は3種以上であっても問題はない。
【0179】
例えば、標的物質が特定配列を含む核酸(DNA、RNA)であり、標的物質の反応がこの特定配列を増幅させる反応である場合、反応液に含まれる成分としては、特定配列の一部と相同的な配列を含むプライマー、特定配列の一部と相補的な配列を含むプライマー、特定配列の一部と相同的又は相補的な配列を含む検出用プローブ、ポリメラーゼ、ヌクレオチド、塩類、及び緩衝液成分があげられる。なお、反応液内で、標的分子、反応基質、酵素などが分解、変質、非特異反応が生じないように組成が工夫されていることが好ましく、装置内での挙動を考慮して、グリセロール、界面活性剤などをさらに添加してもよい。
【0180】
<その他の手段>
(検出手段)
反応の検出のために、例えば、反応による生成物を検出可能な検出手段を用いることができる。
【0181】
検出方法は、反応生成物に応じて適宜適切な方法を選択することができ、例えば、光学的、X線、MALDI(マトリックス支援レーザー脱離イオン化法)、FCS(蛍光相関分光法)、FP(蛍光偏光)/FCS、蛍光法、比色分析、化学ルミネセンス、生物発光、散乱、表面プラズモン共鳴、電気化学法、電気泳動、レーザー、質量分光測定、ラマン分光法、FLIPR(MolecularDevices社)など公知の方法を用いて検出することができる。なお、透過光を用いて検出する場合は、光を透過する材料でマイクロ流路チップを作製すると、マイクロ流路チップを光学検出器に載置するのみで、チップ内の液滴を移動させることなく反応生成物を検出できる点で好ましい。
【0182】
反応生成物の検出に用いる検出手段(検出器)として、標的物質の反応を記録・測定するためのイメージングセンサ及び随意にその構成部品を用いることができる。検出の一例として、検出対象となる個々のシグナルを空間的に分解するのに適切な照明及び解像度を有するカメラ又はイメージング装置があげられる。カメラ又はイメージング装置としては、公知のものを利用することができ、例えばカメラは、電荷結合素子(CCD)、電荷注入装置(CID)、フォトダイオードアレイ(PDA)又は相補型金属酸化物半導体(CMOS)を含む任意の一般的な半導体イメージセンサを使用することができる。また、検出の際、励起/放射された光の偏光を使用することによって改善することができる。例えば、蛍光シグナルを発する液滴を検出する場合、その検出領域を大きな視野を持つ光学ユニットによって一括で撮影することで、迅速かつハイスループットなシグナル検出を行なうことが可能になる。
【0183】
(温調手段)
温調手段は、マイクロ流路チップ内の液体を標的物質の反応に適した温度に保つ役割を有する。温調手段はマイクロ流路チップと近接(好ましくは密着)可能な形状であればよく、必ずしも平板状である必要はない。
【0184】
温調手段のうち、少なくともマイクロ流路チップと近接(好ましくは密着)する部分は、熱伝導性の高い金属材料で作製することが好ましい。なお、基材と上部構造体とを貼り合わせてマイクロ流路チップが作製されている場合、温調手段に接する基材及び/又は上部構造体の厚さを薄くすると、マイクロ流路チップに設けた流路への熱伝導をより効率的に行なえるので、好ましい。温調手段は、少なくとも、標的物質の反応場であるエマルジョン保持流路を温調できればよいが、相液保持部及び流路も温調できると、標的分子の非特異的反応を抑制できる点で好ましい。具体例として、標的物質の反応が核酸増幅反応の場合、各保持部や流路における温度を、エマルジョン保持流路における標的物質の反応温度よりも高くなるよう、温調手段で温調することで、プライマー/プローブ同士の非特異的なアニールを低減することができる。また、マイクロ流路チップの底面を温調手段によって反応温度に加熱し、かつ光を透過する材料でマイクロ流路チップ上面基板を作製し上面から透過光検出を行う場合、各相液供給前の空のマイクロ流路チップの位置並びに/又は流路構造及び/若しくはチップ内外のゴミの評価、各相液を供給する際の流路内の挙動並びに/又は送液中のエマルジョン生成の挙動の評価、並びに、反応中のエマルジョンのシグナル検出結果を利用したデジタル検出の定量上限の向上を、装置上簡便に行えるため、好ましい。
【0185】
以下で、実施例を用いて、本発明をさらに詳細に説明する。本発明は、これらの記載に限定されない。
【実施例0186】
≪マイクロ流路チップの作製≫
【0187】
フォトリソグラフィー及びソフトリソグラフィー技術を用いて、マイクロ流路チップを作製した。具体的な手順を以下に示す。
【0188】
