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特許7594365組換えイズロン酸2スルファターゼの精製
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(19)【発行国】日本国特許庁(JP)
(12)【公報種別】特許公報(B2)
(11)【特許番号】
(24)【登録日】2024-11-26
(45)【発行日】2024-12-04
(54)【発明の名称】組換えイズロン酸2スルファターゼの精製
(51)【国際特許分類】
   A61K 38/46 20060101AFI20241127BHJP
   A61P 43/00 20060101ALI20241127BHJP
   C07K 1/18 20060101ALN20241127BHJP
   C07K 1/20 20060101ALN20241127BHJP
   C12N 9/16 20060101ALN20241127BHJP
【FI】
A61K38/46
A61P43/00
A61P43/00 111
C07K1/18
C07K1/20
C12N9/16 Z ZNA
【請求項の数】 15
【外国語出願】
(21)【出願番号】P 2020037811
(22)【出願日】2020-03-05
(62)【分割の表示】P 2018067404の分割
【原出願日】2013-06-28
(65)【公開番号】P2020105209
(43)【公開日】2020-07-09
【審査請求日】2020-03-05
【審判番号】
【審判請求日】2023-02-24
(31)【優先権主張番号】61/666,733
(32)【優先日】2012-06-29
(33)【優先権主張国・地域又は機関】US
(73)【特許権者】
【識別番号】000002934
【氏名又は名称】武田薬品工業株式会社
(74)【代理人】
【識別番号】100078282
【弁理士】
【氏名又は名称】山本 秀策
(74)【代理人】
【識別番号】100181674
【弁理士】
【氏名又は名称】飯田 貴敏
(74)【代理人】
【識別番号】100181641
【弁理士】
【氏名又は名称】石川 大輔
(74)【代理人】
【識別番号】230113332
【弁護士】
【氏名又は名称】山本 健策
(72)【発明者】
【氏名】デーブ ニコルズ
【合議体】
【審判長】冨永 みどり
【審判官】齋藤 恵
【審判官】山村 祥子
(56)【参考文献】
【文献】国際公開第2012/042857(WO,A1)
【文献】Biochem J.,1993 January 1,289(1),p.241-6
(58)【調査した分野】(Int.Cl.,DB名)
A61K38/00-38/58
(57)【特許請求の範囲】
【請求項1】
配列番号1のアミノ酸配列を有する精製された組換えイズロン酸-2-スルファターゼ(I2S)を含む、ムコ多糖症II型(MPSII、ハンター症候群)を予防または治療するための組成物であって、
該精製された組換えI2Sは、配列番号1のCys59に対応するシステイン残基の、Cα-ホルミルグリシン(FGly)への少なくとも約70%のモル比の転換を含み、かつ
さらに、該精製された組換えI2Sは、平均して1分子あたり少なくとも16のシアル酸を含有する、組成物であって、NSO/1、PER.C6、COS-7、HEK293、HT1080、BHK21、CHO、TM4、CV1 ATCC CCL 70、VERO-76、HeLa、MDCK、BRL 3A、W138、Hep G2、MMT 060562、TRI細胞、MRC 5細胞、FS4細胞、およびHep G2から選択される細胞株によって製造される、組成物
【請求項2】
前記精製された組換えI2Sが、平均して1分子あたり少なくとも18のシアル酸を含有する、請求項1に記載の組成物。
【請求項3】
前記精製された組換えI2Sが、平均して1分子あたり少なくとも20のシアル酸を含有する、請求項1に記載の組成物。
【請求項4】
前記精製された組換えI2Sが、配列番号1のCys59に対応するシステイン残基の、Cα-ホルミルグリシン(FGly)への少なくとも75%のモル比の転換を含む、請求項1~3のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項5】
前記精製された組換えI2Sが、配列番号1のCys59に対応するシステイン残基の、Cα-ホルミルグリシン(FGly)への少なくとも80%のモル比の転換を含む、請求項1~3のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項6】
前記精製された組換えI2Sが、配列番号1のCys59に対応するシステイン残基の、Cα-ホルミルグリシン(FGly)への85%超のモル比の転換を含む、請求項1~3のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項7】
前記精製された組換えI2Sが、配列番号1のCys59に対応するシステイン残基の、Cα-ホルミルグリシン(FGly)への90%超のモル比の転換を含む、請求項1~3のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項8】
前記精製された組換えI2Sが、配列番号1のCys59に対応するシステイン残基の、Cα-ホルミルグリシン(FGly)への95%超のモル比の転換を含む、請求項1~3のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項9】
前記精製された組換えI2Sが、配列番号1のCys59に対応するシステイン残基の、Cα-ホルミルグリシン(FGly)への100%のモル比の転換を含む、請求項1~3のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項10】
前記精製された組換えI2S中に宿主細胞タンパク質(HCP)が存在しないか、または、前記精製された組換えI2S中にHCPが存在し、かつ、HCPの量が100ng/mg未満である、請求項1~9のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項11】
請求項1~10のいずれか一項に記載の組成物および生理学的に許容可能な担体を含む製剤。
【請求項12】
静脈投与に適している請求項11に記載の製剤。
【請求項13】
髄腔内投与に適している請求項11に記載の製剤。
【請求項14】
皮下投与に適している請求項11に記載の製剤。
【請求項15】
ハンター症候群を治療するためにある請求項11に記載の製剤。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【0001】
関連出願の相互参照
本出願は、2012年6月29日に提出した米国仮出願第61/666,733号に基づく優先権を主張するものであり、該仮出願は、参照によりその全体が本明細書に取り込まれる。
【0002】
配列表
本発明の明細書は、2013年6月27日に「2006685-0342_SEQ_LIST」と名付けたASCIIテキストファイルとして電子形式で提出された配列表を参照する。当該テキストファイルは2013年6月25日に生成され、サイズは15KBである。配列表の全内容は、参照により本明細書に取り込まれる。
【背景技術】
【0003】
ムコ多糖症II型(MPSII、ハンター症候群)は、酵素イズロン酸-2-スルファターゼ(I2S)の欠損から生じるX染色体劣性リソソーム貯蔵障害である。I2Sは、末端2-O-硫酸部分をグリコサミノグリカン(GAG)デルマタン硫酸およびヘパラン硫酸から切断する。ハンター症候群の患者のI2Sが失われたか欠陥があることにより、GAGが、様々な細胞型のリソソームに進行的に蓄積し、細胞の拡張、臓器肥大、組織破壊、および臓器系の機能不全を引き起こす。
【0004】
一般的に、ハンター症候群の人々の身体的徴侯には、身体的な症状とニューロンの症状の両方がある。例えば、ハンター症候群のいくつかの事例では、中枢神経系の関与が発育遅延および神経系の問題を引き起こす。ハンター症候群の非ニューロン症状は、誕生時には通常ないものの、時が経過するにつれて身体の細胞にGAGが進行的に蓄積することによって、身体の周辺組織に劇的な影響をもたらす可能性がある。周辺組織のGAGの蓄積は、患者の顔特徴に特有の粗悪さをもたらし、突起した額、平坦な鼻梁および肥大した舌を招き、ハンター患者の顕著な特徴である。同様に、GAGの蓄積は身体の臓器系に有害に影響する可能性がある。初期に、心臓、肺および気道の壁が厚くなり、肝臓、脾臓および腎臓の異常な肥大といった徴侯が見られ、これらの重大な変化は、究極的には、破滅的な臓器不全を拡散させる可能性がある。結果として、ハンター症候群は常に重症であり、進行性であり、寿命を制限する。
【0005】
酵素補充療法(ERT)はハンター症候群(MPSII)を治療するための承認された療法であり、ハンター症候群の患者に、外因性補充I2S酵素を投与することを伴う。
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【0006】
本発明は、数ある中で、酵素補充療法のために組換えをして製造したI2Sタンパク質を精製するための改善した方法を提供する。本発明は、わずか4つのクロマトグラフィーカラムを伴うプロセスを使用して、I2Sを含有する細胞培養培地等の加工されていない生体物質から組換えI2Sタンパク質を精製できる。組換えI2Sの承認された現存する酵素補充療法のための精製プロセスは、6つのクロマトグラフィーカラムを伴う。実施例の節で記載するように、本発明に記載の4つのカラムプロセスを用いて精製される組換えI2Sタンパク質は、米国およびその他多くの国の市販の精製要求に従っている。さらに、本発明に従い精製された組換えI2S酵素は、高い率のCα-ホルミルグリシン(FGly)(例えば、例えば、70%超、最大100%)を保持し、I2S酵素の活性に重要であり、組換えI2Sタンパク質の生物学的利用能および/またはリソソーム標的を促進し得るシアル酸量およびグリカンマップ等の特有の特徴である。したがって、本発明は、組換えI2Sタンパク質を精製するための効果的、安価で速いプロセスを提供する。本発明は、特に、無血清培地で製造される組換えI2Sタンパク質を精製するのに有用である。
【0007】
したがって、ある態様では、本発明は、アニオン交換クロマトグラフィー、カチオン交換クロマトグラフィー、混合モードクロマトグラフィー、および疎水性相互作用クロマトグラフィーの1つ以上に基づくプロセスを用いて、不純調製物から組換えI2Sタンパク質を精製する方法を提供する。いくつかの実施形態では、本発明に記載の発明の方法は、6つ未満(例えば、5つ未満、4つ未満または3つ未満)のクロマトグラフィーのステップを伴う。いくつかの実施形態では、本発明に記載の発明の方法は、2、3、4または5つのクロマトグラフィーのステップを伴う。いくつかの実施形態では、本発明に記載の発明の方法は、4つのクロマトグラフィーのステップを伴う。いくつかの実施形態では、本発明の精製された組換えI2Sタンパク質は、100ng/mg未満の宿主細胞タンパク質(HCP)(例えば、90ng/mg未満のHCP、80ng/mg未満のHCP、70ng/mg未満のHCP、60ng/mg未満のHCP、50ng/mg未満のHCP、40ng/mg未満のHCP、30ng/mg未満のHCP、20ng/mg未満のHCP、10ng/mg未満のHCP)を含有する。
【0008】
いくつかの実施形態では、適切なアニオン交換クロマトグラフィーはQクロマトグラフィーである。いくつかの実施形態では、適切なカチオン交換クロマトグラフィーはSPクロマトグラフィーである。いくつかの実施形態では、適切な混合モードクロマトグラフィーはヒドロキシアパタイト(HA)クロマトグラフィーである。いくつかの実施形態では、適切な疎水性相互作用クロマトグラフィーはフェニルクロマトグラフィーである。
【0009】
アニオン交換クロマトグラフィー(例えば、Oカラム)、カチオン交換クロマトグラフィー(例えば、SPカラム)、混合モードクロマトグラフィー(例えば、HAカラム)、および疎水性相互作用クロマトグラフィー(例えば、フェニルカラム)は任意の順番で行うことができることが理解される。いくつかの実施形態では、本発明に記載の方法は、アニオン交換クロマトグラフィー(例えば、Oカラム)、カチオン交換クロマトグラフィー(例えば、SPカラム)、混合モードクロマトグラフィー(例えば、HAカラム)、および疎水性相互作用クロマトグラフィー(例えば、フェニルカラム)は、この順番で行われる。
【0010】
いくつかの実施形態では、不純調製物または中間溶離物または通過画分は、アニオン交換クロマトグラフィーカラム(例えば、Qカラム)に負荷される前に、pHを約5.0~7.0(例えば、約5.0、5.5、6.0、6.5または7.0)に調整され、約10~20mS/cm(例えば、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20mS/cm)の伝導率に調整される。いくつかの実施形態では、1Mの酢酸ナトリウムを用いてpHを調整する。いくつかの実施形態では、は、5Mの塩化ナトリウムを用いて伝導率を調整する。いくつかの実施形態では、アニオン交換クロマトグラフィーカラムは、一度負荷されると、塩(例えば、NaCl)を含む洗浄緩衝液を用いて、約140mM~200mM(例えば、約140mM、145mM、150mM、155mM、160mM、165mM、170mM、175mM、180mM、185mM、190mM、195mM、または200mM)の濃度、約5.0~7.0(例えば、約5.0、5.5、6.0、6.5または7.0)のpHで洗浄される。いくつかの実施形態では、アニオン交換クロマトグラフィーカラムは、直線的な塩(例えば、NaCl)勾配を含む溶離緩衝液を用いて溶離される。いくつかの実施形態では、適切な直線的NaCl勾配は、約0~500mMのNaCl(例えば、約0~400mM、約0~350mM、約0~300mM、約50~500mM、約150~500mM、約150~450mM、約150~400mM)の範囲を含む。
【0011】
いくつかの実施形態では、不純調製物または中間溶離物または通過画分は、カチオン交換クロマトグラフィーカラム(例えば、SPカラム)に負荷される前に、約1mS/cm~20mS/cm(例えば、約1mS/cm~15mS/cm、約1mS/cm~10mS/cm、約1mS/cm~8mS/cm、約1mS/cm~6mS/cm、約1mS/cm~4mS/cm、約2mS/cm~4mS/cm)の範囲の伝導率に調整される。いくつかの実施形態では、不純調製物または中間溶離物または通過画分は、カチオン交換クロマトグラフィーカラム(例えば、SPカラム)に負荷される前に、約2mS/cm~4mS/cm(例えば、2、2.5、3、3.5、または4mS/cm)の範囲の伝導率で調整される。いくつかの実施形態では、伝導率は、約1~2:1(例えば、1:1、1.1:1、1.2:1、1.3:1、1.4:、1.5:1、1.6:1、1.7:1、1.8:1、1.9:1、または2:1)の比で、HOを含むアニオン交換クロマトグラフィーカラムからの溶離物を希釈することによって調整される。いくつかの実施形態では、伝導率はダイアフィルトレーション(dialfiltration)によって調整される。いくつかの実施形態では、カチオン交換クロマトグラフィーカラムは約5.0~6.5(例えば、5.0、5.5、6.0または6.5)のpHで作動する。いくつかの実施形態では、カチオン交換クロマトグラフィーのカラムは、約0.01M~約0.1M(例えば、約0.01M、0.02M、0.03M、0.04M、0.05M、0.06M、0.07M、0.08M、0.09M、または0.1M)の範囲のリン酸塩(例えば、NaPO4)濃度を含む緩衝液で作動する。いくつかの実施形態では、適切なpHは約5.0~6.5(例えば、約5.0、5.5、6.0、または6.5)である。
【0012】
いくつかの実施形態では、不純調製物または中間溶離物または通過画分は、混合モードクロマトグラフィーカラム(例えば、HAカラム)に負荷される前に、約0.001M~約0.01M(例えば、約0.001M、0.002M、0.003M、0.004M、0.005M、0.006M、0.007M、0.008M、0.009M、または0.01M)の範囲のリン酸塩(例えば、NaPO4)濃度、約5.0~6.5(例えば、約5.0、5.5、6.0、または6.5)のpHに調整される。いくつかの実施形態では、混合モードクロマトグラフィーカラム(例えば、HAカラム)は、一度負荷されると、中性またはそれに近いpHでリン酸塩(例えば、1~10mMのナトリウムまたはリン酸カリウム)を有する洗浄緩衝液で洗浄される。いくつかの実施形態では、混合モードクロマトグラフィーカラム(例えば、HAカラム)は、約10~20mM(例えば、約10~18mM、10~16mM、10~15mM、12~20mM、14~18mM、14~16mM)の範囲のリン酸塩の濃度を有する洗浄緩衝液で洗浄される。いくつかの実施形態では、混合モードクロマトグラフィーカラム(例えば、HAカラム)は、10mM、11mM、12mM、13mM、14mM、15mM、16mM、17mM、18mM、19mM、20mM超のリン酸塩の濃度を有する洗浄緩衝液で洗浄される。いくつかの実施形態では、混合モードクロマトグラフィーカラム(例えば、HAカラム)からの溶離は、勾配リン酸塩緩衝液で達成される。いくつかの実施形態では、適切な溶離緩衝液は、約1~400mM(例えば、1~300mM、1~200mM、1~150mM、1~100mM、10~350mM、10~300mM、10~250mM、10~200mM、10~150mM、10~140mM、10~130mM、10~120mM、10~110mM、10~100mM、10~90mM、10~80mM、10~70mM、10~60mM、10~50mM)のリン酸ナトリウムまたはリン酸カリウムのリン酸塩の勾配を有してもよい。いくつかの実施形態では、HAカラムからの溶離は、溶離緩衝液中のリン酸の濃度を段階的に増加させることによって、達成される。いくつかの実施形態では、段階的な溶離緩衝液は、10mM、20mM、30mM、40mM、50mM、60mM、70mM、80mM、90mM、100mM、110mM、120mM、130mM、140mM、150mM、200mM、250mM、300mM、350mM、400mMから選択されるリン酸塩(例えば、リン酸ナトリウム)濃度を有してもよい。いくつかの実施形態では、混合モードクロマトグラフィーカラム(例えば、HAカラム)からの溶離は、約50mM~150mM(例えば、50mM、60mM、70mM、80mM、90mM、100mM、110mM、120mM、130mM、140mM、150mM、およびその組み合わせのリン酸塩(例えば、リン酸ナトリウム)から選択される)の範囲のリン酸塩(例えば、リン酸ナトリウム)の濃度を有する溶離緩衝液によって達成される。
