令和3(ワ)4658損害賠償等請求事件

令和５年７月１０日判決言渡 同日原本領収 裁判所書記官
令和３年（ワ）第４６５８号 損害賠償等請求事件
口頭弁論終結日 令和５年５月１１日
判 決
原告 Ｐ１
原告 株式会社フジタ
10 原告ら訴訟代理人弁護士 田上洋平
同 冨田信雄
被告 ブルージー・プロ株式会社
被告 Ｐ２
被告 Ｐ３
被告ら訴訟代理人弁護士 中谷彩
20 同 早川光俊
同 井垣敏生
同 溝上哲也
同 高須賀彦人
主 文
25 １ 被告らは、原告Ｐ１に対し、連帯して５万０３２８円及びこれに対する平成２
６年１１月１日から支払済みまで年５分の割合による金員を支払え。
２ 原告Ｐ１の被告らに対するその余の主位的請求をいずれも棄却する。
３ 被告ブルージー・プロ株式会社は、原告Ｐ１に対し、３９６万２５７３円及び
これに対する平成２６年１１月１日から支払済みまで年５分の割合による金員
を支払え（第６項の債権と不真正連帯）。
5 ４ 原告Ｐ１の被告ブルージー・プロ株式会社に対するその余の予備的請求並びに
被告Ｐ２及び被告Ｐ３に対する予備的請求をいずれも棄却する。
５ 原告株式会社フジタの主位的請求をいずれも棄却する。
６ 被告ブルージー・プロ株式会社は、原告株式会社フジタに対し、３９６万２５
７３円及びこれに対する平成２６年１１月１日から支払済みまで年５分の割合
10 による金員を支払え（第３項の債権と不真正連帯）。
７ 原告株式会社フジタの被告ブルージー・プロ株式会社に対するその余の予備的
請求並びに被告Ｐ２及び被告Ｐ３に対する予備的請求をいずれも棄却する。
８ 訴訟費用は、原告らと被告ブルージー・プロ株式会社の間においては、原告ら
に生じた費用の５分の１を被告ブルージー・プロ株式会社の負担とし、その余は
15 各自の負担とし、原告Ｐ１と被告Ｐ２及び被告Ｐ３との間においては、原告Ｐ１
に生じた費用と同被告らに生じた費用の合計の１００分の１を同被告らの負担
とし、その余は原告Ｐ１の負担とし、原告株式会社フジタと被告Ｐ２及び被告Ｐ
３との間においては、全部原告株式会社フジタの負担とする。
９ この判決は、第１項、第３項及び第６項に限り、仮に執行することができる。
20 事 実 及 び 理 由
第１ 請求
１ 被告らは、原告Ｐ１に対し、連帯して１０００万円及びこれに対する平成２６
年１１月１日から支払済みまで年５分の割合による金員を支払え。
２ 被告らは、原告株式会社フジタに対し、連帯して５０００万円及びこれに対す
25 る平成２６年１１月１日から支払済みまで年５分の割合による金員を支払え。
第２ 事案の概要
１ 訴訟物
(1) 主位的請求
ア 原告Ｐ１の被告Ｐ２及び被告Ｐ３に対する後記本件育成者権侵害の不法
行為（民法７０９条）に基づく損害２４０７万１２９２円のうちの１０００
5 万円（一部請求）及びこれに対する原告Ｐ１主張の被告らの行為の後日であ
る平成２６年１１月１日から支払済みまで民法（平成２９年法律第４４号に
よる改正前のもの。以下明示しない限り同じ。）所定の年５分の割合による
遅延損害金の支払請求（被告Ｐ２と被告Ｐ３は共同不法行為。被告ブルージ
ー・プロ株式会社（以下「被告会社」という。）に対しては民法７０９条又は
10 会社法３５０条に基づく同額の請求。）
イ 原告株式会社フジタ（以下「原告会社」という。）の被告Ｐ２及び被告Ｐ３
に対する後記本件育成者権についての独占的通常利用権の侵害の不法行為
（民法７０９条）に基づく損害２億０３３５万２１８５円のうちの５０００
万円（一部請求）及びこれに対する前記アと同様の遅延損害金の支払請求（各
15 被告の責任原因はアと同じ）
(2) 予備的請求
ア 原告Ｐ１の被告らに対する利用料相当額の利得２１８８万３２９２円の
うちの１０００万円（一部請求）の不当利得返還請求及びこれに対する法定
利息請求
20 イ 原告会社の被告らに対する利用料相当額の利得１億０９４１万６４６１
円のうちの５０００万円（一部請求）の不当利得返還請求及びこれに対する
法定利息請求
２ 前提事実（争いのない事実及び証拠により容易に認定できる事実）
(1) 当事者
25 ア 原告ら
原告会社は、緑化事業に関する商品の企画、製造、販売並びに輸出入及び
メンテナンス業務等を目的とする株式会社である。
原告Ｐ１は、品種登録第１５８６６号に係る品種（以下「本件品種」とい
い、本件品種に係る育成者権を「本件育成者権」という。また、本件品種の
出願を「本件出願」という。）の育成者権者である。
5 イ 被告ら
被告会社は、緑化事業の設計、施工、維持管理及びコンサルタント等を目
的とする株式会社である。
被告Ｐ２は、被告会社の代表取締役である。
被告Ｐ３は、被告会社から委託を受けて同被告が屋上緑化工事等で使用す
10 る植物の育成等を行っている者である。
(2) 本件育成者権の内容及び本件出願（乙２３、弁論の全趣旨）
ア 本件育成者権の出願番号等は、次のとおりである。
出願番号 第１６６４６号
出願年月日 平成１６年２月１０日
15 出願者 原告Ｐ１
品種登録の番号 第１５８６６号
登録年月日 平成１９年１２月１７日
農林水産植物の種類 Phedimus kamtschaticus (Fisch.)’t Hart
（和名：エゾノキリンソウ種）
20 登録品種の名称 トットリフジタ１号
品種育成をした者の氏名 Ｐ４
育成者権者 原告Ｐ１
イ 本件出願の経過
Ｐ４（原告Ｐ１の夫であり、原告会社代表者の父である。）は、平成１６年
25 ２月１０日、出願者を原告Ｐ１とし、農林水産大臣に対し、農林水産植物の
