特表2024-531331少量の菌体外多糖を産生するパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株
(19)【発行国】日本国特許庁(JP)
(12)【公報種別】公表特許公報(A)
(11)【公表番号】
(43)【公表日】2024-08-29
(54)【発明の名称】少量の菌体外多糖を産生するパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株
(51)【国際特許分類】
C12N 15/54 20060101AFI20240822BHJP
C12N 1/20 20060101ALI20240822BHJP
C07K 14/195 20060101ALI20240822BHJP
C12N 1/21 20060101ALI20240822BHJP
C12P 1/04 20060101ALI20240822BHJP
C12N 9/10 20060101ALI20240822BHJP
A01P 3/00 20060101ALI20240822BHJP
A01N 63/25 20200101ALI20240822BHJP
A01G 13/00 20060101ALI20240822BHJP
A01C 1/00 20060101ALI20240822BHJP
【ＦＩ】
C12N15/54
C12N1/20 A ZNA
C12N1/20 E
C07K14/195
C12N1/21
C12P1/04 Z
C12N9/10
A01P3/00
A01N63/25
A01G13/00 A
A01C1/00 B
【審査請求】未請求
【予備審査請求】未請求
(21)【出願番号】P 2024509337
(86)(22)【出願日】2022-08-09
(85)【翻訳文提出日】2024-02-16
(86)【国際出願番号】 EP2022072287
(87)【国際公開番号】W WO2023020880
(87)【国際公開日】2023-02-23
(31)【優先権主張番号】21192437.8
(32)【優先日】2021-08-20
(33)【優先権主張国・地域又は機関】EP
(81)【指定国・地域】
(71)【出願人】
【識別番号】508020155
【氏名又は名称】ビーエーエスエフ ソシエタス・ヨーロピア
【氏名又は名称原語表記】ＢＡＳＦ ＳＥ
【住所又は居所原語表記】Ｃａｒｌ－Ｂｏｓｃｈ－Ｓｔｒａｓｓｅ ３８， ６７０５６ Ｌｕｄｗｉｇｓｈａｆｅｎ ａｍ Ｒｈｅｉｎ， Ｇｅｒｍａｎｙ
(74)【代理人】
【識別番号】110002572
【氏名又は名称】弁理士法人平木国際特許事務所
(72)【発明者】
【氏名】マイ，トビアス
(72)【発明者】
【氏名】ハインリヒ，ダニエル クリストフ
(72)【発明者】
【氏名】ヘロルト，アンドレア
(72)【発明者】
【氏名】スティール，ラインハルト
【テーマコード（参考）】
2B051
4B064
4B065
4H011
4H045
【Ｆターム（参考）】
2B051AB01
2B051BA09
4B064CA02
4B064CA19
4B064CC24
4B065AA01X
4B065CA22
4B065CA24
4B065CA27
4B065CA47
4B065CA60
4H011AA01
4H011AA03
4H011BB21
4H045AA20
4H045CA11
4H045DA89
4H045EA05
4H045EA06
4H045FA72
4H045FA74
(57)【要約】
フリッパーゼＰｅｐＲ、フリッパーゼＰｅｐＨ、マンノース－１－ホスフェートグアニリルトランスフェラーゼ、及び／又はレバンスクラーゼＳａｃＢの活性の低下を含むパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株を開示する。これらのパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株は、液体培養物並びにこれらの株を含む農業用組成物及びこれらの株を作製及び使用する方法において成長した場合に低い粘度を示す。
【選択図】なし
【選択図】なし
【特許請求の範囲】
【請求項1】
パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株であって、ａ）ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲ、又は
ｂ）変異体ＰｅｐＨ、又は
ｃ）ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸ、又は
ｄ）変異体ＭａｎＣ、又は
ｅ）変異体ＳａｃＢ、又は
ｆ）ａ）、ｂ）、ｃ）、ｄ）、若しくはｅ）の少なくとも２つの組み合わせ
を含み、
前記ＰｅｐＲが存在しないか若しくは前記変異体ＰｅｐＲにより、野生型ＰｅｐＲを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、前記パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
前記変異体ＰｅｐＨにより、野生型ＰｅｐＨを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、前記パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
前記ＰｅｐＸが存在しないか若しくは前記変異体ＰｅｐＸにより、野生型ＰｅｐＸを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、前記パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
前記変異体ＭａｎＣにより、野生型ＭａｎＣを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、又はＭａｎＣを含まないパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、前記パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
前記変異体ＳａｃＢにより、ＳａｃＢを含まないパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、前記パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
それぞれの野生型ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、又はＳａｃＢを含み、比較に使用される前記パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株は、ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、若しくはＳａｃＢ又はその変異体を含まない株と同じパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）種のものである、
パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株。
【請求項2】
ａ）前記野生型ＰｅｐＲは、配列番号１と少なくとも８０％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、若しくは１００％同一のアミノ酸配列を有し、前記変異体ＰｅｐＲは、図２に示すアラインメントで１００％保存されているアミノ酸と同じ位置のアミノ酸とは異なるアミノ酸を含む、又はｂ）前記野生型ＰｅｐＨは、配列番号８と少なくとも８０％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、若しくは１００％同一のアミノ酸配列を有し、前記変異体ＰｅｐＨは、図３に示すアラインメントで１００％保存されているアミノ酸と同じ位置のアミノ酸とは異なるアミノ酸を含む、又は
ｃ）前記野生型ＰｅｐＸは、配列番号１５と少なくとも８０％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、若しくは１００％同一のアミノ酸配列を有し、前記変異体ＰｅｐＸは、図４に示すアラインメントで１００％保存されているアミノ酸と同じ位置のアミノ酸とは異なるアミノ酸を含む、又は
ｄ）前記野生型ＭａｎＣは、配列番号２２と少なくとも８０％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、若しくは１００％同一のアミノ酸配列を有し、前記変異体ＭａｎＣは、図５に示すアラインメントで１００％保存されているアミノ酸と同じ位置のアミノ酸とは異なるアミノ酸を含む、又は
ｅ）前記野生型ＳａｃＢは、配列番号１と少なくとも８０％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、若しくは１００％同一のアミノ酸配列を有し、前記変異体ＳａｃＢは、図６に示すアラインメントで１００％保存されていると同じ位置のアミノ酸とは異なるアミノ酸を含む、
請求項１に記載のパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株。
【請求項3】
ａ）ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲを含む、好ましくはＷ２２４＊若しくはＳ３９３Ｆ変異を有するＰｅｐＲを含む、又はｂ）変異したＰｅｐＨを含む、好ましくはＥ９６Ｋ若しくはＥ１６３Ｋ若しくはＥ９６Ｋ及びＥ１６３Ｋ変異を有するＰｅｐＨを含む、又は
ｃ）ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲを含む、好ましくはトランケートしたＰｅｐＲを含む、又は
ｄ）変異したＭａｎＣを含む、好ましくはＰ９０Ｓ、Ｅ３４０Ｋ、若しくはＧ４３３Ｄ変異を有するＭａｎＣを含む、又は
ｅ）トランケートしたＳａｃＢ若しくはＧ３２３Ｓ変異を有するＳａｃＢを含む、
請求項１又は２に記載のパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株。
【請求項4】
ＰｅｐＲを含まない、請求項１～３のいずれか１項に記載のパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株。
【請求項5】
ＰｅｐＸを含まない、請求項１～３のいずれか１項に記載のパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株。
【請求項6】
前記パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）の種が、パエニバチルス・ポリミクサ（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｐｏｌｙｍｙｘａ）、パエニバチルス・ジャミラエ（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｊａｍｉｌａｅ）、パエニバチルス・オットウィ（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｏｔｔｏｗｉｉ）、パエニバチルス・テラエ（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｔｅｒｒａｅ）、及びパエニバチルス・クリベンシス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｋｒｉｂｅｎｓｉｓ）から選択される、請求項１～５のいずれか１項に記載のパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株。
【請求項7】
前記パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の親株が、Ｐ．ポリミクサ（Ｐ．ｐｏｌｙｍｙｘａ）株ＤＳＭ３６５、Ｐ．ポリミクサ（Ｐ．ｐｏｌｙｍｙｘａ）株ＰＫＢ１、Ｐ．ポリミクサ（Ｐ．ｐｏｌｙｍｙｘａ）株ＪＢ０５－０１－１、Ｐ．ポリミクサ（Ｐ．ｐｏｌｙｍｙｘａ）株ＡＣ－１、Ｐ．ポリミクサ（Ｐ．ｐｏｌｙｍｙｘａ）株ＨＹ９６－２、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）Ａｌｏｅ－１１、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株ＮＲＲＬ Ｂ－５０９７２、ＮＲＲＬ Ｂ－６７１２９、ＮＲＲＬ Ｂ－６７３０４、ＮＲＲＬ Ｂ－６７３０６、及びＮＲＲＬ Ｂ－６７６１５、ＮＲＲＬ Ｂ－５０３７４、ＮＲＲＬ Ｂ－６７７２１、ＮＲＲＬ Ｂ－６７７２３、ＮＲＲＬ Ｂ－６７７２４、Ｐ．ポリミクサ（Ｐ．ｐｏｌｙｍｙｘａ）株ＶＭＣ１０／９６、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株１０．６Ｄ、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株 ９．４Ｅ、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株Ｌｕ１６７７４、Ｌｕ１７００７、及びＬｕ１７０１５、パエニバチルス・ポリミクサ（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ．ｐｏｌｙｍｙｘａ）株Ｍ１、パエニバチルス・ポリミクサ（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ．ｐｏｌｙｍｙｘａ）株ＳＣ２、Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ．ｐｏｌｙｍｙｘａ）株Ｓｂ３－１、並びにパエニバチルス・ポリミクサ（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ．ｐｏｌｙｍｙｘａ）株Ｅ６８１を含む株の群から選択される、請求項１～６のいずれか１項に記載のパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株。
【請求項8】
請求項１～７のいずれか１項に記載のパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株を含む農業用組成物。
【請求項9】
請求項１～７のいずれか１項に記載のパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株を含むか、又は請求項８に記載の農業用組成物でコーティングされる植物繁殖材料。
【請求項10】
植物の真菌感染を抑制又は予防する方法であって、前記真菌、その生息地、又は真菌の攻撃から保護される材料若しくは植物、又は土壌若しくは植物繁殖材料が、有効量の請求項１～７のいずれか１項に記載のパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株、又は請求項８に記載の農業用組成物で処理される、方法。
【請求項11】
発酵による価値ある生成物の生成方法であって、１）前記価値ある生成物が生成される条件下の培養培地中で、請求項１～７のいずれか１項に記載のパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株を培養する工程と、
３）前記価値ある生成物を収集する工程と、
を含む方法。
【請求項12】
前記価値ある生成物が、ａ）酵素若しくはタンパク質又は
ｂ）パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）の代謝産物又は
ｃ）２，３－ブタンジオール、乳酸、若しくはアセトイン又は
ｄ）この株によって産生されるＥＰＳである、
請求項１１に記載の価値ある生成物の生成方法。
【請求項13】
請求項１～７のいずれか１項に記載のパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の請求項８に記載の農業用組成物での使用、又は請求項１０～１２のいずれか１項に記載の方法での使用。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【0001】
本発明は、フリッパーゼＰｅｐＲ、フリッパーゼＰｅｐＨ、マンノース－１－ホスフェートグアニリルトランスフェラーゼ、及び／又はレバンスクラーゼＳａｃＢの活性の低下を含むパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株に関する。これらのパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株は、液体培養物中で成長した場合に低い粘度を示す。本発明はまた、これらの株を含む組成物、及びこれらの株の作製使用方法に関する。
【背景技術】
【0002】
パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）は、数種類の菌体外多糖（ＥＰＳ）を産生する能力で知られている（Ｌｉａｎｇ ａｎｄ Ｗａｎｇ，Ｒｅｃｅｎｔ Ａｄｖａｎｃｅｓ ｉｎ Ｅｘｏｐｏｌｙｓａｃｃｈａｒｉｄｅｓ ｆｒｏｍ Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐｐ．：Ｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ，Ｉｓｏｌａｔｉｏｎ，Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ，ａｎｄ Ｂｉｏａｃｔｉｖｉｔｉｅｓ，Ｍａｒ．Ｄｒｕｇｓ ２０１５，１３，１８４７ ｔｏ １８６３）。これまでに記載されたパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）種により産生されるＥＰＳの主成分は、以下のとおりである：
１）レバン、β－（２→６）フルクトフラノシド結合により連結したフルクトースのポリマー（Ｂｅｚｚａｔｅ ｅｔ ａｌ，Ｄｉｓｒｕｐｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｐｏｌｙｍｙｘａ ｌｅｖａｎｓｕｃｒａｓｅ ｇｅｎｅ ｉｍｐａｉｒｓ ｉｔｓ ａｂｉｌｉｔｙ ｔｏ ａｇｇｒｅｇａｔｅ ｓｏｉｌ ｉｎ ｔｈｅ ｗｈｅａｔ ｒｈｉｚｏｓｐｈｅｒｅ，Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ ２０００ ２（３），３３３ ｔｏ ３４２），
２）カードラン、（１→３）－ｄ－グリコシド結合のみで構成され、同軸三重らせんを形成する直鎖状グルカン。（Ｒａｆｉｇｈ ｅｔ ａｌ．，Ｏｐｔｉｍｉｚａｔｉｏｎ ｏｆ ｃｕｌｔｕｒｅ ｍｅｄｉｕｍ ａｎｄ ｍｏｄｅｌｉｎｇ ｏｆ ｃｕｒｄｌａｎ ｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ ｆｒｏｍ Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｐｏｌｙｍｙｘａ ｂｙ ＲＳＭ ａｎｄ ＡＮＮ、Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ Ｍａｃｒｏｍｏｌｅｃｕｌｅｓ ７０（２０１４）４６３－４７３）、並びに
３）パエナン（ｐａｅｎａｎ）、グルコース、マンノース、ガラクトース、及びグルクロン酸を含むヘテロ多糖（Ｍａｒｉｕｓ Ｒｕｅｔｅｒｉｎｇ，Ｅｘｏｐｏｌｙｓａｃｃｈａｒｉｄｅｓ ｂｙ Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｉ：ｆｒｏｍ Ｇｅｎｅｔｉｃ Ｓｔｒａｉｎ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ ｔｏ Ｉｎｄｕｓｔｒｉａｌ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎ，Ｄｉｓｓｅｒｔａｔｉｏｎ，２０１９）。
１）レバン、β－（２→６）フルクトフラノシド結合により連結したフルクトースのポリマー（Ｂｅｚｚａｔｅ ｅｔ ａｌ，Ｄｉｓｒｕｐｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｐｏｌｙｍｙｘａ ｌｅｖａｎｓｕｃｒａｓｅ ｇｅｎｅ ｉｍｐａｉｒｓ ｉｔｓ ａｂｉｌｉｔｙ ｔｏ ａｇｇｒｅｇａｔｅ ｓｏｉｌ ｉｎ ｔｈｅ ｗｈｅａｔ ｒｈｉｚｏｓｐｈｅｒｅ，Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ ２０００ ２（３），３３３ ｔｏ ３４２），
２）カードラン、（１→３）－ｄ－グリコシド結合のみで構成され、同軸三重らせんを形成する直鎖状グルカン。（Ｒａｆｉｇｈ ｅｔ ａｌ．，Ｏｐｔｉｍｉｚａｔｉｏｎ ｏｆ ｃｕｌｔｕｒｅ ｍｅｄｉｕｍ ａｎｄ ｍｏｄｅｌｉｎｇ ｏｆ ｃｕｒｄｌａｎ ｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ ｆｒｏｍ Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｐｏｌｙｍｙｘａ ｂｙ ＲＳＭ ａｎｄ ＡＮＮ、Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ Ｍａｃｒｏｍｏｌｅｃｕｌｅｓ ７０（２０１４）４６３－４７３）、並びに
３）パエナン（ｐａｅｎａｎ）、グルコース、マンノース、ガラクトース、及びグルクロン酸を含むヘテロ多糖（Ｍａｒｉｕｓ Ｒｕｅｔｅｒｉｎｇ，Ｅｘｏｐｏｌｙｓａｃｃｈａｒｉｄｅｓ ｂｙ Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｉ：ｆｒｏｍ Ｇｅｎｅｔｉｃ Ｓｔｒａｉｎ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ ｔｏ Ｉｎｄｕｓｔｒｉａｌ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎ，Ｄｉｓｓｅｒｔａｔｉｏｎ，２０１９）。
【0003】
パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｉ）は、これらのＥＰＳを産生するためにいくつかの経路を使用する。レバンの産生に必要なレバンスクラーゼ（ＳａｃＢ）の遺伝子に加えて、それらはいくつかの遺伝子クラスターを有している。１つの既知の遺伝子クラスターは、ＥＰＳを産生する２９個の遺伝子で構成されている。（Ｍａｒｉｕｓ Ｒｕｅｔｅｒｉｎｇ，Ｅｘｏｐｏｌｙｓａｃｃｈａｒｉｄｅｓ ｂｙ Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｉ：ｆｒｏｍ Ｇｅｎｅｔｉｃ Ｓｔｒａｉｎ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ ｔｏ Ｉｎｄｕｓｔｒｉａｌ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎ，Ｄｉｓｓｅｒｔａｔｉｏｎ，２０１９）。ＥＰＳのビルディングブロックを産生する遺伝子と、ペプチドグリカン細胞壁を通過するＥＰＳの輸送機能をコードする遺伝子に加えて、この遺伝子クラスターは、細胞膜を通して脂質結合オリゴ糖を輸送する機能を提供する２つのフリッパーゼ（ｐｅｐＨ及びｐｅｐＲ）と輸送されたオリゴ糖を重合させて最終的なＥＰＳを形成する２つのポリメラーゼ（ｐｅｐＥ及びｐｅｐＧ）で構成されている（Ｍａｒｉｕｓ Ｒｕｅｔｅｒｉｎｇ，Ｅｘｏｐｏｌｙｓａｃｃｈａｒｉｄｅｓ ｂｙ Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｉ：ｆｒｏｍ Ｇｅｎｅｔｉｃ Ｓｔｒａｉｎ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ ｔｏ Ｉｎｄｕｓｔｒｉａｌ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎ，Ｄｉｓｓｅｒｔａｔｉｏｎ，２０１９）。パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｉ）でカードランを産生する正確なメカニズムはまだ知られていない。しかしながら、パエナンは膜に位置するシンテターゼを介して産生されると考えられている（Ｍａｒｉｕｓ Ｒｕｅｔｅｒｉｎｇ，Ｅｘｏｐｏｌｙｓａｃｃｈａｒｉｄｅｓ ｂｙ Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｉ：ｆｒｏｍ Ｇｅｎｅｔｉｃ Ｓｔｒａｉｎ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ ｔｏ Ｉｎｄｕｓｔｒｉａｌ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎ，Ｄｉｓｓｅｒｔａｔｉｏｎ，２０１９）。
【0004】
生成されたＥＰＳは、バイオフィルムの形成など、自然環境においてパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｉ）にとって重要な機能を果たすが、工業生産プロセスにおける人工的な成長条件のように、糖が豊富に供給されている場合には、過剰に生成される傾向がある。このＥＰＳの過剰な生成により、粘度の高い培養ブロスがもたらされ、これにより撹拌が困難になり、発酵槽の全ての領域を最適に通気し、均等に栄養を供給することが困難になる。工業プロセスの目的がＥＰＳの生成ではない場合、その過剰生成は代謝負荷及び貴重な栄養素の吸収を意味するだけでなく、パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｉ）の胞子及びバイオマス、酵素、二次代謝物化合物、又は２，３－ブタンジオールなどの低重量化学物質など、経済的価値のある目的の生成物の下流処理及び単離において追加の問題を引き起こすことがよくある。
【0005】