【0013】
いくつかの実施形態では、不純調製物または中間溶離物または通過画分は、疎水性相互作用クロマトグラフィー(例えば、フェニルカラム)に負荷される前に、約0.5M~約2.0M(例えば、約0.5M、1.0M、1.1M、1.2M、1.3M、1.4M、1.5M、1.6M、1.7M、1.8M、1.9M、または2.0MのNaCl)の範囲の塩(例えば、NaCl)の濃度、約4.5~6.0(例えば、約4.5、5.0、5.5、または6.0)のpHの範囲に調整される。いくつかの実施形態では、疎水性相互作用クロマトグラフィーのカラムは、一度負荷されると、約0.5M~2.0M(例えば、約0.5M、1.0M、1.1M、1.2M、1.3M、1.4M、1.5M、1.6M、1.7M、1.8M、1.9M、または2.0MのNaCl)の範囲の濃度、約4.5~6.0(例えば、約4.5、5.0、5.5、または6.0)のpHの塩(例えば、NaCl)を含む洗浄緩衝液を用いて洗浄される。いくつかの実施形態では、疎水性相互作用クロマトグラフィーのカラムは、0.1M~約0.5M(例えば、約0.1M、0.2M、0.3M、0.4M、または0.5MのNaCl)の範囲の濃度、約4.5~6.0(例えば、約4.5、5.0、5.5、または6.0)のpHの塩(例えば、NaCl)を含む洗浄緩衝液を用いて溶離される。
【0014】
いくつかの実施形態では、アニオン交換クロマトグラフィー、カチオン交換クロマトグラフィー、混合モードクロマトグラフィー、および疎水性相互作用クロマトグラフィーそれぞれのカラムの高さは、14~25cm(例えば、15~25cm、15~20cm、14~24cm、14~22cm、14~20cm、または16~18cm)の範囲である。いくつかの実施形態では、アニオン交換クロマトグラフィー、カチオン交換クロマトグラフィー、混合モードクロマトグラフィー、および疎水性相互作用クロマトグラフィーそれぞれのカラム高さは、約14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、または25cmである。
【0015】
いくつかの実施形態では、本発明に記載の発明の方法は、不純調製物を最初のクロマトグラフィーカラムに負荷する前に、ウイルスの不活性化のステップを含む。いくつかの実施形態では、ウイルスの不活性化のステップは、不純調製物に洗剤を加えることを含む。いくつかの実施形態では、本発明に記載の発明の方法は、最後のクロマトグラフィーカラムの後にウイルスを取り除くステップをさらに含む。いくつかの実施形態では、本発明の方法は、限外濾過および/またはダイアフィルトレーションのステップをさらに含む。いくつかの実施形態では、限外濾過および/またはダイアフィルトレーションのステップは、精製された組換えI2Sタンパク質を薬剤処方緩衝液に交換することを含む。
【0016】
いくつかの実施形態では、本発明は、配列番号1に少なくとも約50%(例えば、少なくとも約55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%)同一のアミノ酸配列を有する組換えI2Sタンパク質を精製するために使用される。いくつかの実施形態では、本発明は、配列番号1と同一のアミノ酸配列を有する組換えI2Sタンパク質を精製するために使用される。
【0017】
いくつかの実施形態では、本発明は、無血清培地中の懸濁液で培養された哺乳類細胞によって製造された組換えI2Sタンパク質を精製するために使用される。いくつかの実施形態では、本発明に適した無血清培地は、動物性由来の成分を欠いている。いくつかの実施形態では、本発明に適した無血清培地は、既知組成培地である。いくつかの実施形態では、哺乳類細胞は、バイオリアクターで培養される。いくつかの実施形態では、哺乳類細胞は、組換えI2Sタンパク質およびホルミルグリシン生成酵素(FGE)を共発現する。いくつかの実施形態では、哺乳類細胞はヒト細胞である。
【0018】
いくつかの実施形態では、本発明の方法に使用される不純調製物は、哺乳類細胞から分泌される組換えI2Sタンパク質を含有する無血清培地から調製される。いくつかの実施形態では、本発明の方法で使用される不純調製物は、凍結された培地調製物から溶解される。
【0019】
いくつかの実施形態では、本発明の精製された組換えI2Sタンパク質は、平均して1分子あたり16~22(例えば、16~21、16~20、16~19、17~22、17~21、17~20、17~19)のシアル酸を含有する。いくつかの実施形態では、本発明の精製された組換えI2Sタンパク質は、平均して1分子あたり16、17、18、19、20、21、または22個のシアル酸を含有する。
【0020】
いくつかの実施形態では、本発明の精製された組換えI2Sタンパク質は、ヒトI2S(配列番号1)のCys59に対応するシステイン残基をCα-ホルミルグリシン(FGly)に、少なくとも約70%(例えば、少なくとも77%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%)転換を有する。いくつかの実施形態では、本発明の精製された組換えI2Sタンパク質は、ヒトI2S(配列番号1)のCys59に対応するシステイン残基をCα-ホルミルグリシン(FGly)に、実質的に100%の転換を有する。いくつかの実施形態では、本発明の精製された組換えI2Sタンパク質は、基質としてヘパリン二糖を使用して、in vitroの硫酸塩放出活性アッセイによって決定されるように、少なくとも約20U/mg、30U/mg、40U/mg、50U/mg、60U/mg、70U/mg、80U/mg、90U/mg、または100U/mgの特異的活性を有する。
【0021】
いくつかの実施形態では、本発明の精製された組換えI2Sタンパク質は、in vitroの取り込みアッセイによって決定されるように、70%、75%、80%、85%、90%、95%超の細胞の取り込みを特徴とする。
【0022】
いくつかの実施形態では、本発明の精製された組換えI2Sタンパク質は、それぞれ、中性(ピーク群1)、モノシアリル化(ピーク群2)、ジシアリル化(ピーク群3)、モノホスホリル化(ピーク群4)、トリシアリル化(ピーク群5)、テトラシアリル化(ピーク群6)、またはジホスホリル化(ピーク群7)I2Sタンパク質を指示する7つのピーク群を含むグリカンマップを特徴とする。いくつかの実施形態では、グリカンマップは、ノイラミニダーゼ消化の後に発生する。その他の実施形態では、グリカンマップは、アルカリホスファターゼ消化の後に発生する。
【0023】
本発明は、数ある中で、本明細書に記載されるように、精製された組換えI2Sタンパク質、および医薬組成物または同組成物を含む製剤を提供する。いくつかの実施形態では、製剤は、静脈内、皮下、および/または髄腔内投与のために処方される。本発明は、精製された組換えI2S、それを含む医薬組成物または製剤を、治療を必要とする対象に投与することによって、ハンター症候群を治療する方法も提供する。
【0024】
本明細書に使用されるように、用語「I2Sタンパク質」、「I2S」、「I2S酵素」、または文法的に等価な用語は、別に特に示されなければ、組換えI2Sタンパク質分子を調製することを意味する。
【0025】
当該出願に使用されるように、用語「約」および「およそ」は等価なものとして使用される。約/およそを付けたまたは付けていない当該出願に使用される数字は、関連技術分野の当業者によって認識される通常の増減を含むことを意味する。
【0026】
本発明のその他の特徴、目的、および利点は、以下の詳細な記述で明らかにする。しかしながら、詳細な記述は、本発明の実施形態を示すが、説明のためだけにあり、限定することを意味しないことを理解されたい。本発明の範囲内での様々な変更または修正は、詳細な記述から、当業者に明白であろう。
本発明は、以下の項目も提供する。
(項目1)
配列番号1に少なくとも70%同一のアミノ酸配列を有する精製された組換えイズロン酸-2-スルファターゼ(I2S)を含む組成物であって、精製された組換えI2Sは、配列番号1のCys59に対応するシステイン残基をCα-ホルミルグリシン(FGly)に、少なくとも約70%転換し、および、さらに、精製された組換えI2Sは、150ng/mg未満の宿主細胞タンパク質(HCP)を含有する、組成物。
(項目2)
精製された組換えI2Sは、100ng/mg未満のHCPを含有する項目1に記載の組成物。
(項目3)
精製された組換えI2Sは、80ng/mg未満のHCPを含有する項目1に記載の組成物。
(項目4)
精製された組換えI2Sは、60ng/mg未満のHCPを含有する項目1に記載の組成物。
(項目5)
配列番号1に少なくとも70%同一のアミノ酸配列を有する精製された組換えイズロン酸-2-スルファターゼ(I2S)を含む組成物であって、精製された組換えI2Sは、配列番号1のCys59に対応するシステイン残基をCα-ホルミルグリシン(FGly)に、少なくとも約70%転換し、および、さらに精製された組換えI2Sは、平均して1分子あたり少なくとも16個のシアル酸を含有する、組成物。
(項目6)
精製された組換えI2Sは、平均して1分子あたり少なくとも18個のシアル酸を含有する、項目5に記載の組成物。
(項目7)
精製された組換えI2Sは、平均して1分子あたり少なくとも20個のシアル酸を含有する、項目5に記載の組成物。
(項目8)
配列番号1に少なくとも70%同一のアミノ酸配列を有する精製された組換えイズロン酸-2-スルファターゼ(I2S)を含む組成物であって、精製された組換えI2Sは、配列番号1のCys59に対応するシステイン残基をCα-ホルミルグリシン(FGly)に、少なくとも約70%転換し、および、さらに、精製された組換えI2Sは、1酵素あたり少なくとも10%のビス-ホスホリルアテドオリゴ糖を含有する、組成物。
(項目9)
精製された組換えI2Sは、1酵素あたり少なくとも20%のビス-ホスホリルアテドオリゴ糖を含有する、項目8に記載の組成物。
(項目10)
配列番号1に少なくとも70%同一のアミノ酸配列を有する精製された組換えイズロン酸-2-スルファターゼ(I2S)を含む組成物であって、精製された組換えI2Sは、配列番号1のCys59に対応するシステイン残基をCα-ホルミルグリシン(FGly)に、少なくとも約70%転換し、および、さらに、精製された組換えI2Sは、中性(ピーク群1)、モノシアリル化(ピーク群2)、ジシアリル化(ピーク群3)、モノホスホリル化(ピーク群4)、トリシアリル化(ピーク群5)、テトラシアリル化(ピーク群6)、またはジホスホリル化(ピーク群7)I2Sタンパク質を指示するピーク群から選択される7つまたはそれより少ないピーク群を含むグリカンマップを特徴とする、組成物。
(項目11)
精製された組換えI2Sは、配列番号1のCys59に対応するシステイン残基をCα-ホルミルグリシン(FGly)に、少なくとも約75%転換する、前記項目いずれか1つに記載の組成物。
(項目12)
精製された組換えI2Sは、配列番号1のCys59に対応するシステイン残基をCα-ホルミルグリシン(FGly)に、少なくとも約80%転換する、項目1~10のいずれか1つに記載の組成物。
(項目13)
配列番号1に少なくとも70%同一のアミノ酸配列を有する精製された組換えイズロン酸-2-スルファターゼ(I2S)を含む組成物であって、精製された組換えI2Sは、配列番号1のCys59に対応するシステイン残基をCα-ホルミルグリシン(FGly)に、約85%超の転換を含む、組成物。
(項目14)
精製された組換えI2Sは、配列番号1のCys59に対応するシステイン残基をCα-ホルミルグリシン(FGly)に、約90%超の転換を含む、項目13に記載の組成物。
(項目15)
精製された組換えI2Sは、配列番号1のCys59に対応するシステイン残基をCα-ホルミルグリシン(FGly)に、約95%超の転換を含む、項目13に記載の組成物。
(項目16)
精製された組換えI2Sは、配列番号1のCys59に対応するシステイン残基をCα-ホルミルグリシン(FGly)に、実質的に100%の転換を含む、項目13に記載の組成物。
(項目17)
精製された組換えI2Sは、配列番号1に少なくとも80%同一のアミノ酸配列を有する、前記項目いずれか1つに記載の組成物。
(項目18)
精製された組換えI2Sは、配列番号1に少なくとも90%同一のアミノ酸配列を有する、前記項目いずれか1つに記載の組成物。
(項目19)
精製された組換えI2Sは、配列番号1に少なくとも95%同一のアミノ酸配列を有する、前記項目いずれか1つに記載の組成物。
(項目20)
精製された組換えI2Sは、配列番号1と同一のアミノ酸配列を有する、前記項目いずれか1つに記載の組成物。
(項目21)
前記項目いずれか1つに記載の組成物および生理学的に許容可能な担体を含む製剤。
(項目22)
製剤は静脈投与に適している項目21に記載の製剤。
(項目23)
製剤は髄腔内投与に適している項目21に記載の製剤。
(項目24)
製剤は皮下投与に適している項目21に記載の製剤。
(項目25)
製剤はハンター症候群を治療するためにある項目21に記載の製剤。
(項目26)
アニオン交換クロマトグラフィー、カチオン交換クロマトグラフィー、混合モードクロマトグラフィー、および疎水性相互作用クロマトグラフィーの1つ以上を実施することによって、不純調製物から組換えイズロン酸-2-スルファターゼ(I2S)タンパク質を精製することを含む方法であって、方法は、6つ未満のクロマトグラフィーのステップを伴い、精製された組換えI2Sタンパク質は、100ng/mg未満の宿主細胞タンパク質(HCP)を含有する、方法。
(項目27)
アニオン交換クロマトグラフィーはQクロマトグラフィーである項目26に記載の方法。
(項目28)
カチオン交換クロマトグラフィーはSPクロマトグラフィーである項目26または27に記載の方法。
(項目29)
混合モードクロマトグラフィーはヒドロキシアパタイト(HA)クロマトグラフィーである項目26~28のいずれか1つに記載の方法。
(項目30)
疎水性相互作用クロマトグラフィーは、フェニルクロマトグラフィーである項目26~29のいずれか1つに記載の方法。
(項目31)
方法は5つまたはそれ未満のクロマトグラフィーのステップを伴う項目26~30のいずれか1つに記載の方法。
(項目32)
方法は4つまたはそれ未満のクロマトグラフィーのステップを伴う項目26~31のいずれか1つに記載の方法。
(項目33)
方法はアニオン交換クロマトグラフィー、カチオン交換クロマトグラフィー、混合モードクロマトグラフィー、および疎水性相互作用クロマトグラフィーをこの順番で実施する、項目26~32のいずれか1つに記載の方法。
(項目34)
不純調製物または中間溶離物を負荷されると、アニオン交換クロマトグラフィーカラムは、pH5.5の約140mM~200mMの範囲の濃度のNaClを含む洗浄緩衝液を用いて洗浄される、項目26~33のいずれか1つに記載の方法。
(項目35)
アニオン交換クロマトグラフィーカラムは、直線的NaCl勾配を含む溶離緩衝液を用いて溶離される、項目26~34のいずれか1つに記載の方法。
(項目36)
直線的NaCl勾配は0~500mMの範囲のNaClを含む、項目33に記載の方法。
(項目37)
不純調製物または中間溶離物は、カチオン交換クロマトグラフィーのカラムに負荷される前に、約1mS/cm~約20mS/cmの範囲の伝導率に調整される、項目26~36のいずれか1つに記載の方法。
(項目38)
カチオン交換クロマトグラフィーカラムは、約5.5のpHで作動する項目37に記載の方法。
(項目39)
不純調製物または中間溶離物は、混合モードクロマトグラフィーのカラムに負荷される前に、約0.001~0.01MおよびpH5.5の範囲のリン酸塩濃度に調整される、項目26~38のいずれか1つに記載の方法。
(項目40)
混合モードクロマトグラフィーカラムは、一度負荷されると、約10~20mM、pH5.5の範囲のリン酸塩濃度を含む洗浄緩衝液を用いて洗浄される、項目39に記載の方法。
(項目41)
混合モードクロマトグラフィーカラムは、約50~150mM、pH5.5の範囲のリン酸塩濃度を含む溶離緩衝液を用いて溶離される、項目40に記載の方法。
(項目42)
不純調製物または中間溶離物は、疎水性相互作用クロマトグラフィーのカラムに負荷される前に、約0.5~2.0M、約4.5~6.0のpHの範囲の塩濃度に調整される、項目26~41のいずれか1つに記載の方法。
(項目43)
疎水性相互作用クロマトグラフィーカラムは、一度負荷されると、約0.5~2.0M、約4.5~6.0のpHの範囲の塩濃度を含む洗浄緩衝液を用いて洗浄される、項目42に記載の方法。
(項目44)
疎水性相互作用クロマトグラフィーのカラムは、約0.1~0.5M、約4.5~6.0のpHの範囲の塩濃度を含む溶離緩衝液を用いて溶離される、項目43に記載の方法。
(項目45)
アニオン交換クロマトグラフィー、カチオン交換クロマトグラフィー、混合モードクロマトグラフィー、および疎水性相互作用クロマトグラフィーのそれぞれのカラムの高さは14~25cmの範囲である、項目26~44のいずれか1つに記載の方法。
(項目46)
方法はウイルスの不活性化のステップをさらに含む前記項目いずれか1つに記載の方法。
(項目47)
ウイルスの不活性化のステップは、最初のクロマトグラフィーのカラムに不純調製物を負荷する前に行われる項目46に記載の方法。
(項目48)
ウイルスの不活性化のステップは、不純調製物に洗剤を加えることを含む項目46に記載の方法。
(項目49)
方法は、最後のクロマトグラフィーのカラムの後にウイルスを取り除くステップをさらに含む、項目26~48のいずれか1つに記載の方法。
(項目50)
方法は、限外濾過および/またはダイアフィルトレーションのステップをさらに含む、項目26~49のいずれか1つに記載の方法。
(項目51)
限外濾過および/またはダイアフィルトレーションのステップは、組換えI2Sタンパク質を、薬剤処方緩衝液に交換することを含む、項目50に記載の方法。
(項目52)
組換えI2Sタンパク質は、配列番号1と少なくとも70%同一のアミノ酸配列を有する、項目26~51のいずれか1つに記載の方法。
(項目53)
組換えI2Sタンパク質は、配列番号1と同一のアミノ酸配列を有する、項目26~52のいずれか1つに記載の方法。
(項目54)
組換えI2Sタンパク質は、無血清培地中の懸濁液に培養される哺乳類細胞によって製造される、項目26~53のいずれか1つに記載の方法。
(項目55)