種類について「ベンケイソウ科（キリンソウ）、学名「Sedum Kamtschaticum
」
Fischer」、出願品種の名称「常緑キリンソウフジタ１号」育成者「Ｐ４」、対
照品種と区別される特性として、対照品種名「カランコエ」 区別される特性
、
「常緑であること」、出願品種の育成の経過として、母親「新潟県柏崎市<以
下略>に自生の野生種」、父親「不明」「平成６年７月新潟県柏崎市でキリン
、
5 ソウ苗を採取、当捕場で栽培し自然交雑により平成８年１１月採種し同時に
播種した。
（１２０粒）」等と記載し、所要の特性表等を添付した品種登録願
を提出して、本件品種を出願した（本件出願）。
(3) 原告会社の独占的通常利用権
原告会社は、本件育成者権につき、平成１９年１２月１７日、原告Ｐ１から
10 独占的通常利用権の許諾を受けた（甲２）。
(4) 被告らの行為
被告Ｐ２は、被告会社の代表取締役として、平成２０年４月頃から現在に至
るまで、トレー式屋上緑化システム「みずいらず」（以下「被告製品１」とい
う。）及びトレー式屋上緑化システム「みずいらずスーパー」
（以下「被告製品
15 ２」といい、被告製品１、同２を総称して「被告製品」という。）の各製品を販
売している。
被告製品には、別紙被告種苗目録記載１の種苗（以下「被告種苗１」という。）
ないし当該種苗を用いられることにより得られた収穫物が利用されたことが
あった（時期及び数量は争いがある。。
）
20 被告Ｐ３は、被告Ｐ２が代表する被告会社の委託に基づき、少なくとも平成
２５年５月９日までの間、自ら又は第三者をして被告種苗１ないし別紙被告種
苗目録記載２の種苗（以下「被告種苗２」という。）を生産するとともに、被告
製品を生産し、被告会社へ納入していた。
(5) 前訴（甲３ないし５）
25 ア 被告会社は、原告Ｐ１に対し、被告製品１に用いられた被告種苗１及び被
告種苗２のうち、特に被告種苗２を使用した被告製品１を被告会社が南海辰
村建設株式会社に販売した行為（以下「前訴対象行為」という。）につき、原
告Ｐ１が本件育成者権を侵害した不法行為に基づく損害賠償請求権を有し
ないこと（以下この請求を「前訴請求」という。）等の確認を求め、大阪地方
裁判所に債務不存在確認請求訴訟を提起した（当庁平成２６年（ワ）第１２
5 ５７３号）。
前訴受訴裁判所は、被告会社の前訴請求を棄却する旨の判決をした。
イ 被告会社は、これを不服として控訴をした（大阪高等裁判所平成３０年（ネ）
第１６７０号） 大阪高等裁判所は、
。 令和元年９月５日に口頭弁論を終結し、
同年１２月１９日、前訴請求に係る控訴を棄却する旨の判決をした。
10 ウ イの判決は、令和２年１０月６日確定した。
(6) 刑事事件（乙２９、４３、弁論の全趣旨）
ア 被告会社、被告Ｐ２及び被告Ｐ３は、平成２７年２月１５日、公訴事実の
要旨を次のとおりとする種苗法違反被告事件につき鳥取地方裁判所に起訴
され、平成３０年１月２４日、いずれも有罪判決を受けた。
15 「被告Ｐ２及び被告Ｐ３は、共謀の上、被告会社の業務に関して育成者権
者の承諾なく平成２４年８月下旬頃から平成２５年２月６日頃までの間、兵
庫県南あわじ市所在の第三者の畑で、情を知らない同第三者にトットリフジ
タ１号約８０００株を育成させて生産した上、同月６日頃、被告会社が南海
辰村建設株式会社から請け負った阪神高速道路大和川線の三宅西入口・出口
20 料金所新築その他工事に伴う屋根工事に関し、前記第三者の畑から前記生産
に係るトットリフジタ１号約１８１２株をトレイに植え込んだ被告製品１
４５３トレイ（設置工費込み代金１２７万９７２０円）を、工事現場に発送
し、同月８日頃にこれを同所に到達させて南海辰村建設株式会社に譲渡し、
もって育成者権を侵害した。」
25 イ 被告会社及び被告Ｐ２がアの有罪判決に控訴したところ、広島高等裁判所
松江支部は、平成３０年１１月９日、原判決を破棄し、事件を鳥取地方裁判
所に差し戻した。
ウ 鳥取地方裁判所は、令和４年３月４日、関係証拠の評価を踏まえ、本件品
種がその品種登録出願前に日本国内又は外国において公然知られた他の品
種と特性の全部又は一部によって明確に区別されることには合理的な疑い
5 が残るとして、アの公訴事実について無罪とする判決をした。同判決は、令
和４年３月１９日確定した。
第３ 本件において審理すべき争点について
１ 前訴の既判力
前訴により、被告会社が、原告Ｐ１に対し、基準時である令和元年９月５日に
10 おいて、前訴対象行為につき本件育成者権侵害の不法行為に基づく損害賠償義務
を負うことが既判力をもって確定しているから、当裁判所はこれに拘束される。
２ 審理の蒸し返しとなる争点
１のほか、前訴において当事者が攻撃防御を尽くし、前訴裁判所が実質的な判
断を示した理由中の判断については、当裁判所がこれを重ねて審理することが不
15 当な蒸し返しに当たるものとして、訴訟上の信義則に照らし許されないと解され
るから、そのような観点から本件における当事者の主張を検討する。
(1) 前訴の攻撃防御の構造及び判断
前訴の前訴請求に係る争点は、①被告種苗２がトットリフジタ１号又はそれ
と特性により明確に区別されない品種かどうか（前訴争点２）、②本件育成者
20 権に係る品種登録に次の無効・取消理由があることにより原告Ｐ１の権利行使
が権利濫用となるか
原始的瑕疵１・育成者性の欠如（前訴争点３－１）。
原始的瑕疵２・区別性の欠如（前訴争点３－２）
原始的瑕疵３・未譲渡性（新規性）の欠如（前訴争点３－３）