このような問題を回避するために、パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｉ）のＥＰＳ産生能力を低下させるいくつかのアプローチが取られてきた。これらのアプローチでは、通常、個々の遺伝子の欠失、又はＥＰＳ産生クラスターの大部分の欠失を使用して、１つ以上のＥＰＳを産生する能力を破壊する。例えば：Ｏｋｏｎｋｗｏ ｅｔ ａｌ。Ｉｎａｃｔｉｖａｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ Ｌｅｖａｎｓｕｃｒａｓｅ Ｇｅｎｅ ｉｎ Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｐｏｌｙｍｙｘａ ＤＳＭ ３６５ Ｄｉｍｉｎｉｓｈｅｓ Ｅｘｏｐｏｌｙｓａｃｃｈａｒｉｄｅ Ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ ｄｕｒｉｎｇ ２，３－Ｂｕｔａｎｅｄｉｏｌ Ｆｅｒｍｅｎｔａｔｉｏｎ，Ａｐｐｌｉｅｄ ａｎｄ Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ，Ｖｏｌｕｍｅ ８６ Ｉｓｓｕｅ ９，２０２０，ｅ００１９６－２０は、レバンスクラーゼをコードする遺伝子を欠失していた。これらのアプローチには、レバンスクラーゼ遺伝子の欠失及びＥＰＳポリメラーゼの両方の遺伝子（ｐｅｐＥ及びｐｅｐＧ）並びに２つのフリッパーゼ遺伝子の１つの遺伝子（ｐｅｐＨ）を含む、パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）のＥＰＳ遺伝子クラスターの追加の１６遺伝子の欠失も含まれていた。同じ遺伝子クラスターが、Ｈｅ ｅｔ ａｌ．Ｅｆｆｅｃｔｓ ｏｆ ａｎ ＥＰＳ Ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ Ｇｅｎｅ Ｃｌｕｓｔｅｒ ｏｆ Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｐｏｌｙｍｙｘａ ＷＬＹ７８ ｏｎ Ｂｉｏｆｉｌｍ Ｆｏｒｍａｔｉｏｎ ａｎｄ Ｎｉｔｒｏｇｅｎ Ｆｉｘａｔｉｏｎ ｕｎｄｅｒ Ａｅｒｏｂｉｃ Ｃｏｎｄｉｔｉｏｎｓ，Ｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍｓ ２０２１，９，２８９．ｈｔｔｐｓ：／／ｄｏｉ．ｏｒｇ／１０．３３９０／ｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍｓ９０２０２８９．で例示されている。Ｈｅ ｅｔ ａｌ．は、遺伝子クラスター全体を２つの別々の大きな欠失で欠失させ、ｐｅｐＨを含む大きな欠失により低量のＥＰＳを産生する菌株が生じることを見出したが、ｐｅｐＲを含む大きな遺伝子クラスターの後半の欠失がＥＰＳの産生に影響を及ぼさないことを見出した。
【0006】
これらのアプローチは大規模発酵中のＥＰＳ生成を低減することに成功している一方で、特に高濃度のグルコース及び／又はサッカロースが成長培地中に存在する場合、微生物の代謝に対する影響はそれほど深刻ではないが、それでも大規模発酵中のＥＰＳ生成を低減する、それほど極端ではないアプローチの必要性が依然として残っている。また、大規模発酵中にＥＰＳ生成は十分に低下するが、自然条件下で成長した場合にバイオフィルム形成及び植物との相互作用を可能にするのに十分な量のＥＰＳを産生する能力を維持する新しい菌株も必要とされている。
【0007】
驚くべきことに、パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｉ）の１つのフリッパーゼの活性を低下させるだけで、総ＥＰＳ生成に強い影響を与えるのに十分であるということが見出された。同様に驚くべきことに、変異体レバンスクラーゼは、レバンスクラーゼコード配列全体を欠失させるよりも総ＥＰＳ生成の強力な低減につながる可能性があるということが見出された。両方の場合において、変異体株の代謝活性は、例えば、発酵プロセス中に到達した最大二酸化炭素移動速度（ＣＴＲ）によって示されるように、増加した。
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【0008】
一態様では、本明細書において、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株であって、
ａ）ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲ、又はｂ）変異体ＰｅｐＨ、又はｃ）ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸ、又は
ｄ）変異体ＭａｎＣ、又はｅ）変異体ＳａｃＢ、又はｆ）ａ）、ｂ）、ｃ）、ｄ）、若しくはｅ）の少なくとも２つの組み合わせを含み、ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲにより、野生型ＰｅｐＲを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、変異体ＰｅｐＨにより、野生型ＰｅｐＨを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸにより、野生型ＰｅｐＸを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、変異体ＭａｎＣにより、野生型ＭａｎＣを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、又はＭａｎＣを含まないパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
変異体ＳａｃＢにより、ＳａｃＢを含まないパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされる、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株が提供される。
ａ）ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲ、又はｂ）変異体ＰｅｐＨ、又はｃ）ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸ、又は
ｄ）変異体ＭａｎＣ、又はｅ）変異体ＳａｃＢ、又はｆ）ａ）、ｂ）、ｃ）、ｄ）、若しくはｅ）の少なくとも２つの組み合わせを含み、ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲにより、野生型ＰｅｐＲを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、変異体ＰｅｐＨにより、野生型ＰｅｐＨを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸにより、野生型ＰｅｐＸを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、変異体ＭａｎＣにより、野生型ＭａｎＣを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、又はＭａｎＣを含まないパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
変異体ＳａｃＢにより、ＳａｃＢを含まないパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされる、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株が提供される。
【0009】
更なる態様では、本明細書において、農業用組成物であって、ａ）ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲ、又はｂ）ＰｅｐＨが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＨ、又はｃ）ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸ、又はｄ）ＭａｎＣが存在しないか若しくは変異体ＭａｎＣ、又はｅ）ＳａｃＢが存在しないか若しくは変異体ＳａｃＢ、又はｆ）ａ）、ｂ）、ｃ）、ｄ）、ｅ）、若しくはｆ）のうちの少なくとも２つの組み合わせを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株を含み、
ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲにより、野生型ＰｅｐＲを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＨが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＨにより、野生型ＰｅｐＨを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸにより、野生型ＰｅｐＸを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＭａｎＣが存在しないか若しくは変異体ＭａｎＣにより、野生型ＭａｎＣを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＳａｃＢが存在しないか若しくは変異体ＳａｃＢにより、ＳａｃＢを含まないパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
それぞれの野生型ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、又はＳａｃＢを含み、比較に使用されるパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株は、ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、若しくはＳａｃＢが存在しないか又はその変異体を含む株と同じパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）種のものである、
農業用組成物が提供される。
ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲにより、野生型ＰｅｐＲを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＨが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＨにより、野生型ＰｅｐＨを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸにより、野生型ＰｅｐＸを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＭａｎＣが存在しないか若しくは変異体ＭａｎＣにより、野生型ＭａｎＣを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＳａｃＢが存在しないか若しくは変異体ＳａｃＢにより、ＳａｃＢを含まないパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
それぞれの野生型ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、又はＳａｃＢを含み、比較に使用されるパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株は、ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、若しくはＳａｃＢが存在しないか又はその変異体を含む株と同じパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）種のものである、
農業用組成物が提供される。
【0010】
更なる態様では、本明細書において、植物繁殖材料であって、ａ）ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲ、又はｂ）ＰｅｐＨが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＨ、又はｃ）ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸ、又はｄ）ＭａｎＣが存在しないか若しくは変異体ＭａｎＣ、又はｅ）ＳａｃＢが存在しないか若しくは変異体ＳａｃＢ、又はｆ）ａ）、ｂ）、ｃ）、ｄ）、ｅ）、若しくはｆ）のうちの少なくとも２つの組み合わせを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株を含み、
ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲにより、野生型ＰｅｐＲを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＨが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＨにより、野生型ＰｅｐＨを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸにより、野生型ＰｅｐＸを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＭａｎＣが存在しないか若しくは変異体ＭａｎＣにより、野生型ＭａｎＣを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＳａｃＢが存在しないか若しくは変異体ＳａｃＢにより、ＳａｃＢを含まないパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
それぞれの野生型ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、又はＳａｃＢを含み、比較に使用されるパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株は、ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、若しくはＳａｃＢが存在しないか又はその変異体を含む株と同じパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）種のものである、
植物繁殖材料が提供される。
ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲにより、野生型ＰｅｐＲを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＨが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＨにより、野生型ＰｅｐＨを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸにより、野生型ＰｅｐＸを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＭａｎＣが存在しないか若しくは変異体ＭａｎＣにより、野生型ＭａｎＣを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＳａｃＢが存在しないか若しくは変異体ＳａｃＢにより、ＳａｃＢを含まないパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
それぞれの野生型ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、又はＳａｃＢを含み、比較に使用されるパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株は、ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、若しくはＳａｃＢが存在しないか又はその変異体を含む株と同じパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）種のものである、
植物繁殖材料が提供される。
【0011】
一態様では、本明細書において、植物の真菌感染を抑制又は予防する方法であって、真菌、その生息地又は真菌の攻撃から保護すべき材料若しくは植物、又は土壌若しくは植物繁殖材料が、ａ）ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲ、又はｂ）ＰｅｐＨが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＨ、又はｃ）ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸ、又はｄ）ＭａｎＣが存在しないか若しくは変異体ＭａｎＣ、又はｅ）ＳａｃＢが存在しないか若しくは変異体ＳａｃＢ、又はｆ）ａ）、ｂ）、ｃ）、ｄ）、ｅ）、若しくはｆ）のうちの少なくとも２つの組み合わせを含む有効量のパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株で処理され、
ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲにより、野生型ＰｅｐＲを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＨが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＨにより、野生型ＰｅｐＨを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸにより、野生型ＰｅｐＸを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＭａｎＣが存在しないか若しくは変異体ＭａｎＣにより、野生型ＭａｎＣを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＳａｃＢが存在しないか若しくは変異体ＳａｃＢにより、ＳａｃＢを含まないパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされるか、又は
真菌、その生息地又は真菌の攻撃から保護すべき材料若しくは植物、又は土壌若しくは植物繁殖材料が、ａ）ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲ、又はｂ）ＰｅｐＨが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＨ、又はｃ）ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸ、又はｄ）ＭａｎＣが存在しないか若しくは変異体ＭａｎＣ、又はｅ）ＳａｃＢが存在しないか若しくは変異体ＳａｃＢ、又はｆ）ａ）、ｂ）、ｃ）、ｄ）、ｅ）、若しくはｆ）のうちの少なくとも２つの組み合わせを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株を含む有効量の農業用組成物で処理され、
ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲにより、野生型ＰｅｐＲを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＨが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＨにより、野生型ＰｅｐＨを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸにより、野生型ＰｅｐＸを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＭａｎＣが存在しないか若しくは変異体ＭａｎＣにより、野生型ＭａｎＣを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＳａｃＢが存在しないか若しくは変異体ＳａｃＢにより、ＳａｃＢを含まないパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
それぞれの野生型ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、又はＳａｃＢを含み、比較に使用されるパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株は、ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、若しくはＳａｃＢが存在しないか又はその変異体を含む株と同じパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）種のものである、
方法が提供される。
ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲにより、野生型ＰｅｐＲを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＨが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＨにより、野生型ＰｅｐＨを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸにより、野生型ＰｅｐＸを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＭａｎＣが存在しないか若しくは変異体ＭａｎＣにより、野生型ＭａｎＣを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＳａｃＢが存在しないか若しくは変異体ＳａｃＢにより、ＳａｃＢを含まないパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされるか、又は
真菌、その生息地又は真菌の攻撃から保護すべき材料若しくは植物、又は土壌若しくは植物繁殖材料が、ａ）ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲ、又はｂ）ＰｅｐＨが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＨ、又はｃ）ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸ、又はｄ）ＭａｎＣが存在しないか若しくは変異体ＭａｎＣ、又はｅ）ＳａｃＢが存在しないか若しくは変異体ＳａｃＢ、又はｆ）ａ）、ｂ）、ｃ）、ｄ）、ｅ）、若しくはｆ）のうちの少なくとも２つの組み合わせを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株を含む有効量の農業用組成物で処理され、
ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲにより、野生型ＰｅｐＲを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＨが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＨにより、野生型ＰｅｐＨを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸにより、野生型ＰｅｐＸを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＭａｎＣが存在しないか若しくは変異体ＭａｎＣにより、野生型ＭａｎＣを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＳａｃＢが存在しないか若しくは変異体ＳａｃＢにより、ＳａｃＢを含まないパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
それぞれの野生型ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、又はＳａｃＢを含み、比較に使用されるパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株は、ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、若しくはＳａｃＢが存在しないか又はその変異体を含む株と同じパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）種のものである、
方法が提供される。
【0012】
また、発酵による価値ある生成物の生成方法であって、
１）価値ある生成物が生成される条件下の培養培地中で、
ａ）ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲ、又はｂ）ＰｅｐＨが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＨ、又はｃ）ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸ、又はｄ）ＭａｎＣが存在しないか若しくは変異体ＭａｎＣ、又はｅ）ＳａｃＢが存在しないか若しくは変異体ＳａｃＢ、又はｆ）ａ）、ｂ）、ｃ）、ｄ）、ｅ）、若しくはｆ）のうちの少なくとも２つの組み合わせを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株を培養する工程であって、
ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲにより、野生型ＰｅｐＲを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＨが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＨにより、野生型ＰｅｐＨを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸにより、野生型ＰｅｐＸを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＭａｎＣが存在しないか若しくは変異体ＭａｎＣにより、野生型ＭａｎＣを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＳａｃＢが存在しないか若しくは変異体ＳａｃＢにより、ＳａｃＢを含まないパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、それぞれの野生型ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、又はＳａｃＢを含み、比較に使用されるパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株は、ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、若しくはＳａｃＢが存在しないか又はその変異体を含む株と同じパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）種のものである、