(1)4インチベアシリコンウェハ(フィルテック社)上へ、フォトレジストSU-8 3050(Microchem社)を滴下後、スピンコーター(MIKASA社)を用いてフォトレジスト薄膜を形成した。
【0189】
(2)マスクアライナー(ウシオ電機社)と、マイクロ流路チップの流路パターンを形成したクロムマスクとを用いて、流路パターンをフォトレジスト膜へ形成させた後、SU-8 Developer(Microchem社)を用いて流路パターンを現像することで、マイクロ流路チップを構成する流路の鋳型を作製した。
【0190】
(3)SU-8への吸着を抑えるために、Trichloro(1H,1H,2H,2H-perfluoro-octyl)silane(Thermo Fisher Scientific社)による蒸着表面処理を行なった。
【0191】
(4)上記(3)の処理を行なった鋳型へ、SYLGARD SILICONE ELASTOMER KIT(東レ・ダウコーニング社)を用いて調製した未硬化のシロキサンモノマーと重合開始剤との混合物(重量比10:1)を流し込み、80℃で2時間加熱することで、流路の形状が転写されたポリマー(PDMS)基板を作製した。
【0192】
(5)得られたポリマー基板を鋳型から慎重に剥がし、カッターで成形後、パンチャーを用いて、分散相液保持部及び連続相液保持部、並びに排出口を形成した。
【0193】
(6)保持部及び排出口を形成したポリマー基板並びにカバーガラス(松浪硝子社)を酸素プラズマ発生装置(メイワフォーシス社)で表面処理後、PDMS基板のパターン面とカバーガラスとを貼り合わせた。作製したチップは、デシケーター内に保存した。
【0194】
作製したマイクロ流路チップは、縦34cm×横75cmの大きさであり、分散相液保持部としてはφ4mmの穴を、連続相液保持部としてはφ8mmの穴を、排出口としてはφ1.5mmの穴を、それぞれ有していた。
【0195】
(流路構造)
マイクロ流路チップは、2つの分散相液保持部、(第一分散相液流路、第二分散相液流路、及び分散相液合流部を有する)分散相液流路、連続相液保持部、2つの連続相液流路、エマルジョン形成部、エマルジョン流路、エマルジョン保持流路、及び排出口を有していた。2つの分散相液保持部が、第一又は第二分散相液流路を介して、エマルジョン形成部に接続しており、連続相液保持部が、2つの連続相液流路を介して、エマルジョン形成部に接続しており、エマルジョン形成部が、エマルジョン流路を介して、エマルジョン保持流路に接続しており、エマルジョン保持流路が、排出口に接続していた。このマイクロ流路チップは、気泡トラップ構造を有していなかった。
【0196】
実施例で使用したマイクロ流路チップは、下記のいずれか(No.1又はNo.2)の詳細な構造を有していた。
【0197】
(No.1)
第一分散相液流路及び第二分散相液流路は高さ80μm、幅100μm、長さ30mmの蛇行を含む流路であり、分散相液合流部で合流し、100μmの流路幅に狭窄され、エマルジョン形成部に合流する。2つの連続相液流路はそれぞれ屈曲部を二箇所有した高さ80μm、幅100μm、長さ30mmの2つの直線流路である。エマルジョン形成部において、分散相液合流部と2つの連続相液流路とが角度90度で十字に交差しており、反応液と非混和性液体(オイル)とが合流し、液滴を形成するようになっている。エマルジョン流路は、エマルジョン形成部に近接する部分で幅80μm×長さ100μm、その下流部分で幅200μm×長さ680μmの直線流路であり、さらにその下流部分ではR275μmの円弧曲線で構成された蛇行を含めた幅200μm×長さ11.5mmの撹拌用流路であり、エマルジョン保持流路に連結する。エマルジョン保持流路は、流路高さ130μm、幅2mm、長さ350mmの蛇行流路であり、幅2mm、長さ10mmの排出口連通流路を介して、排出口に直接つながっている。エマルジョン保持流路の体積は、91μLであった。
【0198】
(No.2)
第一分散相液流路及び第二分散相液流路は高さ100μm、幅200μm、長さ4200μmの蛇行を含む流路であり、分散相液合流部で合流し、100μmの流路幅に狭窄され、エマルジョン形成部に合流する。2つの連続相液流路はそれぞれ屈曲部を二箇所有した高さ100μm、幅280μm、長さ26mmの直線流路である。エマルジョン形成部において、分散相液合流部と2つの連続相液流路とが角度90度で十字に交差している。エマルジョン形成部において、反応液と非混和性液体(オイル)とが合流し、液滴を形成するようになっている。エマルジョン流路は、エマルジョン形成部に近接する部分で幅80μm×長さ100μm、その下流部分で幅200μm×長さ680μmの直線流路であり、さらにその下流部分ではR275μmの円弧曲線で構成された蛇行を含めた幅200μm×長さ11.5mmの撹拌用流路であり、エマルジョン保持流路に連結する。エマルジョン保持流路は、流路高さ130μm、幅2mm、長さ350mmの蛇行流路であり、幅2mm、長さ10mmの排出口連通流路を介して、排出口に直接つながっている。エマルジョン保持流路の体積は、91μLであった。