哺乳類細胞はバイオリアクターで培養される、項目54に記載の方法。
(項目56)
無血清培地は動物性由来成分を欠いている項目54または55に記載の方法。
(項目57)
無血清培地は、既知組成培地である項目54~56のいずれか1つに記載の方法。
(項目58)
哺乳類細胞は、組換えI2Sタンパク質およびホルミルグリシン生成酵素(FGE)を共発現する、項目54~56のいずれか1つに記載の方法。
(項目59)
哺乳類細胞はヒト細胞である項目58に記載の方法。
(項目60)
不純調製物は、哺乳類細胞から分泌される組換えI2Sタンパク質を含有する無血清培地から調製される、項目54~59のいずれか1つに記載の方法。
(項目61)
不純調製物は、凍結培地調製物から溶解される項目60に記載の方法。
(項目62)
精製された組換えI2Sタンパク質は、80ng/mg未満のHCPを含有する、項目26~61のいずれか1つに記載の方法。
(項目63)
精製された組換えI2Sタンパク質は、60ng/mg未満のHCPを含有する、項目26~62のいずれか1つに記載の方法。
(項目64)
精製された組換えI2Sタンパク質は、平均して、1分子あたり16~22個のシアル酸を含有する、項目26~63のいずれか1つに記載の方法。
(項目65)
精製された組換えI2Sタンパク質は、基質としてヘパリン二糖類を用いて、in vitroの硫酸塩放出活性によって特定されるように、少なくとも60U/mgの特異的活性を有する、項目26~63のいずれか1つに記載の方法。
(項目66)
項目26~65のいずれか1つに記載の方法に従い精製された組換えI2Sタンパク質を含む医薬組成物。
(項目67)
項目66に記載の医薬組成物を、治療が必要な対象に投与することを含むハンター症候群を治療する方法。
【図面の簡単な説明】
【0027】
以下に記載の図は、一緒に図を構成し、説明のためだけにあり、限定することを意味しない。
図1】無血清培地に製造された組換えI2Sについての例示的な精製スキームを記述する。
図2】参照I2Sと比較したときの精製された組換えI2S AFの例示的なペプチドマップを記述する。
図3】精製された組換えI2S AFの例示的なSDS-PAGE(銀)分析を記述する。
図4】イオン交換クロマトグラフィーによって評価された精製された組換えI2S AFの例示的な電荷特性分析を記述する。
図5】精製された組換えI2S AFの例示的なグリカンマップ特性を記述する。
図6】組換えI2Sの浄化された回収物のウイルス不活性化UPBステップの後の例示的な活性の分析(U/mg)を記述する。
図7】組換えI2Sの浄化された回収物のウイルス不活性化UPBステップの後の例示的なSEC-HPLCの分析を記述する。
図8】精製された組換えI2Sタンパク質を銀染色で処理された例示的なSDS-PAGEを記述する。
図9】参照と比較したときの、無血清培地条件(上パネル)で成長したI2S-AF 2D細胞株から製造された精製された組換えI2S酵素についての例示的ペプチドマップを示す。
図10】参照と比較したときの、無血清培地条件で成長したI2S-AF 2Dおよび4D細胞株を使用して製造された精製された組換えI2S酵素について発生した例示的なグリカンの特性を記述する。
図11】I2S参照対照と比較したときの、無血清培地条件で成長したI2S-AF 2Dおよび4D細胞株を使用して製造された精製された組換えI2S酵素について発生した例示的な電荷特性を記述する。
【発明を実施するための形態】
【0028】
定義
本発明をもっとわかり易く理解するために、以下に初めに特定の用語を定義する。以下の用語およびその他の用語についての追加の定義は明細書全体にわたって記載する。
【0029】
およそまたは約:目的の1つ以上の値に付けられる用語「およそ」または「約」は、本明細書で使用するとき、定められた基準値とほぼ同じ値を意味する。ある実施形態では、用語「およそ」または「約」は、25%、20%、19%、18%、17%、16%、15%、14%、13%、12%、11%、10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、1%以内にある値の範囲、または別に特に示されなければ、若しくは文脈から別に明白に示されなければ(ただし当該数字が可能な値の100%を超える場合は除く)、定められた基準値のどちらかの方向でより少ない(超または未満)にある値の範囲を意味する。
【0030】
生物学的に活性:フレーズ「生物学的に活性な」は、本明細書で使用されるとき、生物系(例えば、細胞培養、有機体等)に活性を有する任意の物質の特徴を意味する。例えば、物質が有機体に投与され、有機体に生物学的影響をもたらすとき、生物学的に活性であると考えられる。生物学的活性は、in vitroアッセイによって決定することもできる(例えば、硫酸塩放出アッセイ等のin vitro酵素試験)。特定の実施形態では、タンパク質またはポリペプチドが生物学的に活性である場合、タンパク質またはポリペプチドの少なくとも1つの生物学的活性を分かち合うタンパク質またはポリペプチドの部分は、典型的に「生物学的に活性な」部分として意味する。いくつかの実施形態では、タンパク質は細胞培養系から産生および/または精製され、対象に投与されると生物学的活性を表す。いくつかの実施形態では、タンパク質は、生物学的に活性になるために、更なる処理を必要とする。いくつかの実施形態では、タンパク質は、限定されないが、生物学的に活性になるために、グリコシル化(例えば、シアリル化)、ファルネシル化、切断、折りたたみ、ホルミルグリシン転換およびその組み合わせ等の翻訳後修飾を必要とする。いくつかの実施形態では、プロ形態(すなわち未成熟形態)として産生されるタンパク質は、生物学的に活性になるために、追加の修飾を必要とし得る。
【0031】
カチオン非依存性マンノース6リン酸レセプター(CI-MPR):用語「カチオン非依存性マンノース6リン酸レセプター(CI-MPR)」は、本明細書で使用するとき、リソソームを輸送することを運命付けられたゴルジ体中の酸性ヒドロラーゼ前駆体上のマンノース6リン酸レセプター(M6P)タグを結合する分子受容体を意味する。マンノース6リン酸の他に、CI-MPRはIGF-IIを含むその他のンパク質とも結合する。CI-MPRは「M6P/IGF-II受容体」、「CI-MPR/IGF-II受容体」、「IGF-II受容体」、または「IGF2受容体」としても知られる。これらの用語およびその略語は、本明細書では交換可能に使用される。
【0032】
クロマトグラフィー:用語「クロマトグラフィー」は、本明細書で使用するとき、混合物を分離する手技を意味する。典型的に、混合物は「移動相」と呼ばれる液体に溶解し、「固定相」と呼ばれる別の材料を保持する構造を通過する。カラムクロマトグラフィーは、固定したベッドが管、すなわちカラム内にある分離の手技を意味する。
【0033】
希釈剤:用語「希釈剤」は、本明細書で使用するとき、再構築された製剤を調製するのに有用な薬剤的に許容可能な(例えば、ヒトへの投与に安全および非毒性である)希釈物質を意味する。例示的な希釈剤として、無菌水、注射用静菌水(BWFI)、pH緩衝溶液(リン酸塩緩衝生理食塩水)無菌生理食塩溶液、リンゲル溶液またはブドウ糖溶液が挙げられる。
【0034】
溶離:用語「溶離」は、本明細書で使用するとき、溶媒を洗浄することによって、1つの物質を別の物質から抽出するプロセスを意味する。例えば、イオン交換クロマトグラフィーでは、溶離は、捉えたイオンを取り除くために負荷された樹脂を洗浄するプロセスである。
【0035】
溶離物:用語「溶離物」は、移動相「担体」と典型的には溶離の結果として、クロマトグラフィーから現れる分析材料との組み合わせを意味する。
【0036】
酵素補充療法(ERT):用語「酵素補充療法(ERT)」は、本明細書で使用するとき、失われた酵素を提供することによって酵素欠損を直す治療戦略を意味する。一度投与されると、酵素は細胞によって取り込まれ、リソソームに輸送され、そこで酵素は、酵素欠損のためにリソソーム内に蓄積された物質を取り除くように作用する。典型的にはリソソーム酵素補充療法が効果的であり、治療用酵素が、蓄積欠陥が現れる標的細胞の適切な細胞内のリソソームに運ばれる。
【0037】
平衡化するまたは平衡化:クロマトグラフィーに関係する用語「平衡化する」または「平衡化」は、本明細書で使用するとき、最初の液体(例えば、緩衝液)を別のもので調和をとるプロセスを意味し、通常、液体(例えば、緩衝液)の成分の安定および均等な分布を達成することを意味する。例えば、いくつかの実施形態では、1つ以上のカラム容量の望ましい液体(例えば、緩衝液)を、カラムを通過させることによって、クロマトカラムを平衡化してもよい。
【0038】
改善する、増加するまたは減少する:用語「改善する」、「増加する」、若しくは「減少する」、または文法的に等価な用語は、本明細書で使用するとき、本明細書に記載の治療を開始する前の同じ個体の測定、または本明細書に記載の治療のない対照個体(若しくは複数の対照個体)の測定等の基線測定に関連がある値を示す。「対照個体」は、治療を受けている個体と同じ形態のリソソーム蓄積病に苦しむ個体であり、(治療を受けている個体と対照個体の疾患のステージを確実に比較できるように)治療を受けている個体とほぼ同じ年齢である。
【0039】
不純物:用語「不純物」は、本明細書で使用するとき、限定された量の液体、気体、または固体内の物質を意味し、標的物質または化合物の化学組成物とは異なる。不純物は汚染物としても意味する。
【0040】
リンカー:用語「リンカー」は、本明細書で使用するとき、融合タンパク質内の自然のタンパク質内の特定の位置に現れるものではないアミノ酸配列を意味し、通常、2つのタンパク質部分の間のαヘリックス等の構造に柔軟でありまたは挿入するように設計される。リンカーはスペーサーとしても意味する。
【0041】
負荷する:用語「負荷する」は、本明細書で使用するとき、クロマトグラフィー中にカラムに試料を含む液体または固体を加えることを意味する。いくつかの実施形態では、カラムに負荷された試料の特定の成分は、負荷された試料として捉えられ、カラムを通過する。いくつかの実施形態では、カラムに負荷された試料の特定の成分は、カラムによって捉えられず、または「素通り」し、負荷された試料としてのカラムは、カラムを通過する。
【0042】
ポリペプチド:用語「ポリペプチド」は、通常言われるように、ペプチド結合によって互いに結合された少なくとも2つのアミノ酸のひもである。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは少なくとも3~5個のアミノ酸を含み得、そのそれぞれが、少なくとも1つのペプチド結合によって他と結合する。当業者は、ポリペプチドは、「天然ではない」アミノ酸、またはさもなければ、ポリペプチド鎖に取り込むこともできるその他の実体を含むことがあることを理解するだろう。
【0043】
プールする:クロマトグラフィーに関係する用語「プールする」は、本明細書で使用するとき、カラムを一緒に通過した液体の1つ以上の画分を組み合わせることを意味する。例えば、いくつかの実施形態では、クロマトグラフィーによって分離された試料の望ましい成分を含有する1つ以上の画分(例えば、「ピーク画分」)は、一緒に「プールする」ことができ、単一の「プールされた」画分を生み出す。
【0044】
置換酵素:用語「置換酵素」は、本明細書で使用するとき、治療対象の疾患で酵素が欠損または喪失した酵素を少なくとも部分的に置換するように作用することができる酵素を意味する。いくつかの実施形態では、用語「置換酵素」は、治療対象のリソソーム蓄積疾患で酵素が欠損または喪失した酵素を少なくとも部分的に置換するように作用することができる酵素を意味する。いくつかの実施形態では、置換酵素は、哺乳類のリソソームに蓄積された物質を減少することができ、または1つ以上のリソソーム蓄積疾患の症状を救うまたは寛解させることができる。本発明に適した置換酵素として野生型または改変型リソソーム酵素の両方が挙げられ、組換えおよび合成方法を使用して製造することができ、または天然資源から精製することができる。置換酵素は、組換えの、合成の、遺伝的に活性のまたは天然の酵素であってよい。
【0045】
可溶性の:用語「可溶性の」は、本明細書で使用するとき、治療薬が均一な溶液を形成する能力を意味する。いくつかの実施形態では、溶液中の治療薬の可溶性は、投与され、およびそれによって活性の標的部位に輸送される治療薬が、治療有効量の治療薬が活性の標的部位に送達できるのに十分である。いくつかの因子が治療薬の可溶性に影響を与える可能性がある。例えば、タンパク質の可溶性に影響し得る関連因子として、イオン強度、アミノ酸配列およびその他の一緒に可溶する薬剤または塩類(例えば、カルシウム塩)の存在が挙げられる。いくつかの実施形態では、本発明に記載の治療薬は、対応する医薬組成物に可溶性である。
【0046】
安定性:用語「安定の」は、本明細書で使用するとき、拡張した時間にわたって、治療薬(例えば、組換え酵素)が治療効果(例えば、全て、または大部分の意図される生物学的活性および/または生理化学的統一性)を維持する能力を意味する。治療薬の安定性、および当該治療薬の安定性を維持するための医薬組成物の能力は、拡張した時間(例えば、少なくとも、1、3、6、12、18、24、30、36ヶ月以上の間)にわたって評価してもよい。製剤の文脈で、安定した製剤は、治療薬が保管時、および(凍結/溶解、機械的混合および凍結乾燥等の)加工中に物理的および/または化学的統一性および生物学的活性を本質的に保持している剤である。タンパク質の安定性について、高分子量(HMW)凝集物の形成、酵素活性の喪失、ペプチド断片の発生および電荷特性の変化によって測定することができる。
【0047】
ウイルスプロセッシング:用語「ウイルスプロセッシング」は、本明細書で使用するとき、ウイルスが試料から単純に取り除かれる「ウイルス除去」、またはウイルスが試料中に存在するが、感染しない形態にある「ウイルス不活性化」を意味する。いくつかの実施形態では、ウイルス除去は、数ある中でもナノ濾過法および/またはクロマトグラフィーの手技を用いてもよい。いくつかの実施形態では、ウイルス不活性化は、数ある中でも、溶媒不活性化、洗剤不活性化、低温殺菌法、酸性pH不活性化および/または紫外線不活性化を用いてもよい。
【0048】
(発明の詳細な説明)
本発明は、とりわけ、6つ未満のクロマトグラフィーステップを含むプロセスに基づいて、酵素補充療法のために、組換えI2Sタンパク質を精製する改善された方法を提供する。いくつかの実施形態では、本発明は、アニオン交換クロマトグラフィー、カチオン交換クロマトグラフィー、混合モードクロマトグラフィー、および疎水性相互作用クロマトグラフィーの1つ以上に基づくプロセスを使用して不純調製物から組換えI2Sタンパク質を精製する方法を提供する。いくつかの実施形態では、本発明は、Qクロマトグラフィー、ヒドロキシアパタイト(HA)クロマトグラフィー、SPクロマトグラフィー、およびフェニルクロマトグラフィーを実施することによって、不純調製物から組換えI2Sタンパク質を精製する方法を提供する。本発明は精製された組換えI2Sタンパク質およびその使用をさらに提供する。
【0049】
以下の小節にて本発明の種々の態様をさらに詳細に説明する。小節の使用は本発明を限定するものではない。各小節は本発明の任意の態様に適用され得る。本出願では「又は」の使用は、言及されない限り、「及び/又は」を意味する。
【0050】
組換えI2Sタンパク質
本明細書で使用されるとき、I2Sタンパク質は、天然に存在するイズロン酸-2-スルファターゼ(I2S)タンパク質の少なくとも部分的な活性と置き換わることができる又はI2S欠損に関連した1以上の表現型若しくは症状を救済することができるタンパク質又はタンパク質の一部である。本明細書で使用されるとき、用語「I2S酵素」及び「I2Sタンパク質」及び文法的な同等物は交換可能に使用される。
【0051】
通常、ヒトのI2Sタンパク質は前駆体形態として産生される。ヒトI2Sの前駆体形態は、シグナルペプチド(完全長前駆体のアミノ酸残基1~25)と、プロペプチド(完全長前駆体のアミノ酸残基26~33)と、さらに42kDaの鎖(完全長前駆体の残基34~455)にプロセシングされ得る鎖(完全長前駆体の残基34~550)と、14kDaの鎖(完全長前駆体の残基446~550)を含有する。通常、前駆体形態は、550のアミノ酸を含有する完全長前駆体又は完全長I2Sタンパク質とも呼ばれる。通常野生型の又は天然の存在するヒトのI2Sタンパク質のシグナルペプチドが除去された成熟形態(配列番号1)及び完全長前駆体(配列番号2)のアミノ酸配列を表1に示す。シグナルペプチドには下線を引く。加えて、ヒトI2Sタンパク質アイソフォームa及びbの前駆体のアミノ酸配列もそれぞれ、表1の配列番号3及び4にて提供する。
【0052】
【表1-1】

【表1-2】
【0053】
従って、いくつかの実施形態では、組換えI2Sタンパク質はヒトの成熟I2Sタンパク質(配列番号1)である。本明細書で開示されるとき、配列番号1はヒトのI2Sタンパク質の標準的なアミノ酸配列を表す。いくつかの実施形態では、I2Sタンパク質は、I2S遺伝子の5’UTR内での選択的出発部位での転写の結果生じる配列番号1のスプライスアイソフォーム及び/又は変異体であってもよい。いくつかの実施形態では、好適な組換えI2Sタンパク質はヒトの成熟I2Sタンパク質の同族体又は類似体であってもよい。たとえば、ヒトの成熟I2Sタンパク質の同族体又は類似体は、野生型の又は天然に存在するI2Sタンパク質(たとえば、配列番号1)に比べて1以上のアミノ酸の置換、欠失及び/又は挿入を含有するが、実質的なI2Sタンパク質の活性を保持する修飾されたヒトの成熟I2Sタンパク質であってもよい。従って、いくつかの実施形態では、組換えI2Sタンパク質は、ヒトの成熟I2Sタンパク質(配列番号1)に実質的に相同である。いくつかの実施形態では、組換えI2Sタンパク質は、配列番号1に対して少なくとも50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%以上相同であるアミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、組換えI2Sタンパク質は、ヒトの成熟I2Sタンパク質(配列番号1)と実質的に同一である。いくつかの実施形態では、組換えI2Sタンパク質は、配列番号1に対して少なくとも50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%以上同一であるアミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、組換えI2Sタンパク質は、ヒトの成熟I2Sタンパク質の断片又は一部を含有する。