25 原始的瑕疵４・品種登録における特性審査の瑕疵（前訴争点３－６）。
後発的瑕疵１・均一性ないし安定性の喪失（前訴争点３－４）
後発的瑕疵２・均一性の喪失（前訴争点３－５）
であった（争点の番号は前訴控訴審判決による。前訴争点３－６は控訴審にお
いて追加主張されたもの。。
）
前訴の控訴審は、各争点につき、要旨次のような審理判断（引用された第一
5 審の判断を含む。以下同じ。）をした（甲３、４）。
ア 前訴争点２について
平成２４年８月頃にされた被告種苗２の株分けの経緯から、被告種苗２は
全て被告種苗１が使用された疑いもあるが、他方で、被告種苗２の株分けの
時点で、被告Ｐ３の農場ですでに相当数のタケシマキリンソウが栽培されて
10 いたことから更に検討するに、鳥取大学乾燥地研究センター教授が、鳥取警
察署からの鑑定嘱託に応じて実施したＤＮＡ鑑定（平成２６年１月頃の嘱託
によるものと、平成２７年１月頃の嘱託によるものの２件の鑑定がある。）
につき、鑑定の具体的手順や鑑定資料の入手方法等の妥当性、相当性につい
て評価を加えた上で、前記被告Ｐ３のタケシマキリンソウは被告種苗２とＤ
15 ＮＡ型において異なる反面、被告種苗２は本件品種とＤＮＡ型が明確に区別
されないことから、被告種苗２は、全て被告種苗１が使用された。
これに加え、独立行政法人種苗管理センター（当時の組織。現在、国立研
究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構に統合されているが、統合の前
後を通じ、以後「種苗管理センター」ということがある。）が鳥取警察署から
20 平成２５年８月頃にされた鑑定嘱託に応じて実施された比較栽培試験鑑定
についても、その鑑定試料や手法の相当性等につき評価をし、本件品種（挿
し木してから一冬を越えたもの）と被告種苗２は明確な区別性が認められな
いとした結論は誤りとはいえず、前記の認定は妨げられない。
イ 前訴争点３－１、同３－２、同３－３について
25 タケシマキリンソウが冬季の茎の伸長程度が強いという本件品種の最も
重要な特性を備えているかは明らかでなく、明確区別性を欠くと認めること
は困難で、前訴で証拠提出されたＤＮＡ鑑定の結果からも、タケシマキリン
ソウと本件品種のＤＮＡ情報が同一であると認めることができず、特性にお
いて明確に区別できない品種であると認められない（前訴争点３－２）。桐
蔭横浜大学准教授（当時）が第三者に譲渡したものが本件品種に係る種苗で
5 あるとも認められない（前訴争点３－３） そして、
。 同准教授やＰ４の供述の
内容から、同准教授が育成者であるとは認められず、育成者性欠如の原始的
瑕疵があるということもできない（前訴争点３－１）。
ウ 前訴争点３－４、同３－５
本件品種が越冬を経たものとそうでないものとで特性に差異があるとい
10 う前記アの比較栽培試験鑑定の結果から、本件品種が均一性、安定性を欠く
に至っていたということはできない（前訴争点３－４） また、
。 同比較栽培試
験鑑定によると、各株について形質ごとの平均値から１階級値以上異なった
株があることについては、審査基準や同比較栽培試験鑑定の限界をふまえた
上で、これによって均一性の喪失の有無を最終的に判定することはできず、
15 これによる均一性の喪失も認められない（前訴争点３－５）。
エ 前訴争点３－６
本件品種の登録に際し、本件品種が含まれるタケシマキリンソウ種を対象
としない審査基準に基づき、対照品種にタケシマキリンソウ種を選定せずに
特性審査が行われたことが重大な瑕疵に当たるとの主張につき、タケシマキ
20 リンソウ種とエゾノキリンソウ種は比較的最近まで同じものと考えられて
おりその分類は容易ではないことや、審査基準の策定に当たりどの程度の範
囲の種を対象植物とするかが決まっているわけではないことなどから、これ
が明白且つ重大な瑕疵であって登録処分を無効とするものではない。
(2) 当裁判所で審理すべき範囲
25 ア 被告らは、本件において、前訴控訴審判断は誤りであることを前提に、本
件品種の育成者は前記准教授であって、Ｐ４は育成者でないとの冒認出願に
よる無効、本件出願に対し適法・適正な審査がされなかったことをいう無審
査による無効、明確区別性欠如による無効を理由とする権利濫用の抗弁を主
張している。
しかし、これらの主張は前訴争点３－１、同３－６、同３－２と同一であ
5 るところ、前記１の既判力に抵触するとともに、同２のとおり前訴において
実質的に攻撃防御が尽くされた上でされた判断を不当に蒸し返すものとい
うほかはなく、本件において、既判力ないし訴訟上の信義則に照らし、これ
らの主張につき当裁判所が審理を重ねることはしない。前訴対象行為以外の
行為についても同様である。
10 このことは、被告らが、明確区別性欠如につき提出した証拠（種苗管理セ
ンターが平成３０年６月から実施した栽培試験の結果（乙３１の６）をもと
に農林水産省が作成したキリンソウ属の審査基準（乙４６））についても同
様である。すなわち、被告らは、同証拠を前訴争点３－２（ないし同３－６）
の主張に係る証拠として提出しているにすぎないところ、証拠は、基準時後
15 に発見されたものであっても既判力により遮断されるのは当然のことであ
るし（再審事由にも当たらない。、同様の趣旨は、信義則上主張が許されな
）
くなる攻撃防御方法にも該当するというべきである（なお付言すると、上記
証拠を検討しても、前訴の判断を左右するに足りないものというべきであ
る。。
）