工程と、
２）価値ある生成物を収集する工程と、
を含む方法が提供される。
１）価値ある生成物が生成される条件下の培養培地中で、
ａ）ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲ、又はｂ）ＰｅｐＨが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＨ、又はｃ）ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸ、又はｄ）ＭａｎＣが存在しないか若しくは変異体ＭａｎＣ、又はｅ）ＳａｃＢが存在しないか若しくは変異体ＳａｃＢ、又はｆ）ａ）、ｂ）、ｃ）、ｄ）、ｅ）、若しくはｆ）のうちの少なくとも２つの組み合わせを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株を培養する工程であって、
ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲにより、野生型ＰｅｐＲを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＨが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＨにより、野生型ＰｅｐＨを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸにより、野生型ＰｅｐＸを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＭａｎＣが存在しないか若しくは変異体ＭａｎＣにより、野生型ＭａｎＣを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＳａｃＢが存在しないか若しくは変異体ＳａｃＢにより、ＳａｃＢを含まないパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、それぞれの野生型ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、又はＳａｃＢを含み、比較に使用されるパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株は、ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、若しくはＳａｃＢが存在しないか又はその変異体を含む株と同じパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）種のものである、
工程と、
２）価値ある生成物を収集する工程と、
を含む方法が提供される。
【図面の簡単な説明】
【0013】
【図1】図１は、ＰｅｐＲ（本明細書ではｅｘｏＴと呼ぶ）、ＳａｃＢをコードする領域を欠失させることによるパエニバチルスＬＵ１７００７株の異なる変異体及びパエニバチルス株ＬＵ１７００７に由来する株、並びにＳａｃＢのＧ３２３Ｓ変異体を含む株バリアントの培養時間にわたる粘度の変化を示す。
【図2】図２は、パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株ＬＵ１７００７、パエニバチルス・オットウィ（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｏｔｔｏｗｉｉ）、パエニバチルス・ポリミクサ（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｐｏｌｙｍｙｘａ）ＤＳＭ３６５、パエニバチルス・テラエ（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｔｅｒｒａｅ）、パエニバチルス・クリベンシス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｋｒｉｐｂｂｅｎｓｉｓ）、及びパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）Ａｌｏｅ－１１のＰｅｐＲのアミノ酸配列のアラインメントを示す。
【図3】図３は、パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株ＬＵ１７００７、パエニバチルス・オットウィ（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｏｔｔｏｗｉｉ）、パエニバチルス・ポリミクサ（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｐｏｌｙｍｙｘａ）ＤＳＭ３６５、パエニバチルス・テラエ（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｔｅｒｒａｅ）、パエニバチルス・クリベンシス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｋｒｉｐｂｂｅｎｓｉｓ）、及びパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）Ａｌｏｅ－１１のＰｅｐＨのアミノ酸配列のアラインメントを示す。
【図4】図４は、パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株ＬＵ１７００７、パエニバチルス・オットウィ（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｏｔｔｏｗｉｉ）、パエニバチルス・ポリミクサ（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｐｏｌｙｍｙｘａ）ＤＳＭ３６５、パエニバチルス・テラエ（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｔｅｒｒａｅ）、パエニバチルス・クリベンシス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｋｒｉｐｂｂｅｎｓｉｓ）、及びパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）Ａｌｏｅ－１１のＰｅｐＸのアミノ酸配列のアラインメントを示す。
【発明を実施するための形態】
【0014】
本明細書において、パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株であって、
ａ）ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲ、又は
ｂ）変異体ＰｅｐＨ、又は
ｃ）ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸ、又は
ｄ）変異体ＭａｎＣ、又は
ｅ）変異体ＳａｃＢ、又は
ｆ）ａ）、ｂ）、ｃ）、ｄ）、若しくはｅ）の少なくとも２つの組み合わせを含み、
ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲにより、野生型ＰｅｐＲを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
変異体ＰｅｐＨにより、野生型ＰｅｐＨを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸにより、野生型ＰｅｐＸを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
変異体ＭａｎＣにより、野生型ＭａｎＣを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、又はＭａｎＣを含まないパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
変異体ＳａｃＢにより、ＳａｃＢを含まないパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされる、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株が記載される。
好ましくは、それぞれの野生型ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、又はＳａｃＢを含み、比較に使用されるパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株は、ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、若しくはＳａｃＢが存在しないか又はその変異体を含む株と同じパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）種のものである。
更により好ましくは、比較に使用されるパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株は、ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、若しくはＳａｃＢを欠くか、又はそれぞれの変異体を含むパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）の親株である。
好ましくは、ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、又はＳａｃＢを含まない株は、それぞれの遺伝子配列の欠失、又は未成熟終止コドンにつながる変異を有する。
ａ）ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲ、又は
ｂ）変異体ＰｅｐＨ、又は
ｃ）ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸ、又は
ｄ）変異体ＭａｎＣ、又は
ｅ）変異体ＳａｃＢ、又は
ｆ）ａ）、ｂ）、ｃ）、ｄ）、若しくはｅ）の少なくとも２つの組み合わせを含み、
ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲにより、野生型ＰｅｐＲを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
変異体ＰｅｐＨにより、野生型ＰｅｐＨを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸにより、野生型ＰｅｐＸを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
変異体ＭａｎＣにより、野生型ＭａｎＣを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、又はＭａｎＣを含まないパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
変異体ＳａｃＢにより、ＳａｃＢを含まないパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされる、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株が記載される。
好ましくは、それぞれの野生型ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、又はＳａｃＢを含み、比較に使用されるパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株は、ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、若しくはＳａｃＢが存在しないか又はその変異体を含む株と同じパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）種のものである。
更により好ましくは、比較に使用されるパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株は、ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、若しくはＳａｃＢを欠くか、又はそれぞれの変異体を含むパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）の親株である。
好ましくは、ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、又はＳａｃＢを含まない株は、それぞれの遺伝子配列の欠失、又は未成熟終止コドンにつながる変異を有する。
【0015】
本明細書で使用する場合、「パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株」という用語は、「パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株」という用語と同じであり、パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）属の細菌株を意味する。パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）属は、全てのパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐｐ．）を含む。
【0016】
本明細書に開示されるこれらのパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株は、それぞれ、野生型ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、又はＳａｃＢを含むパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株と比較した場合、液体培養物で成長させた場合に粘度の低下を示す。
【0017】
ＰｅｐＲが存在しないか又は変異体ＰｅｐＲを含むパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株は、通常、野生型ＰｅｐＲを含むパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株と比較される。好ましくは、ＰｅｐＲが存在しないか又は変異体ＰｅｐＲを含むパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株は、突然変異又はトランスジェニック又は遺伝子編集法によって生成されたパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株、すなわち親株と比較される。
【0018】
したがって、親株は、それぞれの変異の存在を除いて、それぞれのパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株と同一のゲノム配列を有する。
同じ原理を変異体ＰｅｐＨ又は変異体ＳａｃＢを含むパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株に適用する。
同じ原理を変異体ＰｅｐＨ又は変異体ＳａｃＢを含むパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株に適用する。
【0019】
粘度は、好ましくは本明細書の実施例２及び３に記載したのと同じ方法を使用して測定され、グルコース又はサッカロースのいずれか、好ましくはグルコースがＣ源として使用される。好ましくは、液体培地は、実施例２で記載されるグルコースを含む。菌株は液体培養物で成長した場合、微生物の成長開始から少なくとも１２時間、少なくとも２４時間、又は少なくとも４０時間の培養時間後に、好ましくは少なくとも２４時間の培養時間後に１００／ｓで測定した粘度［ｍＰａ・ｓ］が比較菌株の１００／ｓで測定した粘度［ｍＰａ・ｓ］より低い場合、より粘度が低くなると考えられる。菌株は、好ましくは、培養８時間～培養４０時間までの１時間ごとに測定した粘度の合計が、比較に使用した菌株の培養８時間～培養４０時間までの１時間ごとに測定した粘度の合計より小さい場合、より粘度が低くなると考えられる。
【0020】
本明細書で使用する場合、本明細書及び特許請求の範囲で使用される動詞「含む」、並びにその活用形は、その用語に続く項目が含まれることを意味する非限定的な意味で使用されるが、特に言及されていない項目は除外されない。加えて、不定冠詞「１つ（ａ）」又は「１つ（ａｎ）」による要素への言及は、文脈が明らかに１つの、及び唯一の要素があることを要求しない限り、２つ以上の要素が存在する可能性を排除しない。したがって、不定冠詞「１つ（ａ）」又は「１つ（ａｎ）」は、通常「少なくとも１つ」を意味する。
【0021】
用語「（菌）株」は、細胞の成長中の突然変異の自然頻度を考慮した場合に、遺伝的に均質であると考えられ得る微生物細胞を指すことを意図している。菌株は、１つの細胞から微生物コロニーの培養を介して単離されることが多い。
【0022】
１つの菌株から増殖した微生物培養物は、生物学的純粋培養物と見なされる。
【0023】
本明細書で使用する場合、用語「生物学的純粋培養物」は、他の種又は菌株の微生物を本質的に含まない菌株の培養物を指す。好ましい実施形態では、「生物学的純粋培養物」は、１％未満、より好ましくは０．１％未満、更により好ましくは０．０１％未満の他の種の細胞を含む。
【0024】
菌株はまた、意図的に、他の菌株と混合して共培養物を作成することができる。このような共培養物は、同時に個々の菌株の１つ以上の生物学的純粋培養物を含むと考えられている。
【0025】
変異体という用語は、タンパク質に関して使用される場合、そのようなタンパク質をコードするゲノム領域が、そのようなタンパク質の野生型アミノ酸配列と比較して、コードされたタンパク質のアミノ酸配列の変化をもたらす少なくとも１つのヌクレオチドを含む状況を指す。
【0026】
変異体という用語は、タンパク質の遺伝子に関して使用される場合、プロモーターのポリヌクレオチド配列又はそのようなタンパク質のコードされたＲＮＡ配列が野生型配列とは異なり、コードされたタンパク質の発現レベルが変化する、好ましくは低下する状況を指す。
【0027】
本発明の一実施形態では、パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株は、このパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株の野生型と比較して、このようなパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株のＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、及び／又はＳａｃＢの発現レベルの低下をもたらす変異体遺伝子を含む。
【0028】
本発明のパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株は、バッチプロセス又は供給バッチプロセス若しくは反復供給バッチプロセスにおいて連続的又は不連続的に培養することができる。公知の培養方法の概観は、Ｃｈｍｉｅｌによる教科書（Ｂｉｏｐｒｏｚｅｓｓｔｅｃｈｎｉｋ １．Ｅｉｎｆｕｅｈｒｕｎｇ ｉｎ ｄｉｅ Ｂｉｏｖｅｒｆａｈｒｅｎｓｔｅｃｈｎｉｋ（Ｇｕｓｔａｖ Ｆｉｓｃｈｅｒ Ｖｅｒｌａｇ，Ｓｔｕｔｔｇａｒｔ，１９９１））又はＳｔｏｒｈａｓによる教科書（Ｂｉｏｒｅａｋｔｏｒｅｎ ｕｎｄ ｐｅｒｉｐｈｅｒｅ Ｅｉｎｒｉｃｈｔｕｎｇｅｎ（Ｖｉｅｗｅｇ Ｖｅｒｌａｇ，Ｂｒａｕｎｓｃｈｗｅｉｇ／Ｗｉｅｓｂａｄｅｎ，１９９４））に見出される。
【0029】
パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株の培養に使用される培地は、適切に特定の株の要件を満たさなければならない。種々の微生物のための培地の説明は、Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｓｏｃｉｅｔｙ ｆｏｒ Ｂａｃｔｅｒｉｏｌｏｇｙのハンドブック“Ｍａｎｕａｌ ｏｆ Ｍｅｔｈｏｄｓ ｆｏｒ Ｇｅｎｅｒａｌ Ｂａｃｔｅｒｉｏｌｏｇｙ”（Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ Ｄ．Ｃ．，ＵＳＡ，１９８１）に記載されている。更なる好適な培地は、当該技術分野で、例えば、本明細書で引用される文書に開示されている。
【0030】
好ましくは、パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株は、以下のパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）種に属する：パエニバチルス・ポリミクサ（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｐｏｌｙｍｙｘａ）、パエニバチルス・ジャミラエ（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｊａｍｉｌａｅ）、パエニバチルス・オットウィ（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｏｔｔｏｗｉｉ）、パエニバチルス・テラエ（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｔｅｒｒａｅ）、又はパエニバチルス・クリベンシス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｋｒｉｂｅｎｓｉｓ）。
【0031】
本発明の株を構築するのに好適な好ましい株は、Ｐ．ポリミクサ（Ｐ．ｐｏｌｙｍｙｘａ）株ＤＳＭ３６５、Ｐ．ポリミクサ（Ｐ．ｐｏｌｙｍｙｘａ）株ＰＫＢ１、Ｐ．ポリミクサ（Ｐ．ｐｏｌｙｍｙｘａ）株ＪＢ０５－０１－１、Ｐ．ポリミクサ（Ｐ．ｐｏｌｙｍｙｘａ）株ＡＣ－１、Ｐ．ポリミクサ（Ｐ．ｐｏｌｙｍｙｘａ）株ＨＹ９６－２、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）Ａｌｏｅ－１１、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株ＮＲＲＬ Ｂ－５０９７２、ＮＲＲＬ Ｂ－６７１２９、ＮＲＲＬ Ｂ－６７３０４、ＮＲＲＬ Ｂ－６７３０６、及びＮＲＲＬ Ｂ－６７６１５、ＮＲＲＬ Ｂ－５０３７４、ＮＲＲＬ Ｂ－６７７２１、ＮＲＲＬ Ｂ－６７７２３、ＮＲＲＬ Ｂ－６７７２４、Ｐ．ポリミクサ（Ｐ．ｐｏｌｙｍｙｘａ）株ＶＭＣ１０／９６、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株１０．６Ｄ、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株 ９．４Ｅ、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株Ｌｕ１６７７４、Ｌｕ１７００７、及びＬｕ１７０１５、Ｐ．ポリミクサ（Ｐ．ｐｏｌｙｍｙｘａ）株Ｍ１、Ｐ．ポリミクサ（Ｐ．ｐｏｌｙｍｙｘａ）株ＳＣ２、Ｐ．ポリミクサ（Ｐ．ｐｏｌｙｍｙｘａ）株Ｓｂ３－１、並びにＰ．ポリミクサ（Ｐ．ｐｏｌｙｍｙｘａ）株Ｅ６８１である。特に好ましい株は、Ｌｕ１７００７及びＤＳＭ３６５である。
【0032】
フリッパーゼＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体フリッパーゼＰｅｐＲ又は変異体フリッパーゼＰｅｐＨ、フリッパーゼＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体フリッパーゼＰｅｐＸ、マンノース－１－ホスフェートグアニリルトランスフェラーゼＭａｎＣが存在しないか若しくは変異体マンノース－１－ホスフェートグアニリルトランスフェラーゼＭａｎＣ、又は変異体レバンスクラーゼＳａｃＢを含むパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株は、好ましくは、野生型ＰｅｐＲが配列番号１と少なくとも８０％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、若しくは１００％同一のアミノ酸配列を有し、変異体ＰｅｐＲが、図２で示されたアラインメントで１００％保存されているアミノ酸と同じ位置のアミノ酸とは異なるアミノ酸を含む株であるか、又は
野生型ＰｅｐＨが、配列番号８と少なくとも８０％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、若しくは１００％同一のアミノ酸配列を有し、変異体ＰｅｐＨが、図３に示すアラインメントで１００％保存されているアミノ酸と同じ位置のアミノ酸とは異なるアミノ酸を含む株であるか、又は
野生型ＰｅｐＸが、配列番号１５と少なくとも８０％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、若しくは１００％同一のアミノ酸配列を有し、変異体ＰｅｐＨが、図４に示すアラインメントで１００％保存されているアミノ酸と同じ位置のアミノ酸とは異なるアミノ酸を含む株であるか、又は
野生型ＭａｎＣが、配列番号２２と少なくとも８０％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、若しくは１００％同一のアミノ酸配列を有し、変異体ＭａｎＣが、図５に示すアラインメントで１００％保存されているアミノ酸と同じ位置のアミノ酸とは異なるアミノ酸を含む株であるか、又は
野生型ＳａｃＢが、配列番号２９と少なくとも８０％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、若しくは１００％同一のアミノ酸配列を有し、変異体ＳａｃＢが、図６に示すアラインメントで１００％保存されているアミノ酸と同じ位置のアミノ酸とは異なるアミノ酸を含む株である。