【0054】
或いは、組換えI2Sタンパク質は完全長のI2Sタンパク質である。いくつかの実施形態では、組換えI2Sタンパク質は完全長のヒトI2Sタンパク質の同族体又は類似体であってもよい。たとえば、完全長のヒトI2Sタンパク質の同族体又は類似体は、野生型の又は天然に存在する完全長のI2Sタンパク質に比べて1以上のアミノ酸の置換、欠失及び/又は挿入を含有するが、実質的なI2Sタンパク質の活性を保持する修飾された完全長のヒトI2Sタンパク質であってもよい。従って、いくつかの実施形態では、組換えI2Sタンパク質は完全長のヒトI2Sタンパク質(配列番号2)に対して実質的に相同である。例えば、組換えI2Sタンパク質は、配列番号2に対して少なくとも50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%以上相同であるアミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、組換えI2Sタンパク質は配列番号2と実質的に同一である。例えば、組換えI2Sタンパク質は、配列番号2に対して少なくとも50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%以上同一であるアミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、組換えI2Sタンパク質はヒトの完全長のI2Sタンパク質の断片又は一部を含有する。本明細書で使用されるとき、完全長のI2Sタンパク質は通常シグナルペプチド配列を含有する。
【0055】
いくつかの実施形態では、組換えI2Sタンパク質はヒトのI2Sアイソフォームaタンパク質である。いくつかの実施形態では、組換えI2Sタンパク質はヒトのI2Sアイソフォームaタンパク質の同族体又は類似体であってもよい。たとえば、ヒトのI2Sアイソフォームaタンパク質の同族体又は類似体は、野生型の又は天然に存在するヒトのI2Sアイソフォームaタンパク質(たとえば、配列番号3)に比べて1以上のアミノ酸の置換、欠失及び/又は挿入を含有するが、実質的なI2Sタンパク質の活性を保持する修飾されたヒトのI2Sアイソフォームaタンパク質であってもよい。従って、いくつかの実施形態では、組換えI2Sタンパク質はヒトのI2Sアイソフォームaタンパク質(配列番号3)に対して実質的に相同である。例えば、組換えI2Sタンパク質は、配列番号3に対して少なくとも50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%以上相同であるアミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、組換えI2Sタンパク質は、配列番号3と実質的に同一である。例えば、組換えI2Sタンパク質は、配列番号3に対して少なくとも50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%以上同一であるアミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、組換えI2Sタンパク質はヒトのI2Sアイソフォームaタンパク質の断片又は一部を含有する。本明細書で使用されるとき、ヒトのI2Sアイソフォームaタンパク質は通常シグナルペプチド配列を含有する。
【0056】
いくつかの実施形態では、組換えI2Sタンパク質はヒトのI2Sアイソフォームbタンパク質である。いくつかの実施形態では、組換えI2Sタンパク質はヒトのI2Sアイソフォームbタンパク質の同族体又は類似体であってもよい。たとえば、ヒトのI2Sアイソフォームbタンパク質の同族体又は類似体は、野生型の又は天然に存在するヒトのI2Sアイソフォームbタンパク質(たとえば、配列番号4)に比べて1以上のアミノ酸の置換、欠失及び/又は挿入を含有するが、実質的なI2Sタンパク質の活性を保持する修飾されたヒトのI2Sアイソフォームbタンパク質であってもよい。従って、いくつかの実施形態では、組換えI2Sタンパク質はヒトのI2Sアイソフォームbタンパク質(配列番号4)に対して実質的に相同である。例えば、組換えI2Sタンパク質は、配列番号4に対して少なくとも50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%以上相同であるアミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、組換えI2Sタンパク質は、配列番号4と実質的に同一である。例えば、組換えI2Sタンパク質は、配列番号4に対して少なくとも50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%以上同一であるアミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、組換えI2Sタンパク質はヒトのI2Sアイソフォームbタンパク質の断片又は一部を含有する。本明細書で使用されるとき、ヒトのI2Sアイソフォームbタンパク質は通常シグナルペプチド配列を含有する。
【0057】
ヒトのI2Sタンパク質の同族体又は類似体は、そのような方法を蓄積する参考文献にて見いだされるような当業者に既知のポリペプチド配列を変える方法に従って調製することができる。いくつかの実施形態では、アミノ酸の保存的置換には、以下の群:(a)M、I、L、V;(b)F、Y、W;(c)K、R、H;(d)A、G;(e)S、T;(f)Q、N;及び(g)E、Dの範囲内でのアミノ酸の間で行われる置換が挙げられる。いくつかの実施形態では、「保存的なアミノ酸の置換」は、アミノ酸置換が行われるタンパク質の相対電荷又はサイズ特性を変えないアミノ酸の置換を指す。
【0058】
いくつかの実施形態では、組換えI2Sタンパク質は、標的細胞の表面上の受容体に結合して細胞の取り込み及び/又はリソソームの標的化を促進する部分を含有してもよい。たとえば、そのような受容体は、マンノース-6-リン酸(M6P)残基を結合するカチオン依存性のマンノース-6-リン酸受容体(CI-MPR)であり得る。加えて、CI-MPRはIGF-IIを含む他のタンパク質も結合する。いくつかの実施形態では、組換えI2Sタンパク質は、タンパク質の表面にM6P残基を含む。具体的には、組換えI2Sタンパク質はCI-MPRにもっと高い結合親和性を有するビスリン酸化オリゴ糖を含有していてもよい。いくつかの実施形態では、適切な酵素は、1酵素あたり、最大、おおよそ平均の少なくとも約20%のビスリン酸化オリゴ糖を含有する。他の実施形態では、適切な酵素は、1酵素あたり、約10%、15%、18%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%のビスリン酸化オリゴ糖を含有してもよい。
【0059】
いくつかの実施形態では、組換えI2S酵素は、標的細胞の表面で受容体に結合することができるリソソーム標的部分と融合してもよい。好適なリソソーム標的化部分は、IGF-I、IGF-II、RAP、p97、及びその変異体、同族体又は断片(たとえば、ヒトの野生型成熟IGF-I、IGF-II、RAP、p97ペプチド配列に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%又は95%同一である配列を有するそれらのペプチドを含む)であり得る。リソソーム標的部分は、N末端、C末端または内部で、I2Sタンパク質または酵素と結合または融合してもよい。
【0060】
組換えI2Sタンパク質の製造
本発明は、様々な方法で製造される組換えI2Sタンパク質を精製するために使用してよい。例えば、I2Sタンパク質は、I2Sをコードする核酸を発現するように操作された宿主細胞系を使用することによって、組換えて製造されてもよい。あるいは、I2Sタンパク質を、内因性I2S遺伝子を活性化することによって、製造してもよい。
【0061】
本発明は、様々な発現系を使用して製造される組換えI2Sタンパク質を精製するために使用してもよいことが理解される。適切な発現系として、例えば、卵、バキュロウイルス、植物、イースト、または哺乳類細胞が挙げられる。
【0062】
いくつかの実施形態では、I2S酵素は、哺乳類細胞で製造される。本発明に従い使用してもよい哺乳類細胞の非限定的な例として、BALB/cマウス骨髄種株(NSO/l、ECACC No:85110503);ヒト網膜芽細胞(PER.C6、CruCell、Leiden、The Netherlands);SV40(COS-7、ATCC CRL 1651)によって形質移入されたサル腎CV1株;ヒト胚腎臓株(懸濁培養中で増殖のためにサブクローンされたHEK293または293細胞、Grahamら、J.Gen Virol.、36:59,1977);ヒト繊維肉腫細胞株(例えば、HT1080);ベビーハムスター腎細胞(BHK21、ATCC CCL 10);チャイニーズハムスター卵巣細胞 +/-DHFR(CHO、Urlaub and Chasin、Proc.Natl.Acad.Sci.USA、77:4216、1980);マウスセルトリ細胞(TM4、Mather、Biol.Reprod.、23:243-251、1980);サル腎培養細胞(CV1 ATCC CCL 70);アフリカミドリザル腎培養細胞(VERO-76、ATCC CRL-1 587);ヒト頚部癌細胞(HeLa、ATCC CCL 2);イヌ腎細胞(MDCK、ATCC CCL 34);buffaloラット肝細胞(BRL 3A、ATCC CRL 1442);ヒト肺細胞(W138、ATCC CCL 75);ヒト肝臓細胞(Hep G2、HB 8065);マウス乳癌(MMT 060562、ATCC CCL51);TRI細胞(Matherら、Annals N.Y. Acad.Sci.、383:44-68、1982);MRC5細胞;FS4細胞;およびヒト肝細胞腫株(Hep G2)が挙げられる。
【0063】
いくつかの実施形態では、本発明に記載の発明の方法は、ヒト細胞(例えば、HT1080)から製造された組換えI2S酵素を精製するために使用される。いくつかの実施形態では、本発明に記載の発明の方法は、CHO細胞から製造された組換えI2S酵素を精製するために使用される。
【0064】
典型的に、組換えI2Sを発現するために操作される細胞は、本明細書に記載の組換えI2Sタンパク質をコードする導入遺伝子を含んでもよい。組換えI2Sをコードする核酸は、制御配列、遺伝子制御配列、プロモーター、非コード配列および/または組換えI2Sを発現するためのその他の適切な配列を含んでよい。典型的に、コード領域は、1つ以上のこれらの核酸成分と操作可能に結合される。
【0065】
「制御配列」は典型的にコード配列の上流(5'非コード配列)、その中、または下流(3'非コード配列)に位置されるヌクレオチド配列を意味し、転写、RNAプロセッシング若しくは安定性、または関連するコード配列の翻訳に影響する。制御配列として、プロモーター、翻訳リーダー配列、イントロン、およびポリアデニル化認識配列が挙げられる。「制御配列」は、「遺伝子制御配列」としても意味することがある。
【0066】
「プロモーター」は典型的にコード配列または機能RNAの発現を制御することができるヌクレオチド配列を意味する。通常、コード配列はプロモーター配列の3位に位置される。プロモーター配列は、近位または遠位の上流要素から成り、後者の要素はエンハンサーと呼ばれることが多い。したがって、「エンハンサー」は、プロモーター活性を刺激することができるヌクレオチド配列であり、生得的なプロモーターの要素またはプロモーターのレベルまたは組織特異性を高めるために挿入された異種性要素であってもよい。プロモーターは全体的に、野生型の遺伝子に由来してもよいし、または自然に認められる異なるプロモーターに由来する異なる要素から構成されてもよいし、または合成ヌクレオチド断片を含んでいてもよい。異なるプロモーターが、異なる組織または細胞型で、または発現の異なる段階で、または異なる環境条件に反応して、遺伝子の発現を方向付けてもよいことを当業者は理解する。
【0067】
「3'非コード配列」は、典型的にコード配列の下流に位置されるヌクレオチド配列を意味し、ポリアデニル化認識配列およびmRNAプロセッシングまたは遺伝子発現に影響を及ぼすことのできる制御シグナルをコードするその他の配列が挙げられる。ポリアデニル化シグナルはたいていmRNA前駆体の3'末端へのポリアデニル酸のトクラトの添加に影響することを特徴とする。
【0068】
「翻訳リーダー配列」または「5'非翻訳配列」は典型的に遺伝子のプロモーター配列とコード配列の間に位置されるヌクレオチド配列を意味する。翻訳リーダー配列は、翻訳開始配列の完全に加工されたmRNA上流に存在する。翻訳リーダー配列は、mRNA、mRNA安定性または翻訳効率に対する一次転写のプロセッシングに影響を与え得る。
【0069】
典型的に、用語「操作可能に結合される」は、1つの機能が他によって影響を受けるように、単一の核酸断片上の2つ以上の核酸断片の結合を意味する。例えば、プロモーターは、コード配列の発現に影響を及ぼすことができる(いわゆるコード配列がプロモーターの転写制御下にある)とき、コード配列と操作可能に結合される。コード配列は、センスまたはアンチセンス方向の制御配列に操作可能に結合することができる。
【0070】
導入遺伝子のコード領域は、特定の細胞型についてのコドンの使用を最適化するために、1つ以上のサイレント変異を含んでいてもよい。例えば、I2S導入遺伝子のコドンを、脊椎動物細胞の発現のために最適化してもよい。いくつかの実施形態では、I2S導入遺伝子のコドンを、哺乳類細胞の発現のために最適化してもよい。いくつかの実施形態では、I2S導入遺伝子のコドンを、ヒト細胞の発現のために最適化してもよい。
【0071】
構築物は以下の1つ以上の追加の成分を含んでいてもよい。以下、スプライス部位、エンハンサー配列、適切なプロモーター下の選択可能な標識遺伝子、適切なプロモーター下の増幅可能なマーカー遺伝子、およびマトリックス結合領域(MAR)または挿入された領域の発現を高める当業者に周知のその他の要素。
【0072】
宿主細胞に形質移入または形質導入されると、適切なベクターは染色体外に(エピソームに)発現することができ、または宿主細胞のゲノムに組み込まれる。
【0073】
組換えI2Sタンパク質の活性化
典型的に、組換えI2S酵素は、2-アミノ-3-オキソプロピオン酸またはオキソ-アラニンとしても知られるホルミルグリシンに保存されたシステイン(成熟したヒトI2Sのアミノ酸59位に相当する)を翻訳後修飾することによって活性化する。当該翻訳後修飾は、ホルミルグリシン生成酵素(FGE)として知られる酵素によって行うことができる。したがって、いくつかの実施形態では、組換えI2S酵素は、FGEタンパク質も発現する細胞内で製造される。特定の実施形態では、組換えI2S酵素は、FGEタンパク質の発現を増加させる、または高める細胞で製造する。例えば、細胞を操作して、組換えI2Sと組み合わせてFGEを過剰発現し、高いレベルの活性酵素を有するI2Sの調製物を製造することを促進してもよい。いくつかの実施形態では、FGEの過剰発現は、標準的な組換え技術を用いて外因性FGEを発現する(例えば、過剰発現)ことによって達成される。いくつかの実施形態では、FGEの過剰発現は、例えば外因性FGE遺伝子のプロモーターを活性化し、または高めることによって、外因性FGEの発現を活性化し、または高めることによって達成される。いくつかの場合では、例えば、組換えI2Sをコードする核酸および組換えFGEタンパク質をコードする核酸は、内部のリボソームエントリー領域に対応する配列を有する核酸(例えば、スペーサー配列)によって結合される。
【0074】
システインをホルミルグリシンに転換する能力を有するFGEを本発明に使用してよい。FGEタンパク質について例示的な核酸およびアミノ酸配列を米国特許第2004-0229250号に開示し、当該配列に関係する内容の全体および配列それ自体は、その全体が参照により本明細書に取り込まれる。組換えFGEをコードする核酸が制御配列、遺伝子制御配列、プロモーター、非コード配列および/またはFGEを発現するためのその他の適切な配列を含んでよい。典型的に、コード領域は、1つ以上のこれらの核酸成分と操作可能に結合される。
【0075】
細胞培養の培地及び条件
種々の細胞培養の培地及び条件を用いて、組換えI2Sタンパク質を製造し得る。たとえば、血清含有培地又は無血清培地にて組換えI2Sタンパク質を産生させ得る。いくつかの実施形態では、無血清培地にて組換えI2Sタンパク質を産生させ得る。いくつかの実施形態では、動物成分を含まない培地、すなわち、動物由来の成分を欠く培地にて組換えI2Sタンパク質を産生させ得る。いくつかの実施形態では、既知組成培地にて組換えI2Sタンパク質を産生させ得る。本明細書で使用されるとき、用語「既知組成培地」は化学的な成分の実質的にすべてが知られる培地を指す。いくつかの実施形態では、既知組成培地は、たとえば、血清、血清由来のタンパク質(たとえば、アルブミン又はフェチュイン)及び他の成分を含まない。場合によっては、化学的に定義された培地は1以上のタンパク質(たとえば、タンパク質の増殖因子又はサイトカイン)を含む。場合によっては、既知組成培地は1以上のタンパク質の加水分解物を含む。他の場合では、既知組成培地はタンパク質を含まない培地、すなわち、タンパク質、加水分解物又は未知の組成物の成分を含有しない無血清培地である。
【0076】
いくつかの実施形態では、既知組成培地は1以上の動物に由来する成分によって補完され得る。そのような動物に由来する成分には、ウシ胎児血清、ウマ血清、ヤギ血清、ロバ血清、ヒト血清及びたとえば、アルブミンのような血清に由来するタンパク質(たとえば、ウシ血清アルブミン又はヒト血清アルブミン)が挙げられるが、これらに限定されない。
【0077】
ローラーボトル培養、バイオリアクターバッチ培養及びバイオリアクター流加培養を含むが、これらに限定されない種々の細胞培養条件を用いて組換えI2Sタンパク質を大規模に製造し得る。いくつかの実施形態では、懸濁液で培養される細胞によって組換えI2Sタンパク質が産生される。いくつかの実施形態では、接着性細胞によって組換えI2Sタンパク質が産生される。
【0078】
例となる細胞培地及び培養条件は実施例の項で記載する。組換えI2Sタンパク質を作出するための追加の例となる方法及び組成物は、同日付で同封して出願された「組換えイズロン酸-2-スルファターゼを作出するための方法及び組成物」と題する仮特許出願にて記載されており、参照によってその開示全体が本明細書に組み入れられる。
【0079】