20 イ 前訴の当事者は、被告会社と原告Ｐ１であって、被告Ｐ２及び被告Ｐ３並
びに原告会社は、直接の当事者ではない。
しかし、被告Ｐ２は、前訴当時から被告会社の代表者であって、前記アの
信義則上の制限に服するのが相当である。
被告Ｐ３にあっては、前訴に関与したものではないから、前訴の既判力な
25 いし信義則上の制限に直接服するものではないが、同被告は、前記前提事実
記載のとおり、被告会社から委託を受けて情を知ったうえで被告種苗１、同
２の生産をしていた者であって、かつ、本件において、前訴で実質的に争わ
れた争点について、被告会社及び被告Ｐ２の主張に依拠しており、これとは
別の固有の主張をしていない。このような事情を考慮すると、被告Ｐ３が前
記の争点について争い得るとすることも、紛争の不当な蒸し返しとして許さ
5 れないと解するのが相当である。
ウ なお、原告Ｐ１が、被告会社に対して、本件品種がタケシマキリンソウ種
であっても育成者権を侵害し損害賠償請求ができると主張するのであれば、
訴訟上の信義則に反し許されないとの被告らの主張については、原告Ｐ１は
そのような主張をしているとは解されず、前提を欠き採用することができな
10 い。
３ １及び２を踏まえた本件における争点
(1) 被告らが被告種苗１を使用した被告製品を販売した数量（争点１・請求原因）
(2) 原告Ｐ１の被った損害ないし利得の額（争点２・請求原因）
(3) 原告会社の被った損害ないし利得の額（争点３・請求原因）
15 (4) 消滅時効が成立するか（争点４・不法行為に基づく請求の抗弁）
第４ 争点に関する当事者の主張
１ 争点１（被告らが被告種苗１を使用した被告製品を販売した数量）について
【原告らの主張】
(1) 前訴対象行為に係る１８１２株を含め、被告Ｐ２は、平成２３年６月から平
20 成２６年１０月末日までの間に、別紙被告売上数量一覧表記載のとおり、被告
種苗１を５０万７７３３株譲渡している（甲６）。
当該被告種苗１は、被告Ｐ３が被告Ｐ２の委託に基づき、直接または第三者
に委託して生産したものである。
仮に、上記数量に誤りがあるとしても、被告会社における、被告種苗１の譲
25 渡数量は別紙乙８０添付の「Ｐ３及び下請け農家のキリンソウ取扱状況につい
て」
（訂正後のもの）のとおり、４６万５７６５株を下らない（乙２、乙８０。
以下、乙８０として引用する。。
）
(2) 被告らの主張について
被告らの主張は否認する。
ア 被告会社がタケシマキリンソウを入手したのは、平成２６年３月頃のこと
5 であり（甲１６）、平成２３年のことではない。
イ 被告種苗２が使用されたのは平成２５年２月のことであり（前訴対象行
為）、平成２４年６月からの出荷分にはタケシマキリンソウが使われていた
との主張とは矛盾する。
【被告らの主張】
10 (1) 被告Ｐ２は、平成２３年頃から被告種苗１の生産を始めたが、これ以前から
平成２３年１１月までは、断続的に原告会社から本件品種に係る種苗の製品
（カット苗、プラグ苗、ポット苗）を購入しており、その購入数は１３万３９
００株である。
この在庫数の変化は乙８０添付の表のとおりであって、平成２３年６月２４
15 日段階でマイナスになっており、この出荷分に被告種苗１が使用されている可
能性は否定できない。
(2) 被告らは、平成２３年９月頃からタケシマキリンソウのサンプルを入手する
などしてこれを増殖させ、平成２４年９月以降に受注した出荷分については、
タケシマキリンソウのみで被告製品を製作していた。
20 したがって、被告種苗１が被告製品に使用されたのは、平成２３年６月２４
日から平成２４年５月３１日までに出荷された分（１０万８０３６株）から、
平成２３年６月２４日時点での残株数４０３９株と上記期間中に新たに購入
した２万株を差し引き、被告Ｐ３が平成２５年５月１１日に廃棄した２１２８
株を加算した８万６１２５株である。
25 ２ 争点２（原告Ｐ１の被った損害ないし利得の額）について
【原告Ｐ１の主張】
(1) 不法行為に基づく損害賠償（種苗法３４条３項に基づく損害主張）
ア 被告Ｐ２は、別紙「被告製品の販売額計算書」記載のとおり、被告会社に
おいて、被告種苗１を１株当たり平均８６２円で販売していた（甲７） 本件
。
品種の利用に対して受けるべき利用料率は、販売価格の５パーセントを下ら
5 ない。
よって、原告Ｐ１の被った損害額は、８６２円に出荷数５０万７７３３株
を乗じ、これに利用料率を乗じた２１８８万３２９２円である。
イ 弁護士費用
原告Ｐ１は本訴の提起追行を弁護士に委任したところ、これに要する費用
10 は２１８万８０００円を下らない。
ウ よって、被告らは、合計２４０７万１２９２円及びこれに対する遅延損害
金の支払義務を負う。
(2) 不当利得返還請求
被告らは、何らの利用料を支払うことなく本件品種に係る種苗を生産等して
15 きたのであり、被告らは、法律上の原因なく利用料相当額の利得を得て、原告
Ｐ１は同額の損失を被った。同利得の額は、(1)アと同じである。
(3) まとめ
よって、原告Ｐ１は、(1)ウ又は(2)の金額の一部請求として、請求記載の金
額の支払を求める。
20 【被告らの主張】
(1) 被告会社が行っていた事業は被告製品を屋上等に設置する工事の請負であ
り、単純に被告製品を販売していたわけではない。被告会社が請負業務を行う
ためには、施工費、金物代金等の様々な費用が必要となる。更に、被告製品を
作成するにはトレイや土、育苗の費用を要する。
25 原告会社は、本件品種に係る種苗をカット苗（葉身と葉柄）１５円、プラグ