野生型ＰｅｐＨが、配列番号８と少なくとも８０％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、若しくは１００％同一のアミノ酸配列を有し、変異体ＰｅｐＨが、図３に示すアラインメントで１００％保存されているアミノ酸と同じ位置のアミノ酸とは異なるアミノ酸を含む株であるか、又は
野生型ＰｅｐＸが、配列番号１５と少なくとも８０％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、若しくは１００％同一のアミノ酸配列を有し、変異体ＰｅｐＨが、図４に示すアラインメントで１００％保存されているアミノ酸と同じ位置のアミノ酸とは異なるアミノ酸を含む株であるか、又は
野生型ＭａｎＣが、配列番号２２と少なくとも８０％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、若しくは１００％同一のアミノ酸配列を有し、変異体ＭａｎＣが、図５に示すアラインメントで１００％保存されているアミノ酸と同じ位置のアミノ酸とは異なるアミノ酸を含む株であるか、又は
野生型ＳａｃＢが、配列番号２９と少なくとも８０％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、若しくは１００％同一のアミノ酸配列を有し、変異体ＳａｃＢが、図６に示すアラインメントで１００％保存されているアミノ酸と同じ位置のアミノ酸とは異なるアミノ酸を含む株である。
【0033】
フリッパーゼＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体フリッパーゼＰｅｐＲ又は変異体フリッパーゼＰｅｐＨ、フリッパーゼＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体フリッパーゼＰｅｐＸ、マンノース－１－ホスフェートグアニリルトランスフェラーゼＭａｎＣが存在しないか若しくは変異体マンノース－１－ホスフェートグアニリルトランスフェラーゼＭａｎＣ、
又は変異体レバンスクラーゼＳａｃＢを含むパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株は、好ましくは、野生型ＰｅｐＲが配列番号１と少なくとも８０％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、若しくは１００％同一のアミノ酸配列を有し、変異体ＰｅｐＲが、配列番号１～７のいずれか１つと１００％同一ではないアミノ酸配列を含むか、若しくは未成熟終止コドンを含む株であるか、又は
野生型ＰｅｐＨが配列番号８と少なくとも８０％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、若しくは１００％同一のアミノ酸配列を有し、変異体ＰｅｐＲが、配列番号８～１４のいずれか１つと１００％同一ではないアミノ酸配列を含むか、若しくは未成熟終止コドンを含む株であるか、又は
野生型ＰｅｐＸが配列番号１５と少なくとも８０％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、若しくは１００％同一のアミノ酸配列を有し、変異体ＰｅｐＸが、配列番号１５～２１のいずれか１つと１００％同一ではないアミノ酸配列を含むか、若しくは未成熟終止コドンを含む株であるか、又は
野生型ＭａｎＣが配列番号２２と少なくとも８０％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、若しくは１００％同一のアミノ酸配列を有し、変異体ＭａｎＣが、配列番号２２～２８のいずれか１つと１００％同一ではないアミノ酸配列を含むか、若しくは未成熟終止コドンを含む株であるか、又は
野生型ＳａｃＢが配列番号２９と少なくとも８０％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、若しくは１００％同一のアミノ酸配列を有し、変異体ＳａｃＢが、配列番号２９～３５のいずれか１つと１００％同一ではないアミノ酸配列を含むか、若しくは未成熟終止コドンを含む株である。
又は変異体レバンスクラーゼＳａｃＢを含むパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株は、好ましくは、野生型ＰｅｐＲが配列番号１と少なくとも８０％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、若しくは１００％同一のアミノ酸配列を有し、変異体ＰｅｐＲが、配列番号１～７のいずれか１つと１００％同一ではないアミノ酸配列を含むか、若しくは未成熟終止コドンを含む株であるか、又は
野生型ＰｅｐＨが配列番号８と少なくとも８０％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、若しくは１００％同一のアミノ酸配列を有し、変異体ＰｅｐＲが、配列番号８～１４のいずれか１つと１００％同一ではないアミノ酸配列を含むか、若しくは未成熟終止コドンを含む株であるか、又は
野生型ＰｅｐＸが配列番号１５と少なくとも８０％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、若しくは１００％同一のアミノ酸配列を有し、変異体ＰｅｐＸが、配列番号１５～２１のいずれか１つと１００％同一ではないアミノ酸配列を含むか、若しくは未成熟終止コドンを含む株であるか、又は
野生型ＭａｎＣが配列番号２２と少なくとも８０％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、若しくは１００％同一のアミノ酸配列を有し、変異体ＭａｎＣが、配列番号２２～２８のいずれか１つと１００％同一ではないアミノ酸配列を含むか、若しくは未成熟終止コドンを含む株であるか、又は
野生型ＳａｃＢが配列番号２９と少なくとも８０％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、若しくは１００％同一のアミノ酸配列を有し、変異体ＳａｃＢが、配列番号２９～３５のいずれか１つと１００％同一ではないアミノ酸配列を含むか、若しくは未成熟終止コドンを含む株である。
【0034】
一実施形態では、パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株は、Ｗ２２４＊又はＳ３９３Ｆ変異を含む変異体ＰｅｐＲを含む。
【0035】
一実施形態では、パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株は、Ｅ９６Ｋ変異又はＥ１６３Ｋ変異又はＥ９６Ｋ及びＥ１６３Ｋ変異を含む変異体ＰｅｐＨを含む。
【0036】
一実施形態では、パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株は、変異体ＰｅｐＨと、ＰｅｐＲが存在しないか又は変異体ＰｅｐＲと、を含む。
【0037】
一実施形態では、パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株は、Ｅ９６Ｋ変異又はＥ１６３Ｋ変異又はＥ９６Ｋ及びＥ１６３Ｋ変異を含む変異体ＰｅｐＨと、Ｗ２２４＊又はＳ３９３Ｆ変異を含む変異体ＰｅｐＲと、を含む。
【0038】
一実施形態では、パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株は、Ｐ９０Ｓ、Ｅ３４０Ｋ、又はＧ４３３Ｄ変異を含む変異体ＭａｎＣを含む。
【0039】
一実施形態では、パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株は、Ｇ３２３Ｓ変異を含む変異体ＳａｃＢを含む。
【0040】
パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株は、当業者に周知であり、例えば国際公開第１６０２０３７１号パンフレット（２０ページ３３行目から２２ページ２９行目までが参照により本明細書に組み込まれる）に開示されている培養ブロス及び培養条件下で増殖させることができる。
【0041】
パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｉ）は、植物の病原体感染を抑制又は防止するための生物農薬として使用することができる。病原体感染を抑制又は防止するために好適なパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｉ）の株は、例えば、国際公開第２０１６／１５４２９７号パンフレット、同第２０１９／２２１９８８号パンフレット、同第２０２０／１８１０５３号パンフレット、同第２０１９／１５５２５３号パンフレット、同第２０１８／１９５６０３号パンフレットに開示されている。植物の病原体感染を抑制又は防止することができる多くのパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株は、フザリジジン（Ｆｕｓａｒｉｄｉｄｉｎｓ）を産生する。したがって、本明細書で開示される株は、好ましくは、フザリシジン産生株から作製される。フザリシジンは、環状リポデプシペプチドの類のパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐｐ．）から単離された抗生物質群であり、これらは多くの場合、以下の構造的特徴を共有している：６個のアミノ酸残基（そのうちの３つはＬ－Ｔｈｒ、Ｄ－アロ－Ｔｈｒ及びＤ－Ａｌａである）からなる大環式環、並びにアミド結合によりＮ末端のＬ－Ｔｈｒ残基に結合した１５－グアニジノ－３－ヒドロキシペンタデカン酸テール（ＣｈｅｍＭｅｄＣｈｅｍ ７，８７１－８８２，２０１２；Ｊ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．Ｍｅｔｈ．８５，１７５－１８２，２０１１，本明細書の表１）。これらの化合物は、Ｎ末端Ｌ－Ｔｈｒヒドロキシル基とＣ末端Ｄ－Ａｌａカルボニル基との間のラクトン橋によって環化される。デプシペプチド環内のアミノ酸残基の位置は、通常、それ自体、ＧＨＰＤ鎖を有する上記のＬ－Ｔｈｒで出発して番号付けられ、Ｃ末端Ｄ－Ａｌａで終わる。パエニバチルスから単離されたフザリシジンの非限定的な例は、ＬＩ－Ｆ０３、ＬＩ－Ｆ０４、ＬＩ－Ｆ０５、ＬＩ－Ｆ０７及びＬＩ－Ｆ０８（Ｊ．Ａｎｔｉｂｉｏｔｉｃｓ ４０（１１），１５０６－１５１４，１９８７；Ｈｅｔｅｒｏｃｙｃｌｅｓ ５３（７），１５３３－１５４９，２０００；Ｐｅｐｔｉｄｅｓ ３２，１９１７－１９２３，２０１１）並びにフザリシジンＡ（ＬＩ－Ｆ０４ａとも呼ばれる）、Ｂ（ＬＩ－Ｆ０４ｂとも呼ばれる）、Ｃ（ＬＩ－Ｆ０３ａとも呼ばれる）及びＤ（ＬＩ－Ｆ０３ｂとも呼ばれる）（Ｊ．Ａｎｔｉｂｉｏｔｉｃｓ ４９（２），１２９－１３５，１９９６；Ｊ．Ａｎｔｉｂｉｏｔｉｃｓ ５０（３），２２０－２２８，１９９７）と名付けられている。フザリシジンのアミノ酸鎖は、リボソームによって作製されず、非リボソーム性ペプチドシンセターゼによって作製される。公知のフザリシジンの構造式は、表１に示されている（Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ Ｌｅｔｔ．３４，１３２７－１３３４，２０１２；その図１）。ＬＩ－Ｆ０３ａ、ＬＩ－Ｆ０３ｂからＬＩ－Ｆ０８ａ及びＬＩ－Ｆ０８ｂと名付けられた化合物並びに本明細書において記載される式Ｉ及びＩ．１のフザリシジンも、フザリシジンファミリー内のその構造故にフザリシジンＬＩ－Ｆ０３ａ、ＬＩ－Ｆ０３ｂからＬＩ－Ｆ０８ａ及びＬＩ－Ｆ０８ｂと呼ばれる（例えば、表１を参照のこと）。
【0042】
単離されたフザリシジン抗生物質の中でも、フザリシジンＡは、種々の臨床上関連する真菌及び黄色ブドウ球菌（ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ）（ＭＩＣ値範囲：０．７８～３．１２μｇ／ｍＬ）のようなグラム陽性菌に対して最も有望な抗菌活性を示した（ＣｈｅｍＭｅｄＣｈｅｍ ７，８７１－８８２，２０１２）。天然に存在するＧＨＰＤの代わりに１２－グアニジノ－ドデカン酸（１２－ＧＤＡ）又は１２－アミノ－ドデカン酸（１２－ＡＤＡ）を含有するフザリシジン類似体の合成が確立されているが、１２－ＡＤＡによるＧＨＰＤの置換は、抗菌活性の完全喪失をもたらした一方で、１２－ＧＤＡによるＧＨＰＤの置換は、抗菌活性を保持した（Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ Ｌｅｔｔ．４７，８５８７－８５９０，２００６；ＣｈｅｍＭｅｄＣｈｅｍ ７，８７１－８８２，２０１２）。
【0043】
【表1】
【0044】
［式中、矢印は、ＧＨＰＤのカルボニル部分とＬ－Ｔｈｒ（Ｌ－トレオニン）のアミノ基の間、又はあるアミノ酸のカルボニル基と隣接するアミノ酸のアミノ基の間のいずれかの単（アミド）結合を規定し、ここで、矢印の先端は、前記アミノ酸Ｌ－Ｔｈｒの、又は前記隣接するアミノ酸のアミノ基との結合を示し、
矢頭のない単線は、Ｄ－Ａｌａ（Ｄ－アラニン）のカルボニル基とＬ－Ｔｈｒのヒドロキシル基との間の単（エステル）結合を規定し、ＧＨＰＤは、１５－グアニジノ－３－ヒドロキシペンタデカン酸である］。
矢頭のない単線は、Ｄ－Ａｌａ（Ｄ－アラニン）のカルボニル基とＬ－Ｔｈｒのヒドロキシル基との間の単（エステル）結合を規定し、ＧＨＰＤは、１５－グアニジノ－３－ヒドロキシペンタデカン酸である］。
【0045】
フザリシジンＡ、Ｂ、Ｃ及びＤはまた、フザリウム・オキシスポルム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｏｘｙｓｐｏｒｕｍ）、クロコウジカビ（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｎｉｇｅｒ）、コウジカビ（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｏｒｙｚａｅ）及びペニシリウム・トミー（Ｐｅｎｉｃｉｌｌｕｍ ｔｈｏｍｉｉ）などの植物病原性真菌を阻害すると報告されている（Ｊ．Ａｎｔｉｂｉｏｔｉｃｓ ４９（２），１２９－１３５，１９９６；Ｊ．Ａｎｔｉｂｉｏｔｉｃｓ ５０（３），２２０－２２８，１９９７）。Ｌｉ－Ｆ０５、ＬＩ－Ｆ０７及びＬＩ－Ｆ０８などのフザリシジンは、フザリウム・モニリフォルム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｍｏｎｉｌｉｆｏｒｍｅ）、Ｆ．オキシスポルム（Ｆ．ｏｘｙｓｐｏｒｕｍ）、Ｆ．ロゼウム（ｒｏｓｅｕｍ）、ジベレラ・フジクロイ（Ｇｉｂｅｒｅｌｌａ ｆｕｊｋｕｒｏｉ）、ヘルミントスポリウム・セサマム（Ｈｅｌｍｉｎｔｈｏｓｐｏｒｉｕｍ ｓｅｓａｍｕｍ）及びリンゴ青カビ病菌（Ｐｅｎｉｃｉｌｌｉｕｍ ｅｘｐａｎｓｕｍ）などの種々の植物病原性真菌に対して特定の抗真菌活性を有すると判明した（Ｊ．Ａｎｔｉｂｉｏｔｉｃｓ ４０（１１），１５０６－１５１４，１９８７）。フザリシジンはまた、黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ）を含むグラム陽性菌に対する抗菌活性も有する（Ｊ．Ａｎｔｉｂｉｏｔｉｃｓ ４９，１２９－１３５，１９９６；Ｊ．Ａｎｔｉｂｉｏｔｉｃｓ ５０，２２０－２２８，１９９７）。更に、フザリシジンは、セイヨウアブラナの黒色根腐れ病を引き起こすレプトスフェリア・マクランス（Ｌｅｐｔｏｓｐｈａｅｒｉａ ｍａｃｕｌａｎｓ）に対する抗真菌活性を有する（Ｃａｎ．Ｊ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．４８，１５９－１６９，２００２）。さらに、特定のパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株によって産生される、フザリシジンＡ及びＢ、並びにＤ－アロ－Ｔｈｒがエステル橋を用いてそのヒドロキシル基を介してさらなるアラニンと結合しているその２種の関連化合物は、培養パセリ細胞において耐性反応を誘導し、フザリウム・オキシスポルム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｏｘｙｓｐｏｒｕｍ）の増殖を阻害することが判明した（国際公開第２００６／０１６５５８号パンフレット；欧州特許出願公開第１７８８０７４Ａ１号明細書）。
【0046】
国際公開第２００７／０８６６４５号パンフレットは、フザリシジンシンセターゼ酵素及びパエニバチルス・ポリミクサ（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｐｏｌｙｍｙｘａ）株Ｅ６８１から単離されたそのコード遺伝子について記載している。フザリシジンシンセターゼ及び他のパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｉ）種のその相同体は、フザリシジンＡ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、ＬＩ－Ｆ０３、ＬＩ－Ｆ０４、ＬＩ－Ｆ０５、ＬＩ－Ｆ０７、及びＬＩ－Ｆ０８の合成に関与している。
【0047】
したがって、本発明はまた、農業用組成物であって、
ａ）ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲ、又は
ｂ）ＰｅｐＨが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＨ、又は
ｃ）ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸ、又は
ｄ）ＭａｎＣが存在しないか若しくは変異体ＭａｎＣ、又は
ｅ）ＳａｃＢが存在しないか若しくは変異体ＳａｃＢ、又は
ｆ）ａ）、ｂ）、ｃ）、ｄ）、ｅ）、若しくはｆ）の少なくとも２つの組み合わせを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株を含み、
ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲにより、野生型ＰｅｐＲを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＨが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＨにより、野生型ＰｅｐＨを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸにより、野生型ＰｅｐＸを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＭａｎＣが存在しないか若しくは変異体ＭａｎＣにより、野生型ＭａｎＣを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＳａｃＢが存在しないか若しくは変異体ＳａｃＢにより、ＳａｃＢを含まないパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
それぞれの野生型ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、又はＳａｃＢを含み、比較に使用されるパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株は、ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、若しくはＳａｃＢが存在しないか又はその変異体を含む株と同じパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）種のものである、農業用組成物を含む。
ａ）ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲ、又は
ｂ）ＰｅｐＨが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＨ、又は
ｃ）ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸ、又は
ｄ）ＭａｎＣが存在しないか若しくは変異体ＭａｎＣ、又は
ｅ）ＳａｃＢが存在しないか若しくは変異体ＳａｃＢ、又は
ｆ）ａ）、ｂ）、ｃ）、ｄ）、ｅ）、若しくはｆ）の少なくとも２つの組み合わせを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株を含み、
ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲにより、野生型ＰｅｐＲを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＨが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＨにより、野生型ＰｅｐＨを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸにより、野生型ＰｅｐＸを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＭａｎＣが存在しないか若しくは変異体ＭａｎＣにより、野生型ＭａｎＣを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＳａｃＢが存在しないか若しくは変異体ＳａｃＢにより、ＳａｃＢを含まないパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
それぞれの野生型ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、又はＳａｃＢを含み、比較に使用されるパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株は、ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、若しくはＳａｃＢが存在しないか又はその変異体を含む株と同じパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）種のものである、農業用組成物を含む。
【0048】
好ましくは、農薬組成物は、Ｗ２２４＊又はＳ３９３Ｆ変異を含む変異体ＰｅｐＲを含む。
【0049】
好ましくは、農薬組成物は、Ｅ９６Ｋ変異又はＥ１６３Ｋ変異又はＥ９６Ｋ及びＥ１６３Ｋ変異を含む変異体ＰｅｐＨを含む。
【0050】
好ましくは、農薬組成物は、変異体ＰｅｐＨと、ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲと、を含む。
【0051】
好ましくは、農薬組成物は、Ｅ９６Ｋ変異又はＥ１６３Ｋ変異又はＥ９６Ｋ及びＥ１６３Ｋ変異を含む変異体ＰｅｐＨと、Ｗ２２４＊又はＳ３９３Ｆ変異を含む変異体ＰｅｐＲと、を含む。
【0052】
好ましくは、農薬組成物は、Ｐ９０Ｓ、Ｅ３４０Ｋ、又はＧ４３３Ｄ変異を含む変異体ＭａｎＣを含む。
【0053】
好ましくは、農薬組成物は、Ｇ３２３Ｓ変異を含む変異体ＳａｃＢを含む。
【0054】
農業用組成物は、好ましくは、慣用的なタイプの農薬組成物、例えば溶液、乳剤、懸濁液、粉塵、粉末、ペースト、顆粒、プレス剤、カプセル、及びそれらの混合物である。組成物のタイプの例（“Ｃａｔａｌｏｇｕｅ ｏｆ ｐｅｓｔｉｃｉｄｅ ｆｏｒｍｕｌａｔｉｏｎ ｔｙｐｅｓ ａｎｄ ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ ｃｏｄｉｎｇ ｓｙｓｔｅｍ”，Ｔｅｃｈｎｉｃａｌ Ｍｏｎｏｇｒａｐｈ Ｎｏ．２，６ｔｈ Ｅｄ．Ｍａｙ ２００８，ＣｒｏｐＬｉｆｅ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌも参照されたい）は、懸濁液（例えば、ＳＣ、ＯＤ、ＦＳ）、乳化性濃縮物（例えば、ＥＣ）、乳剤（例えば、ＥＷ、ＥＯ、ＥＳ、ＭＥ）、カプセル（例えば、ＣＳ、ＺＣ）、ペースト、パスティーユ、水和剤又は粉塵（例えば、ＷＰ、ＳＰ、ＷＳ、ＤＰ、ＤＳ）、プレス剤（例えば、ＢＲ、ＴＢ、ＤＴ）、顆粒（例えば、ＷＧ、ＳＧ、ＧＲ、ＦＧ、ＧＧ、ＭＧ）、殺虫物品（例えば、ＬＮ）並びに種子などの植物繁殖材料の処理のためのゲル製剤（例えば、ＧＦ）である。組成物は、例えば、Ｍｏｌｌｅｔ ａｎｄ Ｇｒｕｂｅｍａｎｎ，Ｆｏｒｍｕｌａｔｉｏｎ ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｗｉｌｅｙ ＶＣＨ，Ｗｅｉｎｈｅｉｍ，２００１；又はＫｎｏｗｌｅｓ，Ｎｅｗ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔｓ ｉｎ ｃｒｏｐ ｐｒｏｔｅｃｔｉｏｎ ｐｒｏｄｕｃｔ ｆｏｒｍｕｌａｔｉｏｎ，Ａｇｒｏｗ Ｒｅｐｏｒｔｓ ＤＳ２４３，Ｔ＆Ｆ Ｉｎｆｏｒｍａ，Ｌｏｎｄｏｎ，２００５によって記載されるような公知の方法によって調製される。本発明はまた、本発明のパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株と、助剤と、を含む農薬組成物に関する。
【0055】
好適な助剤は、溶剤、液体担体、固体担体又は充填剤、界面活性剤、分散剤、乳化剤、湿潤剤、アジュバント、可溶化剤、浸透促進剤、保護コロイド、付着剤、増粘剤、保湿剤、忌避剤、誘引剤、摂食刺激物質、相溶化剤、殺菌剤、不凍剤、消泡剤、着色剤、粘着付与剤及びバインダーである。
好適な溶剤及び液体担体は、水及び有機溶媒、例えば中～高沸点の鉱油留分、例えばケロシン、ディーゼル油；植物又は動物由来の油；脂肪族、環式及び芳香族炭化水素、例えばトルエン、パラフィン、テトラヒドロナフタレン及びアルキル化ナフタレン；アルコール類、例えばエタノール、プロパノール、ブタノール、ベンジルアルコール、シクロヘキサノール、グリコール；ＤＭＳＯ；ケトン類、例えばシクロヘキサノン；エステル類、例えばラクテート、カルボネート、脂肪酸エステル、γ－ブチロラクトン；脂肪酸類；ホスホネート類；アミン類；アミド、例えばＮ－メチルピロリドン、脂肪酸ジメチルアミド；及びこれらの混合物である。
好適な溶剤及び液体担体は、水及び有機溶媒、例えば中～高沸点の鉱油留分、例えばケロシン、ディーゼル油；植物又は動物由来の油；脂肪族、環式及び芳香族炭化水素、例えばトルエン、パラフィン、テトラヒドロナフタレン及びアルキル化ナフタレン；アルコール類、例えばエタノール、プロパノール、ブタノール、ベンジルアルコール、シクロヘキサノール、グリコール；ＤＭＳＯ；ケトン類、例えばシクロヘキサノン；エステル類、例えばラクテート、カルボネート、脂肪酸エステル、γ－ブチロラクトン；脂肪酸類；ホスホネート類；アミン類；アミド、例えばＮ－メチルピロリドン、脂肪酸ジメチルアミド；及びこれらの混合物である。