【0199】
≪実施例1≫
(エマルジョンの生成及び保持)
上記のマイクロ流路チップ(No.1)を用いて、本発明に従って、エマルジョンの生成及び保持を行った。詳細を下記の(1)~(6)に示す。
【0200】
(分散相液)
(1)分散相液保持部に導入する分散相液として、下記の2種類の組成の水溶液(「開始液」及び「反応液」)を調製した。なお、下記組成の水溶液は、核酸増幅反応の1つであるTRC反応を使用する際の反応開始液の組成を模している。
【0201】
(開始液)
36.8mM 塩化マグネシウム
180.0mM 塩化カリウム
0.2%(w/v) Tween 20
18.0%(v/v) DMSO
5.0%(v/v) グリセロール
【0202】
(反応液)
0.2%(w/v) Tween 20
300nM トレハロース
5.0%(v/v) グリセロール
【0203】
(2)TRC反応温度である46℃で加熱したガラスヒーター(ブラスト社)を倒立型顕微鏡IX71(オリンパス社)に設置して、その上にマイクロ流路チップを設置してテープで固定した。
【0204】
(3)送液手段として、ペリスタポンプ(高砂工業)、電磁弁(高砂工業)、圧力センサ(キーエンス社)で構成された、200mL容量のタンク内の圧力を-1~-10kPaに制御できる装置を使用した。このタンクとマイクロ流路チップの排出口とをPTFEチューブ(ニチアス社)で接続し、タンク内の圧力を開放することによって、チップに圧力差(陰圧)を適用した。
【0205】
(4)連続相液保持部に、ピペットマン(ギルソン社)を使用して、連続相液としてのDroplet Generatorオイル for EvaGreen(Biorad社、以下、単にオイルとも表記する)を200μL滴下した。オイル滴下から30秒後に、2つの分散相液保持部に、反応液及び開始液を、2.0~20.0μLのピペットマンを使用して、それぞれ20μLずつ滴下し、分散相液保持部において、連続相液と分散相液とを接触させた。なお、上記のピペットマンは、最大許容誤差が±0.06μLに校正されたものを使用した。
【0206】
(5)反応液の滴下から20秒後に、あらかじめ排出口に接続された上記タンク内の圧力を-5kPaに調整した状態で、陰圧を適用して、液滴生成及び保持を開始した。なお、送液中の各相液保持部は、大気圧開放された状態とした。
【0207】
(6)オイルと空気との界面(エマルジョンと空気との界面)がエマルジョン保持流路の下流末端部に到達した後(陰圧の適用から約150秒後)で、排出口に印加されていた陰圧を常圧開放し、送液を停止した。
【0208】
(エマルジョンの生成)
デジタルCMOSカメラ(ORCA-FLASH(商品名)、浜松フォトニクス社)を用いて、送液開始時のエマルジョンの生成のようすを明視野画像として取得した(
図3)。
【0209】
図3で見られるとおり、連続相液で充填された分散相液保持部に分散相液(反応液及び開始液)を供給し、気泡トラップ介さずに連続相液(オイル)と分散相液(反応液及び開始液)とを接触させた実施例1では、良好にエマルジョンの生成を行うことができた。
【0210】
(エマルジョンの保持)
また、実施例1では、エマルジョン保持流路内において液滴の合一などを生ずることなく、エマルジョンを良好に保持することができた。
【0211】
≪実施例2≫
上記のマイクロ流路チップ(No.2)を用いて分散相液及び連続相液の供給並びに送液を下記のとおりにして行ったこと以外は、実施例1と同様にして、エマルジョンの生成及び保持を行った。
【0212】
(分散相液及び連続相液の供給)
実施例2では、2つの分散相液保持部に反応液及び開始液を、ピペットマンを使用して、それぞれ20μLずつ滴下した。その40秒後、連続相液保持部に、オイルを200μL滴下した。この態様では、分散相液が、気体で充填された状態の分散相液流路を通ってエマルジョン形成部にまで移動し、連続相液が、気体で充填された状態の連続相液流路を通ってエマルジョン形成部にまで移動し、エマルジョン形成部において、分散相液(反応液と開始液との混合液)と連続相液(オイル)が接触した。
【0213】
(送液)