苗（カット苗を発根させ土に植えたもの）８０円、ポット苗（プラグ苗を生育
して製品として利用できる状態のもの）１４０円で販売していたところ、被告
会社が購入していたのはほとんどカット苗である。よって、原告会社の販売金
額を基準とした原告Ｐ１の利用料相当額は、前記のとおり１５円を基準として、
１株当たり０．７５円と考えられる。
5 (2) 前訴対象行為における被告製品の原価に占める割合、被告製品における被告
種苗１の１株当たりの金額の割合（被告製品の１平方メートル当たりの単価を
参照して算出）を考慮した被告種苗１の１株の販売金額（３２円）に利用料率
を乗じた利用料相当額は１．６円となるが、原告Ｐ１は、原告会社に独占的通
常利用権の許諾をしていたから、実際に受領していた前記(1)の原告会社の利
10 用料相当額が損害の基準となるべきである。
３ 争点３（原告会社の被った損害ないし利得の額）について
【原告会社の主張】
(1) 不法行為に基づく損害賠償（種苗法３４条１項に基づく損害主張）
ア 原告会社は、本件育成者権の独占的通常利用権者であるから、被告らの侵
15 害行為は、同利用権を侵害する。原告会社は、被告製品と競合する製品であ
る、
「ＦＴＭバック」
（以下「原告製品」という。）を生産、販売している(甲
８)。原告製品を販売することによる本件品種に係る種苗１株当たりの利益
の額は３３１円である。
原告会社は２１棟のビニールハウスを有し、平成２１年には被告会社に対
20 し７万３９００株を納入していることから、原告会社が平成２３年６月から
平成２６年１０月末日までの間に本件品種の種苗を５０万７７３３株生産
することは容易であり、利用の能力を超えるものではない。
よって、原告会社が被った損害額は、３３１円に出荷数５０万７７３３株
を乗じた１億６８０５万９６２３円と推定される。
25 イ 弁護士費用
被告らの侵害行為と相当因果関係のある原告会社の弁護士費用相当の損
害額は、１６８０万６０００円を下らない。
ウ 消費税相当額
アとイの合計１億８４８６万５６２３円に対する消費税相当額は１８４
８万６５６２円である。なお、判決確定日の税率が適用される。
5 エ よって、被告らは、合計２億０３３５万２１８５円及びこれに対する遅延
損害金の支払義務を負う。
(2) 不当利得返還請求
ア 独占的通常利用権者には、債権侵害を理由とする不法行為に基づく損害賠
償請求が認められると解されており、また債権侵害の場合にも不当利得返還
10 請求の行使が可能と解されている。したがって、独占的通常利用権者である
原告会社も不当利得返還請求をすることができる。なお、原告会社の本件育
成者権についての独占的通常利用権は、再利用許諾の権限も含まれている。
イ 本件育成者権の利用に対して原告会社が受けるべき利用料率は、種苗の生
産が、医薬品の製造と同じく利益率が高く、品種に対する育成者権の経済的
15 価値が高いことから、２５パーセントを下らない。
よって被告種苗１の１株当たり販売単価８６２円に５０万７７３３株を
乗じ、利用料相当率を乗じた、１億０９４１万６４６１円が、被告らの利得
額となり、原告会社はこの返還を求めることができる。
【被告らの主張】
20 (1) 原告会社の主張に対する反論（不法行為関係）
ア 前記のとおり、原告会社は本件品種に係る種苗をカット苗１５円で販売し
ていたものであって、ポット苗と同程度に育成されるにせよ、３３１円もの
利益を計上できることはあり得ない。原告製品は特許の実施品でもあり、そ
の実施料も考慮すべきである。
25 原告会社においては、本件品種に係る種苗をそのまま譲渡していたのであ
るから、当該譲渡価格を基準として利益を算出すべきであり、１株当たり利
益の額は１５円を上回ることはあり得ず、利益率を６６．７パーセントと高
く見積もっても、１０円程度である。
イ 原告製品は、被告製品の１．５倍の価格であるうえ、原告製品に使用され
る緑化植物の数は原告製品が１平方メートル当たり２４株に過ぎないのに
5 対し被告製品のそれは３６株であって、価格及び被覆率において被告製品が
優れており、市場における競合性はないか、あっても低いと解される。
(2) 独占的通常利用権者は不当利得返還請求できないこと
原告会社は、本件育成者権につき、原告Ｐ１から独占的通常利用権の許諾を
受けたにすぎないものであって、同原告との関係は債権関係にすぎず法による
10 排他的権利を有していないから、被告らに対し、直接に権利主張をすることが
できない。
また、特許権等の侵害による不当利得返還請求権は、実施料相当額のみが認
められるとされるところ、本件において原告Ｐ１は、本件育成者権の利用に対
して同原告が受けるべき利用料の不当利得返還請求を予備的に請求している
15 から、本件育成者権についての利用料は、この請求によって評価され尽くして
いる。
４ 争点４（消滅時効が成立するか）について
【被告らの主張】
(1) 原告らは、平成２７年１１月１６日には、被告Ｐ２が供述者である鳥取地方
20 検察庁検察官作成の供述調書（甲６。以下「甲６調書」という。）を入手してお
り、遅くとも同日、被告種苗１の育成等による損害及び加害者を知った。
平成３０年１１月１６日は経過した。
(2) 被告らは、本件口頭弁論期日において消滅時効を援用する旨の意思表示をし
た。
25 【原告らの主張】
民法７２４条にいう「損害を知った時」とは、加害行為が不法行為であること
を知る必要があるところ、本件において、原告ら（特に原告会社）において被告