【0056】
好適な固体担体又は充填剤は、鉱物質土、例えばシリケート、シリカゲル、タルク、カオリン、石灰石、石灰、白亜、粘土、苦灰石、珪藻土、ベントナイト、硫酸カルシウム、硫酸マグネシウム、酸化マグネシウム；多糖類、例えばセルロース、デンプン；肥料、例えば硫酸アンモニウム、リン酸アンモニウム、硝酸アンモニウム、尿素；植物由来の製品、例えば穀物粕、樹皮粕、木材粕、堅果殻粕及びこれらの混合物である。
【0057】
好適な界面活性剤は、アニオン性、カチオン性、非イオン性及び両性界面活性剤、ブロックポリマー、高分子電解質及びこれらの混合物のような界面活性化合物である。このような界面活性剤は、乳化剤、分散剤、可溶化剤、湿潤剤、浸透促進剤、保護コロイド又はアジュバントとして使用することができる。界面活性剤の例は、ＭｃＣｕｔｃｈｅｏｎ’ｓ，Ｖｏｌ．１：Ｅｍｕｌｓｉｆｉｅｒｓ＆Ｄｅｔｅｒｇｅｎｔｓ，ＭｃＣｕｔｃｈｅｏｎ’ｓ Ｄｉｒｅｃｔｏｒｉｅｓ，Ｇｌｅｎ Ｒｏｃｋ，ＵＳＡ，２００８（Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｅｄ．又はＮｏｒｔｈ Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｅｄ．）に記載されている。
【0058】
好適なアニオン性界面活性剤は、スルホネート、サルフェート、ホスフェート、カルボキシレート及びそれらの混合物のアルカリ塩、アルカリ土類塩又はアンモニウム塩である。スルホネートの例としては、アルキルアリールスルホネート、ジフェニルスルホネート、α－オレフィンスルホネート、リグニンスルホネート、脂肪酸及び油のスルホネート、エトキシル化アルキルフェノールのスルホネート、アルコキシル化アリールフェノールのスルホネート、縮合ナフタレンのスルホネート、ドデシル－及びトリデシルベンゼンのスルホネート、ナフタレン及びアルキルナフタレンのスルホネート、スルホスクシネート又はスルホスクシナメートである。サルフェートの例は、脂肪酸、油、エトキシル化アルキルフェノール、アルコール、エトキシル化アルコール又は脂肪酸エステルのサルフェートである。ホスフェートの例は、ホスフェートエステルである。カルボキシレートの例は、アルキルカルボキシレート及びカルボキシル化アルコール又はアルキルフェノールエトキシレートである。
【0059】
好適な非イオン性界面活性剤は、アルコキシレート、Ｎ－置換脂肪酸アミド、アミンオキシド、エステル、糖型界面活性剤、高分子界面活性剤、及びそれらの混合物である。アルコキシレートの例は、１～５０当量でアルコキシル化された、アルコール、アルキルフェノール、アミン、アミド、アリールフェノール、脂肪酸又は脂肪酸エステルなどの化合物である。アルコキシル化には、エチレンオキシド及び／又はプロピレンオキシド、好ましくはエチレンオキシドを使用することができる。Ｎ－置換脂肪酸アミドの例は、脂肪酸グルカミド又は脂肪酸アルカノールアミドである。エステルの例は、脂肪酸エステル、グリセリンエステル又はモノグリセリドである。糖型界面活性剤の例は、ソルビタン、エトキシル化ソルビタン、スクロース及びグルコースエステル又はアルキルポリグルコシドである。ポリマー系界面活性剤の例は、ビニルピロリドン、ビニルアルコール又は酢酸ビニルのホモポリマー又はコポリマーである。
【0060】
好適なカチオン性界面活性剤は、四級界面活性剤、例えば１つ又は２つの疎水基を有する四級アンモニウム化合物又は長鎖一級アミンの塩である。好適な両性界面活性剤は、アルキルベタイン及びイミダゾリンである。好適なブロックポリマーは、ポリエチレンオキシド及びポリプロピレンオキシドのブロックを含むＡ－Ｂ若しくはＡ－Ｂ－Ａタイプ又はアルカノール、ポリエチレンオキシド及びポリプロピレンオキシドを含むＡ－Ｂ－Ｃタイプのブロックポリマーである。好適な高分子電解質は、ポリ酸又はポリ塩基である。ポリ酸の例は、ポリアクリル酸のアルカリ塩又はポリ酸櫛型ポリマーである。ポリ塩基の例は、ポリビニルアミン又はポリエチレンアミンである。
【0061】
好適なアジュバントは、それ自体、殺虫活性が無視できるほど低いか又は全くなく、標的に対する化合物Ｉの生物学的性能を向上させる化合物である。例は、界面活性剤、鉱油又は植物油及び他の助剤である。更なる例は、Ｋｎｏｗｌｅｓ，Ａｄｊｕｖａｎｔｓ ａｎｄ ａｄｄｉｔｉｖｅｓ，Ａｇｒｏｗ Ｒｅｐｏｒｔｓ ＤＳ２５６，Ｔ＆Ｆ Ｉｎｆｏｒｍａ ＵＫ，２００６，ｃｈａｐｔｅｒ ５に記載されている。
【0062】
好適な増粘剤は、多糖類（例えば、キサンタンガム、カルボキシメチルセルロース）、無機粘土（有機修飾又は非修飾）、ポリカルボキシレート及びシリケートである。
【0063】
好適な殺菌剤は、ブロノポール及びイソチアゾリノン誘導体、例えばアルキルイソチアゾリノン及びベンズイソチアゾリノンである。
【0064】
好適な不凍剤は、エチレングリコール、プロピレングリコール、尿素及びグリセリンである。
【0065】
好適な消泡剤は、シリコーン、長鎖アルコール及び脂肪酸の塩である。
【0066】
好適な着色剤（例えば、赤、青又は緑）は、水溶性の低い顔料及び水溶性染料である。例えば、無機着色剤（例えば、酸化鉄、酸化チタン、ヘキサシアノ鉄）及び有機着色剤（例えば、アリザリン着色剤、アゾ着色剤及びフタロシアニン着色剤）である。
【0067】
好適な粘着付与剤又はバインダーは、ポリビニルピロリドン、ポリ酢酸ビニル、ポリビニルアルコール、ポリアクリレート、生物又は合成ワックス及びセルロースエーテルである。
【0068】
農薬組成物は、一般に、パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株の細胞又は芽胞の重量に対して、０．０１～９５％、好ましくは０．１～９０％、より好ましくは１～７０％、特に１０～６０％を含む。
【0069】
これらの細胞又は芽胞の量は、好ましくは、農薬組成物の５％ｗ／ｗ～５０％ｗ／ｗ、１０％ｗ／ｗ～５０％ｗ／ｗ、１５％ｗ／ｗ～５０％ｗ／ｗ、３０％ｗ／ｗ～５０％ｗ／ｗ、又は４０％ｗ／ｗ～５０％ｗ／ｗ、又は５％ｗ／ｗ～４０％ｗ／ｗ、１０％ｗ／ｗ～４０％ｗ／ｗ、１５％ｗ／ｗ～４０％ｗ／ｗ、３０％ｗ／ｗ～４０％ｗ／ｗ、又は１０％ｗ／ｗ～４０％ｗ／ｗ、１５％ｗ／ｗ～４０％ｗ／ｗ、３０％ｗ／ｗ～４０％ｗ／ｗである。
【0070】
パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株の細胞又は芽胞は、通常、平均粒径が１～１５０μｍ、又は好ましい昇順に１～１００μｍ、１～７５μｍ、１～５０μｍ、１～２５μｍ、１～１０μｍ、１～８μｍ（ＣＩＰＡＣ法１８７による分散液体中で光散乱法により決定）で固体粒子の形態で存在する。
【0071】
１ｍＬあたりの芽胞の密度数値は、約２０～約３５℃の温度で数日間インキュベートした後、寒天培地、例えばポテトデキストロース寒天上のコロニー形成単位（ＣＦＵ）の数を測定することにより決定できる。本発明の農薬組成物を調製するために使用されるバイオマスのＣＦＵ／ｇの量は、通常、１×１０８ＣＦＵ／ｇ～１×１０１１ＣＦＵ／ｇ、又は１×１０８ＣＦＵ／ｇ～１×１０１０ＣＦＵ／ｇ、又は５×１０８～５×１０１０ＣＦＵ／ｇ、好ましくは１×１０９ＣＦＵ／ｇ～１×１０１０ＣＦＵ／ｇである。バイオマスのＣＦＵ／ｇは、本発明の製剤を調製するために使用されるバイオマスの量に影響を与えるであろう。比較的多い量のＣＦＵ／ｇを有するバイオマスは、比較的少ない量のバイオマスを有する製剤を調製するために使用することができる。
【0072】
本発明の製剤を調製するために使用されるバイオマスの量は、通常、１ヘクタールあたりのＣＦＵの量に合うように選択され、これはそれぞれの目的のために施用されるべきである。
【0073】
植物繁殖材料、特に種子の処理を目的として、通常、種子処理用溶液（ＬＳ）、サスポエマルジョン（ＳＥ）、流動性濃縮物（ＦＳ）、乾燥処理用粉末（ＤＳ）、スラリー処理用水分散性粉末（ＷＳ）、水溶性粉末（ＳＳ）、乳剤（ＥＳ）、乳化性濃縮物（ＥＣ）及びゲル（ＧＦ）が採用されている。対象の組成物は、２～１０倍に希釈した後、直ちに使用できる製剤において、０．０１～６０重量％、好ましくは０．１～４０％の活性物質濃度を与える。施用は、播種前又は播種中に実施することができる。混合物、又は混合物を含む農薬組成物を、それぞれ、若い植物、及び苗のような繁殖材料、根付き／根なし挿し木、細胞培養由来の植物に施用する方法としては、ドレッシング、コーティング、ペレット成形、ダスティング、浸漬、並びにインファロー施用法が挙げられる。好ましくは、混合物及びその農薬組成物は、それぞれ、発芽が誘導されないような方法、例えば、種子ドレッシング、ペレット成形、コーティング、及びダスティングによって、種子に施用される。
【0074】
各種の油剤、湿潤剤、アジュバント、肥料、又は微量栄養素、及び更なる農薬（例えば、殺真菌剤、成長調節剤、除草剤、殺虫剤、緩和剤）を、プレミックスとして混合物又はその農薬組成物に添加しても、又は使用直前まで（タンクミックス）しなくてもよい。これらの薬剤は、１：１００～１００：１、好ましくは１：１０～１０：１の重量比で、本発明による混合物又は農薬組成物に混和することができる。
【0075】
パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株及びこれらの株を含む農薬組成物は、通常、殺真菌活性量で施用される。用語「殺菌有効量」は、有害な真菌植物を防除するのに十分であり、処理された植物、苗のような若い植物、根付き／根なし挿し木、細胞培養由来の植物、又は種子のような植物繁殖材料に実質的に損傷をもたらさない組成物又は混合物の量を意味する。そのような量は、広い範囲で変化し得、様々な要因、例えば、防除すべき真菌種、処理される植物種、気候条件及び使用される特定の混合物に依存する。
【0076】
農薬組成物を葉面処理として、又は土壌への施用、好ましくは葉面処理として施用に用いる場合。葉面処理における施用量は、通常、体積中に細胞又は芽胞を含むフザリシジンを、５０ｇ／ｈａ～２０００ｇ／ｈａ、１００ｇ／ｈａ～２０００ｇ／ｈａ、１５０ｇ／ｈａ～２０００ｇ／ｈａ、６００ｇ／ｈａ～２０００ｇ／ｈａ若しくは８００ｇ／ｈａ～２０００ｇ／ｈａ、又は
５０ｇ／ｈａ～１０００ｇ／ｈａ、１００ｇ／ｈａ～１０００ｇ／ｈａ、１５０ｇ／ｈａ～１０００ｇ／ｈａ、６００ｇ／ｈａ～１０００ｇ／ｈａ若しくは８００ｇ／ｈａ～１０００ｇ／ｈａ、
又は５０ｇ／ｈａ～８００ｇ／ｈａ、１００ｇ／ｈａ～８００ｇ／ｈａ、１５０ｇ／ｈａ～８００ｇ／ｈａ、６００ｇ／ｈａ～８００ｇ／ｈａ、又は
１５０ｇ／ｈａ～１０００ｇ／ｈａ、３００ｇ／ｈａ～１０００ｇ／ｈａ、６００ｇ／ｈａ～１０００ｇ／ｈａと、
水性散布液を、１０００Ｌ／ｈａ～１００Ｌ／ｈａ、６００Ｌ／ｈａ～１００Ｌ／ｈａ、４００Ｌ／ｈａ～１００Ｌ／ｈａ、２００Ｌ／ｈａ～１００Ｌ／ｈａ、又は
１０００Ｌ／ｈａ～６００Ｌ／ｈａ、１０００Ｌ／ｈａ～４００Ｌ／ｈａ、又は１０００Ｌ／ｈａ～２００Ｌ／ｈａ、又は６００Ｌ／ｈａ～２００Ｌ／ｈａ、６００Ｌ／ｈａ～４００Ｌ／ｈａである。
５０ｇ／ｈａ～１０００ｇ／ｈａ、１００ｇ／ｈａ～１０００ｇ／ｈａ、１５０ｇ／ｈａ～１０００ｇ／ｈａ、６００ｇ／ｈａ～１０００ｇ／ｈａ若しくは８００ｇ／ｈａ～１０００ｇ／ｈａ、
又は５０ｇ／ｈａ～８００ｇ／ｈａ、１００ｇ／ｈａ～８００ｇ／ｈａ、１５０ｇ／ｈａ～８００ｇ／ｈａ、６００ｇ／ｈａ～８００ｇ／ｈａ、又は
１５０ｇ／ｈａ～１０００ｇ／ｈａ、３００ｇ／ｈａ～１０００ｇ／ｈａ、６００ｇ／ｈａ～１０００ｇ／ｈａと、
水性散布液を、１０００Ｌ／ｈａ～１００Ｌ／ｈａ、６００Ｌ／ｈａ～１００Ｌ／ｈａ、４００Ｌ／ｈａ～１００Ｌ／ｈａ、２００Ｌ／ｈａ～１００Ｌ／ｈａ、又は
１０００Ｌ／ｈａ～６００Ｌ／ｈａ、１０００Ｌ／ｈａ～４００Ｌ／ｈａ、又は１０００Ｌ／ｈａ～２００Ｌ／ｈａ、又は６００Ｌ／ｈａ～２００Ｌ／ｈａ、６００Ｌ／ｈａ～４００Ｌ／ｈａである。
【0077】
農薬組成物を種子処理、例えば種子コーティングで用いる場合、植物繁殖材料に関する施用量は、通常、約１×１０１～１×１０１２（又はそれ以上）ＣＦＵ／種子、好ましくは約１×１０３～約１×１０１０ＣＦＵ／種子、更に好ましくは約１×１０３～約１×１０６ＣＦＵ／種子の範囲である。或いは、植物繁殖材料に関する施用量は、好ましくは、種子１００ｋｇあたり約１×１０７～１×１０１６（又はそれ以上）ＣＦＵ、好ましくは種子１００ｋｇあたり１×１０９～約１×１０１５ＣＦＵ、更に好ましくは種子１００ｋｇあたり１×１０１１～約１×１０１５ＣＦＵの範囲である。
【0078】
パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株及びこれらの株を含む農薬組成物は、土壌伝染性真菌を含む幅広い植物病原性真菌、特に、ネコブカビ綱（Ｐｌａｓｍｏｄｉｏｐｈｏｒｏｍｙｃｅｔｅｓ）、卵菌綱（Ｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒｏｍｙｃｅｔｅｓ）（卵菌類（Ｏｏｍｙｃｅｔｅｓ）と同義）、ツボカビ綱（Ｃｈｙｔｒｉｄｉｏｍｙｃｅｔｅｓ）、接合菌類（Ｚｙｇｏｍｙｃｅｔｅｓ）、子嚢菌類（Ａｓｃｏｍｙｃｅｔｅｓ）、担子菌類（Ｂａｓｉｄｉｏｍｙｃｅｔｅｓ）及び不完全菌類（Ｄｅｕｔｅｒｏｍｙｃｅｔｅｓ）（不全菌類（Ｆｕｎｇｉ ｉｍｐｅｒｆｅｃｔｉ）と同義）の分類に由来するものに対して有効な殺真菌剤としてそれぞれ好適である。これらは、葉面殺真菌剤、種子粉衣用殺真菌剤及び土壌殺真菌剤として作物保護に使用することができる。
【0079】
混合物及びその農薬組成物は、好ましくは、種々の栽培植物、例えば穀類、例えばコムギ、ライムギ、オオムギ、ライコムギ、オートムギ、又はイネ；ビート、例えばテンサイ又は飼料用ビート；果物、例えばナシ状果（リンゴ、ナシなど）、石果（例：プラム、モモ、アーモンド、サクランボ）、又は液果とも呼ばれるソフトフルーツ（イチゴ、ラズベリー、ブラックベリー、スグリなど）；マメ科植物（例：レンズマメ、エンドウ、アルファルファ、又はダイズ）；油脂植物、例えば、ナタネ、カラシ、オリーブ、ヒマワリ、ココナッツ、カカオ豆、ヒマシ油植物、アブラヤシ、ピーナッツ、又はダイズ；ウリ科植物、例えばカボチャ、キュウリ、又はメロン；繊維植物、例えば、ワタ、アマ、大麻、又はオウマ；柑橘類、例えば、オレンジ、レモン、グレープフルーツ、又はミカン；野菜、例えば、ホウレンソウ、レタス、アスパラガス、キャベツ、ニンジン、タマネギ、トマト、ジャガイモ、ウリ類、又はパプリカ；クスノキ科植物、例えば、アボカド、シナモン、又はカンファー；エネルギー及び原料植物、例えばトウモロコシ、ダイズ、ナタネ、サトウキビ、又はアブラヤシ；トウモロコシ；タバコ；ナッツ；コーヒー；チャノキ；バナナ；ブドウ（テーブルグレープ及びグレープジュース用ブドウ）；ホップ；シバ；ハイノキ（ステビアともいう）；天然ゴム植物；又は観葉植物及び森林植物、例えば、花、低木、広葉樹、又は常緑樹（針葉樹、ユーカリなど）；種子などの植物繁殖材料；及びこれらの植物の作物材料における植物病原性真菌の防除に有用である。
【0080】
より好ましくは、混合物及びその農薬組成物はそれぞれ、農作物、例えばジャガイモ、テンサイ、タバコ、コムギ、ライムギ、オオムギ、オートムギ、イネ、トウモロコシ、ワタ、ダイズ、ナタネ、マメ科植物、ヒマワリ、コーヒー又はサトウキビ；果物；ブドウ；ワイン製造用ブドウ又は果物のブドウ、観葉植物；又は野菜、例えばキュウリ、トマト、コショウ、マメ又はカボチャに対する真菌を防除するために用いられる。
【0081】
「植物繁殖材料」という用語は、種子などの植物の生殖部分；並びに挿し木及び塊茎（例えば、ジャガイモ）などの植物の増殖に使用可能な生長能力のある植物材料の全てを示すものであると理解される。これには、植物の種子、根、果実、塊茎、球根、根茎、芽、新芽並びに発芽後又は土から出た後に移植される苗及び若い植物を含む他の部分が含まれる。
【0082】
したがって、本発明の一実施形態は、混合物を含む、又は混合物を含む農薬組成物のコーティングを含む植物繁殖材料である。好ましくは、植物繁殖材料は、苗、根付き／根なし挿し木、細胞培養由来の植物のような若い植物である。更により好ましくは、植物繁殖材料は、ブドウを含む果実又は野菜植物種由来のものである。
【0083】
本発明によれば、上記の全ての栽培植物は、それぞれの栽培植物に属する全ての種、亜種、変種及び／又は雑種を含むと理解される。例えば、トウモロコシ（ｃｏｒｎ）は、飼料用トウモロコシ及びスイートコーンなどのあらゆる種類を含むトウモロコシ（Ｉｎｄｉａｎ ｃｏｒｎ）又はトウモロコシ（ｍａｉｚｅ）（Ｚｅａ ｍａｙｓ）としても知られている。本発明によれば、全てのトウモロコシ（ｍａｉｚｅ）又はトウモロコシの亜種及び／若しくは変種、特に、フラワーコーン（Ｚｅａ ｍａｙｓ ｖａｒ．ａｍｙｌａｃｅａ）、ポップコーン（Ｚｅａ ｍａｙｓ ｖａｒ．ｅｖｅｒｔａ）、デントコーン（Ｚｅａ ｍａｙｓ ｖａｒ．ｉｎｄｅｎｔａｔａ）、フリントコーン（Ｚｅａ ｍａｙｓ ｖａｒ．ｉｎｄｕｒａｔａ）、スイートコーン（Ｚｅａ ｍａｙｓ ｖａｒ．ｓａｃｃｈａｒａｔａ及びｖａｒ．ｒｕｇｏｓａ）、ワキシーコーン（Ｚｅａ ｍａｙｓ ｖａｒ．ｃｅｒａｔｉｎａ）、アミロメイズ（高アミロースＺｅａ ｍａｙｓ品種）、有ふ種トウモロコシ又はワイルドメイズ（Ｚｅａ ｍａｙｓ ｖａｒ．ｔｕｎｉｃａｔａ）及びストライプドトウモロコシ（Ｚｅａ ｍａｙｓ ｖａｒ．ｊａｐｏｎｉｃａ）が含まれる。当業者であれば、他の植物種、例えば、アマトウガラシ、有限伸育型又は無限伸育型ダイズなどの変種を知っているであろう。
【0084】
本発明の混合物及びその農薬組成物は、それぞれ、以下の植物病害の原因物質の防除に特に好適である：
アルブゴ種（Ａｌｂｕｇｏ ｓｐｐ．）（白さび病）であって、観賞植物、野菜におけるもの（例えば、Ａ．カンジダ（Ａ．ｃａｎｄｉｄａ））及びヒマワリにおけるもの（例えば、Ａ．トラゴポゴニス（Ａ．ｔｒａｇｏｐｏｇｏｎｉｓ））；アルテルナリア種（Ａｌｔｅｒｎａｒｉａ ｓｐｐ．）（黒班病）であって、野菜におけるもの（例えば、Ａ．ダウシ（Ａ．ｄａｕｃｉ）又はＡ．ポルリ（Ａ．ｐｏｒｒｉ））、ナタネにおけるもの（例えば、Ａ．ブラシシコラ（Ａ．ｂｒａｓｓｉｃｉｃｏｌａ）又はＡ．ブラシカエ（Ａ．ｂｒａｓｓｉｃａｅ））、テンサイにおけるもの（Ａ．テヌイス（Ａ．ｔｅｎｕｉｓ））、果実（例えば、Ａ．グランディス（Ａ．ｇｒａｎｄｉｓ））、イネ、ダイズ、ジャガイモ及びトマトにおけるもの（例えば、Ａ．ソラニ（Ａ．ｓｏｌａｎｉ）、Ａ．グランディス（Ａ．ｇｒａｎｄｉｓ）又はＡ．アルテルナタ（Ａ．ａｌｔｅｒｎａｔａ））、トマトにおけるもの（例えば、Ａ．ソラニ（Ａ．ｓｏｌａｎｉ）又はＡ．アルテルナタ（Ａ．ａｌｔｅｒｎａｔａ））及びコムギにおけるもの（例えば、Ａ．トリチシナ（Ａ．ｔｒｉｔｉｃｉｎａ））；アファノマイセス種（Ａｐｈａｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐｐ．）であって、テンサイ及び野菜におけるもの；穀物及び野菜におけるアスコキタ種（Ａｓｃｏｃｈｙｔａ）、例えばコムギにおけるＡ．トリチシ（Ａ．ｔｒｉｔｉｃｉ）（炭疽病）及びオオムギにおけるＡ．ホルデイ（Ａ．ｈｏｒｄｅｉ）；トウモロコシにおける眼紋病（Ａｕｒｅｏｂａｓｉｄｉｕｍ ｚｅａｅ）（トウモロコシ褐斑病（Ｋａｐａｔｉｅｌｌａ ｚｅａｅ）と同義）；ビポラリス種（Ｂｉｐｏｌａｒｉｓ）及びドレシュレラ種（Ｄｒｅｃｈｓｌｅｒａ ｓｐｐ．）（テレオモルフ：コクリオボルス種（Ｃｏｃｈｌｉｏｂｏｌｕｓ ｓｐｐ．））であって、例えばトウモロコシにおけるごま葉枯病（Ｄ．マイディス（Ｄ．ｍａｙｄｉｓ））又はすす紋病（Ｂ．ゼイコラ（Ｂ．ｚｅｉｃｏｌａ））、例えば穀物における斑点病（Ｂ．ソロキニアナ（Ｂ．ｓｏｒｏｋｉｎｉａｎａ））、例えばイネ及びシバにおけるＢ．オリザエ（Ｂ．ｏｒｙｚａｅ）；穀物（例えば、コムギ又はオオムギ）におけるブルメリア（Ｂｌｕｍｅｒｉａ）（以前にはエリシフェ（Ｅｒｙｓｉｐｈｅ））・グラミニス（ｇｒａｍｉｎｉｓ）（ウドンコ病）；灰色かび病菌（Ｂｏｔｒｙｔｉｓ ｃｉｎｅｒｅａ）（テレオモルフ：ボトリチニア・フッケリアナ（Ｂｏｔｒｙｏｔｉｎｉａ ｆｕｃｋｅｌｉａｎａ）：灰色かび病）であって、果実及び液果（例えば、イチゴ）、野菜（例えば、レタス、ニンジン、セロリ及びキャベツ）におけるもの；タマネギ科、ナタネ、観賞植物（例えば、Ｂエリプチカ（Ｂ ｅｌｉｐｔｉｃａ））、ブドウ、森林植物及びコムギにおける白斑葉枯病（Ｂ．ｓｑｕａｍｏｓａ）又は灰色腐敗病（Ｂ．ａｌｌｉｉ）；レタスにおけるブレミア・ラクツカエ（Ｂｒｅｍｉａ ｌａｃｔｕｃａｅ）（べと病）；落葉樹及び常緑樹におけるセラトシスチス（オフィオストマ（Ｏｐｈｉｏｓｔｏｍａ）と同義）種（Ｃｅｒａｔｏｃｙｓｔｉｓ）（根腐れ病又は立ち枯れ病）、例えばニレにおけるＣ．ウルミ（Ｃ．ｕｌｍｉ）（オランダニレ病）；セルコスポラ種（Ｃｅｒｃｏｓｐｏｒａ ｓｐｐ．）（セルコスポラ斑点病）であって、トウモロコシ（例えば、灰斑病：Ｃ．ゼアエ－マイディス（Ｃ．ｚｅａｅ－ｍａｙｄｉｓ））、イネ、テンサイ（例えば、Ｃ．ベチコラ（Ｃ．ｂｅｔｉｃｏｌａ））におけるもの、サトウキビ、野菜、コーヒー、ダイズにおけるもの（例えば、Ｃ．ソジナ（Ｃ．ｓｏｊｉｎａ）又はＣ．キクチイ（Ｃ．ｋｉｋｕｃｈｉｉ））及びイネにおけるもの；マッシュルームにおけるクラドボトリウム（ダクチリウム（Ｄａｃｔｙｌｉｕｍ）と同義）種（Ｃｌａｄｏｂｏｔｒｙｕｍ）（例えば、Ｃ．ミコフィルム（Ｃ．ｍｙｃｏｐｈｉｌｕｍ）
（以前にはダクチリウム・デンドロイデス（Ｄａｃｔｙｌｉｕｍ ｄｅｎｄｒｏｉｄｅｓ、テレオモルフ：ネクトリア・アルベルティニイ（Ｎｅｃｔｒｉａ ａｌｂｅｒｔｉｎｉｉ）、ネクトリア・ロゼルラ（Ｎｅｃｔｒｉａ ｒｏｓｅｌｌａ）（ヒポマイセス・ロセルルス（Ｈｙｐｏｍｙｃｅｓ ｒｏｓｅｌｌｕｓ）と同義））；クラドスポリウム種（Ｃｌａｄｏｓｐｏｒｉｕｍ ｓｐｐ．）であって、トマトにおけるもの（例えば、Ｃ．フルブム（Ｃ．ｆｕｌｖｕｍ）：葉かび病）及び穀物におけるもの、例えばコムギにおけるＣ．ヘルバルム（Ｃ．ｈｅｒｂａｒｕｍ）（黒変病）；穀物におけるクラビセプス・プルプレア（Ｃｌａｖｉｃｅｐｓ ｐｕｒｐｕｒｅａ）（バッカク）；コクリオボルス（Ｃｏｃｈｌｉｏｂｏｌｕｓ）（アナモルフ：ビポラリス（Ｂｉｐｏｌａｒｉｓ）のヘルミントスポリウム（Ｈｅｌｍｉｎｔｈｏｓｐｏｒｉｕｍ））種（斑点病）であって、トウモロコシにおけるもの（Ｃ．カルボヌム（Ｃ．ｃａｒｂｏｎｕｍ））、穀物におけるもの（例えば、Ｃ．サチブス（Ｃ．ｓａｔｉｖｕｓ）、アナモルフ：Ｂ．ソロキニアナ（Ｂ．ｓｏｒｏｋｉｎｉａｎａ））及びイネにおけるもの（例えば、Ｃ．ミヤベアヌス（Ｃ．ｍｉｙａｂｅａｎｕｓ）、アナモルフ：Ｈ．オリザエ（Ｈ．ｏｒｙｚａｅ））；コレトトリカム（Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ）（テレオモルフ：グロメレラ（Ｇｌｏｍｅｒｅｌｌａ））種（炭疽病）であって、ワタにおけるもの（例えば、Ｃ．ゴシピイ（Ｃ．ｇｏｓｓｙｐｉｉ））、トウモロコシにおけるもの（例えば、Ｃ．グラミニコラ（Ｃ．ｇｒａｍｉｎｉｃｏｌａ）：炭疽病根腐れ）、ソフトフルーツ、ジャガイモにおけるもの（例えば、Ｃ．ココデス（Ｃ．ｃｏｃｃｏｄｅｓ）：黒点病））、マメ類におけるもの（例えば、Ｃ．リンデムチアヌム（Ｃ．ｌｉｎｄｅｍｕｔｈｉａｎｕｍ））、ダイズ（例えば、Ｃ．トルンカツム（Ｃ．ｔｒｕｎｃａｔｕｍ）又はＣ．グロエオスポリオイデス（Ｃ．ｇｌｏｅｏｓｐｏｒｉｏｉｄｅｓ））、野菜（例えば、Ｃ．ラゲナリウム（Ｃ．ｌａｇｅｎａｒｉｕｍ）又はＣ．カプシキ（Ｃ．ｃａｐｓｉｃｉ））、果実（例えば、Ｃ．アクタツム（Ｃ．ａｃｕｔａｔｕｍ））、コーヒー（例えば、Ｃ．コフェアヌム（Ｃ．ｃｏｆｆｅａｎｕｍ）又はＣ．カハワエ（Ｃ．ｋａｈａｗａｅ））におけるもの及び様々な作物におけるＣ．グロエオスポリオイデス（Ｃ．ｇｌｏｅｏｓｐｏｒｉｏｉｄｅｓ））；イネにおけるコルチキウム種（Ｃｏｒｔｉｃｉｕｍ ｓｐｐ．）、例えばＣ．ササキイ（Ｃ．ｓａｓａｋｉｉ）（紋枯病）；ダイズ、ワタ及び観賞植物におけるコリネスポラ・カッシイコラ（Ｃｏｒｙｎｅｓｐｏｒａ ｃａｓｓｉｉｃｏｌａ）（斑点病）；シクロコニウム種（Ｃｙｃｌｏｃｏｎｉｕｍ ｓｐｐ．）、例えばオリーブにおけるＣ．オレアギヌム（Ｃ．ｏｌｅａｇｉｎｕｍ）；シリンドロカルポン種（Ｃｙｌｉｎｄｒｏｃａｒｐｏｎ ｓｐｐ．）（例えば、果樹潰瘍病又は幼ブドウの衰弱、テレオモルフ：ネクトリア種（Ｎｅｃｔｒｉａ）又はネオネクトリア種（Ｎｅｏｎｅｃｔｒｉａ ｓｐｐ．））であって、果樹におけるもの、ブドウにおけるもの（例えば、Ｃ．リリオデンドリ（Ｃ．ｌｉｒｉｏｄｅｎｄｒｉ）、テレオモルフ：ネオネクトリア・リリオデンドリ（Ｎｅｏｎｅｃｔｒｉａ ｌｉｒｉｏｄｅｎｄｒｉ）、黒足病）及び観賞植物におけるもの；ダイズにおけるデマトフォラ（Ｄｅｍａｔｏｐｈｏｒａ）（テレオモルフ：ロゼリニア（Ｒｏｓｅｌｌｉｎｉａ））・ネカトリクス（ｎｅｃａｔｒｉｘ）（根及び茎腐れ病）；ダイズにおけるディアポルテ種（Ｄｉａｐｏｒｔｈｅ ｓｐｐ．）、例えばＤ．ファゼオロルム（Ｄ．ｐｈａｓｅｏｌｏｒｕｍ）（苗立ち枯れ病）；ドレシュレラ（Ｄｒｅｃｈｓｌｅｒａ）（ヘルミントスポリウム（Ｈｅｌｍｉｎｔｈｏｓｐｏｒｉｕｍ）と同義、テレオモルフ：ピレノフォラ（Ｐｙｒｅｎｏｐｈｏｒａ））種であって、トウモロコシにおけるもの、穀物、例えばオオムギにおけるもの（例えば、Ｄ．テレス（Ｄ．ｔｅｒｅｓ）、網斑病）及びコムギにおけるもの（例えば、Ｄ．トリチシ－レペンチス（Ｄ．ｔｒｉｔｉｃｉ－ｒｅｐｅｎｔｉｓ）：黄褐色斑病））、イネ及びシバにおけるもの；ブドウにおいて、ホルミチポリア（Ｆｏｒｍｉｔｉｐｏｒｉａ）（フェリヌス（Ｐｈｅｌｌｉｎｕｓ）と同義）・プンクタタ（ｐｕｎｃｔａｔａ）、Ｆ．メジテラネア（Ｆ．ｍｅｄｉｔｅｒｒａｎｅａ）、フェオモニエラ・クラミドスポラ（Ｐｈａｅｏｍｏｎｉｅｌｌａ ｃｈｌａｍｙｄｏｓｐｏｒａ）（以前にはフェオアクレモニウム・クラミドスポルム（Ｐｈａｅｏａｃｒｅｍｏｎｉｕｍ ｃｈｌａｍｙｄｏｓｐｏｒｕｍ））、フェオアクレモニウム・アレオフィルム（Ｐｈａｅｏａｃｒｅｍｏｎｉｕｍ ａｌｅｏｐｈｉｌｕｍ）及び／又はボトリオスフェリア・オブツサ（Ｂｏｔｒｙｏｓｐｈａｅｒｉａ ｏｂｔｕｓａ）に起因するエスカ（Ｅｓｃａ）病（胴枯病、アポプレキシー）；エルシノエ種（Ｅｌｓｉｎｏｅ ｓｐｐ．）であって、ナシ状果におけるもの（Ｅ．ピリ（Ｅ．ｐｙｒｉ））及びソフトフルーツにおけるもの（Ｅ．ベネタ（Ｅ．ｖｅｎｅｔａ）：炭疽病）並びにブドウにおけるもの（Ｅ．アンペリナ（Ｅ．ａｍｐｅｌｉｎａ）：炭疽病）；イネにおけるエンチロマ・オリザエ（Ｅｎｔｙｌｏｍａ ｏｒｙｚａｅ）（葉すす病）；コムギにおけるエピコックム種（Ｅｐｉｃｏｃｃｕｍ ｓｐｐ．）（黒かび病）；エリシフェ種（Ｅｒｙｓｉｐｈｅ ｓｐｐ．）（ウドンコ病）であって、テンサイにおけるもの（Ｅ．ベタエ（Ｅ．ｂｅｔａｅ））、野菜におけるもの（例えば、Ｅ．ピシ（Ｅ．ｐｉｓｉ））、例えばウリ科植物におけるもの（例えば、Ｅ．シコラセアルム（Ｅ．ｃｉｃｈｏｒａｃｅａｒｕｍ））及びキャベツ、ナタネにおけるもの（例えば、Ｅ．クルシフェラルム（Ｅ．ｃｒｕｃｉｆｅｒａｒｕｍ））；果樹、ブドウ及び観賞樹におけるユーチパ・ラタ（Ｅｕｔｙｐａ ｌａｔａ）（ユーチパ潰瘍病又は胴枯病、アナモルフ：シトスポリナ・ラタ（Ｃｙｔｏｓｐｏｒｉｎａ ｌａｔａ）、リベルテラ・ブレファリス（Ｌｉｂｅｒｔｅｌｌａ ｂｌｅｐｈａｒｉｓ）と同義）；トウモロコシにおけるエクセロヒルム（Ｅｘｓｅｒｏｈｉｌｕｍ）（ヘルミントスポリウム（Ｈｅｌｍｉｎｔｈｏｓｐｏｒｉｕｍ）と同義）種（例えば、Ｅ．ツルシクム（Ｅ．ｔｕｒｃｉｃｕｍ））；様々な植物におけるフザリウム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ）（テレオモルフ：ジベレラ（Ｇｉｂｂｅｒｅｌｌａ））種（立ち枯れ病、根又は茎腐れ病）、例えば穀物（例えば、コムギ又はオオムギ）におけるＦ．グラミネアルム（Ｆ．ｇｒａｍｉｎｅａｒｕｍ）又はＦ．クルモルム（Ｆ．ｃｕｌｍｏｒｕｍ）（根腐れ病、黒星病又は赤かび病）、トマトにおけるＦ．オキシスポルム（Ｆ．ｏｘｙｓｐｏｒｕｍ）、ダイズにおけるそれぞれが突然死症候群を引き起こすＦ．ソラニ（Ｆ．ｓｏｌａｎｉ）（ｆ．グリシネス種（ｓｐ．ｇｌｙｃｉｎｅｓ）、現在のＦ．ビルグリフォルメ（Ｆ．ｖｉｒｇｕｌｉｆｏｒｍｅ）と同義）及びＦ．ツクマニアエ（Ｆ．ｔｕｃｕｍａｎｉａｅ）及びＦ．ブラシリエンス（Ｆ．ｂｒａｓｉｌｉｅｎｓｅ）並びにトウモロコシにおけるＦ．ベルチシリオイデス（Ｆ．ｖｅｒｔｉｃｉｌｌｉｏｉｄｅｓ）；