組換えI2Sタンパク質の精製
いくつかの実施形態では、本発明は、アニオン交換クロマトグラフィー、カチオン交換クロマトグラフィー、混合モードクロマトグラフィー、および疎水性相互作用クロマトグラフィーの1つ以上に基づくプロセスを用いて、不純調製物から組換えI2Sタンパク質を精製する方法を提供する。いくつかの実施形態では、本発明に記載の発明の方法は、6つ未満(例えば、5つ未満、4つ未満または3つ未満)のクロマトグラフィーのステップを伴う。いくつかの実施形態では、本発明に記載の発明の方法は、2、3、4または5つのクロマトグラフィーのステップを伴う。いくつかの実施形態では、本発明に記載の発明の方法は、4つのクロマトグラフィーのステップを伴う。いくつかの実施形態では、本発明に記載の発明の方法は、アニオン交換クロマトグラフィー、混合モードクロマトグラフィー、カチオン交換クロマトグラフィー、および疎水性相互作用クロマトグラフィーをこの順序で実施する。
【0080】
不純調製物
不純調製物は、本明細書で使用するとき、組換えI2Sタンパク質を含有する加工されていない生体物質を含む生体物質であってもよい。例えば、不純調製物は、I2Sタンパク質を製造する細胞(例えば、哺乳類細胞)から分泌される組み換えI2Sタンパク質を含有する未加工の細胞培養培地であっても、I2Sタンパク質を含有する生の細胞可溶物であってもよい。いくつかの実施形態では、不純調整物は、部分的に、未加工の細胞培養地または細胞可溶物であってもよい。例えば、細胞培地または細胞可溶物は、濃縮され、希釈され、ウイルス不活性化、ウイルスプロセッシング、またはウイルス除去の処理がなされていてもよい。いくつかの実施形態では、ウイルス除去は、数ある中でもナノ濾過法および/またはクロマトグラフィーの手技を用いてもよい。いくつかの実施形態では、ウイルス不活性化は、数ある中でも溶媒不活性化、洗剤不活性化、低温殺菌、酸性pH不活性化、および/または紫外線不活性化を用いてもよい。細胞培地または細胞可溶物は、プロテアーゼ、DNA分解酵素、および/またはRNA分解酵素で処理し、宿主細胞のタンパク質および/または核酸(例えば、DNAまたはRNA)のレベルを低下させてもよい。いくつかの実施形態では、加工されていないまたは部分的に加工された生体物質(例えば、細胞培地または細胞可溶物)を、精製のために、望ましい温度(例えば、2~8℃、-4℃、-25℃、-75℃)、望ましい期間に、凍結し保管し、溶解してもよい。本明細書で使用されるように、不純調製物は、出発材料または負荷材料としての意味もある。
【0081】
アニオン交換クロマトグラフィー
いくつかの実施形態では、組換えI2Sを精製するための提供される方法として、アニオン交換クロマトグラフィーが挙げられる。端的に、アニオン交換クロマトグラフィーは、負に電荷された化合物と正に電荷された樹脂の間の電荷-電荷相互作用に依存するクロマトグラフィーの手技である。いくつかの実施形態では、アニオン交換クロマトグラフィーは、強アニオン交換クロマトグラフィーである。いくつかの実施形態では、アニオン交換クロマトグラフィーは、治療用タンパク質(例えば、組換えI2S)の最初の精製ステップとして使用される。
【0082】
例示的なアニオン交換樹脂として、限定されないが、第4級アミン樹脂または「Q樹脂」(例えば、Capto(商標)-Q、Q-Sepharose(登録商標)、QAE Sephadex(登録商標));ジエチルアミノエタン(DEAE)樹脂(例えば、DEAE-Trisacryl(登録商標)、DEAE Sepharose(登録商標)、ベンゾイル化ナフトイル化DEAE、ジエチルアミノエチルSephacel(登録商標));Amberjet(登録商標)樹脂;Amberlyst(登録商標)樹脂;Amberlite(登録商標)樹脂(例えば、Amberlite(登録商標)IRA-67、Amberlite(登録商標)強塩基、Amberlite(登録商標)弱塩基)、コレスチラミン樹脂、ProPac(登録商標)樹脂(例えば、ProPac(登録商標)SAX-10、ProPac(登録商標)WAX-10、ProPac(登録商標)WCX-10);TSK-GEL(登録商標)樹脂(例えば、TSKgel DEAE-NPR;TSKgel DEAE-5PW);およびAcclaim(登録商標)樹脂が挙げられる。ある実施形態では、アニオン交換樹脂はQ樹脂である。
【0083】
アニオン性交換クロマトグラフィーの典型的な移動相として、水、アセトニトリル、メタノール、エタノール、およびイソプロパノール等の有機アルコール、または2-(N-モルホリノ)-エタンスルホン酸(MES)を含む溶液等の比較的極性の溶液が挙げられる。したがって、ある実施形態では、移動相は、約0%、1%、2%、4%、6%、8%、10%、12%、14%、16%、18%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または約100%の極性溶液が挙げられる。ある実施形態では、移動相は、分離の最中に所与の時間で、約1% ~約100%、約5%~約95%、約10%~約90%、約20%~約80%、約30%~約70%、または約40%~約60%の間の極性溶液を含む。
【0084】
通常、移動相は塩を含む。例えば、塩(例えば、塩化ナトリウム)は、アニオン交換カラムから結合されたタンパク質を溶離することができる(例えば、対イオンは塩化物であり、標的タンパク質について交換され、その後放出される)。いくつかの実施形態では、移動相は、約0~約1.0M、例えば、約0~約0.8M、約0~約0.6M、約0~約0.5M、約0~約0.4M、約0.05M~約0.50M、約0.10M~約0.45M、約0.10M~約0.40M、または約0.15M~約0.40Mの塩濃度を含む。いくつかの実施形態では、移動相は、約0.01M、0.02M、0.03M、0.04M、0.05M、0.06M、0.07M、0.08M、0.09M、0.1M、0.2M、0.3M、0.4M、0.5M、0.6M、0.7M、0.8M、0.9M、または1.0Mの塩濃度を含む。いくつかの実施形態では、移動相の塩濃度は勾配している(例えば、直線的または非直線的勾配)。いくつかの実施形態では、移動相の塩濃度は定常である。いくつかの実施形態では、移動相の塩濃度は、段階的に増加または減少してもよい。
【0085】
典型的に、移動相は緩衝される。ある実施形態では、移動相は緩衝されない。ある実施形態では、移動相は約5~約14のpHで緩衝される。ある実施形態では、移動相は約5~約10のpHで緩衝される。ある実施形態では、移動相は約5~約7のpHで緩衝される。ある実施形態では、移動相は約6.5のpHで緩衝される。ある実施形態では、移動相は約5.0、5.5、6.0、6.5、7.0、7.5、8.0、8.5、9.0、9.5、または10のpHで緩衝される。
【0086】
いくつかの実施形態では、不純調製物または中間溶離物または通過画分は、アニオン交換クロマトグラフィーのカラム(例えば、Qカラム)に負荷する前に、約5.0、5.5、6.0、6.5、7.0または7.5のpHおよび約2mS/cm、4mS/cm、6mS/cm、8mS/cm、10mS/cm、12mS/cm、14mS/cm、16mS/cm、18mS/cm、または20mS/cmの伝導率に調整される。pHは酢酸ナトリウム(例えば1M)を使用して調整され、伝導率は塩化ナトリウム(例えば5M)を使用して調整される。一度負荷されると、アニオン交換クロマトグラフィーのカラムは、約140mM~約200mM(例えば、約140mM、145mM、150mM、155mM、160mM、165mM、170mM、175mM、180mM、185mM、190mM、195mM、または200mM)の範囲の塩(例えばNaCl)濃度、約5.0~7.5(例えば、約5.0、5.5、6.0、6.5、7.0または7.5)のpHを含む洗浄緩衝液を使用して洗浄してもよい。アニオン交換クロマトグラフィーのカラムは、直線的NaCl勾配を含む溶離緩衝液を用いて溶離されてもよい。適した例示的な直線的NaCl勾配は、約0~500mMのNaCl(例えば、約0~400mM、約0~350mM、約0~300mM、約50~500mM、約150~500mM、約150~450mM、約150~400mM)の範囲を含むことができる。
【0087】
カチオン交換クロマトグラフィー
いくつかの実施形態では、組換えI2Sを精製するために提供される方法として、カチオン交換クロマトグラフィーが挙げられる。端的に、カチオン交換クロマトグラフィーは、正に電荷された化合物と負に電荷された樹脂の間の電荷-電荷相互作用に依存するクロマトグラフィーの手技である。いくつかの実施形態では、カチオン交換クロマトグラフィーは強カチオン交換クロマトグラフィーである。
【0088】
カチオン交換クロマトグラフィーは、通常、強カチオンまたは弱カチオン交換カラムのいずれかで実施され、スルホニウムイオンを含有し、またはカルボキシメチル(CM)若しくはカルボン酸塩(CX)官能基を通常含む弱カチオン交換器で実施される。多くの適切なカチオン交換樹脂は当該技術分野で周知であり、市販されており、限定されないが、SP-Sepharose(登録商標)、CM Sepharose(登録商標);Am
berjet(登録商標)樹脂;Amberlyst(登録商標)樹脂;Amberlite(登録商標)樹脂(例えば、Amberlite(登録商標)IRA120);ProPac(登録商標)樹脂(例えば、ProPac(登録商標)SCX-10、ProPac(登録商標)WCX-10、ProPac(登録商標)WCX-10);TSK-GEL(登録商標)樹脂(例えば、TSKgel BioAssist S;TSKgel SP-2SW、TSKgel SP-5PW;TSKgel SP-NPR;TSKgel SCX;TSKgel SP-STAT;TSKgel CM-5PW;TSKgel OApak-A;TSKgel CM-2SW、TSKgel CM-3SW、およびTSKgel CM-STAT);並びにAcclaim(登録商標)樹脂が挙げられる。ある実施形態では、アニオン交換樹脂はSP-Sepharose樹脂(登録商標)である。
【0089】
カチオン交換クロマトグラフィーの典型的な移動相として、水、アセトニトリル、メタノール、エタノール、およびイソプロパノール等の有機アルコール、または2-(N-モルホリノ)-エタンスルホン酸(MES)を含む溶液等の比較的極性の溶液が挙げられる。したがって、ある実施形態では、移動相は、約0%、1%、2%、4%、6%、8%、10%、12%、14%、16%、18%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または約100%の極性溶液を含む。ある実施形態では、移動相は、分離の最中に所与の時間で、約1%~約100%、約5%~約95%、約10%~約90%、約20%~約80%、約30%~約70%、または約40%~約60%の極性溶液を含む。
【0090】
通常、移動相は塩を含む。例えば、塩(例えば、塩化ナトリウム、リン酸ナトリウム等)はカチオン交換カラムから結合されたタンパク質を溶離することができる(例えば、対イオンはナトリウムであり、標的タンパク質について交換され、その後放出される)。いくつかの実施形態では、移動相は、約0~約1.0M、例えば、約0~約0.8M、約0~約0.6M、約0~約0.5M、約0~約0.4M、約0.05M~約0.50M、約0.10M~約0.45M、約0.10M~約0.40M、または約0.15M~約0.40Mの範囲の濃度の塩を含む。いくつかの実施形態では、移動相は、約0.01M、0.02M、0.03M、0.04M、0.05M、0.06M、0.07M、0.08M、0.09M、0.1M、0.2M、0.3M、0.4M、0.5M、0.6M、0.7M、0.8M、0.9M、または1.0Mの濃度の塩を含む。いくつかの実施形態では、移動相の塩濃度は勾配(例えば直線的勾配または非直線的勾配)である。いくつかの実施形態では、移動相の塩濃度は定常である。いくつかの実施形態では、移動相の塩濃度は段階的に増加させても、減少させてもよい。
【0091】
典型的に移動相は緩衝される。ある実施形態では、移動相は緩衝されない。ある実施形態では、移動相は、約5~約14のpHに緩衝される。ある実施形態では、移動相は、約5~約10のpHに緩衝される。ある実施形態では、移動相は、約5~約7のpHに緩衝される。ある実施形態では、移動相は、約6.5のpHに緩衝される。ある実施形態では、移動相は、約5.0、5.5、6.0、6.5、7.0、7.5、8.0、8.5、9.0、9.5、または10のpHに緩衝される。
【0092】
いくつかの実施形態では、不純調製物または中間溶離物または通過画分は、カチオン交換クロマトグラフィーのカラム(SPカラム)に負荷される前に、約1mS/cm~20mS/cm(例えば、約1mS/cm~15mS/cm、約1mS/cm ~10mS/cm、約1mS/cm~8mS/cm、約1mS/cm~6mS/cm、約1mS/cm~4mS/cm、約2mS/cm~4mS/cm)の範囲の伝導率に調整される。特定の実施形態では、不純調製物または中間溶離物または通過画分は、カチオン交換クロマトグラフィーのカラム(SPカラム)に負荷される前に、約2mS/cm~4mS/cm(例えば、2、2.5、3、3.5、または4mS/cm)の範囲の伝導率に調整される。伝導率はHOで、例えば、1:1、1.1:1、1.2:1、1.3:1、1.4:1、1.5:1、2.0:1、2.5:1、3.0:1、4.0:1、5.0:1、または10:1の比で不純調製物または中間溶離物または通過画分を希釈することによって調整される。伝導率は、また、望ましい緩衝液にダイアフィルトレーションすることによって調整してもよい。いくつかの実施形態では、カチオン交換クロマトグラフィーのカラムは、約5.0~6.5(例えば、約5.0、5.5、6.0または6.5)のpHで作動する。いくつかの実施形態では、カチオン交換クロマトグラフィーのカラムは、約0.01M~約0.1M(例えば、約0.01M、0.02M、0.03M、0.04M、0.05M、0.06M、0.07M、0.08M、0.09M、または0.1M)の範囲の濃度でリン酸塩(例えば、NaPO4)を含む緩衝液で作動する。いくつかの実施形態では、適切なpHは約5.0~6.5(例えば、約5.0、5.5、6.0、または6.5)である。
【0093】
混合モードクロマトグラフィー
ヒドロキシアパタイトクロマトグラフィー(HA)は、「偽親和性(pseudo-affinity)」クロマトグラフィーまたは「混合モード」イオン交換であると考えられ、本発明に従い使用してよい。ヒドロキシアパタイトは、生体分子の分画および精製に使用される固有の形態のリン酸カルシウムである。いくつかの場合では、結晶の脆弱性によって流速および/またはカラムの寿命に限界があるが、結晶性ヒドロキシアパタイトを使用してもよい。2つのタイプの化学的に純粋なセラミックスヒドロキシアパタイト、CHTセラミックスヒドロキシアパタイトI型およびII型はマクロ多孔性で、球状であり、高速の流速および高い圧力で使用することができる。I型は、通常、高いタンパク質結合能力があり、II型は、通常タンパク質についての結合能力が低い。通常、ヒドロキシアパタイトの公式はCa10(PO(OH)(Kawasakiら、1985)である。官能基は、正に電荷された対の結晶性のカルシウムイオン(C-部位)および三つ組の結晶性リン酸塩(P-部位)と結合した6つの負に電荷された酸素原子のクラスターを含む。C-部位、P-部位およびヒドロキシルは、結晶表面に固定されたパターンで分布し、通常、タンパク質およびその他の分子と複雑な相互作用をもたらす。
【0094】
中性または中性に近いpHで、イオン強度の低いリン酸塩緩衝液(例えば、1~10mMのリン酸ナトリウムまたはリン酸カリウム)中のHAカラムに、試料を負荷してもよい。いくつかの実施形態では、不純調製物または中間溶離物または通過画分を、混合モードクロマトグラフィーカラム(例えばHAカラム)に負荷する前に、約0.001M~約0.01M(例えば、約0.001M、0.002M、0.003M、0.004M、0.005M、0.006M、0.007M、0.008M、0.009M、または0.01M)の範囲のリン酸塩(例えば、NaPO4)濃度および約5.0~6.5(例えば、約5.0、5.5、6.0、または6.5)のpHに調整する。負荷されたHAカラムを、典型的に、付加している緩衝液のリン酸塩の濃度と比較することのできるリン酸塩濃度を有する洗浄緩衝液で洗浄する。いくつかの実施形態では、混合モードクロマトグラフィーカラム(例えばHAカラム)は、一度負荷されると、中性または中性に近いpHで、リン酸塩(例えば、1~10mMのリン酸ナトリウムまたはリン酸カリウム)を含む洗浄緩衝液で洗浄される。例えば、適切な洗浄緩衝液は、約1mM、2mM、3mM、4mM、5mM、6mM、7mM、8mM、9mM、または10mMのリン酸塩濃度を有してもよい。いくつかの実施形態では、洗浄緩衝液中のリン酸塩の量を増やし、よりストリンジェントな洗浄条件を作製することが望ましい。I2Sタンパク質の表面上のM6Pレベル、特にジ-M6Pレベルは、リソソーム標的に重要である。洗浄緩衝液中の増加したリン酸塩濃度は、選択的に、I2Sタンパク質を、高いレベルのM6P、特にHAカラム上のジ-M6Pで保持する。したがって、いくつかの実施形態では、望ましい洗浄緩衝液は、10mM、11mM、12mM、13mM、14mM、15mM、16mM、17mM、18mM、19mM、20mM超のリン酸塩濃度を有してよい。いくつかの実施形態では、負荷された混合モードクロマトグラフィーカラム(例えばHAカラム)は、約10~20mM(例えば、約10~18mM、10~16mM、10~15mM、12~20mM、14~18mM、14~16mM)の範囲のリン酸塩濃度を有する洗浄緩衝液で洗浄される。いくつかの実施形態では、負荷された負荷された混合モードクロマトグラフィーカラム(例えばHAカラム)は、10mM、11mM、12mM、13mM、14mM、15mM、16mM、17mM、18mM、19mM、20mM超のリン酸塩濃度を有する洗浄緩衝液で洗浄される。
【0095】