らにおける被告種苗１の増殖行為が不法行為を構成することを知ったのは前訴
判決の確定した令和２年１０月６日である。なお、加害者から具体的な抗弁事由
が予想される場合は、抗弁事由の不存在を認識したことも要すると解される。
5 第５ 判断
１ 判断の大要
当裁判所は、争点１については、２６万３３６８株が被告種苗１であり、被告
らは、これらの出荷について不法行為責任を負うと考えるが、争点４において判
断するとおり、前訴既判力の及ぶ部分を除く不法行為に基づく損害賠償請求権は
10 時効により消滅したと考える。
その上で、争点３の原告会社の不当利得返還請求権につき、これを肯定する余
地があるが、具体的に被告らが誰にどのような返還義務を負うか（争点２、３）
は、本件においては育成者権者である原告Ｐ１も不当利得返還請求を行うことか
ら、これとの相関において定まるものと考える。また、この検討と整合的な被告
15 らの不法行為に基づく原告Ｐ１に対する損害額（前訴既判力の対象となる請求権
等の内容）を算定する。
以下、上記の判断順序に沿って詳述する。
２ 争点１（被告らが被告種苗１を使用した被告製品を販売した数量）について
(1) 証拠（甲３、４、６、１６、乙１、１７、２２、４４。枝番のあるものは枝
20 番を含み、認定に沿わない部分を除く。 及び弁論の全趣旨によると、
） 次の事実
を認めることができる。
ア 平成２０年４月ころ、原告会社は、取引先であった商社を介して、被告会
社に本件品種に係る種苗の販売を始め、同年６月２３日付けで、被告会社、
前記商社との間で、増殖を行わない、施工現場にて生育した麒麟草をカット
25 した補植のみ認める、当麒麟草を親とし品種改良等を行わない等の「常緑麒
麟草に関する種苗登録禁止条項を厳守する」旨が記載された覚書を交わした。
イ 被告会社は、アの覚書に従って、原告会社から前記商社を介して本件品種
に係る種苗を仕入れていたが、被告Ｐ３に指示して、平成２３年５月頃から、
覚書に反する態様で被告種苗１を育成するようになった。
ウ 平成２３年１１月２日に原告会社から被告会社に本件品種に係る種苗が
5 納品された後は、覚書に基づく取引がされることはなかった。
エ 被告Ｐ３は、被告Ｐ２の指示を受け、平成２４年２月頃から公知のタケシ
マキリンソウ種の増殖を始め、被告会社において、同種苗をどのように被告
製品に使うか等の検討がされるようになった。
オ 平成２５年４月頃、原告会社代表者は、同業者から、被告Ｐ３が本件品種
10 に係る種苗を無断で増殖している旨を聞き、同月２３日に、同業者の協力を
得て、被告Ｐ３の農場を訪問し、原告会社代表者の知見において、本件品種
に係る種苗が増殖されている実態を見分するとともに、上記同業者が被告Ｐ
３に話を聞いた。
その際、被告Ｐ３は、前記商社から買ったものを挿し木にして増やしてい
15 る、常緑キリンソウと言ったら種苗法違反になる、タケシマキリンソウと言
って売っている、被告Ｐ２はこのことを知っているとの趣旨の発言をした。
同年５月、被告会社は、被告Ｐ３に、被告種苗１を使用した被告製品を廃
棄するよう指示した。
これ以降も、被告会社は、被告製品に用いる公知のタケシマキリンソウ種
20 を入手し、被告Ｐ３以外の下請先で育成をすすめ、平成２６年４月には、被
告製品に被告種苗１が用いられることがなくなった。
カ 鳥取県警察において、被告Ｐ３方への原告会社からの本件品種に係る種苗
の入荷状況及び被告Ｐ３から出荷されたキリンソウの総数につき捜査がさ
れ、それらを対比した結果は、当初「Ｐ３及び下請け農家のキリンソウ取扱
25 い状況について」
（甲６調書の添付書面）として把握されていたが、後にこれ
を訂正する捜査報告書（乙８０）が作成された。
同報告書によると、平成２６年３月末時点で、出荷数は、入荷数を２６万
３３６８株上回る状態であった。
(2) (1)を総合すると、本件において、被告製品に用いられた被告種苗１の株数
は、前訴対象行為に係る被告種苗２である１８１２株を含め、２６万３３６８
5 株であると認められる。
原告らは、甲６調書を根拠に、被告種苗１の株数は５０万７７３３株である
と主張するが、前記認定のとおり、被告会社は、公知のタケシマキリンソウ種
の採用を検討し、平成２６年４月には被告種苗１を使用することはなかったも
のと認められるから、これを採用することができない。
10 被告らは、公知のタケシマキリンソウ種への切替は平成２４年９月頃であっ
たとの主張をするところ、確かに、被告会社が公知のタケシマキリンソウ種の
採用の検討を始めたのは平成２４年２月頃であって、平成２５年５月の原告会
社代表者の被告Ｐ３の農場への訪問以降は、出荷された被告製品中に被告種苗
１が使用されていないものが混在する可能性も考えられるが、なお抽象的な可
15 能性にとどまり客観的な証拠はなく、公知のタケシマキリンソウ種への切替が
平成２６年４月以前に行われたことが的確に立証されたものとは言えないも
のと判断する。
よって、前記数量に反する原告ら及び被告らの主張は、採用しない。
３ 争点４（消滅時効が成立するか）について
20 (1) 認定事実
原告会社代表者は、平成２５年４月頃、被告Ｐ３の農場に赴き、被告種苗１
が原告らの許諾なく増殖されていると考え、同年５月頃、鳥取県警察に相談す
るなどした。このことから、前提事実(6)記載の刑事事件に係る捜査が行われ、
平成２７年２月８日、甲６調書が作成された。原告らは、同年１１月１６日ま