穀物（例えば、コムギ又はオオムギ）及びトウモロコシにおけるゲウマノマイセス・グラミニス（Ｇａｅｕｍａｎｎｏｍｙｃｅｓ ｇｒａｍｉｎｉｓ）（立ち枯れ病）；ジベレラ種（Ｇｉｂｂｅｒｅｌｌａ ｓｐｐ．）であって、穀物におけるもの（例えば、Ｇ．ゼアエ（Ｇ．ｚｅａｅ））及びイネにおけるもの（例えば、Ｇ．フジクロイ（Ｇ．ｆｕｊｉｋｕｒｏｉ）、馬鹿苗病）；ブドウ、ナシ状果及び他の植物におけるグロメレラ・シングラタ（Ｇｌｏｍｅｒｅｌｌａ ｃｉｎｇｕｌａｔａ）及びワタにおけるＧ．ゴシピイ（Ｇ．ｇｏｓｓｙｐｉｉ）；イネにおける穀粒ステイン複合病；ブドウにおけるギグナルディア・ビドウェリ（Ｇｕｉｇｎａｒｄｉａ ｂｉｄｗｅｌｌｉｉ）（黒腐れ病）；バラ科植物及び杜松におけるギムノスポランギウム種（Ｇｙｍｎｏｓｐｏｒａｎｇｉｕｍ ｓｐｐ．）、例えばナシにおけるＧ．サビネ（Ｇ．ｓａｂｉｎａｅ）（さび病）；トウモロコシ、穀物、ジャガイモ及びイネにおけるヘルミントスポリウム種（Ｈｅｌｍｉｎｔｈｏｓｐｏｒｉｕｍ ｓｐｐ．）（ドレシュレラ（Ｄｒｅｃｈｓｌｅｒａ）と同義、テレオモルフ：コクリオボルス（Ｃｏｃｈｌｉｏｂｏｌｕｓ））；ヘミレイア種（Ｈｅｍｉｌｅｉａ ｓｐｐ．）であって、例えばコーヒーにおけるＨ．バスタトリクス（Ｈ．ｖａｓｔａｔｒｉｘ）（コーヒーの葉さび病）；ブドウにおけるイサリオプシス・クラビスポラ（Ｉｓａｒｉｏｐｓｉｓ ｃｌａｖｉｓｐｏｒａ）（クラドスポリウム・ビチス（Ｃｌａｄｏｓｐｏｒｉｕｍ ｖｉｔｉｓ）と同義）；ダイズ及びワタにおけるマクロフォミナ・ファセオリナ（Ｍａｃｒｏｐｈｏｍｉｎａ ｐｈａｓｅｏｌｉｎａ）（ファセオリ（ｐｈａｓｅｏｌｉ）と同義）（根及び茎腐れ病）；穀物（例えば、コムギ又はオオムギ）におけるミクロドキウム（Ｍｉｃｒｏｄｏｃｈｉｕｍ）（フザリウム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ）と同義）・ニバレ（ｎｉｖａｌｅ）（ピンク雪かび病）；ダイズにおけるミクロスフェラ・ディフューザ（Ｍｉｃｒｏｓｐｈａｅｒａ ｄｉｆｆｕｓａ）（ウドンコ病）；石果及び他のバラ科植物におけるモニリニア種（Ｍｏｎｉｌｉｎｉａ ｓｐｐ．）、例えばＭ．ラクサ（Ｍ．ｌａｘａ）、Ｍ．フルクチコラ（Ｍ．ｆｒｕｃｔｉｃｏｌａ）及びＭ．フルクチゲナ（Ｍ．ｆｒｕｃｔｉｇｅｎａ）（モニラ種（Ｍｏｎｉｌｉａ ｓｐｐ．）と同義：花枯病及び枝枯病、褐色腐れ病）；穀物、バナナ、ソフトフルーツ及びラッカセイにおけるマイコスフェレラ種（Ｍｙｃｏｓｐｈａｅｒｅｌｌａ ｓｐｐ．）、例えばコムギにおけるＭ．グラミニコラ（Ｍ．ｇｒａｍｉｎｉｃｏｌａ）（アナモルフ：コムギ葉枯病菌（Ｚｙｍｏｓｅｐｔｏｒｉａ ｔｒｉｔｉｃｉ）、以前にはセプトリア・トリチシ（Ｓｅｐｔｏｒｉａ ｔｒｉｔｉｃｉ）：セプトリア斑点病）又は及びバナナにおけるＭ．フィジエンシス（Ｍ．ｆｉｊｉｅｎｓｉｓ）（プソイドケルコスポラ・フィジエンシス（Ｐｓｅｕｄｏｃｅｒｃｏｓｐｏｒａ ｆｉｊｉｅｎｓｉｓ）と同義：黒シガトカ病）及びＭ．ムシコラ（Ｍ．ｍｕｓｉｃｏｌａ）、Ｍ．アラキジコラ（Ｍ．ａｒａｃｈｉｄｉｃｏｌａ）（Ｍ．アラキジス（Ｍ．ａｒａｃｈｉｄｉｓ）又はセルコスポラ・アラキジス（Ｃｅｒｃｏｓｐｏｒａ ａｒａｃｈｉｄｉｓ）と同義）、ラッカセイにおけるＭ．ベルケレイイ（Ｍ．ｂｅｒｋｅｌｅｙｉ）、エンドウにおけるＭ．ピシ（Ｍ．ｐｉｓｉ）及びアブラナ科の植物におけるＭ．ブラシシオラ（Ｍ．ｂｒａｓｓｉｃｉｏｌａ）；ペロノスポラ種（Ｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｓｐｐ．）（べと病）であって、キャベツにおけるもの（例えば、Ｐ．ブラシカエ（Ｐ．ｂｒａｓｓｉｃａｅ））、ナタネにおけるもの（例えば、Ｐ．パラサイチカ（Ｐ．ｐａｒａｓｉｔｉｃａ））、タマネギにおけるもの（例えば、Ｐ．デストラクター（Ｐ．ｄｅｓｔｒｕｃｔｏｒ））、タバコにおけるもの（Ｐ．タバキナ（Ｐ．ｔａｂａｃｉｎａ））及びダイズにおけるもの（Ｐ．マンシュリカ（Ｐ．ｍａｎｓｈｕｒｉｃａ））；ダイズにおけるファコプソラ・パキリジ（Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｐａｃｈｙｒｈｉｚｉ）及びＰ．メイボミエ（Ｐ．ｍｅｉｂｏｍｉａｅ）（ダイズさび病）；フィアロフォラ種（Ｐｈｉａｌｏｐｈｏｒａ ｓｐｐ．）、例えばブドウにおけるもの（例えば、Ｐ．トラケイフィラ（Ｐ．ｔｒａｃｈｅｉｐｈｉｌａ）及びＰ．テトラスポラ（Ｐ．ｔｅｔｒａｓｐｏｒａ））及びダイズにおけるもの（例えば、Ｐ．グレガタ（Ｐ．ｇｒｅｇａｔａ）：茎腐れ病）；ナタネ及びキャベツにおけるフォマ・リンガム（Ｐｈｏｍａ ｌｉｎｇａｍ）（レプトスフェリア・ビグロボサ（Ｌｅｐｔｏｓｐｈａｅｒｉａ ｂｉｇｌｏｂｏｓａ）及びＬ．マクランス（Ｌ．ｍａｃｕｌａｎｓ）と同義：根及び茎腐れ病）及びテンサイにおけるＰ．ベタエ（Ｐ．ｂｅｔａｅ）（根腐れ病、斑点病及び苗立ち枯れ病）及びトウモロコシにおけるＰ．ゼアエ－マイディス（Ｐ．ｚｅａｅ－ｍａｙｄｉｓ）（フィルロスチカ・ゼアエ（Ｐｈｙｌｌｏｓｔｉｃａ ｚｅａｅ）と同義）；フォモプシス種（Ｐｈｏｍｏｐｓｉｓ ｓｐｐ．）であって、ヒマワリ、ブドウにおけるもの（例えば、Ｐ．ビチコラ（Ｐ．ｖｉｔｉｃｏｌａ）：茎葉斑点病）及びダイズにおけるもの（例えば、茎腐れ病：Ｐ．ファゼオリ（Ｐ．ｐｈａｓｅｏｌｉ）、テレオモルフ：ディアポルテ・ファゼオロルム（Ｄｉａｐｏｒｔｈｅ ｐｈａｓｅｏｌｏｒｕｍ））；トウモロコシにおけるフィゾデルマ・マイディス（Ｐｈｙｓｏｄｅｒｍａ ｍａｙｄｉｓ）（褐色斑病）；様々な植物におけるフィトフトラ種（Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｓｐｐ．）（立ち枯れ病、根、葉、果実及び茎腐れ病）、例えばパプリカ及びウリ科植物におけるもの（例えば、Ｐ．カプシキ（Ｐ．ｃａｐｓｉｃｉ））、ダイズにおけるもの（例えば、Ｐ．メガスペルマ（Ｐ．ｍｅｇａｓｐｅｒｍａ）、Ｐ．ソヤエ（Ｐ．ｓｏｊａｅ）と同義）、ジャガイモ及びトマトにおけるもの（例えば、Ｐ．インフェスタンス（Ｐ．ｉｎｆｅｓｔａｎｓ）：葉腐れ病）及び落葉樹におけるもの（例えば、Ｐ．ラモルム（Ｐ．ｒａｍｏｒｕｍ）：オークの突然死）；キャベツ、ナタネ、ダイコン及び他の植物におけるプラスモディフォラ・ブラシカエ（Ｐｌａｓｍｏｄｉｏｐｈｏｒａ ｂｒａｓｓｉｃａｅ）（クラブ根病）；プラスモパラ種（Ｐｌａｓｍｏｐａｒａ ｓｐｐ．）、例えばブドウにおけるＰ．ビチコラ（Ｐ．ｖｉｔｉｃｏｌａ）（ブドウのべと病）及びヒマワリにおけるＰ．ハルステディイ（Ｐ．ｈａｌｓｔｅｄｉｉ）；ポドスフェラ種（Ｐｏｄｏｓｐｈａｅｒａ ｓｐｐ．）（ウドンコ病）であって、バラ科植物、ホップ、ナシ状果類及びソフトフルーツにおけるもの（例えば、リンゴにおけるＰ．ロイコトリカ（Ｐ．ｌｅｕｃｏｔｒｉｃｈａ））及びウリ科植物におけるもの（Ｐ．キサンチイ（Ｐ．ｘａｎｔｈｉｉ））；ポリミクサ種（Ｐｏｌｙｍｙｘａ ｓｐｐ．）、例えば穀物、例えばオオムギ及びコムギにおけるもの（Ｐ．グラミニス（Ｐ．ｇｒａｍｉｎｉｓ））及びテンサイにおけるもの（Ｐ．ベタエ（Ｐ．ｂｅｔａｅ））及びそれにより感染するウイルス病；穀物、例えばコムギ又はオオムギにおけるプソイドセルコスポレラ・ヘルポトリコイデス（Ｐｓｅｕｄｏｃｅｒｃｏｓｐｏｒｅｌｌａ ｈｅｒｐｏｔｒｉｃｈｏｉｄｅｓ）（オクリマクラ・ヤルンダエ（Ｏｃｕｌｉｍａｃｕｌａ ｙａｌｌｕｎｄａｅ）と同義、Ｏ．アクフォリミス（Ｏ．ａｃｕｆｏｒｍｉｓ）：眼紋病、テレオモルフ：タペシア・ヤルンダエ（Ｔａｐｅｓｉａ ｙａｌｌｕｎｄａｅ））；様々な植物におけるプソイドペルノスポラ（Ｐｓｅｕｄｏｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ）（べと病）、例えばウリ科植物におけるＰ．キュベンシス（Ｐ．ｃｕｂｅｎｓｉｓ）又はホップにおけるＰ．フミリ（Ｐ．ｈｕｍｉｌｉ）；ブドウにおけるプソイドペツィクラ・トラケイフィラ（Ｐｓｅｕｄｏｐｅｚｉｃｕｌａ ｔｒａｃｈｅｉｐｈｉｌａ）（赤色花火病又はロットブレンナー（ｒｏｔｂｒｅｎｎｅｒ）、アナモルフ：フィアロフォラ（Ｐｈｉａｌｏｐｈｏｒａ））；様々な植物におけるプッチニア種（Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｓｐｐ．）（さび病）、穀物、例えばコムギ、オオムギ又はライムギにおけるＰ．トリチシナ（Ｐ．ｔｒｉｔｉｃｉｎａ）（褐色さび病又は葉さび病）、Ｐ．ストリイホルミス（Ｐ．ｓｔｒｉｉｆｏｒｍｉｓ）（縞さび病又は黄さび病）、Ｐ．ホルデイ（Ｐ．ｈｏｒｄｅｉ）（矮化さび病）、Ｐ．グラミニス（Ｐ．ｇｒａｍｉｎｉｓ）（茎さび病又は黒さび病）又はＰ．レコンジタ（Ｐ．ｒｅｃｏｎｄｉｔａ）（褐色さび病又は葉さび病）、サトウキビにおけるＰ．クエニイ（Ｐ．ｋｕｅｈｎｉｉ）（オレンジ色さび病）及びアスパラガスにおけるＰ．アスパラギ（Ｐ．ａｓｐａｒａｇｉ）；ナタネにおけるピレノペジザ種（Ｐｙｒｅｎｏｐｅｚｉｚａ ｓｐｐ．）、例えばＰ．ブラシカエ（Ｐ．ｂｒａｓｓｉｃａｅ）；コムギにおけるピレノフォラ（Ｐｙｒｅｎｏｐｈｏｒａ）（アナモルフ：ドレシュレラ（Ｄｒｅｃｈｓｌｅｒａ））・トリチシ－レペンチス（ｔｒｉｔｉｃｉ－ｒｅｐｅｎｔｉｓ）（黄褐色斑病）又はオオムギにおけるＰ．テレス（Ｐ．ｔｅｒｅｓ）（網斑病）；ピリクラリア種（Ｐｙｒｉｃｕｌａｒｉａ ｓｐｐ．）、例えばイネにおけるＰ．オリザエ（Ｐ．ｏｒｙｚａｅ）（テレオモルフ：マグナポルテ・グリセア（Ｍａｇｎａｐｏｒｔｈｅ ｇｒｉｓｅａ）：イネイモチ病）並びにシバ及び穀物におけるＰ．グリセア（Ｐ．ｇｒｉｓｅａ）；シバ、イネ、トウモロコシ、コムギ、ワタ、ナタネ、ヒマワリ、ダイズ、テンサイ、野菜及び様々な他の植物におけるピシウム種（Ｐｙｔｈｉｕｍ ｓｐｐ．）（苗立ち枯れ病）（例えばＰ．ウルティムム（Ｐ．ｕｌｔｉｍｕｍ）又はＰ．アファニデルマツム（Ｐ．ａｐｈａｎｉｄｅｒｍａｔｕｍ））及びマッシュルームにおけるＰ．オリガンドルム（Ｐ．ｏｌｉｇａｎｄｒｕｍ）；ラムラリア種（Ｒａｍｕｌａｒｉａ ｓｐｐ．）、例えばオオムギにおけるＲ．コロ－シグニ（Ｒ．ｃｏｌｌｏ－ｃｙｇｎｉ）（ラムラリア葉斑点病、生理的葉斑点病）、ワタにおけるＲ．アレオラ（Ｒ．ａｒｅｏｌａ）（テレオモルフ：ミコスフェレラ・アレオラ（Ｍｙｃｏｓｐｈａｅｒｅｌｌａ ａｒｅｏｌａ））及びテンサイにおけるＲ．ベチコラ（Ｒ．ｂｅｔｉｃｏｌａ）；ワタ、イネ、ジャガイモ、シバ、トウモロコシ、ナタネ、ジャガイモ、テンサイ、野菜及び様々な他の植物におけるリゾクトニア種（Ｒｈｉｚｏｃｔｏｎｉａ ｓｐｐ．）、例えばダイズにおけるＲ．ソラニ（Ｒ．ｓｏｌａｎｉ）（根及び茎腐れ病）、イネにおけるＲ．ソラニ（Ｒ．Ｓｏｌａｎｉ）（紋枯病）又はコムギ若しくはオオムギにおけるＲ．セレアリス（Ｒ．ｃｅｒｅａｌｉｓ）（リゾクトニアの春枯れ病）；
イチゴ、ニンジン、キャベツ、ブドウ及びトマトにおけるリゾプス・ストロニフェル（Ｒｈｉｚｏｐｕｓ ｓｔｏｌｏｎｉｆｅｒ）（黒かび病、軟腐れ病）；オオムギ、ライムギ及びライコムギにおけるリンコスポリウム・セカリス（Ｒｈｙｎｃｈｏｓｐｏｒｉｕｍ ｓｅｃａｌｉｓ）及びＲ．コムネ（Ｒ．ｃｏｍｍｕｎｅ）（火傷病）；イネにおけるサロクラジウム・オリザエ（Ｓａｒｏｃｌａｄｉｕｍ ｏｒｙｚａｅ）及びＳ．アテヌアツム（Ｓ．ａｔｔｅｎｕａｔｕｍ）（鞘腐れ病）；野菜（Ｓ．ミノール（Ｓ．ｍｉｎｏｒ）及びＳ．スクレロチオルム（Ｓ．ｓｃｌｅｒｏｔｉｏｒｕｍ））及び農作物におけるスクレロチニア種（Ｓｃｌｅｒｏｔｉｎｉａ ｓｐｐ．）（茎腐れ病又は白かび病）、例えばナタネ、ヒマワリ（例えばＳ．スクレロチオルム）及びダイズにおけるもの、ダイズ、ラッカセイ、野菜、トウモロコシ、穀物及び観賞植物におけるＳ．ロルフシイ（Ｓ．ｒｏｌｆｓｉｉ）（アテリア・ロルフシイ（Ａｔｈｅｌｉａ ｒｏｌｆｓｉｉ）と同義）；様々な植物におけるセプトリア種（Ｓｅｐｔｏｒｉａ ｓｐｐ．）、例えばダイズにおけるＳ．グリシネス（Ｓ．ｇｌｙｃｉｎｅｓ）（褐色斑病）、コムギにおけるＳ．トリチシ（Ｓ．ｔｒｉｔｉｃｉ）（コムギ葉枯病菌（Ｚｙｍｏｓｅｐｔｏｒｉａ ｔｒｉｔｉｃｉ）と同義、セプトリア斑点病）及び穀物におけるＳ．（スタゴノスポラ（Ｓｔａｇｏｎｏｓｐｏｒａ）と同義）・ノドルム（ｎｏｄｏｒｕｍ）（スタゴノスポラ斑点病）；ブドウにおけるウンシヌラ（Ｕｎｃｉｎｕｌａ）（エリシフェ（Ｅｒｙｓｉｐｈｅ）と同義）・ネカトル（ｎｅｃａｔｏｒ）（ウドンコ病、アナモルフ：オイジウム・ツッケリ（Ｏｉｄｉｕｍ ｔｕｃｋｅｒｉ））；セトスフェリア種（Ｓｅｔｏｓｐｈａｅｒｉａ ｓｐｐ．）（黒葉枯病）であって、トウモロコシにおけるもの（例えばＳ．ツルシクム（Ｓ．ｔｕｒｃｉｃｕｍ）、ヘルミントスポリウム・ツルシクム（Ｈｅｌｍｉｎｔｈｏｓｐｏｒｉｕｍ ｔｕｒｃｉｃｕｍ）と同義）及びシバにおけるもの；スファセロテカ種（Ｓｐｈａｃｅｌｏｔｈｅｃａ ｓｐｐ．）（すす病）であって、トウモロコシにおけるもの（例えばＳ．レイリアナ（Ｓ．ｒｅｉｌｉａｎａ）：ウスチラゴ・レイリアナ（Ｕｓｔｉｌａｇｏ ｒｅｉｌｉａｎａ）と同義：黒穂病）、雑穀及びサトウキビにおけるもの；ウリ科植物におけるスフェロテカ・フリギネア（Ｓｐｈａｅｒｏｔｈｅｃａ ｆｕｌｉｇｉｎｅａ）（ポドスファエラ・キサンチイ（Ｐｏｄｏｓｐｈａｅｒａ ｘａｎｔｈｉｉ）と同義：ウドンコ病）；ジャガイモにおけるスポンゴスポラ・スブレラネア（Ｓｐｏｎｇｏｓｐｏｒａ ｓｕｂｔｅｒｒａｎｅａ）（粉状瘡痂病）及びそれにより感染するウイルス病；穀物におけるスタゴノスポラ種（Ｓｔａｇｏｎｏｓｐｏｒａ ｓｐｐ．）、例えばコムギにおけるＳ．ノドルム（Ｓ．ｎｏｄｏｒｕｍ）（スタゴノスポラ斑点病、テレオモルフ：レプトスフェリア［フェオスファエリア（Ｐｈａｅｏｓｐｈａｅｒｉａ）と同義］・ノドルム（ｎｏｄｏｒｕｍ）、セプトリア・ノドルム（Ｓｅｐｔｏｒｉａ ｎｏｄｏｒｕｍ）と同義）；ジャガイモにおけるシンキトリウム・エンドビオチクム（Ｓｙｎｃｈｙｔｒｉｕｍ ｅｎｄｏｂｉｏｔｉｃｕｍ）（ジャガイモいぼ病）；タフリナ種（Ｔａｐｈｒｉｎａ ｓｐｐ．）、例えばモモにおけるＴ．デフォルマンス（Ｔ．ｄｅｆｏｒｍａｎｓ）（縮葉病）及びプラムにおけるＴ．プルニ（Ｔ．ｐｒｕｎｉ）（ポケットプラム）；タバコ、ナシ状果、野菜、ダイズ及びワタにおけるチエラビオプシス種（Ｔｈｉｅｌａｖｉｏｐｓｉｓ ｓｐｐ．）（黒根腐れ病）、例えばＴ．バシコラ（Ｔ．ｂａｓｉｃｏｌａ）（カララ・エレガンス（Ｃｈａｌａｒａ ｅｌｅｇａｎｓ）と同義）；穀物におけるチレチア種（Ｔｉｌｌｅｔｉａ ｓｐｐ．）（一般の又はなまぐさ黒穂病）、例えばコムギにおけるＴ．トリチシ（Ｔ．ｔｒｉｔｉｃｉ）（Ｔ．カリエス（Ｔ．ｃａｒｉｅｓ）と同義、網なまぐさ黒穂病）及びＴ．コントロベルサ（Ｔ．ｃｏｎｔｒｏｖｅｒｓａ）（矮化黒穂病）；マッシュルームにおけるトリコデルマ・ハルジアヌム（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｈａｒｚｉａｎｕｍ）；オオムギ又はコムギにおけるチフラ・インカルナタ（Ｔｙｐｈｕｌａ ｉｎｃａｒｎａｔａ）（灰色雪かび病）；ウロシスチス種（Ｕｒｏｃｙｓｔｉｓ ｓｐｐ．）、例えばライムギにおけるＵ．オクルタ（Ｕ．ｏｃｃｕｌｔａ）（縞すす病）；野菜におけるウロマイセス種（Ｕｒｏｍｙｃｅｓ ｓｐｐ．）（さび病）、例えばマメ類におけるもの（例えばＵ．アペンジクラツス（Ｕ．ａｐｐｅｎｄｉｃｕｌａｔｕｓ）、Ｕ．ファゼオリ（Ｕ．ｐｈａｓｅｏｌｉ）と同義）、テンサイにおけるもの（例えばＵ．ベタエ（Ｕ．ｂｅｔａｅ）又はＵ．ベチコラ（Ｕ．ｂｅｔｉｃｏｌａ））及びマメ科植物（例えばＵ．ビグナエ（Ｕ．ｖｉｇｎａｅ）、Ｕ．ピシ（Ｕ．ｐｉｓｉ）、Ｕ．ビシアエ－ファバエ）（Ｕ．ｖｉｃｉａｅ－ｆａｂａｅ）及びＵ．ファバエ（Ｕ．ｆａｂａｅ））；ウスチラゴ種（Ｕｓｔｉｌａｇｏ ｓｐｐ．）（裸黒穂病）であって、穀物におけるもの（例えばＵ．ヌダ（Ｕ．ｎｕｄａ）及びＵ．アバエナエ（Ｕ．ａｖａｅｎａｅ））、トウモロコシにおけるもの（例えばＵ．マイディス（Ｕ．ｍａｙｄｉｓ）：トウモロコシすす病）及びサトウキビにおけるもの；ベンチュリア種（Ｖｅｎｔｕｒｉａ ｓｐｐ．）（黒星病）であって、リンゴにおけるもの（例えばＶ．イナエクアリス（Ｖ．ｉｎａｅｑｕａｌｉｓ））及びナシにおけるもの；及び様々な植物、例えば果物及び観賞植物、ブドウ、ソフトフルーツ、野菜及び農作物におけるバーティシリウム種（Ｖｅｒｔｉｃｉｌｌｉｕｍ ｓｐｐ．）（立ち枯れ病）、例えばナタネにおけるＶ．ロンギスポルム（Ｖ．ｌｏｎｇｉｓｐｏｒｕｍ）、イチゴ、ナタネ、ジャガイモ及びトマトにおけるＶ．ダリアエ（Ｖ．ｄａｈｌｉａｅ）、並びにマッシュルームにおけるＶ．フンギコラ（Ｖ．ｆｕｎｇｉｃｏｌａ）；穀物におけるコムギ葉枯病菌（Ｚｙｍｏｓｅｐｔｏｒｉａ ｔｒｉｔｉｃｉ）。
アルブゴ種（Ａｌｂｕｇｏ ｓｐｐ．）（白さび病）であって、観賞植物、野菜におけるもの（例えば、Ａ．カンジダ（Ａ．ｃａｎｄｉｄａ））及びヒマワリにおけるもの（例えば、Ａ．トラゴポゴニス（Ａ．ｔｒａｇｏｐｏｇｏｎｉｓ））；アルテルナリア種（Ａｌｔｅｒｎａｒｉａ ｓｐｐ．）（黒班病）であって、野菜におけるもの（例えば、Ａ．ダウシ（Ａ．ｄａｕｃｉ）又はＡ．ポルリ（Ａ．ｐｏｒｒｉ））、ナタネにおけるもの（例えば、Ａ．ブラシシコラ（Ａ．ｂｒａｓｓｉｃｉｃｏｌａ）又はＡ．ブラシカエ（Ａ．ｂｒａｓｓｉｃａｅ））、テンサイにおけるもの（Ａ．テヌイス（Ａ．ｔｅｎｕｉｓ））、果実（例えば、Ａ．グランディス（Ａ．ｇｒａｎｄｉｓ））、イネ、ダイズ、ジャガイモ及びトマトにおけるもの（例えば、Ａ．ソラニ（Ａ．ｓｏｌａｎｉ）、Ａ．グランディス（Ａ．ｇｒａｎｄｉｓ）又はＡ．アルテルナタ（Ａ．ａｌｔｅｒｎａｔａ））、トマトにおけるもの（例えば、Ａ．ソラニ（Ａ．ｓｏｌａｎｉ）又はＡ．アルテルナタ（Ａ．ａｌｔｅｒｎａｔａ））及びコムギにおけるもの（例えば、Ａ．トリチシナ（Ａ．ｔｒｉｔｉｃｉｎａ））；アファノマイセス種（Ａｐｈａｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐｐ．）であって、テンサイ及び野菜におけるもの；穀物及び野菜におけるアスコキタ種（Ａｓｃｏｃｈｙｔａ）、例えばコムギにおけるＡ．トリチシ（Ａ．ｔｒｉｔｉｃｉ）（炭疽病）及びオオムギにおけるＡ．ホルデイ（Ａ．ｈｏｒｄｅｉ）；トウモロコシにおける眼紋病（Ａｕｒｅｏｂａｓｉｄｉｕｍ ｚｅａｅ）（トウモロコシ褐斑病（Ｋａｐａｔｉｅｌｌａ ｚｅａｅ）と同義）；ビポラリス種（Ｂｉｐｏｌａｒｉｓ）及びドレシュレラ種（Ｄｒｅｃｈｓｌｅｒａ ｓｐｐ．）（テレオモルフ：コクリオボルス種（Ｃｏｃｈｌｉｏｂｏｌｕｓ ｓｐｐ．））であって、例えばトウモロコシにおけるごま葉枯病（Ｄ．マイディス（Ｄ．ｍａｙｄｉｓ））又はすす紋病（Ｂ．ゼイコラ（Ｂ．ｚｅｉｃｏｌａ））、例えば穀物における斑点病（Ｂ．ソロキニアナ（Ｂ．ｓｏｒｏｋｉｎｉａｎａ））、例えばイネ及びシバにおけるＢ．オリザエ（Ｂ．ｏｒｙｚａｅ）；穀物（例えば、コムギ又はオオムギ）におけるブルメリア（Ｂｌｕｍｅｒｉａ）（以前にはエリシフェ（Ｅｒｙｓｉｐｈｅ））・グラミニス（ｇｒａｍｉｎｉｓ）（ウドンコ病）；灰色かび病菌（Ｂｏｔｒｙｔｉｓ ｃｉｎｅｒｅａ）（テレオモルフ：ボトリチニア・フッケリアナ（Ｂｏｔｒｙｏｔｉｎｉａ ｆｕｃｋｅｌｉａｎａ）：灰色かび病）であって、果実及び液果（例えば、イチゴ）、野菜（例えば、レタス、ニンジン、セロリ及びキャベツ）におけるもの；タマネギ科、ナタネ、観賞植物（例えば、Ｂエリプチカ（Ｂ ｅｌｉｐｔｉｃａ））、ブドウ、森林植物及びコムギにおける白斑葉枯病（Ｂ．ｓｑｕａｍｏｓａ）又は灰色腐敗病（Ｂ．ａｌｌｉｉ）；レタスにおけるブレミア・ラクツカエ（Ｂｒｅｍｉａ ｌａｃｔｕｃａｅ）（べと病）；落葉樹及び常緑樹におけるセラトシスチス（オフィオストマ（Ｏｐｈｉｏｓｔｏｍａ）と同義）種（Ｃｅｒａｔｏｃｙｓｔｉｓ）（根腐れ病又は立ち枯れ病）、例えばニレにおけるＣ．ウルミ（Ｃ．ｕｌｍｉ）（オランダニレ病）；セルコスポラ種（Ｃｅｒｃｏｓｐｏｒａ ｓｐｐ．）（セルコスポラ斑点病）であって、トウモロコシ（例えば、灰斑病：Ｃ．ゼアエ－マイディス（Ｃ．ｚｅａｅ－ｍａｙｄｉｓ））、イネ、テンサイ（例えば、Ｃ．ベチコラ（Ｃ．ｂｅｔｉｃｏｌａ））におけるもの、サトウキビ、野菜、コーヒー、ダイズにおけるもの（例えば、Ｃ．ソジナ（Ｃ．ｓｏｊｉｎａ）又はＣ．キクチイ（Ｃ．ｋｉｋｕｃｈｉｉ））及びイネにおけるもの；マッシュルームにおけるクラドボトリウム（ダクチリウム（Ｄａｃｔｙｌｉｕｍ）と同義）種（Ｃｌａｄｏｂｏｔｒｙｕｍ）（例えば、Ｃ．ミコフィルム（Ｃ．ｍｙｃｏｐｈｉｌｕｍ）
（以前にはダクチリウム・デンドロイデス（Ｄａｃｔｙｌｉｕｍ ｄｅｎｄｒｏｉｄｅｓ、テレオモルフ：ネクトリア・アルベルティニイ（Ｎｅｃｔｒｉａ ａｌｂｅｒｔｉｎｉｉ）、ネクトリア・ロゼルラ（Ｎｅｃｔｒｉａ ｒｏｓｅｌｌａ）（ヒポマイセス・ロセルルス（Ｈｙｐｏｍｙｃｅｓ ｒｏｓｅｌｌｕｓ）と同義））；クラドスポリウム種（Ｃｌａｄｏｓｐｏｒｉｕｍ ｓｐｐ．）であって、トマトにおけるもの（例えば、Ｃ．フルブム（Ｃ．ｆｕｌｖｕｍ）：葉かび病）及び穀物におけるもの、例えばコムギにおけるＣ．ヘルバルム（Ｃ．ｈｅｒｂａｒｕｍ）（黒変病）；穀物におけるクラビセプス・プルプレア（Ｃｌａｖｉｃｅｐｓ ｐｕｒｐｕｒｅａ）（バッカク）；コクリオボルス（Ｃｏｃｈｌｉｏｂｏｌｕｓ）（アナモルフ：ビポラリス（Ｂｉｐｏｌａｒｉｓ）のヘルミントスポリウム（Ｈｅｌｍｉｎｔｈｏｓｐｏｒｉｕｍ））種（斑点病）であって、トウモロコシにおけるもの（Ｃ．カルボヌム（Ｃ．ｃａｒｂｏｎｕｍ））、穀物におけるもの（例えば、Ｃ．サチブス（Ｃ．ｓａｔｉｖｕｓ）、アナモルフ：Ｂ．ソロキニアナ（Ｂ．ｓｏｒｏｋｉｎｉａｎａ））及びイネにおけるもの（例えば、Ｃ．ミヤベアヌス（Ｃ．ｍｉｙａｂｅａｎｕｓ）、アナモルフ：Ｈ．オリザエ（Ｈ．ｏｒｙｚａｅ））；コレトトリカム（Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ）（テレオモルフ：グロメレラ（Ｇｌｏｍｅｒｅｌｌａ））種（炭疽病）であって、ワタにおけるもの（例えば、Ｃ．ゴシピイ（Ｃ．ｇｏｓｓｙｐｉｉ））、トウモロコシにおけるもの（例えば、Ｃ．グラミニコラ（Ｃ．ｇｒａｍｉｎｉｃｏｌａ）：炭疽病根腐れ）、ソフトフルーツ、ジャガイモにおけるもの（例えば、Ｃ．ココデス（Ｃ．ｃｏｃｃｏｄｅｓ）：黒点病））、マメ類におけるもの（例えば、Ｃ．リンデムチアヌム（Ｃ．ｌｉｎｄｅｍｕｔｈｉａｎｕｍ））、ダイズ（例えば、Ｃ．トルンカツム（Ｃ．ｔｒｕｎｃａｔｕｍ）又はＣ．グロエオスポリオイデス（Ｃ．ｇｌｏｅｏｓｐｏｒｉｏｉｄｅｓ））、野菜（例えば、Ｃ．ラゲナリウム（Ｃ．ｌａｇｅｎａｒｉｕｍ）又はＣ．カプシキ（Ｃ．ｃａｐｓｉｃｉ））、果実（例えば、Ｃ．アクタツム（Ｃ．ａｃｕｔａｔｕｍ））、コーヒー（例えば、Ｃ．コフェアヌム（Ｃ．ｃｏｆｆｅａｎｕｍ）又はＣ．カハワエ（Ｃ．ｋａｈａｗａｅ））におけるもの及び様々な作物におけるＣ．グロエオスポリオイデス（Ｃ．ｇｌｏｅｏｓｐｏｒｉｏｉｄｅｓ））；イネにおけるコルチキウム種（Ｃｏｒｔｉｃｉｕｍ ｓｐｐ．）、例えばＣ．ササキイ（Ｃ．ｓａｓａｋｉｉ）（紋枯病）；ダイズ、ワタ及び観賞植物におけるコリネスポラ・カッシイコラ（Ｃｏｒｙｎｅｓｐｏｒａ ｃａｓｓｉｉｃｏｌａ）（斑点病）；シクロコニウム種（Ｃｙｃｌｏｃｏｎｉｕｍ ｓｐｐ．）、例えばオリーブにおけるＣ．オレアギヌム（Ｃ．ｏｌｅａｇｉｎｕｍ）；シリンドロカルポン種（Ｃｙｌｉｎｄｒｏｃａｒｐｏｎ ｓｐｐ．）（例えば、果樹潰瘍病又は幼ブドウの衰弱、テレオモルフ：ネクトリア種（Ｎｅｃｔｒｉａ）又はネオネクトリア種（Ｎｅｏｎｅｃｔｒｉａ ｓｐｐ．））であって、果樹におけるもの、ブドウにおけるもの（例えば、Ｃ．リリオデンドリ（Ｃ．ｌｉｒｉｏｄｅｎｄｒｉ）、テレオモルフ：ネオネクトリア・リリオデンドリ（Ｎｅｏｎｅｃｔｒｉａ ｌｉｒｉｏｄｅｎｄｒｉ）、黒足病）及び観賞植物におけるもの；ダイズにおけるデマトフォラ（Ｄｅｍａｔｏｐｈｏｒａ）（テレオモルフ：ロゼリニア（Ｒｏｓｅｌｌｉｎｉａ））・ネカトリクス（ｎｅｃａｔｒｉｘ）（根及び茎腐れ病）；ダイズにおけるディアポルテ種（Ｄｉａｐｏｒｔｈｅ ｓｐｐ．）、例えばＤ．ファゼオロルム（Ｄ．ｐｈａｓｅｏｌｏｒｕｍ）（苗立ち枯れ病）；ドレシュレラ（Ｄｒｅｃｈｓｌｅｒａ）（ヘルミントスポリウム（Ｈｅｌｍｉｎｔｈｏｓｐｏｒｉｕｍ）と同義、テレオモルフ：ピレノフォラ（Ｐｙｒｅｎｏｐｈｏｒａ））種であって、トウモロコシにおけるもの、穀物、例えばオオムギにおけるもの（例えば、Ｄ．テレス（Ｄ．ｔｅｒｅｓ）、網斑病）及びコムギにおけるもの（例えば、Ｄ．トリチシ－レペンチス（Ｄ．ｔｒｉｔｉｃｉ－ｒｅｐｅｎｔｉｓ）：黄褐色斑病））、イネ及びシバにおけるもの；ブドウにおいて、ホルミチポリア（Ｆｏｒｍｉｔｉｐｏｒｉａ）（フェリヌス（Ｐｈｅｌｌｉｎｕｓ）と同義）・プンクタタ（ｐｕｎｃｔａｔａ）、Ｆ．メジテラネア（Ｆ．ｍｅｄｉｔｅｒｒａｎｅａ）、フェオモニエラ・クラミドスポラ（Ｐｈａｅｏｍｏｎｉｅｌｌａ ｃｈｌａｍｙｄｏｓｐｏｒａ）（以前にはフェオアクレモニウム・クラミドスポルム（Ｐｈａｅｏａｃｒｅｍｏｎｉｕｍ ｃｈｌａｍｙｄｏｓｐｏｒｕｍ））、フェオアクレモニウム・アレオフィルム（Ｐｈａｅｏａｃｒｅｍｏｎｉｕｍ ａｌｅｏｐｈｉｌｕｍ）及び／又はボトリオスフェリア・オブツサ（Ｂｏｔｒｙｏｓｐｈａｅｒｉａ ｏｂｔｕｓａ）に起因するエスカ（Ｅｓｃａ）病（胴枯病、アポプレキシー）；エルシノエ種（Ｅｌｓｉｎｏｅ ｓｐｐ．）であって、ナシ状果におけるもの（Ｅ．ピリ（Ｅ．ｐｙｒｉ））及びソフトフルーツにおけるもの（Ｅ．ベネタ（Ｅ．ｖｅｎｅｔａ）：炭疽病）並びにブドウにおけるもの（Ｅ．アンペリナ（Ｅ．ａｍｐｅｌｉｎａ）：炭疽病）；イネにおけるエンチロマ・オリザエ（Ｅｎｔｙｌｏｍａ ｏｒｙｚａｅ）（葉すす病）；コムギにおけるエピコックム種（Ｅｐｉｃｏｃｃｕｍ ｓｐｐ．）（黒かび病）；エリシフェ種（Ｅｒｙｓｉｐｈｅ ｓｐｐ．）（ウドンコ病）であって、テンサイにおけるもの（Ｅ．ベタエ（Ｅ．ｂｅｔａｅ））、野菜におけるもの（例えば、Ｅ．ピシ（Ｅ．ｐｉｓｉ））、例えばウリ科植物におけるもの（例えば、Ｅ．シコラセアルム（Ｅ．ｃｉｃｈｏｒａｃｅａｒｕｍ））及びキャベツ、ナタネにおけるもの（例えば、Ｅ．クルシフェラルム（Ｅ．ｃｒｕｃｉｆｅｒａｒｕｍ））；果樹、ブドウ及び観賞樹におけるユーチパ・ラタ（Ｅｕｔｙｐａ ｌａｔａ）（ユーチパ潰瘍病又は胴枯病、アナモルフ：シトスポリナ・ラタ（Ｃｙｔｏｓｐｏｒｉｎａ ｌａｔａ）、リベルテラ・ブレファリス（Ｌｉｂｅｒｔｅｌｌａ ｂｌｅｐｈａｒｉｓ）と同義）；トウモロコシにおけるエクセロヒルム（Ｅｘｓｅｒｏｈｉｌｕｍ）（ヘルミントスポリウム（Ｈｅｌｍｉｎｔｈｏｓｐｏｒｉｕｍ）と同義）種（例えば、Ｅ．ツルシクム（Ｅ．ｔｕｒｃｉｃｕｍ））；様々な植物におけるフザリウム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ）（テレオモルフ：ジベレラ（Ｇｉｂｂｅｒｅｌｌａ））種（立ち枯れ病、根又は茎腐れ病）、例えば穀物（例えば、コムギ又はオオムギ）におけるＦ．グラミネアルム（Ｆ．ｇｒａｍｉｎｅａｒｕｍ）又はＦ．クルモルム（Ｆ．ｃｕｌｍｏｒｕｍ）（根腐れ病、黒星病又は赤かび病）、トマトにおけるＦ．オキシスポルム（Ｆ．ｏｘｙｓｐｏｒｕｍ）、ダイズにおけるそれぞれが突然死症候群を引き起こすＦ．ソラニ（Ｆ．ｓｏｌａｎｉ）（ｆ．グリシネス種（ｓｐ．ｇｌｙｃｉｎｅｓ）、現在のＦ．ビルグリフォルメ（Ｆ．ｖｉｒｇｕｌｉｆｏｒｍｅ）と同義）及びＦ．ツクマニアエ（Ｆ．ｔｕｃｕｍａｎｉａｅ）及びＦ．ブラシリエンス（Ｆ．ｂｒａｓｉｌｉｅｎｓｅ）並びにトウモロコシにおけるＦ．ベルチシリオイデス（Ｆ．ｖｅｒｔｉｃｉｌｌｉｏｉｄｅｓ）；