HAカラムからの溶離は、典型的に勾配リン酸塩緩衝液で達成される。例えば、適切な溶離緩衝液は、約1~400mM(例えば、1~300mM、1~200mM、1~150mM、1~100mM、10~350mM、10~300mM、10~250mM、10~200mM、10~150mM、10~140mM、10~130mM、10~120mM、10~110mM、10~100mM、10~90mM、10~80mM、10~70mM、10~60mM、10~50mM)のリン酸ナトリウムのリン酸塩の勾配を有してよい。いくつかの実施形態では、HAカラムからの溶離は、溶離緩衝液中のリン酸塩濃度を段階的に増加させることによって達成される。いくつかの実施形態では、段階的な溶離緩衝液は、10mM、20mM、30mM、40mM、50mM、60mM、70mM、80mM、90mM、100mM、110mM、120mM、130mM、140mM、150mM、200mM、250mM、300mM、350mM、400mMから選択されるリン酸塩濃度を有してよい。いくつかの実施形態では、混合モードクロマトグラフィーカラム(例えばHAカラム)からの溶離は、約50mM~約150mM(例えば、約50mM、60mM、70mM、80mM、90mM、100mM、110mM、120mM、130mM、140mM、150mM、およびその組み合わせのリン酸塩(例えば、リン酸ナトリウム)濃度から選択される)の範囲のリン酸塩(例えば、リン酸ナトリウム)濃度を有する溶離緩衝液によって達成される。
【0096】
HAクロマトグラフィーについての多くの異なる条件の組み合わせは周知であり、対象の特定のタンパク質(例えば、組み換えI2S)に適するように数値を調整して使用してよい。
【0097】
疎水性相互作用クロマトグラフィー
疎水性相互作用クロマトグラフィー(HIC)は、タンパク質を他から分離する疎水性の特性を使用する分離の手技である。このタイプのクロマトグラフィーでは、フェニル、オクチル、またはブチル等の疎水基が、固定カラムに結合する。表面に疎水性アミノ酸側鎖を有するカラムを通過するタンパク質は、カラム上で疎水基と相互作用し、結合する。HICカラムは周知であり、例えば、フェニルセファロースが挙げられる。
【0098】
HIC分離は、イオン交換クロマトグラフィーに使用される条件と反対の条件を用いて設計されることが多い。通常、強いイオン強度を持つ緩衝液、たいてい硫酸アンモニウムは、最初にカラムに適用される。緩衝液中の塩が、試料溶離物の溶媒和を減少させ、したがって、溶媒和が減少すると、曝露されるようになる疎水性領域が、培地によって吸収される。固相は通常、他の分子と疎水性の相互作用を形成するように設計される。相互作用は、通常、水中では弱すぎるが、塩(例えば、NaSO、KSO、(NHSO、NaCl、NHCl、NaBr、およびNaSCN)を緩衝液に追加することによって、疎水性の相互作用になる。いくつかの実施形態では、移動相は、約0.1M~約3.0M、例えば、約0.1M~約1.5M,約0.2M~約0.8M、または約0.3M~約0.5Mの塩濃度を含む。
【0099】
ある実施形態では、移動相は緩衝される。ある実施形態では、移動相は緩衝されない。ある実施形態では、移動相は約5~約14のpHで緩衝される。ある実施形態では、移動相は約5~約10のpHで緩衝される。ある実施形態では、移動相は約5~約7のpHで緩衝される。ある実施形態では、移動相約5.0のpHで緩衝される。
【0100】
いくつかの実施形態では、不純調製物または中間溶離物または通過画分は、疎水性相互作用クロマトグラフィー(例えば、フェニルカラム)に負荷される前に、約0.5M~約2.0M(例えば、約0.5M、1.0M、1.1M、1.2M、1.3M、1.4M、1.5M、1.6M、1.7M、1.8M、1.9M、または2.0M)の範囲の塩(例えば、NaCl)濃度に、約4.5~6.0のpHで調整される。一度負荷されると、疎水性相互作用クロマトグラフィーのカラムを、約0.5M~約2.0M(例えば、約0.5M、1.0M、1.1M、1.2M、1.3M、1.4M、1.5M、1.6M、1.7M、1.8M、1.9M、または2.0M)の範囲の塩(例えば、NaCl)濃度を含む洗浄緩衝液を用いて、約4.5~6.0(例えば、約4.5、5.0、5.5、または6.0)のpHで、洗浄してもよい。いくつかの実施形態では、疎水性相互作用クロマトグラフィーのカラムを、約0.1M~約0.5M(例えば、約0.1M、0.2M、0.3M、0.4M、または0.5M)の範囲の塩(例えば、NaCl)濃度を含む約4.5~6.0(例えば、約4.5、5.0、5.5、または6.0)の溶離緩衝液を用いて、約4.5~6.0(例えば、約4.5、5.0、5.5、または6.0)のpHで、溶離してもよい。
【0101】
精製されたI2Sのタンパク質の特徴付け
精製されたI2Sのタンパク質の特徴付けを様々な方法を用いて行ってよい。
【0102】
純度
精製された組換えI2Sのタンパク質の純度は、典型的に、最終産生物に存在する様々な不純物(例えば、宿主細胞タンパク質または宿主細胞DNA)のレベルによって測定される。例えば、宿主細胞タンパク質(HCP)のレベルはELISAまたはSDS-PAGEによって測定してよい。いくつかの実施形態では、精製された組換えI2Sのタンパク質は、150ng HCP/mg未満のI2Sタンパク質(例えば、140、130、120、110、100、90、80、70、60、50、40、30、30、20、10ng HCP/mg未満のI2Sタンパク質)を含有する。いくつかの実施形態では、精製された組換えI2Sのタンパク質は、銀染色のSDS-PAGEに供すると、0.05%、0.01%、0.15%、0.2%、0.25%、0.3%、0.35%、0.4%、0.45%、または0.5%超のアッセイ対照の強度で新しい結合を有しない。様々なアッセイ対照、特にFDA等の制御剤に許容可能な対照を使用してよい。
【0103】
特異的活性
精製された組換えI2Sのタンパク質は、機能的および/生物学的活性を評価することによって、特徴付けることができる。組換えI2S組成物の酵素活性は、当該技術分野に周知の方法を用いて決定してもよい。典型的に、方法は、合成基質から硫酸塩の除去を検出することを伴い、硫酸塩放出アッセイとして周知である。酵素活性アッセイの一例は、イオンクロマトグラフィーを伴う。この方法は、基質から組換えI2Sによって酵素的に放出される硫酸イオンの量を定量化する。基質は、天然の基質であっても、合成の基質であってもよい。いくつかの場合では、基質はヘパリン硫酸塩(例えば、ヘパリン二糖類)、デルマタン硫酸塩、またはその等価物である。典型的に、放出される硫酸塩を、電気伝導度検出器を伴うイオンクロマトグラフィーによって分析する。当該実施例では、結果をタンパク質のU/mgとして表し、1Unitは、時間あたり基質から1マイクロモルの硫酸イオンを放出するのに必要な酵素の量として定義される。いくつかの実施形態では、基質としてヘパリン二糖類を使用したin vitroの硫酸塩放出アッセイによって測定されるように、精製された組換えI2Sタンパク質は特異的活性を有し、その範囲は、約0~100U/mg、約10~100U/mg、約10~80U/mg、約20~80U/mg、約20~70U/mg、約20~60U/mg、約20~50U/mg、約30~100U/mg、約30~90U/mg、約30~80U/mg、約30~70U/mg、約30~60U/mg、約40~100U/mg、約40~90U/mg、約40~80U/mg、約40~70U/mg、約40~60U/mgである。いくつかの実施形態では、基質としてヘパリン二糖類を使用したin vitroの硫酸塩放出アッセイによって測定されるように、精製された組換えI2Sタンパク質は特異的活性を有し、少なくとも約5U/mg、約10U/mg、約15U/mg、約20U/mg、約25U/mg、約30U/mg、約35U/mg、約40U/mg、約45U/mg、約50U/mg、約55U/mg、約60U/mg、約65U/mg、約70U/mg、約75U/mg、約80U/mg、約85U/mg、約90U/mg、約95U/mg、または約100U/mgである。ヘパリン二糖を基質として用いた試験管内の硫酸塩放出活性アッセイを行うための例となる条件を以下に提供する。通常、このアッセイは天然に由来する基質であるヘパリン二糖から硫酸イオンを放出するI2Sの能力を測定する。放出された硫酸塩をイオンクロマトグラフィによって定量してもよい。場合によっては、イオンクロマトグラフィには伝導率検出器が装備されている。非限定の例として、試料を先ず10mMの酢酸ナトリウム、pH6に緩衝液交換し、製剤化緩衝液におけるリン酸イオンによる阻害を取り除く。次いで試料を反応緩衝液(10mMの酢酸ナトリウム、pH4.4)で0.075mg/mlに希釈し、30μlの反応容量にて0.3μgのI2S/100μgの基質の酵素と基質の比でヘパリン二糖と共に37℃で2時間インキュベートする。次いで試料を100℃で3分間加熱することによって反応を止める。IonPac AG18ガードカラムと共にDionex IonPac AS18分析用カラムを用いて分析を行う。1.0ml/分で15分間の30mMの水酸化カリウムによる定組成法を使用する。I2S試料によって放出される硫酸塩の量は1.7~16.0ナノモルの範囲での硫酸塩基準の線形回帰分析から算出する。報告可能な値をタンパク質のmg当たりの単位として表し、1単位は、時間あたり放出される硫酸塩の1マイクロモルとして定義され、タンパク質濃度はA280の測定によって決定する。
【0104】
いくつかの実施形態では、組換えI2Sタンパク質の酵素活性は、当該技術で周知の種々の他の方法、たとえば、4-メチルウンベリフェリル-硫酸塩の硫酸塩と自然に蛍光を発する4-メチルウンベリフェロン(4-MUF)への加水分解を測定する4-MUFアッセイを用いても決定され得る。いくつかの実施形態では、試験管内での4-MUFアッセイによって測定するとき、産生される組換えI2Sタンパク質の所望の酵素活性は、少なくとも0.5U/mg、1.0U/mg、1.5U/mg、2U/mg、2.5U/mg、3U/mg、4U/mg、5U/mg、6U/mg、7U/mg、8U/mg、9U/mg、10U/mg、12U/mg、14U/mg、16U/mg、18U/mg、又は20U/mgである。いくつかの実施形態では、試験管内での4-MUFアッセイによって測定するとき、産生される組換えI2Sタンパク質の所望の酵素活性は、約0~50U/mg(たとえば、約0~40U/mg、約0~30U/mg、約0~20U/mg、約0~10U/mg、約2~50U/mg、約2~40U/mg、約2~30U/mg、約2~20U/mg、約2~10U/mg、約4~50U/mg、約4~40U/mg、約4~30U/mg、約4~20U/mg、約4~10U/mg、約6~50U/mg、約6~40U/mg、約6~30U/mg、約6~20U/mg、約6~10U/mg)の範囲に及ぶ。試験管内での4-MUFアッセイを行うための例となる条件を以下に提供する。通常、4-MUFアッセイは、4-メチルウンベリフェリル-硫酸塩(4-MUF-SO)を硫酸塩と自然に蛍光を発する4-メチルウンベリフェロン(4-MUF)に加水分解するI2Sタンパク質の能力を測定する。活性の1ミリ単位は、37℃にて1分間で1ナノモルの4-MUF-SOを4-MUFに変換するのに必要とされる酵素の量として定義される。通常、活性が既知のI2S試験試料によって生成される平均蛍光単位(MFU)を用いて検量線を生成することができ、それを用いて当該試料の酵素活性を算出することができる。タンパク質濃度による酵素活性を分けることによって、特異的活性を計算してよい。
【0105】
どの実施例でも、組換えI2S組成物のタンパク質濃度を、タンパク質濃度を決定するために、当該技術分野に周知の適切な方法によって決定してよい。いくつかの場合では、タンパク質濃度を、紫外線光吸収度分析によって決定する。当該吸収度分析は典型的に、約280nmの波長(A280)で実施する。
【0106】
電荷特性
精製された組換えI2Sを、タンパク質に関連する電荷特性によって特徴付けてよい。典型的に、タンパク質電荷特性は、典型的にタンパク質の表面に存在する残基側鎖電荷のパターンを反映する。電荷特性を、タンパク質のイオン交換(IEX)クロマトグラフィー(例えば、HPLC)アッセイを実施することによって決定してよい。いくつかの実施形態では、「電荷特性」は、交換イオンを含有する移動相のカラムに加えた後に、ある時点で、イオン交換カラムから溶離するタンパク質量を表す一組の値を意味する。
【0107】
典型的に、適切なイオン交換カラムはアニオン交換カラムである。例えば、電荷特性は、高速液体クロマトグラフィー(HPLC)系を使用して、強アニオン交換(SAX)クロマトグラフィーによって決定してよい。通常、組換えI2Sは、強アニオン交換カラムの固定された正電荷上で吸収し、事前に定められた流速で、移動相を使用した増加したイオン強度の勾配が、正電荷されたカラムとのイオン相互作用の強度に比例して、カラムから組換えI2S種を溶離する。より負に電化した(より酸性)I2S種は、負電荷が弱い(弱い酸性)I2S種より遅く溶離する。溶離物のタンパク質濃度は、紫外線光吸収によって(280nmで)検出される。
【0108】
いくつかの実施形態では、Mini Q PEカラムの固定された正電荷上で、20mMのTRIS-HCl中、約8.0のpHで、組換えI2Sは吸収し、0.8ml/分の流速、pH8.0で、20mMのTRIS-HCL、1Mの塩化ナトリウムから成る移動相を使用して増加したイオン強度の勾配が、正電荷されたカラムとのイオン相互作用の強度に比例して、カラムから組換えI2S種を溶離する。
【0109】
いくつかの実施形態では、電荷特性をHPLCカラムからの溶離後に、時間に対する吸光ユニットのクロマトグラムによって記述してよい。クロマトグラムは一組の1つ以上のピークを含んでよく、その組の各ピークが、同様の表面電荷を有する組成物の組換えI2Sの部分母集団を識別する。
【0110】
いくつかの実施形態では、精製されたI2Sタンパク質組成物は、電荷特性に少なくとも6つのピークを表す。I2Sの例示的な電荷特性を実施例の節および図11に記述する。図11に示すように、増加した負電荷およびクロマトグラムの総ピーク領域に対する減少した分布の順番で、6つのピークに標識を付ける(A~F)。いくつかの実施形態では、精製された組換えI2S組成物についての電荷特性は、タンパク質の表面の負または正電荷の量に依存して、異なる数、大きさ、形、またはピークの時間間隔を含む。いくつかの実施形態では、組換えI2Sは、6つ未満(例えば、5、4、3、または2未満)のピークの電荷特性を有する。いくつかの実施形態では、組換えI2Sの電荷特性は、5、4、3、2、または1つのピークを有してよい。例えば、1、2、3、4、または5つのピークA、B、C、D、E、およびFは、精製された組換えI2Sタンパク質組成物になくても、減少していてもよい。典型的に、電荷特性は、ピークが少ないと、より均質になると考えられる。
【0111】
グリカンマッピング
いくつかの実施形態では、精製された組換えI2Sタンパク質は、プロテオグリカン組成物によって特徴付けされてもよく、典型的に、グリカンマッピングとして意味する。いかなる理論に縛られることを望むものではないが、分岐構造の形状または複雑さに沿ってグリカン結合は、in vivoのクリアランス、リソソーム標的、生物学的利用能、および/または効果に影響を与え得ると考えられる。
【0112】
典型的に、グリカンマップは、酵素消化および次のクロマトグラフィー分析によって決定してよい。限定されないが、適切なグリコシラーゼ、ペプチダーゼ(例えば、エンドペプチダーゼ、エキソペプチダーゼ)、プロテアーゼ、およびホスファターゼを含む酵素消化に様々な酵素を使用してよい。いくつかの実施形態では、適切な酵素は、アルカリホスファターゼである。いくつかの実施形態では、適切な酵素はノイラミニダーゼである。グリカン(例えば、ホスホグリカン)は、クロマトグラフィー分析によって検出され得る。例えば、ホスホグリカンは、パルスアンペロメトリック検出(HPAE-PAD)を伴う高速アニオン交換クロマトグラフィー、または粒径排除高速液体クロマトグラフィー(HPLC)によって検出してよい。グリカンマップの各ピークによって表されるグリカン(例えば、ホスホグリカン)の量は、当該技術分野に周知の方法および本明細書に開示の方法に従い、グリカン(例えば、ホスホグリカン)の標準曲線を用いて計算してよい。
【0113】
いくつかの実施形態では、本発明の精製されたI2Sは、それぞれ、中性(ピーク群1)、モノシアリル化(ピーク群2)、ジシアリル化(ピーク群3)、モノホスホリル化(ピーク群4)、トリシアリル化(ピーク群5)、テトラシアリル化(ピーク群6)、またはジホスホリル化(ピーク群7)I2Sタンパク質を指示する7つのピーク群を含むグリカンマップを表す。例示的なI2Sのグリカンマップを図10に記述する。いくつかの実施形態では、精製された組換えI2Sは、7つ未満の群のグリカンマップを有する(例えば、6、5、4、3、または2つのピーク群)。いくつかの実施形態では、精製された組換えI2Sは7つ以上のピーク群を有するグリカンマップを有する(例えば、8、9、10、11、12またはそれ以上)。
【0114】
各ピーク群に対応するグリカンの相対的な量を、事前に定められた標準試料の対応するピーク群領域に相対するピーク群に基づいて決定してよい。いくつかの実施形態では、ピーク群1(中性)は、標準試料の対応するピーク群領域に対して、約40~120%(例えば、約40~115%、約40~110%、約40~100%、約45~120%、約45~115%、約45~110%、約45~105%、約45~100%、約50~120%、約50~110%)の範囲のピーク領域を有する。いくつかの実施形態では、ピーク群2(モノシアリル化)は、標準試料の対応するピーク群領域に対して、約80~140%(例えば、約80~135%、約80~130%、約80~125%、約90~140%、約90~135%、約90~130%、約90~120%、約100~140%)の範囲のピーク領域を有する。いくつかの実施形態では、ピーク群3(ジシアリル化)は、標準試料の対応するピーク群領域に対して、約80~110%(例えば、約80~105%、約80~100%、約85~105%、約85-100%)の範囲のピーク領域有する。いくつかの実施形態では、ピーク群4(モノホスホリル化)は、標準試料の対応するピーク群領域に対して、約100-550%(例えば、約100~525%、約100~500%、約100~450%、約150~550%、約15~500%、約150~450%、約200~550%、約200~500%、約200~450%、約250~550%、約250~500%、約250~450%、または約250~400%)の範囲のピーク領域を有する。いくつかの実施形態では、ピーク群5(トリシアリル化)は、標準試料の対応するピーク群領域に対して、約70~110%(例えば、約70~105%、約70~100%、約70~95%、約70~90%、約80~110%、約80~105%、約80~100%、または約80~95%)の範囲のピーク領域を有する。いくつかの実施形態では、ピーク群6(テトラシアリル化)は、標準試料の対応するピーク群領域に対して、約90~130%(例えば、約90~125%、約90~120%、約90~115%、約90~110%、約100~130%、約100~125%、または約100~120%)の範囲のピーク領域を有する。いくつかの実施形態では、ピーク群7(ジホスホリル化)は標準試料の対応するピーク群領域に対して、約70~130%(例えば、約70~125%、約70~120%、約70~115%、約70~110%、約80~130%、約80~125%、約80~120%、約80~115%、約80~110%、約90~130%、約90~125%、約90~120%、約90~115%、約90~110%)の範囲のピーク領域を有する。グリカンマッピングの様々な標準試料が当該技術分野に周知であり、本発明を実施するために使用することができる。典型的に、ピーク群7(ジホスホリル化)は、精製された組換えI2Sタンパク質の表面で、ジ-M6Pのレベルに対応する。