25 でに甲６調書の写しを入手した（弁論の全趣旨）。同供述調書には、被告Ｐ２
が、被告Ｐ３に対し、平成２３年５月頃、被告種苗１を違法に増殖するよう指
示したことが記載されており、同調書に添付の「Ｐ３及び下請け農家のキリン
ソウ取扱い状況について」には、納品数と出荷数の差が５０万７７３３株であ
ることが記載されていた。
また、①原告Ｐ１は、平成２６年１１月１１日には、被告会社に対し、無断
5 で被告種苗１を増殖していることを前提に、生産中止、在庫数及び取引の具体
的内容を照会する通知を発し（乙７４）、②同年１２月２６日には、被告会社
は、前訴請求を含む前訴を提起し、その頃訴状が原告Ｐ１に送達された（乙６
５、弁論の全趣旨）。
(2) 検討
10 ア 原告Ｐ１及び原告会社の当時の代表者（Ｐ４、本件品種の育成者）は夫婦
関係にあり、原告Ｐ１と原告会社は、独占的通常利用権の設定者と利用権者
の関係にあって、本件品種に係る種苗に係る事業そのものや、被告らの無断
増殖行為の問題には、一体として対処していたと考えられることから、原告
らの損害及び加害者の認識について差があるとは考えられない。これを前提
15 とすると、原告らは、甲６調書に接するまでに、被告らが原告らの承諾なく
被告種苗１の増殖をしていること（不法行為該当性は自明である。）につき
疑念を持っており、警察の捜査により、その範囲が甲６調書によっておおむ
ね判明したものであるから、原告らは、遅くとも同調書を入手した時点（遅
くとも平成２７年１１月１６日）で、不法行為に基づく損害賠償請求訴訟を
20 提起できる程度に、損害及び加害者を知ったものというべきである。
イ 原告らは、損害及び被害者を知ったのは前訴が確定したときであると主張
するが、権利行使に関し抗弁がないことの確証を得ないと時効が起算されな
いとするのは時効制度の趣旨に沿わないものであって、かかる見解は取り得
ない。
25 原告らの主張を、前訴に応訴したことによる中断（民法１４７条１号）を
いうものと解したとしても、前訴は、前訴対象行為に限定された不法行為に
基づく損害賠償請求権の不存在確認訴訟であることが明示されているので
あって、それ以外の被告らの行為に係る損害賠償請求権の時効の進行に対し
何らかの法的効果を持つとは考えられない（仮に何らかの効果があり得ると
してもせいぜい催告の効果にとどまる。）から、前訴対象行為以外の行為に
5 係る請求権の消滅時効に関する再抗弁にもならないと解される。
(3) 結論
被告らの消滅時効の抗弁は理由があり、前訴既判力の及ぶ前訴対象行為以外
の被告らの行為に係る原告らの損害賠償請求権は、消滅した。
４ 争点２（原告Ｐ１の被った損害ないし利得の額）及び争点３（原告会社の被っ
10 た損害ないし利得の額）について
(1) 独占的通常利用権者が不当利得返還請求できるかについて
原告会社は、本件育成者権の独占的通常利用権者であり、専用利用権者では
ないものの、本件育成者権を独占的に利用して利益を上げることができる点に
おいて専用利用権者と実質的に異なることはないから、当該利益の得喪につい
15 ては民法７０３条の「利益」及び「損失」に該当する場合があると解するのが
相当である。とりわけ、本件育成者権については、再通常利用権（サブライセ
ンス）の設定をすることができる（原告Ｐ１と原告会社間の設定契約において
は、この点は明示されていない（甲２） 原告らがこのように主張する以上、
が、
別異に解する理由はない。）とされていることにも照らすと、原告会社のかか
20 る利用権設定機会の喪失に対応する被告らの利得を観念し得る。排他的独占権
を持つ育成者権者ではなく、独占的通常利用権者であることのみをもって不当
利得返還請求が否定される理由はなく、これと異なる被告らの見解は、採用す
ることができない。
もっとも、独占的通常利用権者から利用権の設定を受けた者（サブライセン
25 シー）は、重ねて育成者権者から利用権の設定を受けることはないし、再通常
利用権の設定によって再通常利用権者が通常利用権者に支払う利用料は、通常
利用権者が育成者権者に支払うべき利用料を含んでいるのが通常であると考
えられるから、本件において原告らがそれぞれ不当利得返還請求をしているの
は、結局のところ被告らが返還すべき総体としての被告らの利用料相当の利得
の原告間における分配の問題に帰着するものというべきであり、本件育成権者
5 である原告Ｐ１と原告会社の各不当利得返還請求権がいずれも成立するよう
な場合の各請求の関係は、いわゆる「不真正連帯債権」の関係に立つものと解
される。
(2) 相当利用料率等について
本件において、本件品種の利用料率について、原告Ｐ１が５パーセントの利
10 用料率を主張し、原告会社がこれを超える２５パーセントの利用料率を主張し
ていること、原告Ｐ１が本件育成者権の権利者となっているのは、育成者であ
ったＰ４のある種の情誼によるもの（乙２０）であって、本件育成者権の対象
品種を利用しているのは専ら原告会社であり、仮に被告らが利用権の設定を受
けるとすればその相手方は原告会社となると想定されることから、原告会社が
15 利用許諾するとすれば想定される料率を乗じる対象及び相当利用料率を検討
する。
ア 被告製品の概要（ただし、被告種苗１が使用されたもの）
被告製品１は、５０センチメートル四方のトレイにメキシコマンネングサ
を４株、被告種苗１を５株植えたものであり、このトレイを建物の屋上等に
20 必要数を並べて配置することにより、屋上緑化の用に供されるものであり、
被告製品２は、同じトレイに被告種苗１を５株又は９株植えたものである