穀物（例えば、コムギ又はオオムギ）及びトウモロコシにおけるゲウマノマイセス・グラミニス（Ｇａｅｕｍａｎｎｏｍｙｃｅｓ ｇｒａｍｉｎｉｓ）（立ち枯れ病）；ジベレラ種（Ｇｉｂｂｅｒｅｌｌａ ｓｐｐ．）であって、穀物におけるもの（例えば、Ｇ．ゼアエ（Ｇ．ｚｅａｅ））及びイネにおけるもの（例えば、Ｇ．フジクロイ（Ｇ．ｆｕｊｉｋｕｒｏｉ）、馬鹿苗病）；ブドウ、ナシ状果及び他の植物におけるグロメレラ・シングラタ（Ｇｌｏｍｅｒｅｌｌａ ｃｉｎｇｕｌａｔａ）及びワタにおけるＧ．ゴシピイ（Ｇ．ｇｏｓｓｙｐｉｉ）；イネにおける穀粒ステイン複合病；ブドウにおけるギグナルディア・ビドウェリ（Ｇｕｉｇｎａｒｄｉａ ｂｉｄｗｅｌｌｉｉ）（黒腐れ病）；バラ科植物及び杜松におけるギムノスポランギウム種（Ｇｙｍｎｏｓｐｏｒａｎｇｉｕｍ ｓｐｐ．）、例えばナシにおけるＧ．サビネ（Ｇ．ｓａｂｉｎａｅ）（さび病）；トウモロコシ、穀物、ジャガイモ及びイネにおけるヘルミントスポリウム種（Ｈｅｌｍｉｎｔｈｏｓｐｏｒｉｕｍ ｓｐｐ．）（ドレシュレラ（Ｄｒｅｃｈｓｌｅｒａ）と同義、テレオモルフ：コクリオボルス（Ｃｏｃｈｌｉｏｂｏｌｕｓ））；ヘミレイア種（Ｈｅｍｉｌｅｉａ ｓｐｐ．）であって、例えばコーヒーにおけるＨ．バスタトリクス（Ｈ．ｖａｓｔａｔｒｉｘ）（コーヒーの葉さび病）；ブドウにおけるイサリオプシス・クラビスポラ（Ｉｓａｒｉｏｐｓｉｓ ｃｌａｖｉｓｐｏｒａ）（クラドスポリウム・ビチス（Ｃｌａｄｏｓｐｏｒｉｕｍ ｖｉｔｉｓ）と同義）；ダイズ及びワタにおけるマクロフォミナ・ファセオリナ（Ｍａｃｒｏｐｈｏｍｉｎａ ｐｈａｓｅｏｌｉｎａ）（ファセオリ（ｐｈａｓｅｏｌｉ）と同義）（根及び茎腐れ病）；穀物（例えば、コムギ又はオオムギ）におけるミクロドキウム（Ｍｉｃｒｏｄｏｃｈｉｕｍ）（フザリウム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ）と同義）・ニバレ（ｎｉｖａｌｅ）（ピンク雪かび病）；ダイズにおけるミクロスフェラ・ディフューザ（Ｍｉｃｒｏｓｐｈａｅｒａ ｄｉｆｆｕｓａ）（ウドンコ病）；石果及び他のバラ科植物におけるモニリニア種（Ｍｏｎｉｌｉｎｉａ ｓｐｐ．）、例えばＭ．ラクサ（Ｍ．ｌａｘａ）、Ｍ．フルクチコラ（Ｍ．ｆｒｕｃｔｉｃｏｌａ）及びＭ．フルクチゲナ（Ｍ．ｆｒｕｃｔｉｇｅｎａ）（モニラ種（Ｍｏｎｉｌｉａ ｓｐｐ．）と同義：花枯病及び枝枯病、褐色腐れ病）；穀物、バナナ、ソフトフルーツ及びラッカセイにおけるマイコスフェレラ種（Ｍｙｃｏｓｐｈａｅｒｅｌｌａ ｓｐｐ．）、例えばコムギにおけるＭ．グラミニコラ（Ｍ．ｇｒａｍｉｎｉｃｏｌａ）（アナモルフ：コムギ葉枯病菌（Ｚｙｍｏｓｅｐｔｏｒｉａ ｔｒｉｔｉｃｉ）、以前にはセプトリア・トリチシ（Ｓｅｐｔｏｒｉａ ｔｒｉｔｉｃｉ）：セプトリア斑点病）又は及びバナナにおけるＭ．フィジエンシス（Ｍ．ｆｉｊｉｅｎｓｉｓ）（プソイドケルコスポラ・フィジエンシス（Ｐｓｅｕｄｏｃｅｒｃｏｓｐｏｒａ ｆｉｊｉｅｎｓｉｓ）と同義：黒シガトカ病）及びＭ．ムシコラ（Ｍ．ｍｕｓｉｃｏｌａ）、Ｍ．アラキジコラ（Ｍ．ａｒａｃｈｉｄｉｃｏｌａ）（Ｍ．アラキジス（Ｍ．ａｒａｃｈｉｄｉｓ）又はセルコスポラ・アラキジス（Ｃｅｒｃｏｓｐｏｒａ ａｒａｃｈｉｄｉｓ）と同義）、ラッカセイにおけるＭ．ベルケレイイ（Ｍ．ｂｅｒｋｅｌｅｙｉ）、エンドウにおけるＭ．ピシ（Ｍ．ｐｉｓｉ）及びアブラナ科の植物におけるＭ．ブラシシオラ（Ｍ．ｂｒａｓｓｉｃｉｏｌａ）；ペロノスポラ種（Ｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｓｐｐ．）（べと病）であって、キャベツにおけるもの（例えば、Ｐ．ブラシカエ（Ｐ．ｂｒａｓｓｉｃａｅ））、ナタネにおけるもの（例えば、Ｐ．パラサイチカ（Ｐ．ｐａｒａｓｉｔｉｃａ））、タマネギにおけるもの（例えば、Ｐ．デストラクター（Ｐ．ｄｅｓｔｒｕｃｔｏｒ））、タバコにおけるもの（Ｐ．タバキナ（Ｐ．ｔａｂａｃｉｎａ））及びダイズにおけるもの（Ｐ．マンシュリカ（Ｐ．ｍａｎｓｈｕｒｉｃａ））；ダイズにおけるファコプソラ・パキリジ（Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｐａｃｈｙｒｈｉｚｉ）及びＰ．メイボミエ（Ｐ．ｍｅｉｂｏｍｉａｅ）（ダイズさび病）；フィアロフォラ種（Ｐｈｉａｌｏｐｈｏｒａ ｓｐｐ．）、例えばブドウにおけるもの（例えば、Ｐ．トラケイフィラ（Ｐ．ｔｒａｃｈｅｉｐｈｉｌａ）及びＰ．テトラスポラ（Ｐ．ｔｅｔｒａｓｐｏｒａ））及びダイズにおけるもの（例えば、Ｐ．グレガタ（Ｐ．ｇｒｅｇａｔａ）：茎腐れ病）；ナタネ及びキャベツにおけるフォマ・リンガム（Ｐｈｏｍａ ｌｉｎｇａｍ）（レプトスフェリア・ビグロボサ（Ｌｅｐｔｏｓｐｈａｅｒｉａ ｂｉｇｌｏｂｏｓａ）及びＬ．マクランス（Ｌ．ｍａｃｕｌａｎｓ）と同義：根及び茎腐れ病）及びテンサイにおけるＰ．ベタエ（Ｐ．ｂｅｔａｅ）（根腐れ病、斑点病及び苗立ち枯れ病）及びトウモロコシにおけるＰ．ゼアエ－マイディス（Ｐ．ｚｅａｅ－ｍａｙｄｉｓ）（フィルロスチカ・ゼアエ（Ｐｈｙｌｌｏｓｔｉｃａ ｚｅａｅ）と同義）；フォモプシス種（Ｐｈｏｍｏｐｓｉｓ ｓｐｐ．）であって、ヒマワリ、ブドウにおけるもの（例えば、Ｐ．ビチコラ（Ｐ．ｖｉｔｉｃｏｌａ）：茎葉斑点病）及びダイズにおけるもの（例えば、茎腐れ病：Ｐ．ファゼオリ（Ｐ．ｐｈａｓｅｏｌｉ）、テレオモルフ：ディアポルテ・ファゼオロルム（Ｄｉａｐｏｒｔｈｅ ｐｈａｓｅｏｌｏｒｕｍ））；トウモロコシにおけるフィゾデルマ・マイディス（Ｐｈｙｓｏｄｅｒｍａ ｍａｙｄｉｓ）（褐色斑病）；様々な植物におけるフィトフトラ種（Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｓｐｐ．）（立ち枯れ病、根、葉、果実及び茎腐れ病）、例えばパプリカ及びウリ科植物におけるもの（例えば、Ｐ．カプシキ（Ｐ．ｃａｐｓｉｃｉ））、ダイズにおけるもの（例えば、Ｐ．メガスペルマ（Ｐ．ｍｅｇａｓｐｅｒｍａ）、Ｐ．ソヤエ（Ｐ．ｓｏｊａｅ）と同義）、ジャガイモ及びトマトにおけるもの（例えば、Ｐ．インフェスタンス（Ｐ．ｉｎｆｅｓｔａｎｓ）：葉腐れ病）及び落葉樹におけるもの（例えば、Ｐ．ラモルム（Ｐ．ｒａｍｏｒｕｍ）：オークの突然死）；キャベツ、ナタネ、ダイコン及び他の植物におけるプラスモディフォラ・ブラシカエ（Ｐｌａｓｍｏｄｉｏｐｈｏｒａ ｂｒａｓｓｉｃａｅ）（クラブ根病）；プラスモパラ種（Ｐｌａｓｍｏｐａｒａ ｓｐｐ．）、例えばブドウにおけるＰ．ビチコラ（Ｐ．ｖｉｔｉｃｏｌａ）（ブドウのべと病）及びヒマワリにおけるＰ．ハルステディイ（Ｐ．ｈａｌｓｔｅｄｉｉ）；ポドスフェラ種（Ｐｏｄｏｓｐｈａｅｒａ ｓｐｐ．）（ウドンコ病）であって、バラ科植物、ホップ、ナシ状果類及びソフトフルーツにおけるもの（例えば、リンゴにおけるＰ．ロイコトリカ（Ｐ．ｌｅｕｃｏｔｒｉｃｈａ））及びウリ科植物におけるもの（Ｐ．キサンチイ（Ｐ．ｘａｎｔｈｉｉ））；ポリミクサ種（Ｐｏｌｙｍｙｘａ ｓｐｐ．）、例えば穀物、例えばオオムギ及びコムギにおけるもの（Ｐ．グラミニス（Ｐ．ｇｒａｍｉｎｉｓ））及びテンサイにおけるもの（Ｐ．ベタエ（Ｐ．ｂｅｔａｅ））及びそれにより感染するウイルス病；穀物、例えばコムギ又はオオムギにおけるプソイドセルコスポレラ・ヘルポトリコイデス（Ｐｓｅｕｄｏｃｅｒｃｏｓｐｏｒｅｌｌａ ｈｅｒｐｏｔｒｉｃｈｏｉｄｅｓ）（オクリマクラ・ヤルンダエ（Ｏｃｕｌｉｍａｃｕｌａ ｙａｌｌｕｎｄａｅ）と同義、Ｏ．アクフォリミス（Ｏ．ａｃｕｆｏｒｍｉｓ）：眼紋病、テレオモルフ：タペシア・ヤルンダエ（Ｔａｐｅｓｉａ ｙａｌｌｕｎｄａｅ））；様々な植物におけるプソイドペルノスポラ（Ｐｓｅｕｄｏｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ）（べと病）、例えばウリ科植物におけるＰ．キュベンシス（Ｐ．ｃｕｂｅｎｓｉｓ）又はホップにおけるＰ．フミリ（Ｐ．ｈｕｍｉｌｉ）；ブドウにおけるプソイドペツィクラ・トラケイフィラ（Ｐｓｅｕｄｏｐｅｚｉｃｕｌａ ｔｒａｃｈｅｉｐｈｉｌａ）（赤色花火病又はロットブレンナー（ｒｏｔｂｒｅｎｎｅｒ）、アナモルフ：フィアロフォラ（Ｐｈｉａｌｏｐｈｏｒａ））；様々な植物におけるプッチニア種（Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｓｐｐ．）（さび病）、穀物、例えばコムギ、オオムギ又はライムギにおけるＰ．トリチシナ（Ｐ．ｔｒｉｔｉｃｉｎａ）（褐色さび病又は葉さび病）、Ｐ．ストリイホルミス（Ｐ．ｓｔｒｉｉｆｏｒｍｉｓ）（縞さび病又は黄さび病）、Ｐ．ホルデイ（Ｐ．ｈｏｒｄｅｉ）（矮化さび病）、Ｐ．グラミニス（Ｐ．ｇｒａｍｉｎｉｓ）（茎さび病又は黒さび病）又はＰ．レコンジタ（Ｐ．ｒｅｃｏｎｄｉｔａ）（褐色さび病又は葉さび病）、サトウキビにおけるＰ．クエニイ（Ｐ．ｋｕｅｈｎｉｉ）（オレンジ色さび病）及びアスパラガスにおけるＰ．アスパラギ（Ｐ．ａｓｐａｒａｇｉ）；ナタネにおけるピレノペジザ種（Ｐｙｒｅｎｏｐｅｚｉｚａ ｓｐｐ．）、例えばＰ．ブラシカエ（Ｐ．ｂｒａｓｓｉｃａｅ）；コムギにおけるピレノフォラ（Ｐｙｒｅｎｏｐｈｏｒａ）（アナモルフ：ドレシュレラ（Ｄｒｅｃｈｓｌｅｒａ））・トリチシ－レペンチス（ｔｒｉｔｉｃｉ－ｒｅｐｅｎｔｉｓ）（黄褐色斑病）又はオオムギにおけるＰ．テレス（Ｐ．ｔｅｒｅｓ）（網斑病）；ピリクラリア種（Ｐｙｒｉｃｕｌａｒｉａ ｓｐｐ．）、例えばイネにおけるＰ．オリザエ（Ｐ．ｏｒｙｚａｅ）（テレオモルフ：マグナポルテ・グリセア（Ｍａｇｎａｐｏｒｔｈｅ ｇｒｉｓｅａ）：イネイモチ病）並びにシバ及び穀物におけるＰ．グリセア（Ｐ．ｇｒｉｓｅａ）；シバ、イネ、トウモロコシ、コムギ、ワタ、ナタネ、ヒマワリ、ダイズ、テンサイ、野菜及び様々な他の植物におけるピシウム種（Ｐｙｔｈｉｕｍ ｓｐｐ．）（苗立ち枯れ病）（例えばＰ．ウルティムム（Ｐ．ｕｌｔｉｍｕｍ）又はＰ．アファニデルマツム（Ｐ．ａｐｈａｎｉｄｅｒｍａｔｕｍ））及びマッシュルームにおけるＰ．オリガンドルム（Ｐ．ｏｌｉｇａｎｄｒｕｍ）；ラムラリア種（Ｒａｍｕｌａｒｉａ ｓｐｐ．）、例えばオオムギにおけるＲ．コロ－シグニ（Ｒ．ｃｏｌｌｏ－ｃｙｇｎｉ）（ラムラリア葉斑点病、生理的葉斑点病）、ワタにおけるＲ．アレオラ（Ｒ．ａｒｅｏｌａ）（テレオモルフ：ミコスフェレラ・アレオラ（Ｍｙｃｏｓｐｈａｅｒｅｌｌａ ａｒｅｏｌａ））及びテンサイにおけるＲ．ベチコラ（Ｒ．ｂｅｔｉｃｏｌａ）；ワタ、イネ、ジャガイモ、シバ、トウモロコシ、ナタネ、ジャガイモ、テンサイ、野菜及び様々な他の植物におけるリゾクトニア種（Ｒｈｉｚｏｃｔｏｎｉａ ｓｐｐ．）、例えばダイズにおけるＲ．ソラニ（Ｒ．ｓｏｌａｎｉ）（根及び茎腐れ病）、イネにおけるＲ．ソラニ（Ｒ．Ｓｏｌａｎｉ）（紋枯病）又はコムギ若しくはオオムギにおけるＲ．セレアリス（Ｒ．ｃｅｒｅａｌｉｓ）（リゾクトニアの春枯れ病）；
イチゴ、ニンジン、キャベツ、ブドウ及びトマトにおけるリゾプス・ストロニフェル（Ｒｈｉｚｏｐｕｓ ｓｔｏｌｏｎｉｆｅｒ）（黒かび病、軟腐れ病）；オオムギ、ライムギ及びライコムギにおけるリンコスポリウム・セカリス（Ｒｈｙｎｃｈｏｓｐｏｒｉｕｍ ｓｅｃａｌｉｓ）及びＲ．コムネ（Ｒ．ｃｏｍｍｕｎｅ）（火傷病）；イネにおけるサロクラジウム・オリザエ（Ｓａｒｏｃｌａｄｉｕｍ ｏｒｙｚａｅ）及びＳ．アテヌアツム（Ｓ．ａｔｔｅｎｕａｔｕｍ）（鞘腐れ病）；野菜（Ｓ．ミノール（Ｓ．ｍｉｎｏｒ）及びＳ．スクレロチオルム（Ｓ．ｓｃｌｅｒｏｔｉｏｒｕｍ））及び農作物におけるスクレロチニア種（Ｓｃｌｅｒｏｔｉｎｉａ ｓｐｐ．）（茎腐れ病又は白かび病）、例えばナタネ、ヒマワリ（例えばＳ．スクレロチオルム）及びダイズにおけるもの、ダイズ、ラッカセイ、野菜、トウモロコシ、穀物及び観賞植物におけるＳ．ロルフシイ（Ｓ．ｒｏｌｆｓｉｉ）（アテリア・ロルフシイ（Ａｔｈｅｌｉａ ｒｏｌｆｓｉｉ）と同義）；様々な植物におけるセプトリア種（Ｓｅｐｔｏｒｉａ ｓｐｐ．）、例えばダイズにおけるＳ．グリシネス（Ｓ．ｇｌｙｃｉｎｅｓ）（褐色斑病）、コムギにおけるＳ．トリチシ（Ｓ．ｔｒｉｔｉｃｉ）（コムギ葉枯病菌（Ｚｙｍｏｓｅｐｔｏｒｉａ ｔｒｉｔｉｃｉ）と同義、セプトリア斑点病）及び穀物におけるＳ．（スタゴノスポラ（Ｓｔａｇｏｎｏｓｐｏｒａ）と同義）・ノドルム（ｎｏｄｏｒｕｍ）（スタゴノスポラ斑点病）；ブドウにおけるウンシヌラ（Ｕｎｃｉｎｕｌａ）（エリシフェ（Ｅｒｙｓｉｐｈｅ）と同義）・ネカトル（ｎｅｃａｔｏｒ）（ウドンコ病、アナモルフ：オイジウム・ツッケリ（Ｏｉｄｉｕｍ ｔｕｃｋｅｒｉ））；セトスフェリア種（Ｓｅｔｏｓｐｈａｅｒｉａ ｓｐｐ．）（黒葉枯病）であって、トウモロコシにおけるもの（例えばＳ．ツルシクム（Ｓ．ｔｕｒｃｉｃｕｍ）、ヘルミントスポリウム・ツルシクム（Ｈｅｌｍｉｎｔｈｏｓｐｏｒｉｕｍ ｔｕｒｃｉｃｕｍ）と同義）及びシバにおけるもの；スファセロテカ種（Ｓｐｈａｃｅｌｏｔｈｅｃａ ｓｐｐ．）（すす病）であって、トウモロコシにおけるもの（例えばＳ．レイリアナ（Ｓ．ｒｅｉｌｉａｎａ）：ウスチラゴ・レイリアナ（Ｕｓｔｉｌａｇｏ ｒｅｉｌｉａｎａ）と同義：黒穂病）、雑穀及びサトウキビにおけるもの；ウリ科植物におけるスフェロテカ・フリギネア（Ｓｐｈａｅｒｏｔｈｅｃａ ｆｕｌｉｇｉｎｅａ）（ポドスファエラ・キサンチイ（Ｐｏｄｏｓｐｈａｅｒａ ｘａｎｔｈｉｉ）と同義：ウドンコ病）；ジャガイモにおけるスポンゴスポラ・スブレラネア（Ｓｐｏｎｇｏｓｐｏｒａ ｓｕｂｔｅｒｒａｎｅａ）（粉状瘡痂病）及びそれにより感染するウイルス病；穀物におけるスタゴノスポラ種（Ｓｔａｇｏｎｏｓｐｏｒａ ｓｐｐ．）、例えばコムギにおけるＳ．ノドルム（Ｓ．ｎｏｄｏｒｕｍ）（スタゴノスポラ斑点病、テレオモルフ：レプトスフェリア［フェオスファエリア（Ｐｈａｅｏｓｐｈａｅｒｉａ）と同義］・ノドルム（ｎｏｄｏｒｕｍ）、セプトリア・ノドルム（Ｓｅｐｔｏｒｉａ ｎｏｄｏｒｕｍ）と同義）；ジャガイモにおけるシンキトリウム・エンドビオチクム（Ｓｙｎｃｈｙｔｒｉｕｍ ｅｎｄｏｂｉｏｔｉｃｕｍ）（ジャガイモいぼ病）；タフリナ種（Ｔａｐｈｒｉｎａ ｓｐｐ．）、例えばモモにおけるＴ．デフォルマンス（Ｔ．ｄｅｆｏｒｍａｎｓ）（縮葉病）及びプラムにおけるＴ．プルニ（Ｔ．ｐｒｕｎｉ）（ポケットプラム）；タバコ、ナシ状果、野菜、ダイズ及びワタにおけるチエラビオプシス種（Ｔｈｉｅｌａｖｉｏｐｓｉｓ ｓｐｐ．）（黒根腐れ病）、例えばＴ．バシコラ（Ｔ．ｂａｓｉｃｏｌａ）（カララ・エレガンス（Ｃｈａｌａｒａ ｅｌｅｇａｎｓ）と同義）；穀物におけるチレチア種（Ｔｉｌｌｅｔｉａ ｓｐｐ．）（一般の又はなまぐさ黒穂病）、例えばコムギにおけるＴ．トリチシ（Ｔ．ｔｒｉｔｉｃｉ）（Ｔ．カリエス（Ｔ．ｃａｒｉｅｓ）と同義、網なまぐさ黒穂病）及びＴ．コントロベルサ（Ｔ．ｃｏｎｔｒｏｖｅｒｓａ）（矮化黒穂病）；マッシュルームにおけるトリコデルマ・ハルジアヌム（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｈａｒｚｉａｎｕｍ）；オオムギ又はコムギにおけるチフラ・インカルナタ（Ｔｙｐｈｕｌａ ｉｎｃａｒｎａｔａ）（灰色雪かび病）；ウロシスチス種（Ｕｒｏｃｙｓｔｉｓ ｓｐｐ．）、例えばライムギにおけるＵ．オクルタ（Ｕ．ｏｃｃｕｌｔａ）（縞すす病）；野菜におけるウロマイセス種（Ｕｒｏｍｙｃｅｓ ｓｐｐ．）（さび病）、例えばマメ類におけるもの（例えばＵ．アペンジクラツス（Ｕ．ａｐｐｅｎｄｉｃｕｌａｔｕｓ）、Ｕ．ファゼオリ（Ｕ．ｐｈａｓｅｏｌｉ）と同義）、テンサイにおけるもの（例えばＵ．ベタエ（Ｕ．ｂｅｔａｅ）又はＵ．ベチコラ（Ｕ．ｂｅｔｉｃｏｌａ））及びマメ科植物（例えばＵ．ビグナエ（Ｕ．ｖｉｇｎａｅ）、Ｕ．ピシ（Ｕ．ｐｉｓｉ）、Ｕ．ビシアエ－ファバエ）（Ｕ．ｖｉｃｉａｅ－ｆａｂａｅ）及びＵ．ファバエ（Ｕ．ｆａｂａｅ））；ウスチラゴ種（Ｕｓｔｉｌａｇｏ ｓｐｐ．）（裸黒穂病）であって、穀物におけるもの（例えばＵ．ヌダ（Ｕ．ｎｕｄａ）及びＵ．アバエナエ（Ｕ．ａｖａｅｎａｅ））、トウモロコシにおけるもの（例えばＵ．マイディス（Ｕ．ｍａｙｄｉｓ）：トウモロコシすす病）及びサトウキビにおけるもの；ベンチュリア種（Ｖｅｎｔｕｒｉａ ｓｐｐ．）（黒星病）であって、リンゴにおけるもの（例えばＶ．イナエクアリス（Ｖ．ｉｎａｅｑｕａｌｉｓ））及びナシにおけるもの；及び様々な植物、例えば果物及び観賞植物、ブドウ、ソフトフルーツ、野菜及び農作物におけるバーティシリウム種（Ｖｅｒｔｉｃｉｌｌｉｕｍ ｓｐｐ．）（立ち枯れ病）、例えばナタネにおけるＶ．ロンギスポルム（Ｖ．ｌｏｎｇｉｓｐｏｒｕｍ）、イチゴ、ナタネ、ジャガイモ及びトマトにおけるＶ．ダリアエ（Ｖ．ｄａｈｌｉａｅ）、並びにマッシュルームにおけるＶ．フンギコラ（Ｖ．ｆｕｎｇｉｃｏｌａ）；穀物におけるコムギ葉枯病菌（Ｚｙｍｏｓｅｐｔｏｒｉａ ｔｒｉｔｉｃｉ）。
【0085】
混合物及びその農薬組成物は、それぞれ、以下の植物病原性真菌属；アルテルナリア（Ａｌｔｅｒｎａｒｉａ）属、ボトリチス（Ｂｏｔｒｙｔｉｓ）、ベンチュリア（Ｖｅｎｔｕｒｉａ）属、レプトスフェリア（Ｌｅｐｔｏｓｐｈａｅｒｉａ）属、フザリウム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ）属、リゾクトニア（Ｒｈｉｚｏｃｔｏｎｉａ）属、フィトフトラ（Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ）属、ピシウム（Ｐｙｔｈｉｕｍ）属、コレトトリカム（Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ）属、ピリクラリア（Ｐｙｒｉｃｕｌａｒｉａ）属、スクレロチニア（Ｓｃｌｅｒｏｔｉｎｉａ）属、ジモセプトリア（Ｚｙｍｏｓｅｐｔｏｒｉａ）属を防除するのに特に好適である。
【0086】
混合物及びその農薬組成物は、それぞれ、アルテルナリア・ソラヌム（Ａｌｔｅｒｎａｒｉａ ｓｏｌａｎｕｍ）、アルテルナリア・オルタナータ（Ａｌｔｅｒｎａｒｉａ ａｌｔｅｒｎａｔａ）、アルテルナリア・ブラシカエ（Ａｌｔｅｒｎａｒｉａ ｂｒａｓｓｉｃａｅ）、アルテルナリア・ブラシシコラ（Ａｌｔｅｒｎａｒｉａ ｂｒａｓｓｉｃｉｃｏｌａ）、アルテルナリア・シトリ（Ａｌｔｅｒｎａｒｉａ ｃｉｔｒｉ）、アルテルナリア・マリ（Ａｌｔｅｒｎａｒｉａ ｍａｌｉ）、灰色かび病菌（Ｂｏｔｒｙｔｉｓ ｃｉｎｅｒｅａ）、ボトリチス・アリイ（Ｂｏｔｒｙｔｉｓ ａｌｌｉｉ）、ボトリチス・ファバエ（Ｂｏｔｒｙｔｉｓ ｆａｂａｅ）、ボトリチス・スクアモサ（Ｂｏｔｒｙｔｉｓ ｓｑｕａｍｏｓａ）、ベンチュリア・イネクアリス（Ｖｅｎｔｕｒｉａ ｉｎａｅｑｕａｌｉｓ）、ベンチュリア・エフーサ（Ｖｅｎｔｕｒｉａ ｅｆｆｕｓａ）、ベンチュリア・カルポフィラ（Ｖｅｎｔｕｒｉａ ｃａｒｐｏｐｈｉｌａ）、ベンチュリア・ピリナ（Ｖｅｎｔｕｒｉａ ｐｙｒｉｎａ）、レプトスフェリア・マクランス（Ｌｅｐｔｏｓｐｈａｅｒｉａ ｍａｃｕｌａｎｓ）、レプトスフェリア・ノドルム（Ｌｅｐｔｏｓｐｈａｅｒｉａ ｎｏｄｏｒｕｍ）、フザリウム・オキシスポルム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｏｘｙｓｐｏｒｕｍ）、フザリウム・グラミネアルム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｇｒａｍｉｎｅａｒｕｍ）、フザリウム・ベルチシリオイデス（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｖｅｒｔｉｃｉｌｌｉｏｉｄｅｓ）、リゾクトニア・ソラニ（Ｒｈｉｚｏｃｔｏｎｉａ ｓｏｌａｎｉ）、ジャガイモ疫病菌（Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｉｎｆｅｓｔａｎｓ）、フィトフトラ・カプシシ（Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｃａｐｓｉｃｉ）、フィトフトラ・フラガリアエ（Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｆｒａｇａｒｉａｅ）、フィトフトラ・ニコチアナエ（Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｎｉｃｏｔｉａｎａｅ）、フィトフトラ・ソジェ（Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｓｏｊａｅ）、ピシウム・ウルティムム（Ｐｙｔｈｉｕｍ ｕｌｔｉｍｕｍ）、ピシウム・アカンティカム（Ｐｙｔｈｉｕｍ ａｃａｎｔｈｉｃｕｍ）、ピシウム・デリエンセ（Ｐｙｔｈｉｕｍ ｄｅｌｉｅｎｓｅ）、ピシウム・グラミニコラ（Ｐｙｔｈｉｕｍ ｇｒａｍｉｎｉｃｏｌａ）、ピシウム・ヘテロタリクム（Ｐｙｔｈｉｕｍ ｈｅｔｅｒｏｔｈａｌｌｉｃｕｍ）、ピシウム・ヒポジヌム（Ｐｙｔｈｉｕｍ ｈｙｐｏｇｙｎｕｍ）、ピシウム・ミドルトニイ（Ｐｙｔｈｉｕｍ ｍｉｄｄｌｅｔｏｎｉｉ）、炭疽病菌（Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｏｒｂｉｃｕｌａｒｅ）、コレトトリカム・カプシシ（Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｃａｐｓｉｃｉ）、コレトトリカム・ココデス（Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｃｏｃｃｏｄｅｓ）、コレトトリカム・フラガリアエ（Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｆｒａｇａｒｉａｅ）、コレトトリカム・リンデムチアヌム（Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｌｉｎｄｅｍｕｔｈｉａｎｕｍ）、イネいもち病菌（Ｐｙｒｉｃｕｌａｒｉａ ｏｒｙｚａｅ）、菌核病菌（Ｓｃｌｅｒｏｔｉｎｉａ ｓｃｌｅｒｏｔｉｏｒｕｍ）、スクレロチニア・ミノール（Ｓｃｌｅｒｏｔｉｎｉａ ｍｉｎｏｒ）、スクレロチニア・トリフォリオルム（Ｓｃｌｅｒｏｔｉｎｉａ ｔｒｉｆｏｌｉｏｒｕｍ）、コムギ葉枯病菌（Ｚｙｍｏｓｅｐｔｏｒｉａ ｔｒｉｔｉｃｉ）の植物病原性真菌の防除に特に好適である。
【0087】
混合物及びその農薬組成物は、それぞれ、アルテルナリア・ソラヌム（Ａｌｔｅｒｎａｒｉａ ｓｏｌａｎｕｍ）、灰色かび病菌（Ｂｏｔｒｙｔｉｓ ｃｉｎｅｒｅａ）、ベンチュリア・イネクアリス（Ｖｅｎｔｕｒｉａ ｉｎａｅｑｕａｌｉｓ）、レプトスフェリア・マクランス（Ｌｅｐｔｏｓｐｈａｅｒｉａ ｍａｃｕｌａｎｓ）、レプトスフェリア・ノドルム（Ｌｅｐｔｏｓｐｈａｅｒｉａ ｎｏｄｏｒｕｍ）、フザリウム・オキシスポルム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｏｘｙｓｐｏｒｕｍ）、フザリウム・グラミネアルム（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｇｒａｍｉｎｅａｒｕｍ）、リゾクトニア・ソラニ（Ｒｈｉｚｏｃｔｏｎｉａ ｓｏｌａｎｉ）、ジャガイモ疫病菌（Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｉｎｆｅｓｔａｎｓ）、ピシウム・ウルティムム（Ｐｙｔｈｉｕｍ ｕｌｔｉｍｕｍ）、炭疽病菌（Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｏｒｂｉｃｕｌａｒｅ）、イネいもち病菌（Ｐｙｒｉｃｕｌａｒｉａ ｏｒｙｚａｅ）、菌核病菌（Ｓｃｌｅｒｏｔｉｎｉａ ｓｃｌｅｒｏｔｉｏｒｕｍ）、及びコムギ葉枯病菌（Ｚｙｍｏｓｅｐｔｏｒｉａ ｔｒｉｔｉｃｉ）の植物病原性真菌の防除に特に好適である。
【0088】