【0115】
精製されたI2Sのグリコシル化パターンはリソソーム標的に影響を与える。様々なin vitroの細胞取り込みアッセイが当該技術分野に周知であり、本発明を実施するために使用することができる。例えば、M6P受容体によるI2Sの取り込みを評価するために、表面にM6P受容体を発現するヒト繊維芽細胞を使用して、細胞取り込みアッセイを実施する。内部に取り入れられたI2Sの量は、ELISA法によって測定することができる。いくつかの実施形態では、本発明の精製された組換えI2Sタンパク質は、in vitroの細胞取り込みアッセイによって決定されるように、70%、75%、80%、85%、90%、95%超の細胞取り込みを特徴とする。
【0116】
ペプチドマッピング
いくつかの実施形態では、ペプチドマッピングを使用して、アミノ酸組成物、翻訳後修飾、および/またはシグナルペプチドの切断、ホルミルグリシン転換および/またはグリコシル化等の細胞プロセッシングを特徴付けてよい。典型的に、組換えタンパク質を、制御されたまたはランダムな切断のいずれかによって、別個のペプチド断片に切断し、パターンまたはペプチドマップを作製してよい。いくつかの場合では、精製されたI2Sタンパク質を、分析する前に、最初に酵素消化に供してよい。分析する前に、ペプチダーゼ、配糖体、ヒドロラーゼ、ホスファターゼ、リパーゼまたはプロテアーゼおよび/またはその組み合わせを使用して消化を行ってよい。ペプチドの構造的組成物を、当該技術分野に周知の方法を用いて決定してよい。例示的な方法として、限定されないが、質量分析、核磁気共鳴(NMR)またはHPLCが挙げられる。
【0117】
ホルミルグリシンの転換率
ペプチドマッピングを使用して、FGly転換率を決定した。I2S活性は、以下に示されるように、ホルミルグリシン生成酵素(FGE)によってホルミルグリシン転換するために、システイン(成熟したヒトI2Sの59位に対応する)を必要とする。
【化1】

したがって、ホルミルグリシン転換率(%FG)を以下の公式を使用して計算することができる。
【数1】
【0118】
%FGを計算するために、組換えI2Sタンパク質を、タンパク分解酵素(例えば、トリプシンまたはキモトリプシン)を使用して、短いペプチドに消化させてよい。短いペプチドを分離し、粒径排除高速液体クロマトグラフィー(HPLC)を使用して特徴付けした。成熟したヒトI2Sの59位に対応する位置を含むペプチドが、対照(例えば、FGly転換のないI2Sタンパク質または100%FGly転換したI2Sタンパク質)と比較して、59位のCysがFGlyに転換されるかどうかを特徴付けした。FGlyを含むペプチドの量(活性I2S分子の数に対応する)、およびFGlyとCysの両方を有するペプチドの全量を、対応するピーク領域に基づいて特定してもよく、%FGを反映する比を計算することができる。
【0119】
いくつかの実施形態では、本発明の精製された組換えI2Sタンパク質は、ヒトI2S(配列番号1)のCys59に対応するシステイン残基をCα-ホルミルグリシン(FGly)に、少なくとも70%(例えば、少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%)転換する。いくつかの実施形態では、本発明の精製された組換えI2Sタンパク質は、ヒトI2S(配列番号1)のCys59に対応するシステイン残基をCα-ホルミルグリシン(FGly)に、実質的に100%転換する。
【0120】
シアル酸量
いくつかの実施形態では、精製された組換えI2Sタンパク質は、シアル酸組成物によって特徴付けられる。理論に縛られることを望むものではないが、タンパク質上のシアル酸残基は、肝細胞に存在するアシアロ糖タンパク質受容体による急速なin vivoのクリアランスを防ぎ、減少させ、または抑制し得ることは理解されている。したがって、比較的高いシアル酸量を有する組換えタンパク質は、典型的に、in vivoの比較的長い循環時間を有すると考えられる。
【0121】
いくつかの実施形態では、精製された組換えI2Sタンパク質のシアル酸量を、当該技術分野に周知の方法を用いて決定してよい。例えば、精製されたI2Sタンパク質のシアル酸量を、酵素消化および次のクロマトグラフィー分析によって決定してよい。任意の適切なシアリダーゼを用いて、酵素消化達成してよい。いくつかの場合では、ノイラミニダーゼ等のグリコシドヒドロラーゼ酵素によって消化をおこなう。シアル酸を、例えば、アンペロメトリック電気化学検出法を伴う高速アニオン交換クロマトグラフィー(HPAE-PAD)等のクロマトグラフィー分析によって決定してよい。組換えI2S組成物中のシアル酸の量を、当該技術分野に周知の方法および本明細書に記載の方法に従い、シアル酸の標準曲線を用いて計算してよい。
【0122】
いくつかの実施形態では、精製された組換えI2Sタンパク質のシアル酸量は、16mol/mol超である。シアル酸量の文脈で「mol/mol」は、酵素の1モルあたりのシアル酸残基のモル数を意味する。いくつかの場合では、組換えI2Sタンパク質のシアル酸量は、約16.5mol/mol、約17mol/mol、約18mol/mol、約19mol/mol、約20mol/mol、約21mol/mol、約22mol/molまたはそれ以上であるか、それ以上である。いくつかの実施形態では、精製された組換えI2Sタンパク質のシアル酸量は、約16~20mol/mol、16~21mol/mol、約16~22mol/mol、16~23mol/mol、16~24mol/mol、約16~25mol/mol、約17~20mol/mol、17~21mol/mol、約17~22mol/mol、17~23mol/mol、17~24mol/mol、または約17~25mol/molの範囲にあり得る。
【0123】
医薬組成物および投与
精製された組換えI2Sタンパク質を既知の方法に従ってハンター症候群患者に投与し得る。たとえば、精製された組換えI2Sタンパク質は、静脈内に、皮下に、筋肉内に、非経口で、経皮で又は経粘膜で(たとえば、経口若しくは経鼻)送達され得る。
【0124】
いくつかの実施形態では、組換えI2S又はそれを含有する医薬組成物は静脈内投与によって対象に投与される。
【0125】
いくつかの実施形態では、組換えI2S又はそれを含有する医薬組成物はクモ膜下投与によって対象に投与される。本明細書で使用されるとき、用語「クモ膜下投与」又は「クモ膜下注入」は、脊柱管(脊髄を取り囲むクモ膜下空間)への注入を指す。穿頭孔又は大槽穿刺又は腰椎穿刺等を介した側脳室内注入含むが、限定されない種々の技法を使用し得る。いくつかの実施形態では、本発明に係る「クモ膜下投与」又は「クモ膜下送達」は、腰椎の域又は領域を介したIT投与又は送達、すなわち、腰椎IT投与又は送達を指す。本明細書で使用されるとき、用語「腰椎領域」又は「腰椎域」は第3と第4の腰椎(腰背部)、さらに包括的には脊椎のL2~S1の領域を指す。
【0126】
いくつかの実施形態では、組換えI2S又はそれを含有する医薬組成物は皮下(すなわち、皮膚の下)投与によって対象に投与される。そのような目的では、製剤は注射器を用いて注入され得る。しかしながら、たとえば、注入用具(Inject-ease(商標)Genject(商標)用具);注入ペン(たとえば、GenPen(商標));針なし装置(たとえば、MediJector(商標)及びBioJector(商標));及び皮下添付送達方式のような製剤の投与用の他の用具が利用可能である。
【0127】
いくつかの実施形態では、投与の他の経路(たとえば、静脈内、皮下、筋肉内、非経口、経皮、又は経粘膜(たとえば、経口若しくは経鼻))との併用でクモ膜下投与が使用され得る。
【0128】
本発明は、治療上有効な量の、本明細書で記載される組換えI2S又はそれを含有する医薬組成物の単回投与と同様に複数回投与を熟考する。組換えI2S又はそれを含有する医薬組成物は、定期的な間隔で、対象の状態(たとえば、リソソーム蓄積症)の性質、重症度及び程度に応じて投与することができる。いくつかの実施形態では、治療上有効な量の組換えI2S又はそれを含有する医薬組成物が、定期的な間隔で(たとえば、毎年1回、6ヵ月ごとに1回、5ヵ月ごとに1回、3ヵ月ごとに1回、2ヵ月に1回(2ヵ月ごとに1回)、1ヵ月に1回(1ヵ月ごとに1回)、2週間に1回(2週間ごとに1回)、毎週、毎日又は連続的に)定期的に投与され得る。
【0129】
組換えI2S又はそれを含有する医薬組成物は、生理的に許容可能なキャリア又は賦形剤と共に製剤化されて医薬組成物を調製することができる。キャリア及び治療剤は無菌であることができる。製剤は投与の方式に適合すべきである。
【0130】
好適な薬学上許容可能なキャリアには、水、塩溶液(たとえば、NaCl)、生理食塩水、緩衝化生理食塩水、アルコール類、グリセロール、エタノール、アラビアゴム、植物油、ベンジルアルコール、ポリエチレングリコール、ゼラチン、たとえば、ラクトース、アミロース又はデンプンのような炭水化物、たとえば、マンニトール、スクロース等のような糖類、デキストロース、ステアリン酸マグネシウム、タルク、ケイ酸、粘性パラフィン、芳香油、脂肪酸エステル、ヒドロキシメチルセルロース、ポリビニルピロリドン等、と同様にそれらの組み合わせが挙げられるが、これらに限定されない。医薬製剤は所望であれば、活性化合物と有害に反応しない、又はその活性を妨害しない補助剤(たとえば、潤滑剤、保存剤、安定剤、湿潤剤、乳化剤、浸透圧に影響するための塩、緩衝液、着色剤、風味剤及び/又は芳香物質等)と混合することができる。いくつかの実施形態では、静脈内投与に好適な水溶性キャリアが使用される。
【0131】
組成物又は薬物は所望であれば、軽微な量の湿潤剤又は乳化剤又はpH緩衝剤も含有することもできる。組成物は、液状溶液、懸濁液、エマルジョン、錠剤、丸薬、カプセル、徐放性製剤、又は粉剤であることができる。組成物はまたトリグリセリドのような従来の結合剤又はキャリアと共に座薬として製剤化することもできる。経口製剤は、たとえば、医薬等級のマンニトール、ラクトース、デンプン、ステアリン酸マグネシウム、ポリビニルピロリドン、サッカリンナトリウム、セルロース、炭酸マグネシウム等のような標準のキャリアを含むことができる。
【0132】
組成物又は薬物はヒトに投与するのに適合した医薬組成物として日常の手順に従って製剤化することができる。たとえば、いくつかの実施形態では、静脈内投与用の組成物は通常、等張の水性緩衝液における溶液である。必要に応じて組成物は可溶化剤及び局所麻酔剤を含んで注射の部位で痛みを軽くし得る。一般に、成分は別々に供給される、又は、たとえば、活性剤の量を示すアンプル若しくはサシェのような密封した容器にて凍結乾燥粉末若しくは水を含まない濃縮物として、単位剤形にて一緒に混合される。組成物が点滴で投与されるべきである場合、無菌の医薬等級の水、生理食塩水又はデキストロース/水を含有する点滴ビンでそれを調剤することができる。組成物が注射で投与される場合、投与に先立って成分が混合され得るように無菌の注射用水又は生理食塩水のアンプルを提供することができる。
【0133】
本明細書で使用されるとき、用語「治療上有効な量」は、本発明の医薬組成物に含有される治療剤の総量に基づいて主に決定される。一般に、治療上有効な量は、対象にとって意味のある利益(たとえば、根底にある疾患又は状態を治療すること、調節すること、治癒すること、予防すること及び/又は改善すること)を達成するのに十分である。たとえば、治療上有効な量は、所望の治療効果及び/又は予防効果を達成するのに十分な量、たとえば、リソソーム酵素受容体又はその活性を調節し、それによってリソソーム蓄積症又はその症状を治療する(たとえば、本発明の組成物の対象への投与に続く、「ゼブラ小体」又は細胞の空胞変性の存在又は発生の軽減又は排除)のに十分な量であり得る。一般に、それを必要とする対象に投与される治療剤(たとえば、組換えリソソーム酵素)の量は対象の特徴に左右されるであろう。そのような特徴には、対象の状態、疾患の重症度、全身状態、年齢、性別及び体重が挙げられる。当業者は、それら及び関連する因子に応じて適当な投与量を容易に決定することができるであろう。加えて、客観的なアッセイ及び主観的なアッセイの双方を任意で採用して最適な投与量範囲を特定し得る。
【0134】
治療上有効な量は一般に複数の単位用量を含む投与計画にて投与される。特定の治療用のタンパク質については、治療上有効な量(及び/又は有効な投与計画の範囲内での適当な単位用量)は、たとえば、投与経路、他の医薬剤との併用に応じて変化し得る。また、特定の患者のための具体的な治療上有効な量(及び/又は単位用量)は、治療される障害及び障害の重症度、採用される具体的な医薬剤の活性、採用される具体的な組成物、患者の年齢、体重、全身状態、性別及び食事、投与の時間、投与の経路及び/又は採用される具体的な融合タンパク質の排泄若しくは代謝の速度、治療の持続時間、及び医療技術で周知のような類似の因子を含む種々の因子に左右され得る。
【0135】
追加の例となる医薬組成物及び投与方法は、双方の開示全体が参照によって本明細書に組み入れられる2012年3月30日に出願された「イズロン酸-2-スルファターゼのCNS送達のための方法及び組成物」と題されるPCT公開WO2011/163649及び「イズロン酸-2-スルファターゼの皮下投与」と題される仮特許出願番号61/618,638にて記載されている。
【0136】
特定の対象については、具体的な投与計画は、個々の必要性及び酵素補充療法を投与する又はその投与を監督する人の専門的な判断に従って時間をかけて調整されるべきであり、本明細書で述べられる投与量範囲は単に例となるだけであって、請求される本発明の実践の範囲を限定するようには意図されないことがさらに理解されるべきである。
【実施例
【0137】
実施例1:組換えI2S AFの捕獲および精製プロセス
当該実施例は、無血清培地に製造される組換えI2Sを捕獲し精製するために単純化した下流精製プロセスを使用してよいことを説明する。例示的な精製スキームを図1に記述する。
【0138】
イズロン酸2スルファターゼ酵素(I2S)およびホルミルグリシン生成酵素(FGE)を安定的に発現する細胞株を開発した。例示的な細胞株の発生および特徴付けについては、米国特許仮出願「ヒトイズロン酸2スルファターゼを製造するための細胞」(提出日は当該明細書に記載)に記載されており、参照によりその全体が本明細書に取り込まれる。端的に、配列番号2に示されるアミノ酸配列および配列番号5に示されるヒトホルミルグリシン生成酵素(FGE)で、ヒトI2Sタンパク質を共発現するように、ヒト細胞株を操作した。
配列番号2
完全長前駆体イズロン酸2スルファターゼ:
MPPPRTGRGLLWLGLVLSSVCVALGSETQANSTTDALNVLLIIVDDLRPSLGCYGDKLVRSPNIDQLASHSLLFQNAFAQQAVCAPSRVSFLTGRRPDTTRLYDFNSYWRVHAGNFSTIPQYFKENGYVTMSVGKVFHPGISSNHTDDSPYSWSFPPYHPSSEKYENTKTCRGPDGELHANLLCPVDVLDVPEGTLPDKQSTEQAIQLLEKMKTSASPFFLAVGYHKPHIPFRYPKEFQKLYPLENITLAPDPEVPDGLPPVAYNPWMDIRQREDVQALNISVPYGPIPVDFQRKIRQSYFASVSYLDTQVGRLLSALDDLQLANSTIIAFTSDHGWALGEHGEWAKYSNFDVATHVPLIFYVPGRTASLPEAGEKLFPYLDPFDSASQLMEPGRQSMDLVELVSLFPTLAGLAGLQVPPRCPVPSFHVELCREGKNLLKHFRFRDLEEDPYLPGNPRELIAYSQYPRPSDIPQWNSDKPSLKDIKIMGYSIRTIDYRYTVWVGFNPDEFLANFSDIHAGELYFVDSDPLQDHNMYNDSQGGDLFQLLMP

配列番号5
完全長ヒトFGE前駆体:
MAAPALGLVCGRCPELGLVLLLLLLSLLCGAAGSQEAGTGAGAGSLAGSCGCGTPQRPGAHGSSAAAHRYSREANAPGPVPGERQLAHSKMVPIPAGVFTMGTDDPQIKQDGEAPARRVTIDAFYMDAYEVSNTEFEKFVNSTGYLTEAEKFGDSFVFEGMLSEQVKTNIQQAVAAAPWWLPVKGANWRHPEGPDSTILHRPDHPVLHVSWNDAVAYCTWAGKRLPTEAEWEYSCRGGLHNRLFPWGNKLQPKGQHYANIWQGEFPVTNTGEDGFQGTAPVDAFPPNGYGLYNIVGNAWEWTSDWWTVHHSVEETLNPKGPPSGKDRVKKGGSYMCHRSYCYRYRCAARSQNTPDSSASNLGFRCAADRLPTMD
【0139】
完全長I2S酵素を合成した後、25アミノ酸シグナルペプチドを取り除き、可溶性の成熟したI2S酵素が細胞から分泌された。
【0140】
既知組成培地(無血清/動物性成分なし;AF)をバイオリアクタープロセスに使用した。
【0141】
個別の回収物質の容量を減少させ、限外濾過/ダイアフィルトレーションプロセスによって緩衝液を交換した。未精製バルク(UPB)と呼ばれる物質を個々の回収物あたり、-50℃に凍結した。下流の精製プロセスを、未精製バルクの溶解およびプールから開始し、連続するウイルス不活性化、アニオン交換(Capto Q)、混合モード(セラミックスヒドロキシアパタイト)、カチオン交換(SPセファロース)および疎水性相互作用(フェニルセファロース)クロマトグラフィーのステップを行い、次にウイルス濾過、並びに、最終濃度およびダイアフィルトレーションのステップを行った。特に、当該精製プロセスは、Q、ヒドロキシアパタイト、SPおよびフェニルクロマトグラフィー様式を使用した。I2S精製プロセスに伝統的に使用されるタンパク質Gクロマトグラフィーおよび粒径排除クロマトグラフィーは、削除した。例示的なステップを表3に示す。