（甲３、７、乙６７）。
被告が扱う製品には、同じトレイにメキシコマンネングサのみを植えた
「てまいらず」というものもあるが、メキシコマンネングサは、冬には枯れ
25 るのに対し、本件品種に係る種苗は常緑性である（甲１、８、乙６７）
。
イ 一般に、知的財産権の利用許諾において、利用料率の算定方法につき、基
準の明確性や利用権者の開示する情報の性質等から、製品の販売金額を基礎
に、所定の料率を乗じる方法が取られることが相応に存することは公知の事
実に属し、上記被告製品の性質や、本件品種に係る種苗の用いられ方等を勘
案すると、本件においてもこのような方法によって利用料率を算定すること
5 が相当である。これと異なる被告らの主張は、採用しない。
なお、被告製品の設置には工事が必要であり、そのための外注費は被告製
品の販売金額そのものではないと解されるから、売上から同費用を除いた部
分を販売金額と把握すべきである。他方、販売金額に設置に要する物品等が
含まれる（乙６７）としても、それらは被告製品を構成するものであるから、
10 販売金額から控除することはしない。もっとも、利用料率の設定においてか
かる事情を考慮することはできると解する。
これによると、１株当たりの被告製品の販売金額は、外注費込みの１株当
たり販売金額である８６２円（甲７。なお、前記のとおり、
「みずいらずスー
パー」
（被告製品２）には、被告種苗１を５株又は９株使用されているが、甲
15 ７においては、一律に５株として計算されており、その意味で控えめな算定
となっている。）に外注工事費を除く割合５８．６パーセント（乙６９）を乗
じた５０５円と認められる。
ウ 製品の販売金額を基礎とする相当な利用料率については、本件品種に係る
種苗の特性、販売金額を料率算定の基礎としたこと、前記アのとおりの被告
20 製品における本件品種に係る種苗の用いられ方（前記イのとおり、設置には
別途物品が必要である。、種苗の育成等を含む生産工程に要する費用、自然
）
環境の影響による生育不良等の危険等も勘案すると、利用料率については、
これを３パーセントと推認するのが相当である。なお、原告会社はこれを２
５パーセントと主張するが、そのような取引が成立する蓋然性について的確
25 な立証はなく、これを採用することはできない。また、仮に原告Ｐ１が利用
権を設定するとしても、原告会社が設定するとすれば想定される上記料率を
超えることはないと考えられるから、これも採用の限りでない。もっとも、
不当利得返還請求と異なり、原告Ｐ１が種苗法３４条３項の適用を求める不
法行為に基づく損害賠償請求においては、利用に対し受けるべき金銭を算定
するに当たり用いるべき利用料相当額は、令和元年法律第３号による特許法
5 の改正の趣旨を参酌し、これを５パーセントとするのが相当である。
(3) 原告らの具体的な損害・損失額
ア 原告Ｐ１の損害賠償請求（主位的請求）
前訴対象行為である１８１２株に、単価５０５円と相当利用料率５パーセ
ントを乗じた４万５７５３円及びこれに弁護士費用４５７５円を加えた５
10 万０３２８円を、種苗法３４条３項により推定される損害と認め、被告らは、
連帯してこれを賠償する義務を負う（なお、前訴対象行為に関し、被告Ｐ３
も共同不法行為者として責任を負うことについては、甲３、４、乙１及び弁
論の全趣旨によりこれを認める。。
）
イ 原告らの不当利得返還請求（予備的請求）
15 前記２(2)の２６万３３６８株からアの１８１２株を除いた２６万１５５
６株に、単価５０５円と相当利用料率３パーセントを乗じた３９６万２５７
３円を利得と認め、これを上限として、被告会社が不真正連帯債権として原
告らの請求に応じて支払うべきものと判断する。
他方、侵害行為は被告会社として行われ、その利得も被告会社に帰属して
20 いるのであって、代表者である被告Ｐ２に利得が帰属するとの事情は認めら
れないから、被告Ｐ２に対する請求は理由がない。また、本件において、被
告Ｐ３は被告会社の下請けとして関与したものであるところ、原告らは、被
告会社の出荷行為に基づく利得のみを主張し、被告Ｐ３に固有の利得や、そ
れと被告会社の利得との関係は何ら主張していないから、被告Ｐ３に対する
25 請求も理由がない。
ウ なお、本件において、原告Ｐ１は５パーセントの、原告会社は２５パーセ
ントの利用料率に基づく不当利得返還請求するものであるが、前記のとおり、
本件において、相当な利用料率は相対的に低廉な料率を主張する原告Ｐ１の
主張を下回るものであるから、認容されるべき返還請求権の全額について不
真正連帯債権関係に立つものと解される。
5 第６ 結論
以上の次第で、原告Ｐ１の主位的請求は主文第１項の、予備的請求は第３項の
限度で理由があり、その余はいずれも理由がなく、原告会社の主位的請求は全部
理由がなく、予備的請求は主文第６項の限度で理由があり、その余はいずれも理
由がない。なお、仮執行の免脱宣言は相当でないのでこれを付さない。
大阪地方裁判所第２６民事部
15 裁判長裁判官
松 阿 彌 隆
裁判官
島 田 美 喜 子
裁判官
阿 波 野 右 起
（別紙）
被告種苗目録
１ 原告Ｐ１の許諾なく生産されたトットリフジタ１号の種苗
２ 被告会社が南海辰村建設株式会社から請け負った阪神高速道路大和川線三宅西
5 出入口料金所新築その他工事に伴う屋根工事に関し、平成２５年２月８日頃、工事
現場に納入され、南海辰村建設株式会社に譲渡された約１８１２株の常緑性の種苗
10 （以下別紙省略）