混合物及びその農薬組成物は、それぞれ、アルテルナリア・ソラヌム（Ａｌｔｅｒｎａｒｉａ ｓｏｌａｎｕｍ）、灰色かび病菌（Ｂｏｔｒｙｔｉｓ ｃｉｎｅｒｅａ）、レプトスフェリア・ノドルム（Ｌｅｐｔｏｓｐｈａｅｒｉａ ｎｏｄｏｒｕｍ）、炭疽病菌（Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｏｒｂｉｃｕｌａｒｅ）、イネいもち病菌（Ｐｙｒｉｃｕｌａｒｉａ ｏｒｙｚａｅ）、菌核病菌（Ｓｃｌｅｒｏｔｉｎｉａ ｓｃｌｅｒｏｔｉｏｒｕｍ）、及びコムギ葉枯病菌（Ｚｙｍｏｓｅｐｔｏｒｉａ ｔｒｉｔｉｃｉ）の植物病原性真菌の防除に特に好適である。
【0089】
したがって、本発明はまた、植物の真菌感染を抑制又は予防する方法であって、真菌、その生息地、又は真菌の攻撃から保護される材料若しくは植物、又は土壌若しくは植物繁殖材料は、
ａ）ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲ、又は
ｂ）ＰｅｐＨが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＨ、又は
ｃ）ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸ、又は
ｄ）ＭａｎＣが存在しないか若しくは変異体ＭａｎＣ、又は
ｅ）ＳａｃＢが存在しないか若しくは変異体ＳａｃＢ、又は
ｆ）ａ）、ｂ）、ｃ）、ｄ）、ｅ）、若しくはｆ）の少なくとも２つの組み合わせを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株を含む有効量のパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株で処理され、
ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲにより、野生型ＰｅｐＲを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＨが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＨにより、野生型ＰｅｐＨを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸにより、野生型ＰｅｐＸを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＭａｎＣが存在しないか若しくは変異体ＭａｎＣにより、野生型ＭａｎＣを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＳａｃＢが存在しないか若しくは変異体ＳａｃＢにより、ＳａｃＢを含まないパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
それぞれの野生型ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、又はＳａｃＢを含み、比較に使用されるパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株は、ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、若しくはＳａｃＢが存在しないか又はその変異体を含む株と同じパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）種のものである、方法を含む。
ａ）ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲ、又は
ｂ）ＰｅｐＨが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＨ、又は
ｃ）ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸ、又は
ｄ）ＭａｎＣが存在しないか若しくは変異体ＭａｎＣ、又は
ｅ）ＳａｃＢが存在しないか若しくは変異体ＳａｃＢ、又は
ｆ）ａ）、ｂ）、ｃ）、ｄ）、ｅ）、若しくはｆ）の少なくとも２つの組み合わせを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株を含む有効量のパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株で処理され、
ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲにより、野生型ＰｅｐＲを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＨが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＨにより、野生型ＰｅｐＨを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸにより、野生型ＰｅｐＸを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＭａｎＣが存在しないか若しくは変異体ＭａｎＣにより、野生型ＭａｎＣを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＳａｃＢが存在しないか若しくは変異体ＳａｃＢにより、ＳａｃＢを含まないパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
それぞれの野生型ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、又はＳａｃＢを含み、比較に使用されるパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株は、ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、若しくはＳａｃＢが存在しないか又はその変異体を含む株と同じパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）種のものである、方法を含む。
【0090】
パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株は、インドール酢酸などの植物成長生成物質を産生する。したがって、ａ）ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲ、又は
ｂ）ＰｅｐＨが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＨ、又は
ｃ）ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸ、又は
ｄ）ＭａｎＣが存在しないか若しくは変異体ＭａｎＣ、又は
ｅ）ＳａｃＢが存在しないか若しくは変異体ＳａｃＢ、又は
ｆ）ａ）、ｂ）、ｃ）、ｄ）、ｅ）、若しくはｆ）の少なくとも２つの組み合わせを含み、
ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲにより、野生型ＰｅｐＲを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＨが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＨにより、野生型ＰｅｐＨを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸにより、野生型ＰｅｐＸを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＭａｎＣが存在しないか若しくは変異体ＭａｎＣにより、野生型ＭａｎＣを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＳａｃＢが存在しないか若しくは変異体ＳａｃＢにより、ＳａｃＢを含まないパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
それぞれの野生型ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、又はＳａｃＢを含み、比較に使用されるパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株は、ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、若しくはＳａｃＢが存在しないか又はその変異体を含む株と同じパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）種のものである、菌株は、
また、これらのパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株で植物、苗木、種子、又は植物若しくは種子に近い土壌を処理することによって、植物の成長を促進する方法にも使用することができる。
ｂ）ＰｅｐＨが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＨ、又は
ｃ）ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸ、又は
ｄ）ＭａｎＣが存在しないか若しくは変異体ＭａｎＣ、又は
ｅ）ＳａｃＢが存在しないか若しくは変異体ＳａｃＢ、又は
ｆ）ａ）、ｂ）、ｃ）、ｄ）、ｅ）、若しくはｆ）の少なくとも２つの組み合わせを含み、
ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲにより、野生型ＰｅｐＲを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＨが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＨにより、野生型ＰｅｐＨを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸにより、野生型ＰｅｐＸを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＭａｎＣが存在しないか若しくは変異体ＭａｎＣにより、野生型ＭａｎＣを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
ＳａｃＢが存在しないか若しくは変異体ＳａｃＢにより、ＳａｃＢを含まないパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物と比較して、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の液体培養物の粘度の低下がもたらされ、
それぞれの野生型ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、又はＳａｃＢを含み、比較に使用されるパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株は、ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、ＭａｎＣ、若しくはＳａｃＢが存在しないか又はその変異体を含む株と同じパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）種のものである、菌株は、
また、これらのパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株で植物、苗木、種子、又は植物若しくは種子に近い土壌を処理することによって、植物の成長を促進する方法にも使用することができる。
【0091】
パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株はまた、植物の栄養素を可溶化することも知られている。したがって、本明細書で開示される菌株は、有機又は無機肥料によって提供される植物の栄養素を動員するために使用することもできる。
【0092】
別の態様では、本発明はまた、ａ）ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲ、又はｂ）ＰｅｐＨが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＨ、又はｃ）ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸ、又はｄ）ＳａｃＢが存在しないか若しくは変異体ＳａｃＢ、又はａ）、ｂ）、ｃ）、若しくはｄ）の少なくとも２つの組み合わせを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株の発酵による価値ある生成物の生成方法を含む。
【0093】
価値ある生成物とは、パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｉ）の発酵により生成することができる商品価値のあるあらゆる生成物であり得る。このような生成物の非限定的な例は、食品又は飼料の加工、洗剤又は化学合成などの産業用途で使用される酵素である。このような酵素の例は、フィターゼ、キチナーゼ、プロテアーゼ、マンナナーゼ、キシラナーゼ、セルラーゼ、ラッカーゼ、又はリパーゼである。これらの酵素は、野生型パエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株によっても発現される酵素、又はそれぞれのパエニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）株に対して異種であり、導入遺伝子から発現される酵素であり得る。他の例としては、（酵素活性を有さない）タンパク質、例えば、牛乳又は肉の代替品などの動物性タンパク質の代替品として使用するためのものである。
【0094】
価値ある生成物の更なる例は、ビタミンなどの二次代謝産物、又は２，３－ブタンジオール、乳酸、若しくはアセトインなどの商品価値のあるその他の化学物質である。価値ある生成物が２，３－ブタンジオール、乳酸、又はアセトインである場合、パエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株は、好ましくは変異体若しくは野生型ＰｅｐＨ及び又は変異体若しくは野生型ＳａｃＢを含む。
【0095】
価値ある生成物の追加の例は、ポリミキシン、オクタペプチン、ポリペプチン、ペルギペプチン、フザリシジン、又はランチビオティック（ｌａｎｔｉｂｉｏｔｉｃ）などの抗菌化合物である。
【0096】
価値ある生成物の追加の例は、ａ）ＰｅｐＲが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＲ、又はｂ）ＰｅｐＨが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＨ、又はｃ）ＰｅｐＸが存在しないか若しくは変異体ＰｅｐＸ、又はｄ）ＳａｃＢが存在しないか若しくは変異体ＳａｃＢ、又はａ）、ｂ）、ｃ）、若しくはｄ）の少なくとも２つの組み合わせを含むパエニバチルス種（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）の株により産生されるＥＰＳであり、ＥＰＳの組成は、野生型ＰｅｐＲ、ＰｅｐＨ、ＰｅｐＸ、及びＳａｃＢを含む野生型株とは異なる。
【0097】
本発明の技術的教示は、言語手段を使用して、特に科学用語及び技術用語を使用することにより、本明細書で表される。しかしながら、当業者は、言語手段が、それが詳細且つ正確であり得るとしても、教示を表現する複数の方法があり、その各々が全ての概念上のつながりを完全に表現することは、表現の各々が必然的に完結しなければならないことから必然的に不可能である、ということのみが理由であるとしても、技術的教示の完全な内容に近似するものに過ぎない可能性があることを理解している。これを念頭において、当業者は、本発明の主題が、本明細書で示されるか又は本明細書の本質的な制約によって必然的にパルス・プロ・トト方式で表現される個々の技術的概念の総和であることを理解する。特に、当業者は、個々の技術的概念の表明が、本明細書において、技術的に実用的である限り概念の各々の考えられる組み合わせを詳細に述べたものの略記としてなされ、その結果、例えば、３つの概念又は実施形態の開示であるＡ、Ｂ及びＣは、概念Ａ＋Ｂ、Ａ＋Ｃ、Ｂ＋Ｃ、Ａ＋Ｂ＋Ｃの省略表記であることを理解するであろう。特に、特徴に関する代替案は、代替例又は具体例を集約するリストに関して本明細書で記載される。別途記述されない限り、本明細書に記載の本発明は、そのような代替例の任意の組み合わせを含む。そのようなリストから幾分好ましい要素を選択することは、本発明の一部であり、またそれぞれの特徴によって伝えられる利点を最小程度に現実化させるための当業者の優先性によるものである。このような複数の組み合わされた具体例は、本発明の適切に好ましい形態を表す。
【実施例】
【0098】
実施例１ 変異体の生成：
Ｐ．ポリミクサ（Ｐ．ｐｏｌｙｍｙｘａ）におけるＣＲＩＳＰＲ Ｃａｓ９による点変異の標的化組み込みに使用される株のリストを表１に示す。プラスミドのクローニング及び増殖は、ＮＥＢ（Ｎｅｗ Ｅｎｇｌａｎｄ Ｂｉｏｌａｂｓ，ＵＳＡ）からのいずれかの大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）ＤＨ５αで実施した。Ｐ．ポリミクサ（Ｐ．ｐｏｌｙｍｙｘａ）の形質転換は、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）Ｓ１７－１（ＤＳＭＺ）を介した接合によって行った。株はＬＢ又はＴＳＢ培地で成長させた。平板培地には１．５％寒天を使用した。必要に応じて、培地に５０μｇ／ｍＬのネオマイシン及び／又は２０μｇ／Ｌポリミキシンを補充した。Ｐ．ポリミクサ（Ｐ．ｐｏｌｙｍｙｘａ）は３０℃及び２５０ｒｐｍで成長し、一方、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）は３７℃及び２５０ｒｐｍであった。
Ｐ．ポリミクサ（Ｐ．ｐｏｌｙｍｙｘａ）におけるＣＲＩＳＰＲ Ｃａｓ９による点変異の標的化組み込みに使用される株のリストを表１に示す。プラスミドのクローニング及び増殖は、ＮＥＢ（Ｎｅｗ Ｅｎｇｌａｎｄ Ｂｉｏｌａｂｓ，ＵＳＡ）からのいずれかの大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）ＤＨ５αで実施した。Ｐ．ポリミクサ（Ｐ．ｐｏｌｙｍｙｘａ）の形質転換は、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）Ｓ１７－１（ＤＳＭＺ）を介した接合によって行った。株はＬＢ又はＴＳＢ培地で成長させた。平板培地には１．５％寒天を使用した。必要に応じて、培地に５０μｇ／ｍＬのネオマイシン及び／又は２０μｇ／Ｌポリミキシンを補充した。Ｐ．ポリミクサ（Ｐ．ｐｏｌｙｍｙｘａ）は３０℃及び２５０ｒｐｍで成長し、一方、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）は３７℃及び２５０ｒｐｍであった。
【0099】
【表2】
【0100】
Ｌｕ１７００７はドイツの作付面積から単離され、ブダペスト条約に基づいて、２０１３年２月２０日に受託番号ＤＳＭ２６９７０でドイツ微生物管理機構（ＤＳＭＺ）に寄託された。
【0101】
Ｒｕｅｔｅｒｉｎｇ Ｍ， Ｃｒｅｓｓ ＢＦ，Ｓｃｈｉｌｌｉｎｇ Ｍ，Ｒｕｅｈｍａｎｎ Ｂ，Ｋｏｆｆａｓ ＭＡＧ，Ｓｉｅｂｅｒ Ｖ，Ｓｃｈｍｉｄ Ｊ．Ｔａｉｌｏｒ－ｍａｄｅ ｅｘｏｐｏｌｙｓａｃｃｈａｒｉｄｅｓ－ＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓ９ ｍｅｄｉａｔｅｄ ｇｅｎｏｍｅ ｅｄｉｔｉｎｇ ｉｎ Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｐｏｌｙｍｙｘａ．Ｓｙｎｔｈ Ｂｉｏｌ（Ｏｘｆ）．２０１７ Ｄｅｃ ２１；２（１）：ｙｓｘ００７．ｄｏｉ：１０．１０９３／ｓｙｎｂｉｏ／ｙｓｘ００７に記載されているＣＲＩＳＰＲ Ｃａｓ９手順に従って、Ｐ．ポリミクサ（Ｐ．ｐｏｌｙｍｙｘａ）（レシピエント株）及び目的のプラスミドを保有する大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）Ｓ１７－１（ドナー株）の間で接合を実施した。正しい接合体の確認は、コロニーＰＣＲ及びＤＮＡ断片の配列決定によって実行された。プラスミドの硬化は、３７ＣのＬＢ液体培地中で陽性変異体を１：１００継代培養することによって実施した。
【0102】
ｐｅｐＲ及びｓａｃＢ遺伝子の改変又はノックアウトは、Ｒｕｅｔｅｒｉｎｇ Ｍ，Ｃｒｅｓｓ ＢＦ，Ｓｃｈｉｌｌｉｎｇ Ｍ，Ｒｕｅｈｍａｎｎ Ｂ，Ｋｏｆｆａｓ ＭＡＧ，Ｓｉｅｂｅｒ Ｖ，Ｓｃｈｍｉｄ Ｊ．Ｔａｉｌｏｒ－ｍａｄｅ ｅｘｏｐｏｌｙｓａｃｃｈａｒｉｄｅｓ－ＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓ９ ｍｅｄｉａｔｅｄ ｇｅｎｏｍｅ ｅｄｉｔｉｎｇ ｉｎ Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｐｏｌｙｍｙｘａ．Ｓｙｎｔｈ Ｂｉｏｌ（Ｏｘｆ）．２０１７ Ｄｅｃ ２１；２（１）：ｙｓｘ００７．ｄｏｉ：１０．１０９３／ｓｙｎｂｉｏ／ｙｓｘ００７によって確立されたＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓ９媒介系によって達成された。選択されたｇＲＮＡ配列は、ｐｅｐＲ及びｓａｃＢ遺伝子内の標的位置への最も近い位置に基づいて選択された。隣接する相同体として、それぞれｐｅｐＲ又はｓａｃＢに由来する１０００ｂｐの隣接遺伝子を使用した。ｐＣａｓＰＰベクター系を使用して１０００の次の突然変異を生成した（表２）。
【0103】
【表3】
【0104】
実施例２ 発酵条件及び変異体の特性評価：
変異体の特性評価は、Ｒｕｅｔｅｒｉｎｇ Ｍ，Ｃｒｅｓｓ ＢＦ，Ｓｃｈｉｌｌｉｎｇ Ｍ，Ｒｕｅｈｍａｎｎ Ｂ，Ｋｏｆｆａｓ ＭＡＧ，Ｓｉｅｂｅｒ Ｖ，Ｓｃｈｍｉｄ Ｊ．Ｔａｉｌｏｒ－ｍａｄｅ ｅｘｏｐｏｌｙｓａｃｃｈａｒｉｄｅｓ－ＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓ９ ｍｅｄｉａｔｅｄ ｇｅｎｏｍｅ ｅｄｉｔｉｎｇ ｉｎ Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｐｏｌｙｍｙｘａ．Ｓｙｎｔｈ Ｂｉｏｌ（Ｏｘｆ）．２０１７ Ｄｅｃ ２１；２（１）：ｙｓｘ００７．ｄｏｉ：１０．１０９３／Ｓｙｎｂｉｏ／ｙｓｘ００７．から採用された１２Ｌの菌体外多糖産生培地を充填した２１Ｌのバイオリアクター（Ｔｅｃｈｆｏｒｓ，Ｉｎｆｏｒｓ）で実施した。発酵培地の組成を表３に列挙する。
変異体の特性評価は、Ｒｕｅｔｅｒｉｎｇ Ｍ，Ｃｒｅｓｓ ＢＦ，Ｓｃｈｉｌｌｉｎｇ Ｍ，Ｒｕｅｈｍａｎｎ Ｂ，Ｋｏｆｆａｓ ＭＡＧ，Ｓｉｅｂｅｒ Ｖ，Ｓｃｈｍｉｄ Ｊ．Ｔａｉｌｏｒ－ｍａｄｅ ｅｘｏｐｏｌｙｓａｃｃｈａｒｉｄｅｓ－ＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓ９ ｍｅｄｉａｔｅｄ ｇｅｎｏｍｅ ｅｄｉｔｉｎｇ ｉｎ Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｐｏｌｙｍｙｘａ．Ｓｙｎｔｈ Ｂｉｏｌ（Ｏｘｆ）．２０１７ Ｄｅｃ ２１；２（１）：ｙｓｘ００７．ｄｏｉ：１０．１０９３／Ｓｙｎｂｉｏ／ｙｓｘ００７．から採用された１２Ｌの菌体外多糖産生培地を充填した２１Ｌのバイオリアクター（Ｔｅｃｈｆｏｒｓ，Ｉｎｆｏｒｓ）で実施した。発酵培地の組成を表３に列挙する。
【0105】
表３：原液の保存（室温（ＲＴ）又は４℃）及び滅菌方法（滅菌濾過／オートクレーブ、ｓ／ａ）仕様を備えた菌体外多糖産生培地の組成
【0106】
【表4】
【0107】
３０℃で４０時間発酵を行い、ｐＨを６．８に設定して、Ｈ３ＰＯ４（２５％）及びＮａＯＨ（１Ｍ）で調節した。前培養として、全ての変異体は、１００ｍＬの改変ＴＳＢ培地（Ｂｅｃｔｏｎ Ｄｉｃｋｅｎｓｏｎ Ａｒｔ．Ｎｒ．２１１８２５の３０ｇ／ＬのＴＳＢ、３ｇ／Ｌの酵母抽出物、２０．９ｇ／ＬのＭＯＰＳ、１０ｇ／Ｌのグルコース）を含むバッフル付き１Ｌ振盪フラスコ内で３３℃及び１５０ｒｐｍ／２．５ｃｍ振とう径にて２４時間成長させた。
【0108】
バイオリアクターでは、スターラー－ガス流のカスケードで目標溶存酸素レベルを３０％以上に設定した。産生される菌体外多糖の剥離を防ぐために、２つのプロペラ及び１つのＲｕｓｈｔｏｎで構成される撹拌装置セットアップを使用する間、撹拌は３００～６００ｒｐｍに制限され、後者は撹拌シャフトの近くに配置された。酸素供給を維持するために、０．５ｂａｒの圧力で５～３０Ｌ／分でエアレーションを実施した。Ｓｔｒｕｋｔｏｌ Ｊ６７３（Ｓｃｈｉｌｌ＋Ｓｅｉｌａｃｈｅｒ「Ｓｔｒｕｋｔｏｌ」ＧｍｂＨ，Ｇｅｒｍａｎｙ）を消泡剤として使用した。培養試料はレオロジー粘度分析と更なるオフライン分析のために４時間ごとに採取した。
【0109】
実施例３ 培養ブロス粘度のレオロジー分析：
ブロス粘度のレオロジー分析を、ダブルスライド形状のＡｎｔｏｎ Ｐａａｒ ＭＣＲ３０２レオメーターを使用して発酵中４時間ごとに実施した（Ｍｅａｓｕｒｉｎｇ Ｃｕｐ：Ｃ－ＤＧ２６．７／ＳＳ／Ａｉｒ、温度：３０℃、試料体積：全培養ブロス５ｍＬ）。試料は、１０ｓ－１の一定剪断速度で、１００秒間の予備剪断実験で予備調整した。１０秒ごとに１０個のデータポイントを記録した。予備調整の後、粘度を剪断速度の関数として測定した。したがって、合計２５個のデータポイントを記録しながら、剪断速度は１ｓ－１から１００ｓ－１まで対数的に増加した。発酵時間にわたって測定された培養ブロス粘度を図１に図示する。
ブロス粘度のレオロジー分析を、ダブルスライド形状のＡｎｔｏｎ Ｐａａｒ ＭＣＲ３０２レオメーターを使用して発酵中４時間ごとに実施した（Ｍｅａｓｕｒｉｎｇ Ｃｕｐ：Ｃ－ＤＧ２６．７／ＳＳ／Ａｉｒ、温度：３０℃、試料体積：全培養ブロス５ｍＬ）。試料は、１０ｓ－１の一定剪断速度で、１００秒間の予備剪断実験で予備調整した。１０秒ごとに１０個のデータポイントを記録した。予備調整の後、粘度を剪断速度の関数として測定した。したがって、合計２５個のデータポイントを記録しながら、剪断速度は１ｓ－１から１００ｓ－１まで対数的に増加した。発酵時間にわたって測定された培養ブロス粘度を図１に図示する。
【図1】
【図2】
【図3】
【図4】
【図5】
【図6】
【配列表】
【国際調査報告】