【表3-1】

【表3-2】
【0142】
精製されたI2Sタンパク質の純度について、ペプチドマッピング、SDS-PAGE(銀)、粒径排除HPLCによって評価した。酵素特異的活性、ホルミルグリシン量、シアル酸量、グリカンマップ、電荷特性を標準的な方法を用いて決定した。例示的な結果を表4に示す。
【表4-1】

【表4-2】
【0143】
市販のI2S参照と比較したときの例示的なペプチドマップを図2に示す。例示的なSDS-PAGE(銀)分析の結果を図3に示す。典型的に、本明細書に記載のプロセスを使用して、薬物物質のHCP濃度(DS)は<100ppmであり、米国を含む多くの市場で要求されている<l00ppm規格を満たしている。DSのSECは≧99.5%であり、これも多くの市場で要求されている現状の>99.3%を満たしている。例示的な電荷特性を図4に示す。例示的なグリカンマップを図5に示す。特に、精製されたI2Sのグリカンマップは7つのピーク群を含み、シアル酸およびマンノース6リン酸残基から生じる負電荷の増加量に従い溶離し、順に、溶離、中性、モノ、ジシアリル化、モノホスホリル化、トリシアリル化、およびハイブリッド(モノシアリル化およびキャップされたM6P)、テトラシアリル化、およびハイブリッド(ジシアリル化およびキャップされたM6P)並びにジホスホリル化グリカンを表した。
【0144】
まとめると、当該実施例は、単純化された4つのカラム精製プロセスを使用して、大規模に、無動物性培地に精製されたI2Sの精製を成功させることができることを説明する。
【0145】
実施例2:組換えI2S AFの回収およびウイルス不活性化の安定化試験
当該実施権の目的は、浄化した回収物の組換えI2Sの安定性に与える温度保持時間および凍結-溶解周期の影響を評価する。
【0146】
浄化した回収試料を雰囲気および2~8℃で、最大7日間保管し、ウイルス不活性化UPB試料を雰囲気で、最大24時間保管した。浄化した回収物の凍結-溶解試料を-20℃、-50℃、および-80℃に凍結し、最大3周期の凍結-溶解を行った。ウエスタンブロット、SEC HPLCおよび活性アッセイを用いて、安定性を測定した。
【0147】
遠心分離保持装置を備えたB.Braun20Lのバイオリアクターを使用して、望ましい流出速度で、CCPDによる2D細胞株から、I2S-AF回収物質を製造した。温度保持試験について、それぞれ浄化した回収物を雰囲気および2~8℃で保管し、選択した保持時間で回収した。サンプリングの量および保持時間を表5に挙げる。凍結-溶解試料を-20℃、-50℃、および-80℃で保管し、水浴を用いて、25℃で溶解した。
【表5】
【0148】
最初のカラムに負荷する前に、ウイルスの不活性化のステップを未精製バルクのステップで起こした。濃縮し、浄化した回収物の緩衝液の交換によって、UPBを製造した。Pall 1 sq.ftを使用してUF/DFを実施した。Centramate系および緩衝液を10mMのMES、155mMのNaCl、pH=6.5に交換した。ウイルスの不活性化のステップは、1%のTween 80および0.3%のTnBPを加え、各時点でDuraporシリンジフィルターを使用して濾過した。表6に挙げる各時点で試料を取り出し、-80℃で凍結した。ウエスタンブロットおよび活性(4-MUFアッセイ)によって、浄化した回収物の保持ポイントからの試料および凍結-溶解試験をおこなった。ウイルスの不活性化からのUPB試料の純度についてSEC HPLCによって試験した。表5の回収物12および18から保持ポイントの活性の結果は、両方の回収物について、雰囲気および2~8℃での最大7日間の保管に著しい変化を示さなかった。-20℃、-50℃、および-80℃で保管された最大3回の凍結-溶解周期の間に、回収物12の活性に著しい変化は示されなかった。
【表6】
【0149】
ウイルス不活性化UPBステップの安定性についての活性およびSEC-HPLCを図6および7に記載する。活性および最大24時間の純度に基づくウイルス不活性化の安定性に、問題がなかったことを示す。
【0150】
まとめると、本明細書に記載の安定性分析に基づき、浄化された回収物は、2~8℃で(例えば、最大7日間)、回収物の品質に著しい変化を示すことなく、保管することができる。浄化された回収物に、複数回の凍結-溶解周期を行うことができ、安定性に著しい変化を示すことなく、-20℃、-50℃、および-80℃で保管することができる。SEC HPLC純度の結果に基づき、活性および純度に何の変化もなく、雰囲気温度(例えば、最大24時間)でUPBステップでのウイルス不活性化を行うことができる。
【0151】
実施例3:無動物性IL CD培地の確認作動の精製および分析
【0152】
当該試験の目的は、既知組成培地を使用して無動物灌流で製造されたI2S-AFのプールされた回収物から精製すること、および薬物物質を特徴付けることである。
【0153】
当該試験は、I2S-AF精製プロセスの性能および既知組成培地のバイオリアクターから製造された薬物物質(DS)を評価した。
【0154】
細胞培地
実施例1に記載のI2Sおよびホルミルグリシン生成酵素(FGE)を発現する細胞株2DからI2S-AF物質を製造した。既知の無血清培地を使用して1LのDas GipスピンフィルターバイオリアクターでCCPDに、物質を製造した。浄化された回収物(HI-21)のそれぞれからの個別のバッグを受け取り、-20℃で凍結し、2~8℃で一晩溶解した。浄化された回収物のそれぞれの等量をプールし、全体の回収プールを表し、その後、0.2μmフィルターにかけ、全膜領域が1ftの30 kD Pall Omega Centramate cassetteを使用して濃縮した。使用前に、未精製バルク(UPB)を0.2μmフィルターにかけ、凍結した。
【0155】
精製
例示的なカラムの規格および負荷を表7に記述する。Qセファロースを3g/Lの標的で、力価によって負荷した。次のカラムを前のカラム溶離物から100%で負荷し、物質を取り除かなかった。
【表7】
【0156】
バイオリアクターから、プールしている回収物1~21からのUPBを使用して、1回の精製を行った。UPBを2~8℃で一晩溶解し、各回収物から等量でプールした。
【0157】
個々のカラムのプロセスステップおよび緩衝液の配合について表8~11に認めることができる。QセファロースFFカラムに負荷する前に、プールされたUPBを、0.2umのボトルフィルター系を使用して濾過し、1Mの酢酸ナトリウムを使用してpHを6.5に調整し、5Mの塩化ナトリウムで伝導率を16mS/cmに調整した。HAカラムに負荷する前に、Qセファロース溶離を、0.25MのNaP0を使用して0.001MのNaP0に調整し、pH5.5、および0.22umのPESボトルトップフィルターでフィルターをかけた。HA溶離伝導率を5MのNaClで1.55MのNaClに調整し、1Mの酢酸ナトリウムでpHを5.5に調整した。調整時間は約1時間であった。フェニルセファロースカラムに負荷する前に、調整されたプールを、0.22umのPESボトルトップフィルターを使用してフィルターをかけた。フェニル溶離物を4倍に濃縮し、0.02MのNaP0、0.137MのNaCl、pH6.0に6回ダイアフィルトレーションした。ダイアフィルトレーションした産生物を2.0g/Lに調整し、0.2%のポリソルベート20で処方し、模擬の薬物物質が発生した。DSのH1-20の模擬プールを追加で特徴付けるために作製した。
【表8】

【表9】

【表10】

【表11】
【0158】
ELISAによるHCLPによるインプロセス精製
表12は各ステップについてインプロセスHOP除去を記述する。インプロセスHCLPの結果は、HAステップで大部分の除去が高かった。
【表12】
【0159】
薬物物質の特徴付け
例示的な薬物物質のロットの放出の結果を表13に挙げる。見るとわかるように、薬物物質は精製された物質の中で高い特異的活性および%FGを有した。例示的な薬物物質の属性の特徴付けを表13に示す。HCPは最終のUF/DFステップで1,870ng/mgから372ng/mgに減少した。
【表13-1】

【表13-2】
【0160】
実施例4:精製された組換えI2S酵素の生理化学的および生物学的特徴付け
実施例の目的は、上述の方法を使用して精製された組換えI2Sタンパク質の詳細な特徴付けをすることである。
【0161】
SDS-PAGE
実験のために、2つの別個の無血清培養培地反応液に、2Dおよび4Dヒト細胞株を用いて組換えI2Sタンパク質を発生させた。試料を回収し、上述の方法を用いて精製した。精製されたI2S酵素を、SDS-PAGEによって分析し、視覚化のために銀染色した。例示的な結果を図8に示す。図8に示されるように、本明細書に記載の方法を使用して精製された組換えI2Sタンパク質は、標準的な方法を使用して精製されたI2S標準試料と比較して、比較可能な横縞模様を示した。
【0162】
ペプチドマップ
I2S-AF 2D細胞株から製造された組換えI2Sタンパク質を上述の方法で精製した。精製された組換えI2Sおよび参照のヒトI2Sの試料を、それぞれ、タンパク質分解消化に供し、HPLC分析によって検査した。参照I2Sのペプチドマップと比較したときの例示的なペプチドマップを図9に示す。
【0163】
ホルミルグリシンの転換率
ペプチドマッピングを使用して、FGly転換率を決定した。I2S活性は、以下に示されるように、ホルミルグリシン生成酵素(FGE)によってホルミルグリシン転換するために、システイン(成熟したヒトI2Sの59位に対応する)を必要とする。
【化2】

したがって、ホルミルグリシン転換率(%FG)を以下の公式を使用して計算することができる。
【数2】
【0164】
例えば、50%のFGは、精製された組換えI2Sの半分は、任意の治療効果のない酵素的に不活性であることを意味する。
【0165】
ペプチドマッピングを使用して%FGを計算した。端的には、精製された組換えI2Sタンパク質は、タンパク分解酵素(例えば、トリプシンまたはキモトリプシン)を使用して、短いペプチドに消化された。短いペプチドを分離し、HPLCを使用して特徴付けした。成熟したヒトI2Sの59位に対応する位置を含むペプチドが、対照(例えば、FGly転換のないI2Sタンパク質または100%FGly転換したI2Sタンパク質)と比較して、59位のCysがFGlyに転換されるかどうかを特徴付けした。FGlyを含むペプチドの量(活性I2S分子の数に対応する)、およびFGlyとCysの両方を有するペプチドの全量を、対応するピーク領域に基づいて特定してもよく、%FGを反映する比を計算した。例示的な結果を表14に示す。
【0166】
グリカンマップ-マンノース6リン酸およびシアル酸量
精製された組換えI2Sタンパク質のグリカンおよびシアル酸組成物を決定した。アニオン交換クロマトグラフィーを使用してグリカン組成物の定量化を行い、グリカンマップを作製した。以下に記載するように、本明細書に記載の条件で精製される組換えI2Sのグリカンマップは、7つのピーク群から構成され、負電荷の増加量に従って溶離し、少なくとも部分的に、酵素消化物から生じるシアル酸およびマンノース-6-リン酸グリコフォームに由来する。端的には、無血清細胞培養(I2S-AF 2D無血清およびI2S-AF 4D無血清)から精製された組換えI2Sおよび参照の組換えI2Sを、(1)シアル酸残基を取り除くための精製されたノイラミニダーゼ酵素(アルスロバクター・ウレアファシエンス(10mU/μL)、Roche Biochemical(インディアナポリス、インディアナ州)、カタログ番号269 611(1U/100μL))、(2)マンノース-6-リン酸残基を完全に放出するためのアルカリホスファターゼを、37±1℃で2時間、(3)アルカリホスファターゼ+ノイラミニダーゼ、または(4)処理なし、のいずれかで処理した。各酵素消化物を、Dionex CarboPac PA1 Guard Columnを備えたCarboPac PA1 Analytical Columnを使用して、Anion Exchange Chromatography with Pulsed Amperometric Detection(HPAE-PAD)によって分析した。0.4~2.0ナノモルの範囲のシアル酸およびマンノース-6-リン酸標準を、各アッセイについて実施した。100mMの水酸化ナトリウム中の48mMの酢酸ナトリウムを使用して、定組成法を、雰囲気カラム温度、流速1.0mL/分で最小15分間実施し、各ピークを溶離した。I2S-AFとI2S標準試料の両方について、個別の実施から生成されたデータを、単一のクロマトグラフにそれぞれまとめ、各個別の組換えタンパク質についてグリカンマップを表した。図10に示されるように、無血清培地から精製されるI2Sのグリカンマップは、代表的な溶離ピーク(溶離の順序で)を表し、中性、モノ、ジシアリル化、モノホスホリル化、トリシアリル化、およびハイブリッド(モノシアリル化およびキャップされたマンノース-6-リン酸)、テトラシアリル化、およびハイブリッド(ジシアリル化およびキャップされたマンノース-6-リン酸)並びにジホスホリル化グリカンを構成した。例示的なグリカンマップを図10に示す。
【0167】
各組換えI2S試料の平均的なシアル酸量(モルタンパク質あたりのモルシアル酸)を、シアル酸標準の線形回帰分析から計算した。PeakNet6ソフトウェアを使用して、各クロマトグラムの実施を視覚化した。組換えI2Sアッセイ対照および試験試料から放出されたシアル酸標準およびシアル酸は、単一のピークとして現れる。I2Sについてシアル酸の量(ナノモル)を、以下の公式を使用して生値として計算した。
【数3】

ここで、Cは試料または組換えI2Sアッセイ対照のタンパク質濃度(mg/ml)である。
各試験試料について、タンパク質のモルあたりシアル酸のモルとしてシアル酸の補正値を以下の公式を使用して計算した。
【数4】
【0168】
I2S-AF 2Dまたは4D細胞株から精製される組換えI2S上のシアル酸量を指示する例示的なデータを表14に示す。
【表14-1】

【表14-2】
【0169】
特異的活性
本明細書に記載の方法を使用して精製された組換えI2S酵素の特異的活性を、in vitroの硫酸塩放出アッセイまたは4-MUFアッセイを使用して分析した。
【0170】
in vitroの硫酸塩アッセイ
ヘパリン二糖類を基質として使用して、in vitroの硫酸塩アッセイを実施した。特に、このアッセイでは、天然由来の基質であるヘパリン二糖類から硫酸イオンを放出するI2Sの能力を測定する。電気伝導度検出器を備えたイオンクロマトグラフィーによって、放出される硫酸塩を定量化してもよい。端的には、最初に試料をpH6、10mMのNa酢酸塩に緩衝液交換し、緩衝液処方物中のリン酸塩イオンによる阻害を取り除いた。その後、試料を反応緩衝液(10mMのNa酢酸塩、pH4.4)で、0.075mg/mlに希釈し、30μLの反応容量中、基質比が0.3μgのI2S/100μgの酵素の基質ヘパリン二糖類で、37℃で2時間インキュベートした。試料を100℃で3分間加熱することによって、反応を停止した。IonPac AG18ガードカラムを備えたDionex IonPac AS18分析カラムを使用して分析を行った。1.0mL/分で15分間、30nMの水酸化カリウムで定組成法を使用した。I2S試料によって放出される硫酸塩の量を、1.7~16.0ナノモルの範囲の硫酸塩標準の線形回帰分析から計算した。報告できる値をmgあたりの単位のタンパク質として表し、1単位は一時間あたりに放出される硫酸塩の1マイクロモルとして定め、タンパク質濃度をA280測定法によって決定した。例示的な結果を表14に表す。
【0171】
4-MUFアッセイ
精製された組換えI2S酵素の特異的活性についても、蛍光に基づく4-MUFアッセイを使用して分析してもよい。端的には、アッセイはI2S基質の4-メチルウンベリフェリル-硫酸塩(4-MUF-SO)の加水分解を測定する。I2Sによって4-MUF-SO基質を切断したとき、分子が硫酸塩および自然に蛍光を発する4-メチルウンベリフェロン(4-MUF)に転換される。結果として、経時的な蛍光シグナルの全体的な変化を評価することによってI2S酵素活性を決定することができる。当該実験について、I2S-AF 2Dおよび4Dヒト細胞株から製造された精製されたI2S酵素を、4-メチルウンベリフェリル-硫酸(4-MUF-SO)、カリウム塩(Sigmaカタログ番号M-7133)の溶液でインキュベートした。一連の対照の標準試料を使用し、保存液の1:100、1:200および1:20,000で希釈された市販のI2S酵素を使用して、アッセイの較正を行った。37℃で酵素アッセイを実施し、較正した蛍光光度計を使用して分析した。各標準試料について、得られる蛍光値を使用して、以下の等式を使用して、変動係数率を決定した。
【数5】
【0172】
その後、報告可能な酵素活性を決定するために、率CV値を使用して、各試料の補正した平均蛍光を計算し、以下の公式を使用してmU/mLで表した。
【数6】

CFU=負に補正された平均蛍光
DF=希釈係数
【0173】
活性の1ミリ単位は、37℃、1分で、4-メチルウンベリフェリル-硫酸の1ナノモルを4-メチルウンベリフェロンに転換するのに必要とされる酵素の量である。
【0174】
電荷特性
この実験では、それぞれ精製された組換えI2Sの電荷分布を、高速液体クロマトグラフィー(HPLC)を有する強アニオン交換(SAX)クロマトグラフィーによって決定した。この方法は、表面電荷差に基づいて、試料内の組換えI2S変異体を分離する。pHが8.00では、負電荷した種が、SAXカラムの固定された正電荷上で吸収される。増加しているイオン強度の勾配を使用してカラムとのイオン相互作用の強度に比例して、各タンパク質の種を溶離する。無血清成長条件下の2D細胞株または参照の組換えI2S酵素から単離された100マイクログラムの精製されたI2Sを、雰囲気温度で保持されたAmersham BiosciencesMini Q PE(4.6x50mm)カラムに負荷し、20mMのトリス-HC1、pH8.00に平衡した。20mMのトリス-HC1、1.0Mの塩化ナトリウム、pH8.00の移動相を使用して、流速0.80mL/分で勾配溶離を行った。280nmの波長で試料の溶離の吸光度を測定することによって、実施中にタンパク質濃度を連続して決定した。2Dおよび4D細胞株から精製される組み換えI2Sに観察される電荷特製の例示的な結果を図11に示す。
図1
図2
図3
図4
図5
図6
図7
図8
図9
図10
図11
【配列表】
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