実施例2では、オイル滴下から30秒秒後に、あらかじめ排出口に接続された送液装置のタンク内圧力を-5kPaに調整した状態で、圧力差(陰圧)を適用して液滴生成及び液滴保持を開始した。なお、送液中の各保持部は大気圧開放された状態とした。
【0214】
(エマルジョンの生成)
デジタルCMOSカメラ(ORCA-FLASH(商品名)、浜松フォトニクス社)を用いて、送液開始時のエマルジョンの生成のようすを明視野画像として取得した。結果を
図4に示す。
【0215】
図4で見られるとおり、気泡トラップ介さずに連続相液(オイル)と分散相液(反応液及び開始液)とをエマルジョン形成部で接触させた実施例2では、良好にエマルジョンの生成を行うことができた。
【0216】
≪実施例3≫
(エマルジョンの保持及び検出処理)
実施例3では、実施例2と同様にしてエマルジョンの生成及び保持を行い、そして、エマルジョン保持流路に保持された液滴に対して、検出処理を行った。具体的には、C型肝炎ウイルス(HCV)RNAのデジタル等温核酸増幅を行った。詳細を下記に示す。
【0217】
(分散相液:反応液)
HCV遺伝子が挿入されたプラスミドから、in vitro転写によりHCV標準RNA(配列番号1)を調製した。当該標準RNAを104コピー/2μLとなるように注射用水で希釈し、これをRNA試料とした。
【0218】
10μL中に以下の組成を含む水溶液を調製し、これを標準RNAを含む反応液とした。なおモレキュラービーコンプローブ(配列番号6)は、標準RNAの相同鎖の5’末端側及び3’末端側に、当該標準RNAと相補的二本鎖を形成しないときにはステムループ構造を形成できるようなオリゴヌクレオチドを、それぞれ6塩基付加しており(5’側の1塩基のみ重複している)、さらに5’末端側にはFAMを、3’末端側にはIDT社製IowaBlackFQをそれぞれ結合させている。
132mM Tris-HCl緩衝液(pH8.36)
5.0%(v/v) グリセロール
各0.66mM dATP、dCTP、dGTP、dTTP
各4.0mM ATP、CTP、GTP、TTP
6.6mM ITP
193.2mM トレハロース
100nM モレキュラービーコンプローブ(標準RNAの相同鎖の一部[配列番号1の107番目から123番目まで]を含む:配列番号6)
2.0μM 第一のプライマー(配列番号2)
2.0μM 第二のプライマー(配列番号3)
8.5U AMV逆転写酵素
94U T7 RNAポリメラーゼ
50nM フルオレセイン
104コピー 標準RNA
【0219】
第一のプライマー(配列番号2)は、標準RNAの相補鎖の部分配列(具体的には配列番号1の125番目から145番目まで:配列番号4)及び当該配列の5’末端側にT7プロモーター配列(配列番号5)を付加したオリゴヌクレオチドである。また第二のプライマー(配列番号3)は、標準RNAの相同鎖の部分配列(具体的には、配列番号1の1番目から16番目まで)からなるオリゴヌクレオチドである。フルオレセインは陰性液滴のS/N比を向上させるため、TRC反応を阻害しない濃度で添加した。
【0220】
(分散相液:開始液)
以下の組成を含む水溶液を調製し、これを開始液とした。
36.8mM 塩化マグネシウム
180.0mM 塩化カリウム
0.2%(w/v) Tween 20
18.0%(v/v) DMSO
5.0%(v/v) グリセロール
100nM モレキュラービーコンプローブ(配列番号6)
50nM フルオレセイン
【0221】
(エマルジョンの生成及び保持)
上記のマイクロ流路チップをサーマルサイクラー(Mast ercycler nexus flat eco、Eppendorf社)の上に固定して、46℃に加熱した。その後、実施例2と同様にして、エマルジョンの生成及び保持を行った。
【0222】
送液停止後、46℃加熱を維持したままで20分間にわたって静置し、TRC反応を完了させた。
【0223】
(検出処理)
TRC反応終了後のマイクロ流路チップに対して検出処理を行った。検出は、蛍光イメージング用の光源としてX-Cite 110LED、画像を取り込むためのCCDカメラとして、Cooling Camera System(Pacific Image Electronics社、台湾)を使用して行った。検出の結果を、
図5及び
図6に示す。
【0224】
図5及び
図6で見られるとおり、エマルジョン保持流路において、良好にエマルジョンを保持することができ、かつ、保持されたエマルジョンに対して、良好に検出反応を行うことができた。このように、本発明によれば、迅速・簡便なデジタル検出を安定して実施することが可能である。